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分子シミュレーションの効率化

分子シミュレーション効率化の ためのアルゴリズム

分子シミュレーション効率化の ためのアルゴリズム

... ペプチド生成(2) 4. Add Peptide Sequenceウインドウで主鎖 二面角を指定し「OK」(ここでは α helix構造 を作るのでデフォルトままで良い) 5. メイン画面に生成されたペプチド ...

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分子シミュレーション効率化の ためのアルゴリズム

分子シミュレーション効率化の ためのアルゴリズム

... 分子動力学シミュレーション手順 1. 講義ページからnamd2.exeとtcl85t.dllを ダウンロードし、デスクトップに保存 2. 講義ページからala14.zipをダウンロードし、 デスクトップに保存 ...

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分子動力学法による非晶・結晶PP/PEとグラファイト層界面のせん断シミュレーション

分子動力学法による非晶・結晶PP/PEとグラファイト層界面のせん断シミュレーション

... 3 シミュレーション方法 x,y 方向は周期境界,z 方向は仮想壁面とした立方体セル中に PP/PE 分子鎖をそ れぞれランダムに成長させた非晶 PP/PE 無限薄板,ならびに,図 ...3.1 単位格子を並 べた結晶 PP に,剛体グラファイト壁を配置して圧着・せん断シミュレーションを行う (図 ...

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1 研究実施の概要 さまざまな ものづくり において シミュレーション技術は設計 製造の効率化 高品質化 高付加価値化実現に不可欠な技術です 本研究では 計算機パワーをフルに活用して効率的に高品質な処理を実現しうる技術の確立を目的として 数値数式ハイブリッド計算に基づくロバスト最適化プラットフォーム

1 研究実施の概要 さまざまな ものづくり において シミュレーション技術は設計 製造の効率化 高品質化 高付加価値化実現に不可欠な技術です 本研究では 計算機パワーをフルに活用して効率的に高品質な処理を実現しうる技術の確立を目的として 数値数式ハイブリッド計算に基づくロバスト最適化プラットフォーム

... 多目的最適手法としては、複数目的関数を重み付きで足し合わせて単目的 して最適を行う方法と、多目的まま Pareto line を求めてから、最終的に複 数パレート解から最適解を選択・決定する方法大きく2つあります。実際設 ...

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ISim ハードウェア協調シミュレーション チュートリアル : 浮動小数点高速フーリエ変換(FFT) のシミュレーションの高速化

ISim ハードウェア協調シミュレーション チュートリアル : 浮動小数点高速フーリエ変換(FFT) のシミュレーションの高速化

... 第 2 章 : チ ュ ー ト リ ア ル デザインをハードウェア協調シミュレーション用にコンパイルしたら、[Enable Incremental Implementation] を使用できます。ハードウェア協調シミュレーション用に選択されたイン スタンスがその後実行で変更されない場合、このオプションをオンにすると、ハードウェ ...

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直動ガイドの数値シミュレーション ANSYS & Optimus による “高精度化” “自動化” “最適化”

直動ガイドの数値シミュレーション ANSYS & Optimus による “高精度化” “自動化” “最適化”

... 2.2 FEM 適用による負荷分布理論精度向上 負荷分布理論 + FEM ⇒ 解析精度向上を実現 図6 各種モデルを適用した直動ボールガイド負荷分布理論 キャリッジ,レール変形をモデル ...

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都市気候数値シミュレーションによる都市温暖化の要因解析 [ PDF

都市気候数値シミュレーションによる都市温暖化の要因解析 [ PDF

... ~9/30 真夏日数・夜間 23℃以上日数を示す。図 16, 17 に緑被率,空調パターンをパラメータとした,一日 (8/14)経時変化を示す。緑被率を変更したケースで は,基準条件(緑被率 50%)と比較して 8 月平均気温 ...時平均気温で最大±1.0℃程度 変化があり, 日中気温へ影響が大きくなっている。 これは,経時変化(図 16 ...

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細胞環境下の生命システムを再現した1分子粒度シミュレーション

細胞環境下の生命システムを再現した1分子粒度シミュレーション

... 3. 分子混雑が酵素処理能力を高める 多重リン酸化反応はシグナル伝達系において頻繁に観察 される一般的な反応である.多重リン酸化反応によって二 値的な応答が説明できることからシステム生物学における 基本的な「素子」一つとなってきた.我々はまず,この 単純な二重リン酸・脱リン酸化反応系をeGFRD法を用い て計算し,さまざまな細胞内環境を再現した条件下で応答 を調べた 1) ...

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高速化が進む電子機器製品開発へのシミュレーション設計技術の適用

高速化が進む電子機器製品開発へのシミュレーション設計技術の適用

... いで行ってきている。近年高速、小型に対しては、 シミュレーションモデル高精度が求められており、伝送 路解析では 3 次元電磁界解析技術を組み合わせ数 Gbps 以 上信号でも十分な精度が得られる波形シミュレーション 技術を構築し、熱シミュレーションにおいてもプリント基 ...

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製品カタログ 設計業務効率化ツール for icad 設計業務効率化ツール for icad ご紹介 お客様の業務に合わせた設計業務効率化ツールを提供します 設計業務効率化ツール for icad の特徴 設計者の声を反映かゆいところに手が届くコマンドを実現! 豊富なサポート実績をもとに設計者の生の

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... 豊富なサポート実績をもとに設計者声を反映して開発しました。 「この一手間が面倒」といったお困りごとを改善します。 ■作業時間を短縮し業務効率UP! 単一オペレーションによる手数軽減により最低限操作で設計業務を行うことができます。 また、入力ミス削減による手戻り防止が見込めます。 ...

