今後のゲノムのデータ量
香港駐在報告 HKIR 年 6 月 中国通信ネットワーク機器メーカーを取り巻く環境と今後の見通し 近年 世界的に 無線通信 固定通信の通信データ量の増加が続いており 今後 通信関連のインフラ投資額は増加傾向を辿ると考えられる また 足元 世界の通信ネットワーク機器市場の中で
... （注）1.銅ケーブルの電話回線から光ファイバー回線へ切り替えを行うこと。 2.光ファイバー回線を用いた高速通信データサービスの総称。 《 図表13：中国政府の光ファイバー網構築に関する政策 》 2010年に中国工業情報化部など合計政府7部門は「光ファイバー・ブロードバンド網建設 に関する意見」を発表した。同意見には、光ファイバー網構築に今後3年間で1,500億元を ...
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エピゲノム制御を介した作物ゲノムの構造と機能の改変
... 交配育種における有用形質遺伝子の集積では一般に既存 の遺伝資源を利用するが，積極的にゲノム塩基配列を改変 することにより，新たな塩基配列を持つ系統を意図的に作 出することも可能である．目的とする遺伝子領域内の特定 塩基の改変にはジーンターゲティング技術やゲノム編集技 術が有効であり，少なくとも一部の作物では実現可能な技 ...
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（資料１０）「体細胞（体性幹細胞含む）ゲノム編集治療の開発、ゲノム編集を用いる生殖医療の開発、ヒト生殖細胞系列ゲノム編集の基礎医学研究」（石井先生資料）
... 課題点 今後の倫理審査委員会における体細胞ゲノム編集治療研究計画の審査で、重要な課 題はリスクの評価である。米国で実施された、 ZFN で CCR5 を破壊した T 細胞を投 与した第一相試験では、患者に移植する前に、 T 細胞でのオフターゲット変異は調査 されなかった。これは、リスク -ベネフィット比較衡量のみならず、移植細胞を体外で 4 ...
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Agenda 既存バックアップ方式の問題点 解決すべき部分 重複除外 (De-dupe) の有効性 データ保護の今後 将来を見据えたデータ保護用ストレージ PC のデータ保護と仮想環境の問題 既存のバックアップ方式を SLA の観点からもう一度洗い直し データセンターにおける異機種環境の問題点や D
... RTO/RPO • SLA： – 高：データロスを最小限（ゼロ）にしたい • CDP、アプリケーション側でのリプリケーション（DataGuard等） – ログデータをNetwork転送しDR側アプリケーションで吸収 – データ量が増大し回線コスト高→限られたアプリケーション ...
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アフリカツメガエルの複雑なゲノムを解読：脊椎動物への進化の原動力「全ゲノム重複」の謎に迫る
... ませんでした。しかし日本とアメリカを中心とする国際コンソーシアムは、アフリカツメガエルの全 ゲノム解読に挑み、見事その全貌を明らかにしました。得られた情報は今後生物学から医学に至るさ まざまな研究分野に大きく貢献すると期待できます。加えて、アフリカツメガエルのゲノムの中にあ る 2 ...
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我々のビッグデータ処理の新しい産業応用 広告やゲーム レコメンだけではない 個別化医療 ( ライフサイエンス ): 精神神経系疾患 ( うつ病 総合失調症 ) の網羅的ゲノム診断法の開発 全人類のゲノム解析と個別化医療実現を目標 ゲノム育種 ( グリーンサイエンス ): ブルーベリー オオムギ イネ
... （分散処理によるスケールアウトを含む）。 ２、その実施には、大規模なコンピュータリソースを必要とし、 気軽にできるとは言いがたい。 ３、今後、ゲノム科学のデータ産生量の増加に伴い、同様の大量の計算機リソース を必要とする場面が増えてくることが予想される。 ...
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Partek 社の NGS データ解析ソリューションは次世代シーケンサーから出力されたファイルを読み込んで 参 照ゲノム配列へのアラインメント データの品質管理 統計解析 ゲノム統合解析 生物学的解釈 各種グラフ やゲノムビューアーでの表示など NGS のデータ解析をすべてサポートします ファイルの
... 対応しているので、タスクを各ノードに振り分けることで処理を高速化できます。アマゾンウェブサービス のようなクラウドサービスに対応しているので、解析するデータ量に応じてサーバーのリソースを増減させ ることができます。サーバーを用意することが難しい場合、Partek 社が提供するホスティングサーバー（有 料オプション）を利用することもできます。 ...
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植物のDNAを生きたまま観察できる手法を開発 ～ゲノム編集のハサミをランプに替えることで作物のゲノム育種に貢献～
... できることから、ゲノム育種の研究現場における染色体解析や倍数性解析の効 率化を図ることが可能になります。本法に用いた TALE は無毒化されており、 どの植物にも導入可能なタンパク質であるため、今後、有用作物の DNA 解析に も応用可能であると考えられます。また、植物の細胞核内における DNA の 3 次 ...
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新スマートナビゲーションシステム研究会の取組と船舶 IoT におけるビッグデータの活用 船舶 IoT とビッグデータ IoT とビッグデータ 船上データ収集の現状と理想的な形 新スマートナビゲーション研究会の取組 活動の背景と目的 活動内容の紹介 IoT プラットフォームの活用 まとめと今後の活動
... SCOPE ：船舶の構造および搭載されている装置に適用され、各装置の SCOPE ：船舶の構造および搭載されている装置に適用され、各装置の センサーデータの取込みおよびシステム間やソフトウェアの処理に使用 される各種データを標準化することにより，機器やシステム間の連接利 便性を向上させる。 ...
