生命科学研究に資する放射光Ｘ線構造生物学研究
応用生命化学科 2019 年度研究室活動報告 1 応用細胞生物学研究室 2 応用微生物学研究室 3 食品微生物工学研究室 4 森林生物化学研究室 5 生物制御化学研究室 6 生命資源化学研究室
... 褐色腐朽菌キチリメンタケをスギ木粉を炭素源として培養し，木材分解関連酵素遺伝子 の経時的な発現量変化を RNA-seq により解析した.得られた遺伝子発現情報から，木材細胞 壁分解関連酵素のうち，特に加水分解酵素群において，経時的な遺伝子発現増加が見られ た.本実験ではロングリードシークエンサーである MinION を使用して，シークエンス解析 ...
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Vol.24 No.1 (2015) バイオイメージング 特集 顕微鏡で測る (2) ルシフェラーゼを用いた細胞レベルの遺伝子発現動態解析 今井章裕 1* 村田隆 1,2 長谷部光泰 1,2 1 自然科学研究機構 基礎生物学研究所 生物進化研究部門 2 総合研究大学院大学 生命科学研究科 *E-ma
... 要旨 多細胞生物の発生や環境応答の過程では、遺伝子発現が細胞ごとに異なる動態を示すことがある。遺伝子発現の動態を 詳細に知るためには、生体内でレポータータンパク質を発現させ、そのシグナルの時空間変化を調べる必要がある。これ までの遺伝子発現の動態解析では、シグナルが強く、かつ多色イメージングが可能である蛍光タンパク質が、レポーター ...
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3-3. 物質化学グループ 木村正雄物質構造科学研究所放射光科学第二研究系総合研究大学院大学高エネルギー加速器科学研究科物質構造科学専攻 1. 概要 グループのミッション XAFS/ [1] ビームラインの高度化視点 (1) (heterogeneity) (2) (dynamics) (3) /
... １．概要 NW2A はアンジュレーター光源から得られる大強度の 単色および白色Ｘ線を自由に利用できるビームラインであ る。ビームラインで整備しているユーザー共用装置として は波長分散型 XAFS（DXAFS）および通常の XAFS があ り，特に時間分解 DXAFS に関する研究に注力している。 DXAFS を用いた時分割 XAFS 測定ではミリ秒からマイク ...
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放射光軟X線分光法による研究と立命館ＳＲに期待するもの
... 単層有機シリコンナノシートの合成、構造評 価と光学特性 （岡本、杉山、中野 他（豊田中研）） ・H. Okamoto et al. “Silicon Nanosheets and Their Self-Assembled Regular Stacking Structure” J. Am. Chem. Soc. 132 (2010) 2710-2718 ...
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生命・錯体分子科学研究領域
... は，暗所で調製したアデノシルコバラミン結合型 CarH（AdoCbl-CarH）は，四量体構造を有しているが，これに可 視光を照射すると単量体へと解離することを明らかにした。光照射による四量体から単量体への高次構造変化は不 可逆的な変化であり，光照後のサンプルを暗所に戻しても四量体へと戻ることはなかった。CarH による DNA 結合 ...
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生命・錯体分子科学研究領域
... a) 放射光エッチングの特性を生かして，生体情報システムと S i 電子回路システムの融合を目指す。前者はイオンに よる電気伝導系で後者は電子による電気伝導系である。両者を結合する基本素子は膜タンパクのイオンチャンネル である。Si 基板に貫通穴を形成し，そこに脂質二重膜／イオンチャンネル集積構造を形成しチャンネル前後に電極 ...
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生命・錯体分子科学研究領域
... Rep. に発表された。 c) 圧縮気体で動作するシリンジポンプによる急速溶液交換装置を，藤貴夫准教授のグループが開発したチャープパル ス上方変換による全反射赤外分光装置と組み合わせて実験を行った。全反射プリズム上で，水とアセトンが置き換 わる様子を 1 ミリ秒の時間分解能で計測することに成功した。その結果，溶液交換が約 10 ミリ秒で完結しているこ ...Express に発表された。 d) ...
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3-3-2 理研ビームライン 大型放射光施設の現状と高度化 理研放射光科学総合研究センターではSPring-8のビームライン利用技術高度化やSACLAの新規利用技術開拓に向けた様々なR&Dに対応し また理研内の物質科学や生命科学での放射光利用研究を推進するために 現在立上げ調整中のビームラインを含め
... 2 に設置されたフェムト秒レーザーを実験ハッ チ 3 で簡便に使えるように隔壁に貫通孔を設けレーザー 専用のダクトを設置した。同時に実験ハッチ 3 内での安 定したレーザーの取回しのためにポストを設置した。ま た、実験ハッチ 3 の上流側に長焦点距離の K-B ミラーシ ステムを常設した（図 5）。これにより 20 ミクロン程度 ...
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生命・錯体分子科学研究領域
... 考えられがちであるが，近年になって，ヘムおよびヘムタンパク質の新規な生理機能が次々と報告され始め，多くの 研究者の注目を集めている。それらの代表的な例として，酸素，C O，N O などのガス分子に対するセンサーとして の機能を有し，遺伝子発現制御，走化性制御，セカンドメッセンジャーの合成・分解を介した多様な生理機能制御 ...
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生命・錯体分子科学研究領域
... 表面増強赤外分光計測を膜タンパク質に適用するため，金薄膜の厚みの違いによる赤外吸収への影響を調べた。対象 にはハロロ ドプシン試料を選び，タンパク質骨格の吸収を反映する ami ...を精製し，脂質二重膜 に再構成した上で，全反射フーリエ変換赤外分光法を用いて，光定常状態での構造変化を解析した。C hR W R 及び C hR F R ...