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分子動力学法によるポリマー内部分子構造のモデル化と変形挙動解析

分子動力学法によるポリマー内部分子構造のモデル化と変形挙動解析

... 程においては gauche ⇒ trans 遷移が優位に生じており,分子鎖が直線状になる内部構 造変化が生じていることが示された.さらに,内部分子鎖構造変化直接観察ならび に各粒子近傍局所密度分布変化により,降伏⇒硬化過程では分子鎖が複雑にから みあって変形しにくいクラスター状部分 (からみ点) ...

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理化学研究所計算科学研究機構研究部門量子系分子科学研究チーム殿 hp170163: 有機半導体 有機分子発光材料の全自動探索シミュレーションシステムの開発 高度化支援作業 2017 年 9 6 ( R405 般財団法 度情報科学技術研究機構利 援部 1

理化学研究所計算科学研究機構研究部門量子系分子科学研究チーム殿 hp170163: 有機半導体 有機分子発光材料の全自動探索シミュレーションシステムの開発 高度化支援作業 2017 年 9 6 ( R405 般財団法 度情報科学技術研究機構利 援部 1

... • Scalapack と ELPA を比較すると、 ELPA方が 、 MPI待ちと、MPI通信時間が、 大きく 減少して 、 インバランスも緩和 されていることがわかった。 à ELPA では、Scalapack と比べて、 通信方法が大きく改善 されていることがわかった。 通信は ELPA方が速くなっていることがわかった。 ...

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資料 4 火災調査の業務効率化等に係るアンケート調査結果について 火災調査の業務効率化に向けた検討部会 ( 第 2 回 )

資料 4 火災調査の業務効率化等に係るアンケート調査結果について 火災調査の業務効率化に向けた検討部会 ( 第 2 回 )

... 9 動画伝送装置 ・リアルタイム情報共有による遠隔支援 現場見分 10 GARMIN(GPS測量機) ・広範な焼損範囲詳細な測定 現場見分 11 電子顕微鏡等 ・迅速・詳細な見分 鑑識・鑑定 12 レーダー距離計 ・正確な計測 現場見分 13 図面作成ソフト ・図面精度向上 ・作成効率 書類作成 14 WEB会議システム ...

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パンデミックへの備えとしての医療資材の循環備蓄:モデル化とシミュレーション

パンデミックへの備えとしての医療資材の循環備蓄:モデル化とシミュレーション

... 測することは難しい.医療資材は⼀定期間は保管できるもの ,たとえばマスクであれば保管中に感染抑⽌効果は徐々に低 下しており,⻑期間にわたって備蓄されていたものを感染症 流⾏時に使⽤することは望ましくない.なお,医療⽤マスク消 費期限は⼀般に3 年間が⽬安である.そこで,備蓄倉庫に保管は するものの,⼀定期間後に⽇常診療に使⽤していき,備蓄機関 ...

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企業価値重視、効率化経営の時代到来へ

企業価値重視、効率化経営の時代到来へ

... き減価償却費を加えたもの)、分子が株価評価尺度 方式とよく似ており、実際株価キャッシュフロー 倍率改良型と言われる。例えば、株価キャッシュ フロー倍率は、株価が無ければ比率が計算出来ない ため公開企業に限られるに対し、これは未公開企 業に対しても、又同一企業グループ内カンパニー それぞれに対しても適用出来るからである(表7)。 ...

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モデルポテンシャルによるビクスバイト型酸化物と転位芯の分子動力学シミュレーション

モデルポテンシャルによるビクスバイト型酸化物と転位芯の分子動力学シミュレーション

... 3 らせん転位と酸化物相互作用 3.1 シミュレーション条件 図 3.1 に模式的に示すように,x, y, z 軸をそれぞれ [111], [¯ 110], [¯ 1¯ 12] とする座標系で, 中央すべり面に bixbyte 型酸化物を有し,セル端面から y 方向に 1/10 位置に転位を 導入した薄板状周期セルを用いて解析を行った.転位線方向 x 軸方向には周期境界 ...

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カーボンナノコイルの機械的特性に関する分子動力学シミュレーション

カーボンナノコイルの機械的特性に関する分子動力学シミュレーション

... 5 菱形断面 CNC 5.1 応力 - ひずみ曲線と変形概要 Fig. 5.1 に菱型断面モデル応力-ひずみ曲線を示す.ヤング率は armchair が 107[GPa], zigzag が 124[GPa] となり,前章円形断面より低い値となった.armchair と zigzag ...

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分子動力学法によるアモルファスポリエチレン/グラファイト界面の剥離シミュレーション

分子動力学法によるアモルファスポリエチレン/グラファイト界面の剥離シミュレーション

... .また,界面 強度を実験的に評価するものとして繊維引き抜き試験 (2) 等による評価がなされて いるが,様々な樹脂・繊維界面組み合わせを考えると,高分子-炭素繊維表面ミ クロ挙動に関する基礎的な知見が必要と考える.原子シミュレーションで高分子-炭 素界面を検討したものとして,Frankland らはカーボンナノチューブ (CNT) をポリ エチレン (PE) ...

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分子シミュレーションの応用

分子シミュレーションの応用

... 3.阻害剤構造データ取得(2) • 以下通り名前変更とエネルギー最小を行う 1. Hierarchy Windowで「Molecule 1」を左クリックした後 右クリックして「Attributes of Molecule 1」を選択 ...

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分子動力学シミュレーションによるOLCの摩擦メカニズム評価

分子動力学シミュレーションによるOLCの摩擦メカニズム評価

... ンように中空ではなく,径大きさに対して凹凸サイズが小さかったことで,図 5.14(d) で他モデルようなゆらぎ波形を描かなかったものと推測される.摩擦シ ミュレーション中変形様子を図 5.16∼図 5.19 に示す.それぞれ上段は対象 全体を z ...

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