金沢大学十全医学会雑誌第115巻第1号2-9(2006)
2
ゼブラフイッシュプルプリン遺伝子クローニングと 視神経再生網膜における発現
金沢大学大学院医学系研究科脳医科学専攻脳情報分子学
(旧講座名:分子神経情報)
(主任:加藤聖教授)
田中聖之
我々は既に金魚視神経再生のトリガー分子として神経再生初期に発現が増加するプルプリンcDNAをクローニングして いる.本研究では,金魚プルプリンcDNAと高い相同性(90%)を示した591bpのオープンリーディングフレームを含む全長 854bpのゼブラフイッシュプルプリンcDNAを同定した視神経損傷後のゼブラフィッシュ網膜でプルプリンmRNAレベル は損傷後1-3日で急激に増加し,その後急激に減少し10日目には正常レベルに戻った.mRNA変化の細胞局在は視細胞に限局 していたプルプリンタンパク質レベルは損傷後3-5日で急激に増加し,その後急激に減少し10日目には正常レベルに戻った.
以上の結果は,プルプリンがゼブラフィッシュでも視神経再生のトリガー分子であることを強く示唆する.更に,金魚プルプ リンcDNAをプローブとして,ゼブラフィッシュ脳DNAから作製したゲノミックDNAライブラリーをスクリーニングし,
4.2kbpのプルプリンゲノミックDNAをクローニングした.そのクローンは2.3kbpの転写領域とその5,上流領域1.9kbpから 構成されていたプルプリン遺伝子は6つのエクソンと5つのイントロンから成っていた.エクソン1は非翻訳領域のみで,
タンパク質をコードする翻訳領域はエクソン2-6に含まれていた.推定される5,上流L9kbpの転写調節領域には,オプシン遺 伝子上流に存在が知られている,OTX1,NRE,CRX,E-opsin-1,Retl/PCE-1などの網膜特異的な遺伝子のコンセンサス配列 が存在した.このようにゼブラフィッシュの視神経再生開始の分子メカニズムをより詳細に解明するためには,網膜または視 細胞特異的な遺伝子のゲノム情報とそれに基づくプロモーター解析が必須になるであろう.
Keywordszebrafish,purpuringene,cloning,retina,opticnerveregeneration
哺乳類とは異なり,魚類の中枢神経系(centralnervous system,CNS)ニューロンの軸索は神経損傷後においても再生 可能であり,軸索は標的部位に向かって再伸長しCNSの機能 も回復することが知られている.例えば,金魚の網膜神経節細 胞(retinalganglioncells,RGCs)は視神経損傷後5-7日で軸索再 伸長を開始し,4-6週間経つと標的部位である視蓋にまで到達 し,4-6ケ月で視覚機能が完全に回復する1M).一方,ラットの RGCsは視神経損傷後アポトーシスにより1-2週間でほぼ完全に 死滅する5).このように,魚類の視覚システムは長期間にわた るCNS再生過程の研究において非常によいモデルであり,再 生開始や完了を決定する分子メカニズムを解析するためには魚 類を利用することは非常に重要である.歴史的にも,金魚は CNS再生の研究において最もよく使われている実験動物であ る.我々はその再生メカニズムに興味をもち,金魚視神経再生 に関わる分子を探索する研究をはじめた金魚の視神経損傷後 5日目の網膜からcDNAライブラリーを作成し,正常網膜との デイファレンシヤルハイブリダイゼーシヨン法にて再生初期に 発現の増加するcDNAクローンをいくつかスクリニーングした6).
そのうちの一つがプルプリンの全長cDNAであった?).プルプ リンは元来,発達期のヒヨコ網膜で発見された分子8)であり,
スクリーニングにより得られたcDNAクローンは,その金魚ホ モローグであった.この網膜特異的プルプリンは分子量22kDa の分泌型レチノール結合タンパク質で,金魚の網膜においてプ ルプリンmRNAの発現は視神経損傷後2-5日で未処理群と比較 して約2倍に増加し,損傷後10日目には正常レベルに戻った.
