蛋白質のフォールディングと
桑島邦博 ( 教授 )(2007 年 1 月 1 日着任 ) A-1) 専門領域 : 蛋白質科学, 生物物理学, 生体分子科学 A-2) 研究課題 : a) モルテン グロビュール状態蛋白質化学療法剤複合体の抗腫瘍活性 b) DMSO 停止水素 / 重水素交換二次元 NMR 法の改良 c) GroE
... 研究活動の課題と展望 蛋白質のフォールディング問題は物理化学としても興味深いが，生命科学や医学とも深い関わりを持っている。特に，フォー ルディング中間体であるモルテン・グロビュール状態のa ラクトアルブミンが脂肪酸（オレイン酸）と複合体を形成すると抗腫 ...
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蛋白質科学会アーカイブ ストップト・フロー法を用いた速度論測定
... でいる場合もある。例えば、蛋白質のフォールディング反応の場合、不感時間内に中間体 の蓄積が起こるものもある。この様な場合、反応曲線をゼロ時刻外挿することにより、中 間体の特徴づけを行うことができるが、そのためには反応開始時刻が正確に定義されてい ...
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ツメガエルの眼の初期発生に関わるZnフィンガー蛋白質とホメオドメイン蛋白質Otx2に関する研究
... Functional analyses using phosphomimetic or non-phosphorylatable Otx2 mutants suggest that phosphorylated Otx2 represses the Cdk inhibitor gene p27xic1 and the posterior gene [r] ...
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平成 26 年度研究開発実施報告書 ライフサイエンスデータベース統合推進事業 統合化推進プログラム 研究代表者 [ 中村春木 ] [ 大阪大学蛋白質研究所 所長 / 教授 ] [ 蛋白質構造データバンクの高度化と統合的運用 ] 1
... B-3. 小林直宏、"データベースの積極的な活用が生み出す BioNMR の新しい使い方"、平成 26 年 度日本分光学会ＮＭＲ分光部会、東京、2014 年 9 月 11 日 〈国際〉 A-1. Haruki Nakamura, New Approach to Electrostatic Properties of Proteins and Protein-Protein ...
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アミド基を有するルテニウムトリスビピリジン錯体の光化学的性質とアニオン結合能：光機能性人工蛋白質を目指して
... 討した結果、アミノ化キニンを側鎖に有するポリフェニルアセチレン（ cis-poly-AQn）が、対応する モノマーより遙かに高い不斉選択性をヘンリー反応で示すことを最近見出した。側鎖のキラリティ とラセンキラリティとの相乗効果により、不斉選択性が向上したものと推測される。ラセン構造の重 ...
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第16回日本蛋白質科学会年会 プログラム・要旨集
... 下記以外のフォントを利用する際は、他のフォントを使用したい場合は、 パワーポイントデータ作成時に『フォントの埋込』をしてください。 日本語フォント : 【Windows】MS明朝、MSゴシック 【 Macintosh OSⅩ以降】MS明朝、MSゴシック、ヒラギノ 【Macintosh OS9.2以前のヴァージョン】 ...
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膀胱癌における膜貫通型蛋白質BST-2の高発現は AktとErkのリン酸化を誘導する
... 14 種類のヒト全身正常臓器および膀胱癌組織 8 例を材料に、定量的 RT-PCR で BST2 の発現 を検討したところ、正常臓器では肺、胃、骨髄、肝臓において BST2 の発現が比較的高く認めら れたが、膀胱癌組織ではさらに高い発現レベルであった。当院で 2003 年 4 月から 2007 年 3 月 ...
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Ⅳ 基質結合に伴う溶液中での蛋白質の構造変化の研究
... 精度データ収集を目指した、 X 線 CMOS 検出器を用いた連続回転データ収集法の開発と実用化を進 めている。さらに、微小結晶構造解析の実用化に重要な、壊れやすい微小結晶を安全かつ簡便に取り 扱うための光ピンセットによる非接触微小結晶ハンドリング技術の開発も進めている。 Ⅲ 脂質メディエータの構造生物学的研究 ...
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宇宙環境利用蛋白質結晶生成応用利用実証プロジェクトのご案内
... が重要です。DTT の添加等による安定化をお願いします。ただしこれまでの実験で、調製後直ちにバッ チ法や蒸気拡散法での実験を開始すれば変性することなく結晶が生成するような試料は、例えば沈殿化 剤を含まない（あるいは塩強度の低い）状態では不安定だが若干量の沈殿化剤（もしくは塩等）で安定 ...
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抵抗性遺伝子によりつくられた蛋白質が 細胞内に留まる例も知られています その場 合 細胞内の抵抗性遺伝子産物と細胞膜を貫通する植物因子が結合した状態で存在し 細胞膜貫通因子で病原菌のavr 蛋白質を認識します Avr 蛋白質が認識されると 抵抗性遺伝子産物と細胞膜貫通因子は解離し 遊離した抵抗性遺伝
... 白質複合体のことを「ディフェンゾーム」と名づけました。ディフェンゾームは、細胞内 の生化学反応のスイッチの役割をするOsRac1（GTP 結合蛋白質の一種）や、蛋白質の安 定性を制御するRAR1、HSP90（heat shock protein ...
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立体構造予測 フォールディング問題、
... を検索し、その鋳型・アラインメントを基にモデル構築をおこないましたが、 マルチプルアラインメント、プロファイル（PSSM）を有効に用いたり、構造配列相 関を用いることにより、より遠縁の鋳型を検索することができます。 これらフォールド認識法を用いた多くのサーバーが存在します。 ...