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生命・錯体分子科学研究領域
... -3) 研究活動の概略と主な成果 a) アルツハイマー病の発症に関わるアミロイド β （A β ）は，神経細胞表層に豊富に存在する糖脂質である G M1 ガング リオシドとの相互作用を契機として，アミロイド繊維とよばれる異常な会合体を形成することが知られている。A β の重合初期過程に関する構造情報を得るために，超高磁場 N M R 分光法を利用して，G ...
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生命・錯体分子科学研究領域
... -3). 研究活動の概略と主な成果 a). プロテインジスルフイドイソメラーゼ（PD I）は小胞体に豊富に存在する酵素であり，ジスルフィ ド結合形成反応を触 媒する作用を通じて他のタンパク質のフォールディングを補助する働きをしている。本酵素は a-b-b’-a’ という４つのチ オレドキシン様ドメインを有しており，そのうち a および a’ ...
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平成30年度 後期 高エネルギー加速器研究機構 物質構造科学研究所 放射光共同利用実験課題公募
... 主に大学等の研究者を対象としますが、科学研究費助成事業の申請資格を有す る企業等の基礎研究も対象となります。 【応募期限】 平成30年5月 9日（水） （一般課題、特別課題） 平成30年5月18日（金） （大学院生奨励課題） ...
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生物圏科学研究科研究紀要53.indb
... と類似した生態的特性を有するクロメは安定度の高い岩盤部に，またホンダワラ類はより安定度の低い礫部 に出現しているとみることができる。また， St. 4の砂泥質海底から露出した暗礁では，暗礁上の高さ（比高） に応じて漂砂の影響が異なると考えられる（寺脇ら，1996；Terawaki et ...
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理学部・大学院理学研究院 ・大学院先端生命科学研究院
... HP アドレス ： http://astro3.sci.hokudai.ac.jp/~habe 何を目指しているのですか？ 宇宙の中で銀河の形成と進化の物理的な過程を研究しています。ビックバンで膨張を開 始した初期宇宙はほぼ一様な状態であり、銀河や星は形成されていません。そのような宇 宙から、銀河がいつごろどのように形成され進化してきたのかを明らかにする事を目指し ...
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平成 19 年度実績報告 糖鎖の生物機能の解明と利用技術 平成 15 年度採択研究代表者 野村一也 九州大学理学研究院生物科学部門 准教授 遺伝子破壊による糖鎖機能の戦略的解明 1. 研究実施の概要 生命の第 3 の鎖とよばれる糖鎖の 多細胞生物での機能を明らかにするためには モデル生物線虫 Cae
... アンカー構造合成 に関わる全ての酵素や糖鎖関連のトランスポーターについて RNAi を行い、約半数以上の遺伝子 について激しい表現型を確認した。同時平行で進めている遺伝子欠失突然変異株の取得では RNAi では異常がみられない糖鎖遺伝子でも激しい異常が確認される例も多かった。これらの実験 結果は糖鎖が生命にとって不可欠の働きを果たしているというゆるぎのない証拠である。また遺伝 ...
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放射光第 12 巻第 3 号 (1999 年 ) 生命科学 蛋白特集 シンクロトロン放射光を使った 原子分解能の蛋自質結晶構造解析 野中孝昌 長岡技術科学大学生物系 * および理化学研究所播磨研究所 Str 阻 cture Analysis 臨 si 盟 g Resol 副 io 目 BioEngi
... ti の方法10) で見積もった誤差が 0.20-0.25 A 程度であるの と比較して極めて正確であるということができる。 (2) 差フーリエ図上に溶媒分子や乱れた構造のみなら ず，水素原子をも容易に見出すことができるようになる。 Rubredoxin では 2/3 以上11) ， Sakabe らのインスリンでは 突に 90% もの水素原子の同定が可能となっている [r] ...
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生命・錯体分子科学研究領域
... の距離では脂質の拡散が速く，ピット間をまたいで移動する µ m オーダーの距離では拡散係数が減少することを明ら かにした。細胞膜内で起きている異常拡散現象を， 基板表面ナノ構造を利用して人為的に誘起しうることが示された。 b). 神経細胞ネットワーク素子の応用として，物理化学の観点から細胞核内反応を調べることに的をしぼって素子開発を ...
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加藤晃一 ( 教授 )(2008 年 4 月 1 日着任 ) A-1) 専門領域 : 構造生物学, タンパク質科学, 糖鎖生物学,NMR 分光学 A-2) 研究課題 : a) NMR 分光法をはじめとする物理化学的手法による複合糖質およびタンパク質の構造 ダイナミクス 相互作用の解析 b) 生化学
... 国立長寿医療研究センター認知症先進医療開発センター , 客員研究員, 2011年 4月– . 総合研究大学院大学統合生命科学教育プログラム, 「基礎生体分子科学」, 2013年. B-9) 学位授与 Mahesh Shantilalji Chandak , 「Structural Fluctuations of the Escherichia coli ...
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植物科学最前線 6:41 (2015) ヒメツリガネゴケの幹細胞誘導機構 石川雅樹基礎生物学研究所生物進化研究部門総合大学院大学生命科学研究科基礎生物学専攻 愛知県岡崎市明大寺町字西郷中 38 Molecular mechanisms of stem cell formation
... この仮説を検証するためには、CDKA の標的因子を同定するとともに、CDKA のキナーゼ活性 によってヒストン修飾状態がどのように変化するのか調べることが必要であろう。 ５. 今後の展望 陸上植物間でのゲノム比較から、細胞周期制御因子だけでなく基本的な遺伝子セットは陸上植 物間で保存されている (Banks et al., 2011)。また、シロイヌナズナの CDKA が細胞周期制御だけ ...
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