また,発現の局在は視細胞に限局していた7).このようなプル プリンmRNAの早期かつ一過性の増加はプルプリンが金魚視神 経再生のトリガー分子になる可能性をしめした.また興味深い ことに,網膜組織片培養においてプルプリンとレチノールの共 添加が視神経未切断の網膜(無処理網膜)では軸索の突起伸展 を誘発したのに対して,あらかじめ・切|折5-7日後の網膜(処理網 膜)では効果のないことが証明された7).この結果から,視神 経再生の初期刺激(プライミング)が生じている切断後網膜で は既にプルプリンは発現しており,神経突起伸展には添加によ る効果がないと考えられた.また,プルプリンはレチノールと 結合してレチノイン酸合成を高め,軸索伸展に関わるレチノイ
平成17年11月2日受付,平成17年11月9日受理
Abbreviations:CNS,centralnervoussystem;DIG,digoxigenin;GCL,ganglioncelllayer;IgG,immunogloblinG;
INL,innernuclearlayer;ONL,outernuclearlayer;OS,outersegment;PFA,parafOrmaldehyde;RBP4,retinolbinding protein-4;RGCs,retinalganglioncells
ゼブラフイツシユプルプリン遺伝子とその発現 3
ン酸レセプターを転写因子とする様々な遺伝子を活性化するこ とが考えられた.
発生生物学ではゼブラフィッシュは金魚よりも,よく用いら れる動物である.その理由として多産で一年中卵が得られるこ と,発達期の生体が透明であり遺伝子発現などの追跡ができる こと9),また現在ゼブラフィッシュのゲノムは全て解読されて おり,cDNAや遺伝子DNAのデータベースに日々新しい情報 が登録ざれ利用等が容易なことが挙げられる.このことから,
CNS再生に関与する分子メカニズムを解明するためにはゼブラ フィッシュを用いた遺伝学的な手法が不可欠である.そこで本 研究では,金魚で見つけた神経再生のトリガー分子プルプリン がゼブラフィッシュでも同様であるか否かを調べて遺伝子発現 を精査するために,ゼブラフィッシュのプルプリン全長cDNA とゲノムDNAをクローニングした.その結果,ゼブラフイッ シユプルプリン遺伝子の転写領域とその5,上流領域を含む4.2 kbpのゲノミックDNAを世界で初めてクローニングすること ができた.更にゼブラフィッシュ視神経損傷後の網膜において プルプリンmRNAやタンパク質の発現を調べ,金魚同様,ゼブ ラフィッシュ網膜においても,プルプリンが神経再生の初期か ら発現していることを確認した.
ユ72 GF:ATGGHATATTACAAGTTTGCCCTGCTTGTGGTTIT℃CTGTCCTAdlTTGAGCGCTGCTGGTCTTC-‐C-TCCTGCMBYYKFJhLLVVFLSYIERCWSSSC
、
’’’’’’’’’’’’’1lllI ZF:_lLGFYKFALLVVFLSYエERCFSASC ATGGGATTrTACAAGTTT℃CCCTGCTCGT℃GTTTTCCTGTCmlTACATrGAGcGcTGcT-T-TTCTGCJkTCCrGc 73ユ47
GTTGrGGACRGcTTurAcAG?CAAGGUACGncTTT℃ACCCCAAGAGUlTATCcAcGcJuhGTCGT且CGCTCAGCJLGAAc●●●●凸●Ce●●●●●●●■
VVDSFTVXDDFDPKRYjAGKWYAQQX l11111111111111111111111 AVESFTVKDDFDPXRYAGKWYAQQK GCZkGTAGAGAGTTTrACFLG写CAAGGACGACITTGACCCCAAGAGGTATGCAGGCハハハTGGTACGCTdhGCAGAAG ユ48222
ハハAGFLTCCAGAGGGACTCTTCCTCCAGGACAACATCTCTGCCGAATACACCATrGATGATGACGGdLCCATGACT K。PEGLFLQDNエSAEYTエDDDGTMT
’’’’’’’’’’’’’’’’’’’’’’’’’
1(。PEGLFLQDNエSAEYTェDDDGTMT AAAGAccCAGAGGGACTCTTCCTccnGGACAACATCTCrGCCGAATAcAcAATCGATCATGAT℃GJkAccATBACT 223297
GCCTCTTCCAAGGGCCGCGTTACTC[TrTCCGATTeTGGGTTGTGT℃T℃CIUACjkTGGCTGCCCAGTACAGT℃TT ASSKGRVTLFGFWVVCADIulAAQYSV