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生体内に存在する蛋白質の中には、20種類の基本アミノ酸だけでは機能の発現ができない蛋白質が存在する
... SelB の C 末端側のフラグメント(SelB-M)と、特徴的な二次構造を持つ mRNA である SECIS-RNA の複合体構造解析を行った。SelB-M は DNA 結合モチーフとして 名高い winged helix モチーフを持つ蛋白質であるが、SECIS との結合はこれまでに知 ...
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別添 5 研究開発課題別事後評価結果 1. 研究開発課題名蛋白質構造データバンクの国際的な構築と高度化 (PDBj) 2. 代表研究者名中村春木 ( 大阪大学蛋白質研究所教授 ) 3. 代表研究者による成果開発概要 3-1. 研究目的欧米 日本を中心とする国際的な構造ゲノムプロジェクトの進展 成熟に
... ４－５．総合評価 研究開発計画以上の成果が見られ、ライフサイエンス分野の情報基盤整備に大きく貢献し た。 タンパク質立体構造のデータベース基盤を、厳密なデータ品質の管理のもとに構築する など、データベースの標準化に大きく貢献し、国際的な協調体制を確立した。また、有用 ...
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体が結合してから水疱形成に至るまでの分子メカニズムに関する基礎的知見を得ることにある デスモソーム関連蛋白ならびに表皮角化細胞の中間径線維であるケラチンに蛍光蛋白質を融合した発現ベクターを作製し それぞれを培養角化細胞に導入して融合蛋白の発現を試みた 続いて細胞接着における発現蛋白の細胞内動態を経時
... ㎖ の AK23 mAb を反応させ、その後AxioVision 社の Delta Vision 撮影装置を用いて EGFP-K14 の細胞内動態を 12 時 間まで観察した。その結果、AK23 mAb 反応後 ...EGFP-K14 のごく一部で接着面の細胞膜への insertion が消失し、ケラチン線維が細胞の中心へと ...
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平成 17 年度事業報告書 自平成 17 年 4 月 1 日 至平成 18 年 3 月 31 日 I. 事業の状況 1. 助成部 ( 一般会計 ) に関する事項蛋白質に関する研究の助成及び奨励について 従来どおり下記のごとく助成を行いました (1) 一般研究に対する助成大阪大学蛋白質研究所における各
... Int. J. Pept. Res. & Ther., (2006) in press. (3) 情報関連事業について（情報室） データベースの利用の現状について Peptide Information 誌は、本年３月末現在で５８名が利用しています。また、 Peptide Information 誌のフロッピーディスク版 (PI-DISK) の利用者は、本年３月 末現在 ...
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(2) 牛群として利活用 MUNを利用することで 牛群全体の飼料設計を検討することができます ( 図 2) 上述したようにMUN は 乳蛋白質率と大きな関係があるため 一般に乳蛋白質率とあわせて利用します ただし MUNは地域の粗飼料基盤によって大きく変化します 例えば グラスサイレージとトウモコシ
... は、乳蛋白質率と大きな関係があるため、一般に乳 蛋白質率とあわせて利用します。ただし、MUNは地 域の粗飼料基盤によって大きく変化します。例えば、 グラスサイレージとトウモコシサイレージでも異な りますし、蛋白飼料のバイパス率でも異なります。さ ...
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ロ構成要素の機能 目的遺伝子 発現調節領域 局在化シグナル 選抜マーカーその他の供与核酸の構成要素それぞれの機能 目的遺伝子及び選抜マーカーの発現により産生される蛋白質の機能及び当該蛋白質がアレルギー性 ( 食品としてのアレルギー性を除く ) を有することが明らかとなって
... リコシド系抗生物質のハイグロマイシン B、ハイグロマイシン B2、さらに構造 が類似したデストマイシン A、デストマイシン B をリン酸化することが知られ ているが、他のアミノシクリトール系やアミノグリコシド系の抗生物質（ネオ マイシン、ストレプトマイシン、ゲンタマイシン、カナマイシン、スペクチノ マイシン、トブラマイシン、アミカシン等）はリン酸化しない (Rao et al., 1983; ...
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トーゴーの日シンポジウム 2016 東大弥生講堂, 5 October 2016 生命科学におけるデータサイエンスの課題と PDB 中村春木 大阪大学蛋白質研究所
... – メタデータの記載が面倒であり情報を引き出しにくい • 新規フォーマットでもできるだけ互換性を保つ • 新規フォーマットから PDBフォーマットへの変換サービスを公開 ...
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「蛋白質発現・相互作用解析技術開発」産業科学技術研究開発基本計画
... 本研究開発は、遺伝子やタンパク質等の生体分子の機能・構造解析等を行うとともに、 それらの研究を強力に推進するためのバイオツールやバイオインフォマティックスの 開発、成果を高度に利用するためのデータベース整備や先端技術を応用した高度医療機 器開発等により、テーラーメイド医療・予防医療・再生医療の実現や画期的な新薬の開 ...
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PDBのデータとその見方 探し方 PDBj講習会 金城玲 大阪大学蛋白質研究所
... ● PDBフォーマットは基本的なデータを目で確認するには適しているが、その他の用途には信頼 性の面で問題がある。プログラムで一貫して扱うのはほとんど不可能。 ● mmCIFは完全なデータが比較的目に易しい形で閲覧できるのが良い。パーザライブラリ(C++) は RCSBから用意されている。（あるいは lex/yacc などで自作する） ...
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