並列化のパターン：データ並列
講義の流れ 並列プログラムの概要 通常のプログラムと並列プログラムの違い 並列プログラム作成手段と並列計算機の構造 OpenMP による並列プログラム作成 処理を複数コアに分割して並列実行する方法 MPI による並列プログラム作成 ( 午後 ) プロセス間通信による並列処理 処理の分割 + データの
... 他のプロセスが持っているデータを参照するには、通信する MPIルーチンの種類 MPIルーチンの種類 MPIの環境に関するルーチン MPI_Init, MPI_Finalize, MPI_Comm_rank 等 一対一通信 MPI_Send, MPI_Recv, MPI_Isend, MPI_Irecv, MPI_Wait 等 集団通信 ...
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連載講座 : 高生産並列言語を使いこなす (4) ゲーム木探索の並列化 田浦健次朗 東京大学大学院情報理工学系研究科, 情報基盤センター 目次 1 準備 問題の定義 αβ 法 16 2 αβ 法の並列化 概要 Young Brothers Wa
... Cilk でそのようなことを行う手段として, inlet という特別な構文が用意されている. それは, spawn したタスクが終了したときに, その返り値を伴って呼び出されるハンドラである. inlet を定義する構 文は C の関数定義の構文とほぼ同じである. ただしプログラムのトップレベルではなく, それを用 いる Cilk 関数の中で定義される. そして spawn ...
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情報処理学会研究報告 IPSJ SIG Technical Report 並列 FMO プログラム OpenFMO の性能最適化 稲富雄一, 眞木淳, 高見利也, 本田宏明, 小林泰三, 南里豪志, 青柳睦, 南一生 数万 ~ 数 10 万並列での効率的な実行を目指して, 並列フラグメント分子軌道プ
... group のジョブ実行を阻害しな い方法として，データ保存のための専用プロセスを用いること（以降，方法２）も検 討した．この方法では，モノマー密度行列データを保持してワーカプロセスからのア クセス要求に応答することを専門とするストレージプロセス（storage group に属す る）と，計算を専門に行うワーカプロセス（いずれかの ...
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MBP（モデルベース並列化）を用いたクロスレイヤ設計
... – （事前・ターゲットごと）LLVM IR各命令の性能情報を計測→SHIM XMLを作成 – 対象ソフトウェアをClang (LLVMコンパイラ)で中間言語表現にし、 SHIM XMLを用いて見積もる – ∑ 𝑖𝑖∈𝐼𝐼𝐼𝐼 𝑖𝑖の性能 × 𝑖𝑖の出現回数 により簡単に求まりそうであるが、 以下に示す理由で実際には簡単ではない ...
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並列・高速化を実現するための 高速化サービスの概要と事例紹介
... ▌ データ転送 MPI や CUDA では適切な位置やサイズでデータを転送 転送に必要なデータの洗い出し ボトルネックになりやすい為、必要なデータのみ転送 並列高速化のポイント ...
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2E1-2 状態遷移の並列比較によるNFA照合高速化
... ンボルのサイズをより大きくした時の照合速度の変化について の調査も必要である。また、並列比較を利用したアクティブ状 態探索は、あらゆる形のオートマトンに応用可能であるので、 有限状態トランスデューサでの利用や TRIE の探索高速化な ...
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スパコンに通じる並列プログラミングの基礎
... K: 神戸大学大学院システム情報学研究科・計算科学専攻の計算科学演習用 web. http://exp.cs.kobe-u.ac.jp/wiki/comp practice/index.php? %B7%D7%BB%BB%B2%CA%B3%D8%B1%E9%BD%AC O: 大阪大学サイバーメディアセンター大規模計算機システム ...
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並列処理の背景
... Kepler GK110 では、カーネルから別カーネルを起動することがで、必要なストリー ムやイベントを生成したり、追加ワークの処理に必要な依存関係を管理することがホ スト CPUの関与なしに実行できます。 GPU 上で再帰的な実行パターンやデータ依存の実行パターンを生成・最適化するこ とが可能になり、（中略）システムの ...
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内容 イントロダクション スカラチューニング OpenMPによる並列化 最近のHPC分野の動向 まとめ
... ● プログラムに指示行を挿入（オプション無効時はコメント 行と見なされる（C言語は警告される場合も）） ● 自動並列化に比べて柔軟に最適化が可能 ● 標準規格なため、マシン／コンパイラに依らずポータブル ● 2013 年8月現在、OpenMP 4.0。SIMD化の指示行、アクセ ...