’’’’’1)||llllllllllllllll ASSKGRVTLFGFWVVCADHハハQySV GCCT℃GTCCAAGGGCcGAGTAAcTCTTTTCGGATrCTGGGTTGTGTGTGCTGACATGGCTGCccJLGTACAGTGTG 298372
CCTGACCCAAGCACTCCTGGCAAGATGTTCATGAACTATCAGGGCTTGGCTAGCTATCTGTCqlGTCGJlGGTGAC PDPSTPGKMFMNYQGLASYLSSGGD lll|llllllllllllllllllll PDPTTPGKHFMNyQGLASYLSSGGD ccTGACCCrACCACTCCTGccAHGATGTTCAT℃AACT7LCCJLGGGccT℃GcAAGCTACCTGTCTAGCCGAGGT℃FLC 373447
AACTソhCTGGGTCATTGACjhCAGUkCTACGACAACTATGCTATCACCTACGCn℃CCGCACTCTGAJhGGJlTGATGGC NYWVエDTDYDNYAエTYACRTLXDDG llll’’’’’’’’’’1llllllllll NYWVIDTDYDNYハエTYACRTLKDDG AACIWACTGGGTCATTGACACハGACTハCGACAACTATGCTATCACCTACGCTTCCCGCACTCTGAAGGmLTGATGGC 448522
ACpuTGCGAGGATGGCTATGCCTTGGTCrTCTCPbCGTAACCCCCGTGGCCTGCCTCCTGCAATCCpLGCGCCTCCTC TCEDGYAIjVFSRNPRGLPPAエQRLV
l1lllllllllllllllllll SCDDGYSLVFSRNPRGLPPAエQRLV TCATGTGATGACGGATATTCCCTcGTCTITTCJLCGTAACCCCCGT℃ccCTGCCTCCZqGCAATCCAGCGTCTTGTG 52359ユ
CGCCAGAAACUU4GATGAGJLTCTGCATGGCTGGCCAGTwrCCAGCCJbGTCCTGgAGTCTGGGGCTTGCTAA ROKQDEIcMAGQFQPvLQsGAc
I|||||llllllllllllllll ROKQDEIClvIAGQFQPV四QSGAC CGCcAGAAAcAAGATGAGFLTCTGCATGGcTGGTcAGTTCcAGCCTGTGCTGCAGTcTGGTGcTwrGCTAA
材料および方法 L実験動物
ゼブラフィッシュ(成魚,体長3-4cm)を使用した.FA100 (2000倍希釈;田辺製薬,大阪)を麻酔薬として用い,視神経は 眼球から約1mmのところを切断した28±1℃に水温を一定 にし,餌は十分与えて飼育した.
Iノーザンブロット法
視神経未切断群(コントロール)および視神経切断群の網膜 全RNAはSepasol-RNAISuperKit(ナカライテスク,京都)を 用いて抽出した.1%アガロース/ホルムアルデヒドゲルの電気 泳動で2/ugの全RNAを泳動し,ニトロセルロースメンブレン (SchleisherandSchuell,Dassel,Germany)に一晩かけて転写さ せた18Sと28SrRNAのエチジウムブロミド染色像をコント ロールとした.フィルターに[α_32p]dCTpでラベルをした金魚 プルプリン全長cDNAを42℃,一晩でハイブリダイゼーション させた.GAPDHcDNAを内部標準として使用した.それを 2xSSC/0.1%SDS,lxSSC/0.1%SDS,O5xSSC/0.1%SDS,
0.1xSSC/0.1%SDSの順に60℃,20分の洗浄をした.その後,
X線フイルムにてバンドの検出を行なった.バンドの定量はフ イルムをスキャナーで取り込んだ後,NIHImageで行なった.
mInsituハイブリダイゼーション法
眼球は摘出後,0.1Mリン酸緩衝液(pH74)と5%スクロー スを含む4%バラホルムアルデヒド(parafOrmaldehyde,PFA)
液で4℃,2時間固定した.その後,スクロースの濃度を徐々 に5-20%ヘと上げスクロース置換を行なった.その眼球は OCrコンパウンド(rissueTek;Miles,Eikhart,USA)を用いて
包埋後,12/umで薄切した.このサンプルを0.5浬g/mlプロテ
イナーゼKで37℃,10分間処理後,4%PFAで再固定した.そ れから20%ホルムアルデヒド/4xSSCで室温(23℃),30分間プ レハイブリダイゼーションをした.その後,ジゴキシゲニン (digoxigenin,DIG)がラベルされたゼブラフィッシュプルプリ ンー本鎖cRNAを42℃,一晩でハイブリダイゼーションさせた.
