理化学研究所フロンティア研究システム
- 目次 - はじめに 1 Ⅰ 次世代生命体統合シミュレーションソフトウェアの研究開発の概要 2 Ⅱ 中間評価の概要 4 Ⅲ 中間評価の結果 1. 事業運営主体 理化学研究所 茅幸二 7 2. 各チームおよび個別研究課題の評価 A 分子スケール研究開発チーム 理化学研究所 木寺詔紀 10 A1 長時
... 個別研究課題名 ： [E4] 無脊椎動物嗅覚系シミュレーション 代表機関名・代表研究者名 ： 東京大学・神崎 亮平 １． 計算機科学からの評価 評点３．７ 脳神経系は多階層を成す超複雑システムであり、複雑なシステムの中で本研究は無脊椎動物（カイコガ）にお ける匂い刺激大から匂い源探索行動までの嗅覚情報処理をシミュレーションするものである。脳神経系の情報処 ...
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PRESS RELEASE 毒のないジャガイモ 参考資料配布 2016 年 7 月 26 日理化学研究所大阪大学神戸大学 - さらに萌芽を制御できる可能性の発見 - 要旨理化学研究所 ( 理研 ) 環境資源科学研究センター統合メタボロミクス研究グループの梅基直行上級研究員 斉藤和季グループディレクタ
... 今回、共同研究グループは SGA が多く蓄積される芽や花で多く発現する遺伝子を 解析しました。その結果、シトクロム P450 酸化酵素のファミリーをコードする遺伝 子「PGA1」と「PGA2」を発見しました。次に、RNA 干渉法 [6] で PGA1 と PGA2 の発 現をそれぞれ抑制した遺伝子組換え植物体を作り出し、ジャガイモを収穫しました。 その SGA ...
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PRESS RELEASE 2019 年 4 月 3 日理化学研究所金沢大学国立天文台 ガンマ線バーストのスペクトルと明るさの相関関係の起源 - 宇宙最大の爆発現象の理論的解明へ前進 - 理化学研究所 ( 理研 ) 開拓研究本部長瀧天体ビッグバン研究室の伊藤裕貴研究員 長瀧重博主任研究員 数理創造プ
... 3 や、近似的なアプローチを採用しているため、現実的なジェットのダイナミク スを反映した光球面放射の詳細は解明できていないのが現状です。 ２．研究手法と成果 国際共同研究グループは、大質量星（太陽質量の 16 倍）の中心領域から噴出 された相対論的ジェットの光球面放射を、大規模な 3 次元相対論的流体シミュ レーション（図１）および輻射輸送シミュレーションを実行することによって 評価しました。 ...
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糖尿病の薬で皮膚の難病を発症するリスク因子を発見 プレスリリース（研究成果）2017 | 理化学研究所
... 【研究成果】 DPP-4 阻害薬の服用による水疱性類天疱瘡 30 例では，紅斑が少ない「非炎症型」が 21 例（70%）と 大半を占めていました。「非炎症型」水疱性類天疱瘡の発症時に服用していた DPP-4 阻害薬の内訳は， ビルダグリプチン 7 件，アログリプチン 4 件，テネリグリプチン 4 件，リナグリプチン 4 件，アナグリ プチン 1 件，シタグリプチン 1 件でした。 ...
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理化学研究所統合生命医科学研究センターにおいては 免疫システムの基礎的 総合的な研究を実施し 花粉症等のアレルギー疾患の原因究明と治療法の開発を目指している 平成 4 年度からアレルギー疾患について臨床研究事業を推進している ( 厚生労働科学研究費補助金 ( 難治性疾患等克服研究事業 ( 免疫アレル
... Ⅳ ○花粉症がある人へ ①花粉症状を強くしないよう、花粉をからだや家の中に入れないようにしましょ う。 ②医療機関への受診状況を把握し、適切な受診を勧めたり、その後のフォローアッ プを行いましょう。 ③花粉情報に注意し、飛散の多い日の外出や洗濯物を外に干したりすることはさ けるように指導しましょう。 ④花粉のばく露からの予防用具（メガネ・マスク・帽子）などを効果的に使え[r] ...
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表出系としての行動異常の統合的研究 ( 研究代表 : 内匠透 ) の支援を受けて行われました 注 1)Chandana et.al. J. Dev. Neurosci (2005) 共同研究グループ理化学研究所脳科学総合研究センター精神生物学研究チームシニアチームリーダー 内匠透 ( たくみとおる
... おいて神経伝達物質のセロトニンが減少していることが示されていました 注 1） 。 しかし、ゲノム異常やセロトニン異常がどのように自閉症につながるのかは分 かっていませんでした。 今回、共同研究グループはヒトの 15 番染色体重複と同じゲノム異常を持つモ デルマウス（15 番染色体重複モデルマウス）を解析したところ、脳内セロトニ ンの減少に関連して、セロトニンの供給元である中脳の縫線核の働きが低下し ...