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Microsoft PowerPoint - 演習1：並列化と評価.pptx
... recvcount: 受信するデータの数（整数型） recvtype: 受信するデータの型 source: 送信してくる相手のプロセス番号 recvtag: メッセージ識別番号．送られて来たデータを区別するための番号 comm: コミュニケータ（例えば，MPI_COMM_WORLD） ...
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Mode Modylas NAREGI において並列化チューニングを開始 次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発 において京コンピュータに最適化した並列化チューニングを実施 MODYLAS CMSI MateriApps に登録 論文公刊 Y.Andoh et al., J. Chem
... 下司雅章編 , 計算科学のためのHPC技術, vol 1&2, 大阪大学出版会 (2017) [吉井・安藤 部分執筆] 論文公刊 Y.Andoh et al., J. Chem. Theory Comp., 9, 3201-3209 (2013). 第 12回CMSI神戸ハンズオン : MODYLAS講習会, FOCUS (2013) 第 21回CMSI神戸ハンズオン : ...
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スパコンに通じる並列プログラミングの基礎
... 阪大のスーパーコンピュータ (SX-ACE) はベクトル型計算機を束ねたものな ので，1 ノード (1 cpu, 4 core) でおさまる計算ならばテクニック的には難し いことはない．ベクトル化率を高める為の工夫はまた別に必要だが． 実は普通の PC でも 4 コア持っていたりするので，4 倍ぐらいまでの並列化 は容易にできたりする． ...
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最新の並列計算事情とCAE
... TOP500 スーパーコンピュータのランキング、半年ごとに更新 ６月のISCと１１月のSCにあわせて発表される 旧地球シミュレータが連続５期も君臨したためにアメリカが本気になったことは有名 指標はLINPACKベンチマークの性能 ...
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並列プログラミング入門（OpenMP編）
... データ共有属性（並列領域内の変数・配列の属性） Shared データ： 全てのスレッドからアクセス可能なデータ Private データ： 各スレッド固有の、他のスレッドからは見えないデータ ...
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並列計算プログラミング超入門
... MPI_Wait の間に、プロセス間境界メッシュ以外でのメッシュでの処理がおかれている ことが分かります。つまり MPI_Irecv で指定されたデータ通信と、その通信にかかわるデ ータを参照しない計算を「同時に」行なうことで MPI_Recv を使用した場合に比べて計算 時間を短縮できるということになります。計算時間を表２に示します。表１の計算と同じ ...
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並列処理論2
... – 単一PEでの複数プロセスの並行処理の発展形 – プログラム中のタスク群を複数のプロセスに割り当 て，それらを複数プロセッサで実行する． • スレッド間並列（マルチスレッディング） ...
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マルチコア時代の並列プログラミング
... Sequence lock Optimistic lock (楽観的なロック) 任意のデータ + counter 読み込みスレッドだけなら lock-free 書き込みスレッドは lock が必要 Counter が偶数なら解放、奇数なら占有状態 counter data 1.. Read counter と読んで、 1が奇数か、 1≠3なら失敗。 data を破棄して[r] ...
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1. 薬物や機能性化合物デザインの基本と環境の変化 2. 多変量解析 / パターン認識に基づく インシリコスクリーニングとインシリコデザインの基本原理 3. 並列創薬 ( 複数特性の同時最適化 ) の提案 4. 並列創薬 と 逐次創薬 の開発成功確率に基づく比較シミュレーション 5. 分類 / 予測
... ・フェーズ２： １６９億円＋（３０３億円： 同上 ）＝ ４７２億円 ＆ 開発期間 ４７２ ・フェーズ３： １６９億円＋（４７２億円： 同上 ）＝ ６４１億円 ＆ 開発期間 ６４１ フェーズ３での開発失敗は、６４１億円 ６４１億円 の投資回収を不可能 投資回収を不可能 とし、開発期間の無駄使い 開発期間の無駄使い 、利益の減少 利益の減少 ...
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コンピュータ将棋と並列化
... 参考文献 • 横山 大作. 「激指」におけるゲーム木探索並列化手法, 人工知能学会誌 Vol.26, No.6, pp. 648--654, 2011. • Akira Ura, Daisaku Yokoyama, Takashi Chikayama: Two-level Task Scheduling for Parallel Game Tree Search Based on Necessity, ...
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