50%ホルムアルミド/2xSSCで洗浄後,20/αg/mlRNaseAを
FiglHomologyofdeducednucleotideandaminoacid sequencebetweengoldfishpurpurinandzebrafishBCO59516 cloneUppertrace,GF:goldfishpurpurininsequence・Lower trace,ZF:zebrafishRBPL41ikemRNAinsequence(GenBank accessionnumberBCO59516).AnunderlineintheN-tenninus ofthezebraiishsequenceshowssignalpeptidefOrsecretiolLA dottedlineinthegoldhshaminoacidsequenceshowssiteof syntheticpeptidefOrmakinganti-peptideantibodies7).Ashort verticalbarbetweengoldfishpurpurinandzebrafishRBPL41ike mRNAindicatestheidenticalnucleotide.
37℃,30分反応させた.検出にはアルカリホスファターゼ結 合抗DIG抗体を室温,60分反応後ニトロテトラゾリウム/5-ブ ロモー4インドリルー3-ホスファターゼによって視覚化した.
Ⅳ.ウエスタンプロット法
6-8個の眼球を摘出し水晶体を取り除いた後,ソニケーシヨ ン緩衝液[50mMms-HCl,150mMNaCl,0.2,Mふっ化フエ ニルメチルスルホニル,0.5%界面活性剤(NonidetPL40),1
,MEDTA]で超音波処理を行なった.遠心後の上清を回収し タンパク量60/ugをSDSポリアクリルアミドゲル(12.5%)にて 泳動した.タンパク定量はブラッドフォード法血で測定し,標 準液としてγ-グロブリンを使用した.メンブレンに転写後,1 次抗体として300倍希釈した抗プルプリンのペプチド抗体と反 応させた7).プルプリンに対する抗ペプチド抗体は以前金魚で 作製した7)(図1).洗浄後,2次抗体として500倍希釈したぺル オキシダーゼ結合抗ウサギ免疫グロブリンG(immunogloburin G,IgG)(医学生物学研究所,名古屋)と反応させた.バンドの 定量はメンブレンをスキャナーで取り込んだ後,NIHImageで
行なった.
中 田
4
A
OS
013510day・I1111UDUW2Wijl ONL
PurpⅢU“.鰯ii:iiiiili蕊iiiili鶴、鱗JJYTJ
浄薫4狐UU-qq、Foq。B
Il1ll1IlMmll1ll1lllillIMliI
W1Mi1i9ii1篭鰯ii,iiilllIil1illllllllllllill1ili
qhグー『
GAPDHヨHIH■僻、釘HnlH鯰!nIWWI蝋1H99關iHH6 lNL
ゴー、
・61..-4。、△、。
.I’1..「'’1..8L,'1::-1?「:=...j1.:Ⅷ
~lhiljl』:fii
…w↓鵜融;枠…繍捗蕊蕊ョ几■ロ-,-1
1一山『‐『》》》品‐〉『‐‐|訓鈎熟議》
弁韓鍵一・・’千二豪・魂一
二凸冒Ⅱ『▲上▼〉二▲0-。辨咀.。“‐〈|‐一・・・・‐告川合.心坤』『’卸。』Ⅱ。‐・‐へ》》一‐〉、妃h‐‐】‐0’|’‐淀も
‐‐・升け-0‐肌》岬‐wⅧ.】‐澱羊・沙垣・
宮』。』『→Ⅱ午小』ⅢF}宮へ卍:‐‐.,■.Ⅱ.‐・虻.,(写、几.‐『←,‐。‐|‐『紅‐・究蜀+〈生・万一.Ⅲ引‐‐f・▽,妙●香)洪丸辮甲‐1‐}‐一罪今川一》鋒》》》一一駆岫→繊鐇》課.叩.瀦一}バー錬二c・‐‐rべ‐:.
‐lAP。’宍・‐‐‐酢&■、■‐0|『」
’》や‐友山..
