分子動力学法による研究の手順
分子動力学法によるアモルファスポリエチレン/グラファイト界面の剥離シミュレーション
... 2π の正弦波凹凸では，わずかではあるが前者のほうが引力が大きい． 10π の表面凹凸では最大引力が著しく低下している．6π の周期でも最大引力は 2π より低下するが 10π よりは大きく，10π, 6π, 2π の順番で最大引力が大きくなってい る．つまりこれらから表面凹凸が小さいほうが界面強度が低下するという法則性が ...
44
計算科学技術特論 A 古典分子動力学計算法の高速化 2019 年 7 月 4 日名古屋大学大学院工学研究科附属計算科学連携教育研究センター吉井範行
... • M. P. Allen, D. J. Tildesley，“ Computer Simulation of Liquids," Oxford Science, Oxford（１９８７）． • J. P. Hansen, I. R. McDonald, “Theory of Simple Liquids," Academic Press, London（１９８６）． • 岡崎 進, 吉井 範行, ...
63
カーボンナノコイルの機械的特性に関する分子動力学シミュレーション
... 1. コイルの外側が安定な六員環となるように配置し，内側で重なった部分の原子 を削除して最急降下法で構造緩和して引張前の CNC を作成した結果，円形断 面の CNC は断面形状が保たれたが菱形は十字に近い断面となった． 2. 円形 CNC では，armchair 型はコイル内側に配位数 4 の高密度な部分が形成さ れた．zigzag では配位数 3 と ...
58
Microsoft Word - web修正 _校了_26_分子動力学.docx
... Analyzing Mechanism of Increasing Interfacial Strength in Glass Fiber Reinforced Polypropylene Using Molecular Dynamics 要 約 自動車の軽量化のため，繊維強化樹脂複合材が注目されている。繊維強化樹脂複合材料の特性には繊維， ...
6
Ni基超合金微細析出構造における転位の分子動力学解析
... Al の 2 原子系への適用方法について説明する．つづいて，分子動力学法の基礎方程式を示 し，大規模分子動力学計算の手法である領域分割による高速化および並列化について 説明する．第 3 章では，複数の立方体 γ ′ 相を含有するセルが周期的に並んだ理想的な ...
50
第一原理分子動力学法を用いたNi及びNi3Alの理想格子不安定性解析
... は，金属ではフェルミ面がぼやけるために非占有状態も考慮しなければならないこと による．このため，占有状態にしか依存しない全エネルギーを最小化する方法では適 切な電子状態計算を行うことができない．そこで，BKL 法では占有状態と非占有状態 の両方について計算できるエネルギー期待値 εkn =< Ψ kn |H|Ψ kn > の最小化を行う． したがって，BKL ...
94
連載講座 : 高生産並列言語を使いこなす (5) 分子動力学シミュレーション 田浦健次朗 東京大学大学院情報理工学系研究科, 情報基盤センター 目次 1 問題の定義 17 2 逐次プログラム 分子 ( 粒子 ) セル 系の状態 ステップ 18
... セルの大きさ (辺の長さ) は原理的には任意だが, 辺の長さをカットオフ半径以上とすることで, あ るセル内の分子に計算すべき力を及ぼす分子は, そのセルおよび隣接するセル内にのみ存在するとい うことになる. ここではカットオフ半径を 3σ, セルの一辺の長さを 3.2σ としている. ...
14
様式 19 別紙 1 課題番号 先端研究助成基金助成金 ( 最先端 次世代研究開発支援プログラム ) 実施状況報告書 ( 平成 23 年度 ) GR010 本様式の内容は一般に公表されます 研究課題名研究機関 部局 職名氏名 第一原理分子動力学法に基づくマルチフィジックスシミュレータの開発と低炭素化
... 32. Muneyuki Ishikawa, Nobuki Ozawa, Tomomi Shimazaki, Momoji Kubo, “A Study of Chemical Mechanical Polishing Process of Glass Surface Using CeO 2 Particle via Computational Simulations”, Tribochemistry Hagi 2011, ...
8
シリコンにおける非弾性変形開始時の局所力学状態に関する分子動力学的研究
... 力が急減した．引張ひずみ下の「瞬間的な」原子配置データから detB α ij ＜ 0 となった 「不安定」原子を調べると，応力急減直前のひずみ 0.410 で初めて結晶内に不安定原子 が現れ，そこを中心として不安定原子領域が拡大してループ状の欠陥が生成していた． また，x, y 方向を自由境界条件としたナノワイヤの引張シミュレーションでは，引張 ひずみ 0.389 ...