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トランスクリフ トーム トモク ラフィーを用いた 遺伝子発現に基づく全脳地図作成 理化学研究所光量子工学研究領域客員研究員於保祐子
... • 凍結切片から抽出して定量測定できる物質であ れば、なんでも３次元分布（解剖学的位置と量）を 示す事ができる応用範囲の広いシステムである。 • 研究者が各自の実験系で、網羅的発現地図を作 ...
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第 10 回シーケンス講習会 RNA-seq library 調製法の特徴と選び方 理化学研究所 (RIKEN) ライフサイエンス技術基盤研究センター (CLST) 機能性ゲノム解析部門 (DGT) ゲノムネットワーク解析支援施設 (GeNAS) 野間将平
... RNA シーケンスをする目的 l RNAを研究することで分かること – RNA-seq は細胞・組織の”今”の状態を知る l ライブラリー作製・シーケンスは解明のための通過点（一手段） ...
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抗体 抗がん剤複合体におけるリンカーテクノロジー 抗体デリバリー - 基礎から臨床まで - 独立行政法人 * 理化学研究所細胞制御化学研究室 * 眞鍋史乃 Linker Technology in Antibody-Drug Conjugates for Cancer Treatment Linke
... 1 . はじめに ドラッグ・デリバリー・システムにおいて、近 年、抗体－抗がん剤複合体が注目を集めている。抗 体－抗がん剤複合体は、悪性腫瘍や炎症部位などに おいて、目的の組織や細胞表面タンパク質に対する モノクローナル抗体に抗がん剤を結合させることに より、薬剤を病変部位に選択的に到達させ、放出さ せることができる。複合体は、抗体の持つ高い特異 的結合性に加え、EPR 効果 1） により、がん組織に集 ...
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共同研究チーム 理化学研究所光量子工学研究センター画像情報処理研究チーム チームリーダー 横田秀夫 ( よこたひでお ) ( 兼務副ク ルーフ テ ィレクタ- 科技ハブ産連本部医科学イノベーションハブ推進プログラム 健康医療データ多層統合プラットフォーム推進グループ ) 研究員 竹本智子 ( たけも
... 陰性的中率 [5] （ 「正常」と判断した画像中、実際に「正常」であった割合）は 83.6％ と極めて高く、胃炎や胃潰瘍と特徴が似ているために判断が難しい例について も、高い確率で判断できることが分かりました。 さらに、内視鏡画像から早期胃がんの領域を自動検出する問題を、再学習を 終えた CNN に与えました。早期胃がんには肉眼型分類として主に、明らかな腫 瘤状の隆起が認められる「隆起型（ Type0-Ⅰ） 」 ...
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戦略的創造研究推進事業 CREST 研究領域 生物の発生 分化 再生 研究課題 Geneticdissection による神経回路網形成機構の解析 研究終了報告書 研究期間平成 12 年 11 月 ~ 平成 17 年 10 月 研究代表者 : 岡本仁 ( 独立行政法人理化学研究所脳科学総合 研究セン
... このような振る舞いが比較的単純なことから、後脳運動神経細胞は、神経細胞の分化、移動、標的 認識の機構を調べる上で、最も単純なモデルシステムとなる。 後脳の構造は脊椎動物の進化を通じて高度に保存されている。我々は、このことを利用し、脊椎動 物の中でも最も単純な神経系を持ち、胚が透明で、胚操作や遺伝学的解析を容易に行えるゼブラ フィッシュを用いて、それぞれの後脳運動神経細胞が、分化し移動し軸索伸展する過程の各ステッ ...
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国際共同研究グループ 理化学研究所統合生命医科学研究センター ゲノムシーケンス解析研究チーム チームリーダー 中川英刀 ( なかがわひでわき ) 研究員 藤田征志 ( ふじたまさし ) 研究員 ( 研究当時 ) クリストファー ウォーデル (Christopher Wardell) 北海道大学大学院
... 今回、国際共同研究グループは、日本とイタリアの胆道がん、412 例の大規模 なゲノム解析を行い、分子生物学的特性を調べました。その結果、 TP53、KRAS、 SMAD4、NF1、ARID1A、PBRM1、ATR などの 32 個の遺伝子と今回新たに同定し た MUC17 遺伝子が、胆道がん発症にとって重要な変異遺伝子であり、それらは 患者の予後や再発リスクと強く関連していることが分かりました。特に 7 番染 ...
