固有ベクトルの並列計算
並列プログラミング入門（OpenMP編）
... OMP_SCHEDULE スケジュールタイプがruntimeであるループ指示文のスケジュー リングを制御します。（デフォルトはstatic） OMP_STACKSIZE 各スレッドが実行時に利用するスタックサイズを指定します。ス レッドごとの固有データなどのメモリ領域に利用されます。 ...
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び 850hPa 東西風を基に 予め結合経験的直 交関数 (EOF) の第 1 モード (EOF1) と第 2 モー ド (EOF2) の固有ベクトルを求め これに解析 値や予測値を投影することで算出されている 当検証でも WH04 の固有ベクトルを使用して MJO 指数を求めた 1 MJO 指数の
... 気象庁 55 年長期再解析（JRA-55; 古林ほか, 2015; Kobayashi et al., 2015）及び NOAA の 極軌道衛星搭載の可視赤外放射計 AVHRR （ Advanced Very High Resolution Radiometer） による観測を基に作成された外向き長波放射 量（OLR）解析値（Liebmann and Smith, 1996） ...
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SENAC Vol. 48, No. 2( ) 29 [ 大規模科学計算システム ] 並列コンピュータ LX 406Re-2 の利用法 情報部情報基盤課共同利用支援係共同研究支援係サイバーサイエンスセンタースーパーコンピューティング研究部 1 章はじめに 本センターは並列コンピュータ L
... NumericFactory でサポートしているライブラリを使用する場合、ライブラリによってはユーザプログラム側でモ ジュールファイルやヘッダファイルをインクルードする必要があります（表 14）。 Fortran から ASL または ASLSTAT の 64 ビット整数に対応したライブラリを利用する場合、コンパイル時に必 ずオプション ...
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東海地区ベクトル並列計算機保守請負契約
... ５．実施期日等 機構の施設管理、情報管理等を鑑み、本仕様書に定める業務は下記の期間及び時間で実 施することとする。 ただし、監督員及び総括責任者の双方にて協議により、下記 (1)ただし書きに定める日 又は (2)に定める時間以外の時間（以下、「定常外」という。）において、本仕様の範囲内 ...
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高生産 高性能プログラミング のための並列言語 XcalableMP 佐藤三久 筑波大学計算科学研究センター
... 2007年１２月にkick-off, 現在、e-scienceプロジェクトの並列プログラミング検討 委員会に移行 メーカからのコメント・要望（活動開始時） 科学技術アプリケーション向けだけでなく、組み込みのマルチコアでも使えるようなも ...
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スパコンに通じる並列プログラミングの基礎
... 阪大のスーパーコンピュータ (SX-ACE) はベクトル型計算機を束ねたものな ので，1 ノード (1 cpu, 4 core) でおさまる計算ならばテクニック的には難し いことはない．ベクトル化率を高める為の工夫はまた別に必要だが． 実は普通の PC でも 4 コア持っていたりするので，4 倍ぐらいまでの並列化 は容易にできたりする． ...
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東北大学金属材料研究所 並列計算 インフォマティクスサーバ マニュアル 2019 年 10 月 3 日 東北大学金属材料研究所計算材料学センター
... ４-２２ ４ .２ プライベートインフォマティクスサーバ（仮想サーバ） プライベートインフォマティクスサーバ（仮想サーバ）では以下のアプリケーションが利用可能です。 GUI アプリケーションを Windows から使用する場合は、SSH クライアントソフトウェアと X サーバソフ ...
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講師取締役千田範夫シニアコンサルタント竹内宗孝 の事業内容 Winmostar の開発 販売 科学技術計算コードの並列化 高速化 およびカスタム開発 計算化学コンサル etc 2
... I. PDBからタンパクの分子構造をダウンロードする II. Winmostarを使って、計算可能な構造へ修正する ～結晶水（酸素原子）を取り除く～ III. Gromacsを起動し、エネルギー極小化を実行する IV. 得られた構造を用いて二段階の熱平衡計算（温度一定、温度・圧力一定）を実行する V. 本計算（1 ナノ秒）を実行する。 ...
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Stage 並列プログラミングを習得するためには : 1 計算機リテラシ, プログラミング言語 2 基本的な数値解析 3 実アプリケーション ( 例えば有限要素法, 分子動力学 ) のプログラミング 4 その並列化 という 4 つの段階 (stage) が必要である 本人材育成プログラムでは1~4を
... 本人材育成プログラムでは，①，②のレベルは各学部・研究科の既存の講義に任せるものと するが，③，④に役立つような内容を含めたガイドラインを作成する。③，④については，手 法（有限要素法，差分法，有限体積法，境界要素法，分子動力学など）ごとに基礎的なプログ ラミングとその並列化を教える講義・演習を新たに開講する。有限要素法は情報理工学系，有 ...
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並列計算の数理とアルゴリズム サンプルページ この本の定価 判型などは, 以下の URL からご覧いただけます. このサンプルページの内容は, 初版 1 刷発行時のものです.