83
分裂酵母のα-アクチニン Ain1 の生化学的、細胞生物学的、分子動力学的研究
... 本論文の第二部で著者は、Ain1 のアクチン繊維結合性について、分子動力学計算によるシミュレー ションを行った。まず著者は、第一部の R216E 点変異が、CH1 と CH2 の間の非共有結合を開裂すること で、Ain1 ...
3
整合界面の構造安定性ならびにミスフィット転位に関する分子動力学的研究
... 界面で の Tersoff 型ポテンシャルの問題は，原子 i を中心として，他の原子 j, k との結合角を 考慮するポテンシャルパラメータが，Tersoff の Si では原子 i の種類だけに依存するの に対し，Jefferson の GaAs では原子 i と j の組に陽に依存する点である．そこで，[ 1 ] ...
104
分子動力学によるMg-Zw-Y合金のLPSO構造の安定性ならびにキンク発生メカニズムの検討
... 田中克志先生へも屋代先生と同様に最大限の感謝を致します．研究が行き詰った時 に幾度となく有益なアドバイスを頂き，幅広く，かつ深い知識を持ちながらも，いつ も気楽にふらっと話しかけに来て下さった先生には何度救われたか分かりません． また，机を並べて未知の「シミュレーション」という壁に共に向かったシミュレー ション班（富平を含む）の 3 ...
77
放射光光電子分光法と超音速分子線技術を組み合わせたO2によるGe(100)及び(111)表面の酸化に関する研究
... Ge の価 数を見積もると、並進エネルギーを高めても、1+と 2+に限られていた。これは、3+、4+と高次の酸化が現 れる Si の場合と大きく異なる挙動であり、またも Ge 表面の不活性さを表す結果である。また、付着係数は 酸化過程において、大きく変化するものの、1+と 2+の価数をもつ Ge ...
5
研究顧問による点検評価（3ページ） 分子研リポート2014 | 分子科学研究所
... 訳文 分子科学研究所ならびに岡崎統合バイオサイエンスセンター訪問リポート 2014 年 10 月 27 日〜 29 日 多数の教員の定年退職に伴い，幅広い研究分野をカバーする，精力的かつ創造的な若手研究者を後任として採用す ることとなり，分子研が重要な変革期を迎えていることは明らかである。田中教授から説明のあった U V S O R におけ ...
3
研究顧問による点検評価（5ページ） 分子研リポート2015 | 分子科学研究所
... る。 加藤教授が領域代表を務めている新学術領域研究 「生命分子システムにおける動的秩序形成と高次機能発現」 では， 生物が有する特徴を示す人工的な自己集合システムを構築するという，すぐれた目標を掲げている。もしこの目標が 達成されれば，分子科学の範囲や機能性についての再定義が必要となるであろう。昨年指摘したように，規模が大き ...
5
研究顧問による点検評価（3ページ） 分子研リポート2013 | 分子科学研究所
... I による経過報告を含む定期的なミーティング（ランチョンセミナー？） 等を継続して実施することをセンター長に強く推奨するものである。来年度に分子研を訪問した際，C IM oS 内での相 互作用や連携を作り出す努力についてはもちろん，研究の進展についても話を聞けることを期待している。非常に楽 ...
3
放射光光電子分光法と超音速分子線技術を組み合わせたO2によるGe(100)及び(111)表面の酸化に関する研究
... 18 2-2 表面反応分析装置 本研究の全ての実験は、 SPring-8の日本原子力研究開発機構専用軟X線ビームラインBL23SUに設 置した表面反応分析装置 (SUREAC2000) において行った。SUREAC2000はロードロック室、クリー ニング室、SPM(Scanning Probe ...
93
心理学研究法としてのウェブ調査
... 適切だと判断した回答を行うというデータ収集プロセス のすべてが，参加者の主観的な認知に依存した形で行わ れることから，データにノイズが入り込むリスクは，実 験よりも大きい。また，心理過程を言語化することに よって，個々の質問が調査参加者の何を調べようとして いるのかが調査参加者本人に容易に推察されることにつ ...
9
外国人研究者による点検評価 分子研リポート2001 | 分子科学研究所
... 強め合うと共に，理論研究グループとの強い連携を生み出しています。西教授は，巨視的な大きさの物質から溶液中 の小分子の動力学にわたる研究プログラムを展開し，大きな成功を収めています。分子クラスター磁石に関する彼の ...
9
リカージョン法による分子軌道計算のプログラム開発
... 第 1 章 序論 1.1 背景 炭素の構造をあらわす理論の研究として、第一原理を基礎とした計算方法と、タ イトバインディングハミルトニアンを利用した近似計算がある。第一原理を利用し た計算はタイトバインディングによる計算と比べて非常に多くの計算努力を必要と するので、タイトバインディングによる計算は有用であると考えられる。炭素には、 ...
62