‐‐小4m
‐.m職.
b GCL lijia
0000000321。』E8←。ま)く之匡E一○一こつ。Eく
llI1ilim1IIWIlIllll1l1ll11lll1II11i11lll
’
■ :卜f013510
Daysafteropticnerveinjury
Fi9.2.Northemblotanalysisand〃s伽hybridizationofpurpurinmRNAinthezebrahshretinaatvarioustimeintervalsafteropticnerve transectionA)TotalRNA(2〆g)hPomzebrafishretinawereelectrophoresed,transferredtonitrocellulosemembraneandhybridizedwith 32PIabeledpurpurincDNAVerticalbarineachhistogramshowsthemean±S,EM(、=4).*p〈0.05ascomparedwithcontroLB)Retinal sectionsfromvariousdaysafteropticnelvetransectionwerehybridizedwithanti-senseprobe(a-e)andsenseprobe(0.(a)control;(b)1 day;(c)3days;(d)5days;(e)10days;and(1)3daysafteraxotomy、Arrowheadsinb,c,anddindicatepositivesignalOS,outer segment;ONL,outernuclearlayer;INL,innernuclearlayer;GCL,ganglioncelllayerinthisandsubsequentfiguresScalebar=50/zm
A
01 3510days
|]断可ww 蛎鰯羅蕊蕊::,胄離鶴繊き#Ⅱ~殿鍵
OS
0000021(’○』E○○一○誤)Eの一○」Q」○一こ.。Eく
ONL INL GCL
013510’
Daysafteropticnerveinjury
Fig.3.Changeandimmunohistochemicalstainingofpurpunnproteininthezebrafishretinaafteropticnervetransection.A)60ノugof retinalproteinsfromzebranshretinaatvariousdaysafteraxotomywereloadedonSDSgel,transferredtonitrocellulosemembraneand reactedwithanti-purpunnpeptideantibody・Verticalbarineachhistogramshowsthemean±SEM(、=5).*p<0.O1ascomparedwith controLB)ReUnalsectionsfromzebrafishretinaatvariousdaysafteropticnervetransectionwereincubatedwiththeanti-purpunn peptideantibody:(a)control;(b)3days;(c)5days;(。)10daysArrowheadsinbandcindicatepositivesignalScalebar=50ノュ、
v,免疫組織学的染色法
眼球の固定および薄切はj〃s伽ハイブリダイゼーション法と 同様にして行なった.抗原賦活処理のため10,Mクエン酸緩 衝液で121℃,15分のオートクレーブをした.洗浄およびブロ ッキングした後,300倍希釈の抗プルプリンペプチド抗体と 4℃,一晩反応させた.それから,500倍希釈の抗ウサギIgG (SantaCruzBiotechnology,SantaCmz,USA)を室温,60分反応 させた.検出には西洋ワサビペルオキシダーゼ結合ストレプト アビジンと3-アミノー9-エチルカルバゾール(DakoCytomation,
Glostrup,Denmark)を使用した.
Ⅵ.ゼブラフィッシュプルプリンのゲノミックDNAのスク リーニング法
ゲノミックDNAライブラリーはゼブラフィッシュのゲノミ ックDNA(SeegeneInc,Seoul,Korea)とLambdaFYxII/XhoI partialFill~invectorkit(StratageneInc,LaJolla,USA)を用いて 作製した.スクリーニングは大腸菌O【L1-BlueMRA)に感染さ せたゲノミックDNAライブラリーのファージを,金魚プルプ リン全長cDNAに[α-32p]dCTpをラベルしたプローブとハイブ リダイゼーシヨンさせ,1xlO6ファージプラークから選別した.
