ソフト活用事例③自動Rawデータ管理システム

(1)

ソフト活用事例③

自動Rawデータ管理システム

ACD/Labs NMR無料講習会&セミナー2014

於）2014.7.29 東京/2014.7.31大阪

富士通株式会社

テクニカルコンピューティング・ソリューション事業本部

HPCアプリケーション統括部

(2)

ACD/Spectrusをご選択頂いた理由（NMR領域）

• ベンダーニュートラルな解析環境

• 直感的なインターフェース

• 高精度なスペクトル予測による解析支援

パワフルな解

析機能

• 構造式、スペクトルで検索可能

• 解析結果とともに蓄積

• 再解析可能なデータ

自社データ

ベース構築

• 自動処理による解析スピード削減

• 過去の解析データを活用する事による解

析スピード向上

業務効率化

(3)

Spectrusで業務効率化って何が出来るの？

NMR測定

測定データの整理・蓄積

測定データの解析

NMR領域での作業フロー

(4)

Spectrusで業務効率化って何が出来るの？

波形処理

作業の効

率化

解析作業

の効率化

測定作業

の効率化

業務効率化

NMR作業フローにおける効率化ポイント

(5)

測定データの解析

Spectrusで業務効率化って何が出来るの？

NMR測定

測定データの整理・蓄積

NMR領域での作業フロー実体

解析データの整理・管理

1) 装置設定に

依存

2) 各自で管理

基本的な波形処

理は自動化（装

置機能）

解析は手動で

1) 報告書作成

2) 個人管理

(6)

NMR領域での作業フロー実体

測定データの解析

Spectrusで業務効率化って何が出来るの？

NMR測定

測定データの整理・蓄積

解析データの整理・管理

基本的な波形処

理は自動化（装

置機能）

解析は手動で

負荷大

1) 装置設定に

依存

2) 各自で管理

負荷小

1) 報告書作成

2) 個人管理

負荷大

(7)

1) 報告書作成

2) 個人管理

NMR領域での作業フロー実体

測定データの解析

Spectrusが支援出来るところは?

NMR測定

測定データの整理・蓄積

解析データの整理・管理

基本的な波形処

理は自動化（装

置機能）

解析は手動で

負荷大

1) 装置設定に

依存

2) 各自で管理

負荷小

(8)

1) 報告書作成

2) 個人管理

測定データの解析

Spectrusが支援出来るところは?

NMR測定

測定データの整理・蓄積

NMR領域での作業フロー

解析データの整理・管理

基本的な波形処

理は自動化（装

置機能）

解析は手動で

負荷大

1) 装置設定に

依存

2) 各自で管理

負荷小

装置から独立

した作業環境

による装置の

効率化

自動処理によ

る解析作業の

効率化

スペクトルデー

タベースによる

データの管理

現在のワークフローを部分的に支援する効率化

(9)

測定データの解析

Spectrusが支援出来るところは?

NMR測定

測定データの整理・蓄積

NMR解析処理効率だけを効率化させた場合

解析データの整理・管理

1) 解析データ作

成の生産性が向

上

2)もっとすばやく

データを取り出し

たい!!

3)もっとすばやく

データをしまいた

い!!

どうやってデータを整理す

るか?

誰がデータを整理するか?

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業務効率化

メリット

• 改善ポイントがわかりやすく着手しやすい

• 短期的な効果は上がる。

デメリット

• 現在の作業のうち部分的に効率化されるため、新たなボト

ルネックが発生する。

現状の作業をSpectrusを利用して断片的に効率化する

新たに発生するボトルネックに対する対策は?

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ACD/Labsプロフェッショナルサービス

• ACD/Labs Spectrus製品の機能を利用した様々なカスタマイズ

を実施

• 実作業の効率化（自動化）はもとより、ファイル管理、データ

ベース構築、ワークフロー管理まで適用可能

NMR解析においてどのような適用が出来るか?

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ACD/Labsプロフェッショナルサービス

Step1) 自動ファイル回収

分析装置ディスクの監視

Rawデータの回収

パラメータに応じた振り

分け

Step2) 自動ファイル変換

ACD形式への変換

（スペクトルファイル/

データベース）

Step3) さらに要望に応じて

自動波形処理

自動検索結果レポート作

成

自動検証作業…

段階的適応できるプランが提示可能

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ACD/Labsプロフェッショナルサービス

NMR測定

測定データの整理・蓄積

測定データの解析

NMR領域での作業フロー

解析データの整理・管理

Step1) 自動ファ

イル回収

Step2) 自動ファ

イル変換

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1) 自動ファイル回収

基本機能

• 対象の測定データの作成されるディスクを監視

• 処理対象のファイル/フォルダを検出し、処理を実行

• ファイル位置、ファイル名、パラメータなどから、処理内容を判別

導入効果

• 完全自動のファイル整理

• 確実なファイル整理の実行

• ステップ２（自動ファイル変換）のための準備

• どこにどのくらいの量のどのような分析データがあるかを網羅的に調

査可能。

• 分析データの保管ルールの整備

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1) 自動ファイル回収：システム構成例

Step.1

RAWデータファイルは測定後、

装置端末に生成・保存。

ACD/Automation Serverは

RAWデータファイルの生成を

監視し、データを自動で取得。

Step.2

RAWデータファイルが持つ情

報（測定者ID等）を自動で認

識し、あらかじめ指定された

ルールに則り、ファイルサーバ

へRAWデータファイルのコピー

を保存

Step.3

Spectrus ProcessorのOpen

File Panelのお気に入り登録

から、保存場所へダイレクトに

アクセスし、解析

Step.2

Step.3

ファイル・サーバ

CATECHIN.ESP 11109876Chemical Shift (ppm)543210-1 0 0.05 0.10 0.15 0.200.25 0.30 0.35 0.40 0.45 0.500.55 0.60 0.65 0.70 0.75 0.800.85 0.90 0.95 1.00 Normalized Intensity 1.03 1.03 1.02 0.98 0.96 1.03 0.96 CATECHIN 2.5 2.0 1.5 1.0 0.5 0 Time ( sec) -1.00 -0.95 -0.90 -0.85 -0.80 -0.75 -0.70 -0.65 -0.60 -0.55 -0.50 -0.45 -0.40 -0.35 -0.30 -0.25 -0.20 -0.15 -0.10 -0.05 00.05 0.10 0.15 0.20 0.25 0.30 0.35 0.40 0.45 0.50 0.55 0.60 0.65 0.70 0.75 0.80 Normalized Intensity

