機能性の解析
第 10 回シーケンス講習会 RNA-seq library 調製法の特徴と選び方 理化学研究所 (RIKEN) ライフサイエンス技術基盤研究センター (CLST) 機能性ゲノム解析部門 (DGT) ゲノムネットワーク解析支援施設 (GeNAS) 野間将平
... l ムダ – RNAの持つ情報は極力失いたくない • とはいえ、Total RNA をそのままシーケンスするとほとんど(9割) がrRNA • 現行のシーケンサー能力やコストを考慮するとrRNA を効率的に除去する必要がある ...
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糸状菌メロテルペノイドの複雑骨格構築に関わるα-ケトグルタル酸依存性ジオキシゲナーゼの構造機能解析
... 査 の 結 果 の 要 旨 氏名 中嶋 優 本学位論文において中嶋優は「糸状菌メロテルペノイドの複雑骨格構築に関わる α-ケトグルタ ル酸依存性ジオキシゲナーゼの構造機能解析」という題目で、糸状菌二次代謝経路に存在する複 数の α-ケトグルタル酸（αKG）依存性ジオキシゲナーゼに対する、X ...
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イネ新規感光性遺伝子Se14の機能解析と育種への応用について
... Ghd7、Ehd2 、 OsMADS50 及び UBQ のプライマーセットとユニバーサルプローブは ProbeFinder version 2.45 を元に設計したものを使用した（表 3-1）。 HS112におけるH3K4のメチル化状態の解析 HS112および銀坊主の種子を上記と同様の方法で催芽した後、プラスチック製セルトレイに ...
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多中心性手根骨足根骨融解症（MCTO）の治療を目的とした、破骨細胞における転写因子MafBの機能解析
... E 学位規則 第４条第１項該当（昭和２８年４月１日文部省令第９号） 審 査 組 織 グローバル教育院 学 位 論 文 題 目 MafB boosts o ste oclasto genesis: A break-th rou gh to the current treatment for Mu lticentric Ca rpal Tarsa l Osteo lysis (多 中 心 性 手 根 骨 足 根 骨 融 解 ...
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バイオフィルム超高産生性黄色ブドウ球菌臨床分離株から見出されたica locusの新規リプレッサーの機能解析
... 申請者は粉瘤から分離された強いバイオフィルム産生性を示す TF2758 株を用い て、本菌の高バイオフィルム産生性のメカニズムを明らかにすることを目的として 実験を行った。最初に黄色ブドウ球菌の標準株の全 ORF を貼り付けたマイクロア レイを用いて、 TF2758 近縁株を対照とした遺伝子発現解析を行った結果、黄色ブ ...
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バイオフィルム超高産生性黄色ブドウ球菌臨床分離株から見出されたica locusの新規リプレッサーの機能解析
... 〔論文審査の結果の要旨〕 黄色ブドウ球菌はヒトの常在菌でありながら時として病原性を発揮する化膿性炎 を起こす代表的な病原菌である。ブドウ球菌属の中では表皮ブドウ球菌がバイオ フィルムを形成する菌として位置づけられているが、臨床分離黄色ブドウ球菌の中 ...
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癌の進展におけるTGF-βシグナルの機能解析
... NANOG、OCT4A、SOX2 の発現が上昇しており、より未分化な状態にあること が分かった (図 30)。Panc-1-shSMAD4 細胞ではこれら未分化性マーカーの発現が上昇 していることから、膵癌細胞では、ALDH1 だけでなく、NANOG、OCT4A、SOX2 も TGF- シ グ ナ ル に よ り 負 に 発 現 制 御 を 受 け る 可 能 性 が 示 唆 ...
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リボソームアッセンブリーにおけるrRNAメチル化修飾の機能解析
... 修飾はその化学的性質によって、RNA の局所的な構造形成に寄与していると考えられる。例えば、水 素原子の代わりにメチル基が入ることで、水素結合を弱めたり、疎水性相互作用を強めたりする効果がある。ま た、嵩高い置換基が入ることで、立体構造上の間隙を埋める効果も期待される。リボース 2’位のヒドロキシル基 はしばしばメチル化される（2’O ...
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植物低温シグナル伝達におけるMCAsおよびPIF4の機能解析
... 存在し、カルシウムチャネルとしてはたらくことが明らかにされている。著者は、低温ストレス誘導 性一過的カルシウム濃度上昇が野生型に比べて、mca変異体では約半分しか上昇していないことを明ら かにし、カルシウム濃度上昇にMCAが必要であることを見出した。また、カルシウムチャネル阻害剤 により、完全にカルシウム濃度上昇が抑えられたことから、MCA以外のカルシウムチャネルの存在が ...
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小脳プルキンエ細胞におけるmTORシグナルの機能解析
... 5. L7-mTOR Tg マウスにおけるプルキンエ細胞数の減少の原因を調べるため、アポ トーシスマーカーである Cleaved caspase 3、酸化ストレスマーカーである Heme oxygenase 1、低酸素マーカーである Hypoxia inducible factor 1 alpha (HIF1α) によ ...
