生命科学系データベースアーカイブ データDL
2016 年 2 月 8 日情報 システム研究機構シンポジウム 生命科学とオープンデータ 東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻 科学技術振興機構 (JST) バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC) 情報 システム研究機構 (ROIS) 国立遺伝学研究所 (NIG) DDBJ センター
... – Wellcome Trust：資金援助した研究から出る成果の価値を最 大化するため • 出版社：発表論文に関するエビデンスの確保 – PLOS系列：論文作成に関係する全データを制限なしで公開 – Nature系列：論文Submit時にはEditorsやReviewersが見られ ...
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05/0/7 論文準備ここからスタート in 農学生命科学図書館 共催 : 農学生命科学図書館 本部情報基盤課 [ 学術情報リテラシー担当 ] テーマや著者名から雑誌論文を探す英語論文 Web of Science コアコレクション ( 全分野 ) 学内から GACoS 定番データベース から 学外
... 共催：農学生命科学図書館・本部情報基盤課 [学術情報リテラシー担当] 東京大学で利用できる電子ジャーナルのリンク集。 【学内から】 GACoS 「定番データベース」から ※ TREE の画面上部に GACoS へのリンクあり 【学外から】 SSL-VPN Gateway サービス or 認証 GW サービス にログイン ⇒「データベース・電子ジャーナル一覧」の画面上部の検索欄から ...
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ORACLEデータベース10G データ・ポンプ: 超高速データ移動ユーティリティの基盤
... れます。 データベース・オブジェクトの定義は、元のエクスポートで実行された SQL DDL ではなく XML 文書として抽出されダ ンプファイル・セットに書き込まれます。これにより、インポート時に DDL を作成する場合の柔軟性が向上し XSL-T 変 換が適用できます。たとえば、オブジェクトの所有権、格納特性および表領域レジデンスは、インポート中に簡単に変更 できます。XML では、DDL ...
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中尾佐助探検記録（タイプスライド）のデータベース化について 公開シンポジウム・論文集 – 人文系データベース協議会
... （大阪府立大学名誉教授） 自然や人間生活の実地調査では得た情報の根拠を残すのが難しく、多くの場合、紀行文の記録だけになって再 確認できないため、実験科学的研究者からの評価を受けられない事がある。フィールド研究では再現性を確認でき る採集物や種子などで根拠を確保し、生物学での新種の記録（記載 description ）では根拠のタイプ標本を指定す ...
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2018年度 実験補遺（ＰＤＦ) 基礎生命科学実験・生命科学実験（東京大学 教養学部）お知らせ一覧
... 生命科学実験では、生物材料、割れたカバーガラス等のガラスゴミ、カミソリ、マイクロピペットの チップ、マイクロチューブ、チューブ、ビニール手袋など様々な廃棄物が出る。これらは分別して回 収し、事業系一般廃棄物（可燃ごみ）、産業廃棄物（不燃ごみ）、プラスチックリサイクルごみ（滅 菌・洗浄後、高炉燃料リサイクルされる）、感染性（疑似感染性）廃棄物等として処理される。よっ ...
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一括 公開シンポジウム・論文集 – 人文系データベース協議会
... on Rails や Python が普及し、更には開発当初には存 在 し なか っ た マッ シ ュ ア ッ プ 型 の 様 々 な サ ー ビ ス が 登 場してきている。 蓄積したデータを将来に亘って安定的に提供し続け る た め に は 、 よ り 汎 用 的 ・ 公 共 的 な 基 盤 を 利 用 す る の が確実であると考えられる。近年、大学や国立研究機 関で集約が進められている機関リポジトリは、まさに研 ...
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国会図書館法を改正し、投稿機能付きの全メディア・アーカイブと権利情報データベースを始動せよ
... 2）「なぜ税金を使うのか」「民間でやるべき」「民業圧迫である」との意見 おそらくこうした意見は強いだろう。いずれももっともな懸念である。 公共のサポートによっておこなう第一の理由は、こうした全文化アーカイブは社会イン フラだからである。日本は今もって国費だけで約 6 兆円の税金を道路などの公共事業工事 に投資している国である xv 。こうした公共工事の中には無論必要なものもあろうが、不要不 ...
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改訂履歴 訂番日付頁変更内容 /02/28 - 新規作成 /11/07 表紙タイトルを修正修正前 : 東日本大震災アーカイブデータベースシステム修正後 : 災害アーカイブデータベースシステム 改訂履歴 改訂履歴の追加 全体 311 まるごとアーカイブス検索シス
... 「コンテンツデータを表示する」をクリックすると、別タブでコンテンツが 表示されます。ブラウザ上で再生可能でないファイルの場合はコンテンツデー タのダウンロードが開始されますので、お手持ちのソフトで再生して下さい。 位置情報 ...
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目次 生命科学系の研究分野において主にゲノムデータ解析用の プラットフォームとして使われている Galaxy について オンデマンドクラウド機能を活用して解析環境を提供する 事例をご紹介します 1. データ解析プラットフォーム Galaxy とは 2. Galaxy によるNGSデータ解析について
... gigascience-special-session-at-iscb-asia-on-workflows-cloud-for-reproducible-bioinformatics/ 入力データ データ取得先情報＝公共データベースの登録 IDなど ツール 公開リポジトリで版数付けされたものでコンテナ化 ワークフロー ツールの組み合わせ手順（パイプライン）をGalaxy ...