データ処理用端末

ACD/Automation

Server(Automated

File Transfer)

NMR測定装置

Step.1

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1) 自動ファイル回収：システム構成例

• サーバ要件

–

自動処理用

Windows Server 2008 R2

マルチプロセッサ２コア以上

4GB以上メモリ（4コア以上は6GB以上）

動作用にHDD 50GB以上の空き領域

.net(対象の分析装置に依存)

–

ファイルサーバ用

Diskサイズ … 格納予定のRawデータのサイズを配慮

–

高速ネットワーク

• 導入費用例

–

ソフトウェア費用（分析装置10台まで）

年間使用権：¥863,000

購入：¥2,157,000

–

構築支援作業

ファイル回収ルールの設計・構築（対象のルールの種類、条件判断の要因に依

存）

システム設置（ファイルサーバ、各対象の分析装置）…¥1,000,000～

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2) 自動ファイル変換

基本機能（自動ファイル転送に加え）

• ファイル形式を変換（よりファイルを探索・展開するスピー

ドを向上）

• データベース形式にすることで、検索も可能

導入効果（自動ファイル転送に加え）

• 素早い取り出し（1ファイル化されているため）

• 任意の情報で必要なデータが抽出可能な環境（DB）

• 解析後のデータも意識せずに更新・格納させる事も可能

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2) 自動ファイル変換：システム構成例

データ処理用端末

ACD/Automation

Server(Automated

File Converter)

NMR測定装置

Step.1

RAWデータファイルは測定後、装

置端末に生成・保存。

ACD/Automation ServerはRAW

データファイルの生成を監視し、

データを自動で取得。

Step.2

RAWデータファイルが持つ情報（測

定者ID等）を自動で認識し、あらか

じめ指定されたルールに則り、ファ

イルサーバへRAWデータファイルの

コピーを保存。併せてSpectrus DB

に格納

Step.3

Spectrus Processorから、

Spectrus DBへアクセスし、任意の

条件でスペクトルを開き、解析。

Step.4

解析終了後はespファイルを指定

した場所へ保存

Step.5

Automation Serverが解析済み

ファイルを検出し、対応したDBレ

Step.1

Step.2

Step.3

ファイル・サーバ

CATECHIN.ESP 11109876Chemical Shift (ppm)543210-1 0 0.05 0.10 0.15 0.200.25 0.30 0.35 0.40 0.45 0.500.55 0.60 0.65 0.70 0.75 0.800.85 0.90 0.95 1.00 Normalized Intensity 1.03 1.03 1.02 0.98 0.96 1.03 0.96 CATECHIN 2.5 2.0 1.5 1.0 0.5 0 Time ( sec) -1.00 -0.95 -0.90 -0.85 -0.80 -0.75 -0.70 -0.65 -0.60 -0.55 -0.50 -0.45 -0.40 -0.35 -0.30 -0.25 -0.20 -0.15 -0.10 -0.05 00.05 0.10 0.15 0.20 0.25 0.30 0.35 0.40 0.45 0.50 0.55 0.60 0.65 0.70 0.75 0.80 Normalized Intensity

Step.4

Step.5

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2) 自動ファイル変換：システム構成例

• サーバ要件

–

自動処理用

Windows Server 2008 R2

マルチプロセッサ２コア以上

4GB以上メモリ（4コア以上は6GB以上）

動作用にHDD 50GB以上の空き領域

.net(対象の分析装置に依存)

–

ファイルサーバ用

Disk … 格納予定のRawデータのサイズ、データベースのサイズを配慮

–

高速ネットワーク

• 導入費用例（本構成で新規に導入する場合）

–

ソフトウェア費用（分析装置10台まで）

年間使用権：¥1,725,000

購入：¥4,313,000

–

構築支援作業

ファイル回収ルールの設計・構築（対象のルールの種類、条件判断の要因に依

存）

データベースの設計・構築（データベースを利用する場合）

システム設置（ファイルサーバ、各対象の分析装置）…¥1,500,000～

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2) 自動ファイル変換：システム構成例

その他留意事項

• 同時利用10名以上の環境でDBを運用する場合はEnterprise

版のご利用を推奨します。

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3) さらに要望に応じて

• スペクトルデータを使った様々な作業を行わせる“究極の

ワークフロー支援システム“として利用可能です。

• 要望に応じて必要なシステム構成、作業が異なります。

• 本日ご紹介したFragment Base Drug Designシステムや検証

機能を利用した自動検証システム、NMR定量などの実績が

あります。

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3) さらに要望に応じて

測定データの自動回収

NMRスペクトルの自動解析

結果の出力

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まとめ

• スペクトルデータ活用の作業効率化は作業全体を見通した

作業フローが望ましい。

• ACD/Spectrusはスポット対応だけでなく、全体を網羅する支

援ツールが準備されている。

• 監視対象装置台数が10台まで拡張されたことにより、閲覧環