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ゲノム情報科学-観測技術の進展を支えるインフォマティクス-

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Academic year: 2021

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(1)[email protected]. 地球上には莫大な数の生命が存在し,しかもそれぞれ独自の遺伝子を多数持っている.これら生物や遺伝子の多様 性は,長大な期間に蓄積した遺伝子の進化が基礎となって生じてきた.遺伝子はその名のとおり親から子に遺伝し てゆく.その間に突然変異が起きて,ゆっくりと生物が変化してきたことが生物進化の核心である.現在に至るま でこの変化は続いており,ヒトの進化も例外ではない.現在「ゲノム」という 1 つの生物が持っているすべての塩基 配列が次々に明らかにされつつある.生物進化の研究でも,ゲノム全体を常に考える「進化ゲノム学」 (Evolutionary Genomics) が誕生しつつあるといえよう.本稿は,この進化ゲノム学について,比較ゲノム解析という観点を中心に 紹介する.. 進化ゲノム学とは. 1953. DNA. DNA. 43巻1号 情報処理 2002年1月. −1−. DNA.

(2) 1995 DDBJ. 50. GIB http://gib.genes.nig.ac.jp/ 1960 -1. Rh. Rh. Rh50. 比較ゲノム解析の方法. 2. -2. IPSJ Magazine Vol.43 No.1 Jan. 2002. −2−.

(3) ヒト. 100. カニクイザル Rh50 100. マウス (domesticus) Rh50 100. マウス (brevirostris) Rh50 ラット Rh50. 97. ヒト Rh. 97. カニクイザル Rh 100 99. マウス (domesticus) Rh マウス (brevirostris) Rh. 100. ラット Rh 線虫1. 94. 線虫2. 0.1. -1 Rh 1. ヒト チンパンジー ボノボ ヒ ト 科. 山ゴリラ 低地ゴリラ スマトラ島オランウータン ボルネオ島オランウータン シロテテナガザル シャーマン コンカラーテナガザル. 20. 10. テ ナ ガ ザ ル 科. 0. 分岐年代(単位:百万年). -2. -3 A X. 43巻1号 情報処理 2002年1月. −3−. T.

(4) 突然変異:T→A. T T T 祖先種Z. A. ヒト. T. チンパンジー. T. ゴリラ. T. オランウータン. 祖先種X. 祖先種Y. -3. 30 0.2% X -3 A X. Y. Z. T. 95. DNA. T. X T. A. DNA 4 3. ヒトの独自性を決定する遺伝子. 30 4 1. 3,000. 4,000. 2 12 0.2%. 1/2. 4%. 30. 1 1.4. 1. IPSJ Magazine Vol.43 No.1 Jan. 2002. −4−.

(5) -5. HoxA. HoxA. 21. 2001. 3 GEMINI Web. http://sayer.lab.. nig.ac.jp/GEMINI/. -4. MHC. Silver. MHC. 1,000. 遺伝子型と表現型をつなぐことの難しさ 類人猿ゲノム計画. 1999 Ape genome. Ag. Ag silver Web. nig.ac.jp/~silver/. http://sayer.lab.. -4. Silver Project Silver 300 DDBJ/EMBL/GenBank. 43巻1号 情報処理 2002年1月. −5−.

(6) -5. 4. Hox. DNA. DNA 4 A,C,G,T. 4. 2. 1 2 3. , : ABO Rh , Vol.18, No.7, pp.1039-1047 (1999). , : , : 35 , (1997).. , (2001).. 13. 12. 5. IPSJ Magazine Vol.43 No.1 Jan. 2002. −6−.

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