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目次 生命科学系の研究分野において主にゲノムデータ解析用の プラットフォームとして使われている Galaxy について オンデマンドクラウド機能を活用して解析環境を提供する 事例をご紹介します 1. データ解析プラットフォーム Galaxy とは 2. Galaxy によるNGSデータ解析について
... ▪ データ解析者（利用者）とツール開発者（実装者）は必ずしも 同じではない ⇒ 利用者がツールの挙動を完全に把握しているとは限らない ▪ 昨今は、ツールの「コンテナ化」が解決の一助となっている ...
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非アルコール性脂肪肝障害のゲノム・エピゲノム解析
... 59 第三項 RNA 精製と Quantitative PCR（qPCR） 肝臓のトータル RNA は、ゲノム DNA を抽出した凍結肝生検体と同じ断片か ら RNeasy Mini Kit（Qiagen GmbH, Hilden, Germany）を用いて抽出を行っ た。2nd セットの 1 サンプルについては十分な量の RNA が得られなかったの ...
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黒ダイズのプロアントシアニジン含量に関与するゲノム領域の同定
... 要旨： プロアントシアニジンは、種皮色が黒のダイズの種皮に多く含まれており、様々な生体調節機能をもつとされて いる。黒ダイズ種皮に含まれるプロアントシアニジン含量には大きな遺伝的変異がある。今回の研究では、低プロアン トシアニジン品種である「丹波黒」と高プロアントシアニジン品種である「ペキン」の交雑後代を用いてプロアントシ ...
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自己紹介 : プロフィール 石井一夫 ( 東京農工大学特任教授 ) 専門分野 : ゲノム科学 バイオインフォマティクス データマイニング 計算機統計学 経歴 : 徳島大学大学院医学研究科博士課程修了後 東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センターリサーチアソシエート 理化学研究所ゲノム科学総合研究セン
... Velvet, Oases, Trinity などの操作とデータアセンブリー⽅方法、原理理 MySQL, PostgreSQL を⽤用いたデータベースの構築と、クエリ、集計 E3:RNA-‐‑‒Seq解析・ChIP-‐‑‒Seq解析・統計解析（R/MatLab） 発現定量量データの取得と統計解析、パラメトリック検定、ノンパラメトリック検 ...
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自己紹介 : プロフィール 石井一夫 ( 東京農工大学特任教授 ) 専門分野 : ゲノム科学 バイオインフォマティクス データマイニング 計算機統計学 経歴 : 徳島大学大学院医学研究科博士課程修了後 東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センターリサーチアソシエート 理化学研究所ゲノム科学総合研究セン
... ��http://www.ospn.jp/press/20130124no32-1-useit-oss.html �OPSN Press メールマガジン 「オープンソース」を使ってみよう (第27回 フリーソフトウェアを用い たゲノム科学におけるビッグデータ処理) ...
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ゲノム配列の登録 ～大量登録システム(MSS) ～
... 登録の申し込みと問い合わせ ------------------------------------------------- 29 参考資料 ----------------------------------------------------------------------------- 30 I. TSA (Transcriptome Shotgun Assembly)データの登録 ...
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ヒトの健康における細菌およびメタゲノム
... Dacheux L., Cervantes-Gonzalez M., Guigon G., Thiberge J. M., Vandenbogaert M., et al. (2014) A preliminary study of viral metagenomics of French bat species in contact with humans: identification of new mammalian ...
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１３．モリブデン (Mo) （植物の金属元素含量に関するデータ集録）
... Mo の有効性に対して最も大きな影響を与える因子は、土壌 pH であり、 他の微量要素と異なり Mo の有効性は、土壌 pH が中性に近づいたり、あるいはアルカ リ性になると増加し、酸性状態では低下することが知られている。これは酸性土壌に おいては、土壌中の鉄やアルミニウムと結合し、不可給態となるためであるとされて いる。酸性土壌は、世界各地に分布し、各種作物の Mo ...
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COD COD DIN 99 DIN 9 DIN 9 NPO 7 データの収集について DIN, 溶存無機態リン ( 以下 と記す ) DIN DIN ノリ生産量 DIN アサリ漁獲量 漁獲量 9 経営体数
... ならない。特に低次生産から魚類などにつながる食物網 の定量的な解明や，それに及ぼす環境要因（栄養塩，水 温等）の影響を把握していくことが重要である。 河川からの砂の供給の減少や海底の底質変化（悪化） を懸念する声が多く聞かれるが，それらに関する情報や 科学的知見は少なく，調査・研究の推進が望まれる。 ...
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表 1 食品廃棄物等の発生量 (1= ) 肉加工品製造業居酒屋等合計 発生量の把握方法 発生量 (t) 全 5 店舗中 3 店舗において 平成 28 年 5 月の 1 ヶ月間における発生量を実測し 3 店舗のデータから 1 店舗当たりの平均年間発
... 業者 特定肥飼料等の種類 肥料 ◆平成１９年度の基準実施率は、平成１９年度における再生利用等実施率「（再生利用の実施量＋熱回収の実 施量×０．９５＋減量の実施量）÷食品廃棄物等の発生量×１００（％）」により、計算した値を入力して下さい。 ...
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プロダクトシート Syncsort DMX-h ビッグデータの統合をシンプルに モダンデータアーキテクチャの目標 データウェアハウスおよびメインフレームは従来のデータアーキテクチャにおける中核であり 現在でも重要な役割を担っています しかし データ量の急増に対処したり 企業で分析が必要な多くの新しい
... モダン データ アーキテクチャの中核 Apache™ Hadoop はモダン データ アーキテクチャの中心的存在で あり、 Apache™ Spark はさまざまな種類のワークロードに対応する 単一のコンピューティング フレームワークになる可能性を秘めてい ます。ワークロードには、ディープ ラーニング、高度な分析、バッチ デ ...
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