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PRESS RELEASE 報道解禁日 : 日本時間 2016 年 10 月 24 日午後 8 時 25 日朝刊 2016 年 10 月 21 日理化学研究所千葉大学高知大学大阪大学生薬 甘草 のゲノム解読に成功 - 重要生薬の原料の安定供給と有用遺伝子の探索に貢献 - 要旨理化学研究所 ( 理研
... 要旨 理化学研究所（理研）環境資源科学研究センター統合メタボロミクス研究グ ループの斉藤和季グループディレクター（千葉大学大学院薬学研究院教授） 、セ ルロース生産研究チームの持田恵一チームリーダー、統合ゲノム情報研究ユニ ットの櫻井哲也ユニットリーダー（高知大学総合科学系複合領域科学部門准教 授） ...
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国際共同研究グループ理化学研究所放射光科学研究センター利用技術開拓研究部門 SACLA 利用技術開拓グループグループディレクター岩田想 ( いわたそう ) ( 京都大学大学院医学研究科教授 ) XFEL 研究開発部門ビームライン研究開発グループイメージング開発チーム研究員南後恵理子 ( なんごえりこ
... 体） 。また、光受容から 200 フェムト秒以内に、レチナール上のシッフ塩基に水素結合している水分子や周 辺のアスパラギン酸残基（Asp212）がレチナールの変化に応じて動いた（緑の矢印） 。 ３．今後の期待 本研究成果は、ヒトの視覚に関与するロドプシンや光遺伝学に用いられるチ ャネルロドプシンなど、他のレチナールタンパク質における光化学反応初期段 階を理解する上で重要な知見となります。また、本成果で用いられた手法は、光 ...
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報道発表資料 2004 年 9 月 6 日 独立行政法人理化学研究所 記憶形成における神経回路の形態変化の観察に成功 - クラゲの蛍光蛋白で神経細胞のつなぎ目を色づけ - 独立行政法人理化学研究所 ( 野依良治理事長 ) マサチューセッツ工科大学 (Charles M. Vest 総長 ) は記憶形
... 利根川進センター長）興奮性シナプス可塑性研究チームの林康紀ユニットリーダー、 岡本賢一研究員と脳科学総合研究センター細胞機能探索技術開発チームの宮脇敦史 チームリーダー、永井健治研究員との共同研究による成果です。 かねてから記憶・学習に伴い神経回路が再構成される事が想定されていましたが、 ...
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GROMACS-Viewer 利用者マニュアル 平成 26 年 3 月 独立行政法人理化学研究所 HPCI 計算生命科学推進プログラム
... 15.. 表示モデルの変更 原子単位で表示モデルや色を変更できます。まず対象とする原子を選択し、選択された原 子に対して表示モデルや色を変更します。これらは jV が提供しているコマンドラインイン ターフェースによって行います。 [File]-[Option]-[Command Line]メニューを選択するとコ マンドラインウィンドウが表示され、コマンドを使用できるよ[r] ...
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GPU チュートリアル :OpenACC 篇 Himeno benchmark を例題として 高エネルギー加速器研究機構 (KEK) 松古栄夫 (Hideo Matsufuru) 1 December 2018 HPC-Phys 理化学研究所 共通コードプロジェクト
... Introduction to GPU computing GPU システムの一般的構成 – ノード ホスト (CPU) デバイス (GPU) グローバルメモリ 共有メモリ (local store) デバイスコア O(10k)/device Streaming Multiprocessor (NVIDIA) 共有メモリを共有 PCIe or NVLink (ここが[r] ...
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理化学研究所計算科学研究機構研究部門量子系分子科学研究チーム殿 hp170163: 有機半導体 有機分子発光材料の全自動探索シミュレーションシステムの開発 高度化支援作業 2017 年 9 6 ( R405 般財団法 度情報科学技術研究機構利 援部 1
... PWscf フロー図（旧バージョン v5.4.0） Start read_input Stop qmmm run_pwscf stop_run init_run electrons forces stress punch mp_global iosys setup check_stop 計算のセットアップを行う。 電子状態を self-[r] ...
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出版物・パンフレット | 理化学研究所 計算科学研究センター(RCCS)
... ● システムソフトウェア コンピュータにどういう動作をさせるか、その動作をどういう順番で行わ せるかの指示書（命令の列、プログラム） を作ること。指示書（プログラ ム）は計算機が理解できる言葉（プログラミング言語）で作られる。 AICSの研究者は、FORTRAN、C、Python等のプログラミング言語を ...
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植物のエピジェネティクス変化をリアルタイムに捉えることに成功 プレスリリース（研究成果）2017 | 理化学研究所
... 本研究の社会的貢献 今回の研究を通じて、植物細胞におけるヒストン修飾イメージング技術を確 立しました。植物の環境応答や環境記憶メカニズムを担うエピジェネティクス 制御を、ヒストン修飾動態からリアルタイムで解析できるようになります。こ の技術を用いることで、植物細胞は外部環境の温度変化・湿度変化や物理的障 害を、どのくらいの時間で応答し、どのくらいの期間、記憶しているか明らか になると期待されます。 ...
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