... 本書の主たる目的は，非常に多くのプロセッサやメモリを搭載した計算機（コンピュー タ）上で行う並列計算に，数値計算手法をどのように適用するかを詳しく解説するこ とである．本書を適切に理解するためには，情報工学の基礎知識と数値解析の知識が ...
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東北大学金属材料研究所 大規模並列計算サーバマニュアル 2019 年 4 月 1 日 東北大学金属材料研究所 計算材料学センター
... ４-１３ ４.１.３ 実行スクリプトの書式 スーパーコンピュータ上でプログラムを動作させる際に使用する実行スクリプトの書式について説明し ます。実行スクリプトを必要とするアプリケーションを実行する際は、事前に実行スクリプトを作成して おく必要があります。/home 領域よりも/work 領域のほうが I/O 性能が良いため、以下の例を参考に /work ...
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000/6/3 目次 地球シミュレータの紹介 大気大循環モデル 基礎方程式 スペクトル法 コアとなる計算部分 並列化手法 実行性能 問題点と今後の予定 ワークショップ 計算科学におけるアルゴリズム
... 「地球シミュレータ」計画 ■ 地球変動現象の解明・予測の研究開発を推進 ■ 大規模，高精度シミュレーションにより「仮想地球」を実現 数値シミュレーション 数値シミュレーション 数値シミュレーション 数値シミュレーション ...
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CCS HPCサマーセミナー 並列数値計算アルゴリズム
... – FFTW 3.3.3（ http://www.fftw.org/ ，CPUを使用） • 順方向FFTを1～256MPIプロセス（1ノードあたり4MPIプロセス）で連続 10回実行し，その平均の経過時間を測定した． • HA-PACSベースクラスタ（268ノード，4288コア，1072GPU）の うち，1～64ノードを使用した． ...
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内容に関するご質問は まで お願いします [Oakforest-PACS(OFP) 編 ] 第 85 回お試しアカウント付き並列プログラミング講習会 ライブラリ利用 : 科学技術計算の効率化入門 スパコンへのログイン テストプログラム起動 東京大学情報基盤セ
... ＵＮＩＸ備忘録 rm ファイル名： ファイル名のファイルを消す。 rm *~ : test.c~ などの、~がついたバックアップファイルを消す。 使う時は 慎重に。*~ の間に空白が入ってしまうと、全てが消えます。 ...
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計算システム計画 運用部 ( 横浜研究所 ) 海洋地球情報部データ統合 解析グループ ( 横浜研究所 ) すべてのクール可 最大 2 名 地球シミュレータあるいはJAMSTEC スパコンを用いたシミュレーション実験の体験を通して 大規模並列数値計算に関するプログラムの性能評価や最適化の基礎を学ぶこと
... 船を用いた深海から熱帯、極域まで の海洋調査はもとより、極寒のシベ リアからチベット、東南アジア、太平 洋の島々などの陸域でも調査活 動、さらには、陸上又は船上で放射 線同位元素を用いた実験や組換え DNA実験なども行っています。 安全・環境管理室は、このようなさ まざまな調査研究活動における事 故防止と、事故が生じた場合の緊 急時対応を担当し、同時に機構に ...
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並列計算
... – 最近のTCPコネクションごとにthreadを貼り付けるのも近い考え • Transputer – Occamと同時に考えられたハードウェア – CPUをトランジスタのごとく並べて使用。4～8本のシリアル通信ハードウェア を持つ。その CPUを2次元のメッシュ状に配置。 ...
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SGI AltixUV1000 並列化プログラミング講習会
... 浮動小数点演算の多いループや大きなデータセットを処理するコードで性能向上が見込めます。 -axSSE4.2および-xSSE4.2オプションとの組み合わせでより詳細なデータ依存性解析をします。 -fast -xHOST –O3 –ipo –no-prec-div –staticを有効にするマクロオプションです。 ...
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最新の並列計算事情とCAE
... TOP500 スーパーコンピュータのランキング、半年ごとに更新 ６月のISCと１１月のSCにあわせて発表される 旧地球シミュレータが連続５期も君臨したためにアメリカが本気になったことは有名 指標はLINPACKベンチマークの性能 ...
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並列計算プログラミング超入門
... MPI_Wait の間に、プロセス間境界メッシュ以外でのメッシュでの処理がおかれている ことが分かります。つまり MPI_Irecv で指定されたデータ通信と、その通信にかかわるデ ータを参照しない計算を「同時に」行なうことで MPI_Recv を使用した場合に比べて計算 ...
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マルチコアPCクラスタ環境におけるBDD法のハイブリッド並列実装
... GPUや今後のCPUとの付き合い方 • Heterogeneous computing, Memory hierarchy を意識して数値計算アルゴリズムを見直す → CPUとGPUの役割分担, メモリ利用方法, 線形代数ライブラリ への依存度を自由に調整できるように解法レベルで考える ...
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