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110606医学系文献データベースガイダンス
... 引用文献と被引用文献 この論文が 引用 された 論文 この論文が 引用 している 論文 SCOPUS ：いろいろな機能 • 引用分析。 • 論文ごとの被引用傾向をテーブル表示。 Citation overview • 検索アラート • 著者引用ｱﾗｰﾄ検索履歴の表示 パーソナル 機能 • ジャーナル別に評価指数、年間の被引用数、 年間発行論分数などをグラフで表示。 •[r] ...
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改 訂 履 歴 訂 番 日 付 頁 変 更 内 容 /02/28 - 新 規 作 成 /11/07 表 紙 タイトルを 修 正 修 正 前 : 東 日 本 大 震 災 アーカイブデータベースシステム 修 正 後 : 災 害 アーカイブデータベースシステム 改
... 「コンテンツデータを表示する」をクリックすると、別タブでコンテンツが 表示されます。ブラウザ上で再生可能でないファイルの場合はコンテンツデー タのダウンロードが開始されますので、お手持ちのソフトで再生して下さい。 位置情報 ...
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生命・錯体分子科学研究領域
... チングできることを初めて確認した。これにより，P D M S によるマイクロ流路形成や細胞外マトリックスの印刷な どにおいて従来できなかった各種の構造を形成することが可能となった。 b) 脂質二重膜／膜タンパク集積系は，細胞の基本的機能を支配する，脂質−タンパクやタンパク−タンパク相互作用 を調べる興味深い反応場と言える。この構造と機能の研究は分子科学の新分野であるとともに，上記の素子構造形 ...
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2020 年分子生物学会 生命科学のデータベース活用法 2020 多階層オーミクスデータ DBKERO: Kashiwa Encyclopedia for Researchers of multi-omics analysis) 〇鈴木穣 菅野純夫東京大学新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻
... データコンテンツの選択と表示 KEROデータコンテンツ DBKEROのデータ構造の全 体像. 日本人の臨床オミック ス情報がモデルシステムか らの包括的オミックス情報と どのように関連しているかを 示す. ...
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生命・錯体分子科学研究領域
... C ). 研究活動の課題と展望 蛋白質のフ ォ ールディ ング問題は物理化学と して も興味深いが，生命科学や医学と も深い関わ り を持っている。特に， フ ォ ー ルディ ング中間体であるモルテン・グロ ビュール状態の a ラ ク ト アルブミ ンが脂肪酸 （オ レイ ン酸） と複合体を形成する と抗腫 瘍活性を発現するのは興味深い現象である。現在までの研究から， われわれはヤギ a ラ ク ト アルブミ ...
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生命・錯体分子科学研究領域
... c). ナノテクノロジーと構造生物学の融合による生命分子科学研究 A -3). 研究活動の概略と主な成果 a). 糖鎖の機能を詳細に理解するためには，その立体構造を溶液中での揺らぎを含めて明らかにする必要がある。我々は， 常磁性ランタニドイオンの導入によって観測される擬コンタクトシフト（PC S）を活用し，NM R 法と分子動力学（M D） ...
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生命・錯体分子科学研究領域
... a). 緑膿菌（ Pseudomonas aeruginosa）の酸素に対する走化性（A erotaxis）制御系において酸素センサーとして機能する シグナルトランスデューサータンパク質である A er2 タンパク質の構造機能相関の解明を目的とし，A er2 タンパク質 のＸ線 結 晶 構 造 解 析を行った。アミノ酸 配 列から推 定される A er2 のドメイン 構 造は，N 末 から H A M P，P A S， ...
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生命・錯体分子科学研究領域
... B -11).産学連携 共同研究 （ （株） カネカ） 「固相担持型 Buchwald-Hartwig 反応触媒の開発」 ,. ,.魚住泰広.(2008年 –2009年 ). C ). 研究活動の課題と展望 数年前にゼロからのス タ ー ト を切った精密有機分子変換反応の aqueous-switching，heterogeneous-switching の試みも十分な ...
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生命・錯体分子科学研究領域
... 他の国際ジャーナルに発表されており，これは本研究のプロダクティビティとクオリティをよく反映している。総合 的に，本研究は非常に創造的で，国際的に競争力のある内容である。 魚住泰広教授 本研究の中心はグリーンケミストリーである。特に，魚住教授の研究では水中で機能しかつ高い活性と選択性を示 す不均一系有機反応触媒の開発が行われている。この目標に対する非常に成功した例として，ポリエチレングリコー ル（P E ...
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生命・錯体分子科学研究領域
... きる事を発見したことを受け，２ ０ ０ ８年度は，これを現在研究課題 c) として進めている神経細胞ネッ トワーク素子にお ける神経細胞の設置場所の制御や軸索，シナプスの成長制御のためのマイクロ流路形成に利用することを念頭にいれ て，新たにエッチングチャンバーを製作し，この新しい放射光エッチング反応の基本特性の測定を進めた。 b) ...
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「西浦の田楽」で継承される「教え」の映像デジタルアーカイブの構想 公開シンポジウム・論文集 – 人文系データベース協議会
... 簡易データベースを作成した結果、地能「治部の手」 からはね能全 12 演目にかけて、同じお囃子が使われ ていることを可視化できた。また、「御子舞」、「猿の舞」、 「 田 楽 舞 」 のお 囃 子 は、 そ の各 演 目 で し か 演 奏 さ れ な ...
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