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1 Last modified : 2014/08/14 FrontISTR を Ubuntu LTS へインストール はじめに FrontISTR は 非線形構造解析機能が充実した オープンソースの構造解析ソフトウェアです 規模並列 FEM 基盤ミドルウェア上に構築され 先進性と実 性
... 「京」や「地球シミュレータ」など、⼤規模並列環境でのスケーラビリティを備えているのにもかかわらず、並列環境をあまり意 識しないシンプルで使いやすい解析⼿順が提供されているため、⾃社のPCクラスタやノートパソコンでの実⾏も可能です。 ...
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ヒトの上肢運動に関連した脊髄固有ニューロンの機能解析
... 今回の研究のもう一つの目的は，開発した手順を用いて， 間接経路を介した入力への利き腕の影響を検証することで あった。その結果，左利き被験者は数も少なく特異的な傾 向は見られないものの，右利き被験者では利き腕側で促通 効果が強かった。右利き被験者の利き腕側で効果が強い理 由として，3 つの要因が考えられる（Fig. 7）。すなわち皮 ...
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脂肪滴周囲蛋白Perilipin 1の機能解析
... PLIN1 の過剰発現は、動脈硬化の進展を一般的な動脈硬化の リスク因子とは独立して抑制した。マクロファージ内脂肪滴周囲の PLIN1 発現 の増加が、脂肪滴の安定貯留に寄与し、マクロファージの炎症表現型に影響を与 えた可能性が推測される。動脈硬化性疾患は単一の原因ではなく多様な原因に ...
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目次 1 SAP2000 概要 SAP2000 基本解析機能 SAP2000 の解析モデル要素機能 材料特性 ジョイント フレーム要素 シェル要素 平面 / 軸対称 / ソリッド要素
... 単軸材料は、鉄筋の材料特性（線形、非線形）を表すために適用します。 温度依存の材料特性を考慮できます（温度に依存したヤング率を設定可能）。 材料減衰特性(部材ごとに異なる減衰特性を設定できます)。 非線形材料特性は、フレーム要素の Fiber 塑性ヒンジや Layered Shell 非線形特性をモデル 化するために利用できます。 Confined/Unconfined ...
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粘膜免疫におけるFcα/μ受容体の機能解析
... れている。Fc R はミエロイド系の細胞上に発現が認められ、IgA によりオプソニン化 された抗原と Fc R との会合は貪食や炎症性サイトカイン産生に働く(Maliszewski et al., 1990; Monteiro and Van De Winkel, 2003)。しかしながら、マウスにおいて Fc R と相同な 遺伝子は存在していない。そのため in vivo における ...
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粘膜免疫におけるFcα/μ受容体の機能解析
... TLR4 の生理的なリガンドは、それぞれウィルス由 来の dsRNA および細菌由来の LPS であり、それらは TI 抗原に分類することができる。Fcα/μR 欠損マウスは TI 抗原に対する抗体産生応答をはじめとした液性免疫応答の亢進が認められる。一 方で、腸内細菌への応答の結果、産生される自然抗体 IgA は T ...
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遺伝子発現の転写後調節におけるPbp1の機能解析
... Target of rapamycin complex 1 (TORC1)を SG に取り込むことで熱ストレスよって 生じる遺伝子突然変異を防いでいる（ Takahara et al., 2012）。また先行研究で、 ccr4Δ変異株は DNA 合成阻害剤に感受性を示すが、pbp1Δ変異がこの感受性を抑 圧すること（Woolstencroft et al., 2006）、さらに近年、Pbp1 は RNA ...
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脳の発生、発達、病態におけるスフィンゴ糖脂質の機能解析研究
... ことは、MCP-1の発現亢進によるものかもしれない。今回の検討では、肯定的な所見 の得られなかった体循環から中枢神経系へのマクロファージの遊走の可能性を含め、 マクロファージの脳内への遊走の分子メカニズムについて今後のさらなる検討が必 要である。 ...
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脂肪滴周囲蛋白Perilipin 1の機能解析 [全文の要約]
... 【対象と方法】 第一部) Plin1Tg を動脈硬化モデルマウスである apolipoprotein E knockout mice (ApoeKO) と 交配し、Plin1Tg/ApoeKO を作製した。C57BL/6J 野生型マウス、ApoeKO、ApoeKO/Plin1Tg を普通 食下に 20 週齢まで飼育した後、安楽死させて大動脈を採取しオイルレッド O 染色にて動脈硬化領 域を評価した。20 ...
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骨格筋発生分化における転写因子Lhx2の機能解析
... 別紙２ 論文審査の結果の要旨 論文提出者氏名 小髙悠作 LIM ホメオドメイン型転写因子 Lhx2 は、脳神経系の発生や毛包幹細胞の維持に必須の 働きをする核内タンパク質である。 Lhx2 には、マウス ES/iPS 細胞から造血幹細胞を分化 誘導し体外増幅させる活性があり、再生医療ツールとしても有望である。 Lhx2 は様々な種 ...
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