金魚プルプリン全長cDNAは視神経切断後5日目の金魚網膜か
ゼブラフイツシユプルプリン遺伝子とその発現 5
-ユ943 ACCAGTTCCCAGGCCTPLTCTGGCTAjACPLTPATGCTGAATT八CCHGTnTCPLG ̄ NRE
GATrGG1l1AGGGCACAGG0rAATGTCACACTACAGCAC0rGAGAI,CAGTTGGC TCAGACGCAACAGTCACCTCAATGAACTTTGCTCTGGTGGGGTAATCCAG TATCATATGCATCCATACTGCCATTAGTATATTTGATAAGTTCCATTACn TTGTGCATATTTPLGGTCCCGTTTAAjACCTATATTGGG』AATGCTGCCCCCT-
TTTGAATGCTAATATGTTATCACAATGTTCACCTTTATTACCTCTCTTGC 八CAATnTTCAGCACAATCTCATGTPLAZLAGTACTTGTATAGCCTGGCTTAT GTGTpLTAGTTAAGCATCTTATjAGTTApLTGTTCGTTAAGCATPAGGTTTTTA
33333339494949887756511111LL一一一一一一一
ミエミニミ01三二聖△
-1543AATAATAGTTTCTATGTCCAGTGTTGTGTTTGTATTTCTGJATTAATTTAT…
OTX-1
-793jACnTGTAATCPATHG1BLTpLTATTATGGTATATTCT風GATTTTGTTTGGTAAA CRX
-743GTCTTTTTTTTTHGTnCjACpUAATATGCTATTATTAAA」AAGGCCCTCTTTA
-693ACCTTATGAAACTGATCACACCACATZAAATCTTCAACAATGTGCCAAGTA
ミミェニミ202ニニニニムBi
-643 CCTTCTTACATAACAGACTCTTATAAAAAAAAAGCAGCTTTGTAATCACA…
 ̄
CRX CAACCTAATAACATTTCATAATGCjAGTGCHTAACACAATAACACAAATAA
 ̄
E-opsin-1-like
TGCTjAGCAGACTGATTCTTTTPLGCTTTGCTTCCHGnTGTGATTGGnTTGC TTAAACZLAAGTCTCACCGTATTCAACTGjAGTTGCATAAAGCTTTPLATTGT TTTTTTGGCAAGCATGGGPLGGGTTCjDUACCGnGPUAGCCpLGjpLTTPLCHGTGAG ̄
Retl/PCE-1-Iike
GATTTCrrACAAACGGATTAACCGTAGATTTAAGAACCCT且TTrPhGTCACA
且G…TGエAA2AAFAZATC岬…CCTGTCTGTGG圏GTTGCI〒R〒FBB団CGGC.■
CRX TATAbox
TCTTGGTC八GTTTnGACAACACAGCCTTGTGGAGAACCACAZUBL
GAAGGATCCTACACTACTAAAACCATTCTTTCATTCATTCAGGACATCAT
-343
-293
-243
-193
-ユ43
-93
-43
+1
型堅21LニミAニニツニニ里g
CAAAACAAGCAG..、AATGGGATTTTACAAGTTTGCCCTGCTGGTGGTTTTCC start
TGTCATACATTGAGCGCTGTTTTTCTGCATCCTGCGCAGTAGAGAGTTTT
エビIエミユニミミビエニニツヨヅ,
ACAGTCAAGGACGACTTTGACCCCAAGAGG…TATGCAGGCAAATGGTACGC TCAGCAGAAGAAAGACCCAGAGGGACTCTTCCTCCAGGACAACjDLTCTCTG CCGAATACACAATCGATGATGATGGAACCATGACTGCCTCGTCCAAGGGC
ェ型ニミ21Lミミニ'1ニツョリLo
CGAGTAACTCTTTTCGG..、ATTCTGGGTTGTGTGTGCTGACATGGCTGCCCA GTACAGTGTGCCTGACCCTACCACTCCTGCCAAGATGTTCjATGAACTACC
ミ'エミ22ニミL2TE二二i」22二坐旦
AAGGCCTGGCAAGCTACCTGTCTAGCGGAG…GTGACAACTACTGGGTCATC GACACCGACTATGACAACTATGCCATTACCTATGCTTGCCGCACTCTGAA GGATGATGGCTCATGTGATGACGGATATTCCCTGGTCTTTTCACGTAACC CCCGTGGCCTGCCTCCAGCAATCCAGCGTCTTGTGCGCCAGAAACAAGAT
二'1エミ21二」L竺凰二三且」ヨニニニニムg
GAGATCTGCATGGCTGGTCAGTTCCAGCCTGTGCTGCAGTCTG…GTGCTTG CTAAACTGTTTGAGGAAACAAAAAGGGATTCCTTTTGCGTGCTGGCATAA
StOp
GAAGCGGATTCTGGGGCCATTCCATTTCAGCGCTGTAGAGGTGCATGTGT GCATCAGGGAGCCTAAGATCTTTGAAGTTATCTCAAGGGAATGTTGTATT CTGTAAAGTGTCTATGACAATAAATATTTTTTAAACAAAA
polyAsignal
+5エ
+225
+275
+427
+477
+527
+1534
+1684
+1828
+1878
+1928
+1978 +2146
+2196
+2246
+2296
Fig.4.Nucleotidesequenceofzebrafishpurpuringene・Total4.2kbpgenomicDNAfOrzebrafishpurpurinwassequencedPositionat+1 indicatesthetranscriptionstartsite・Inlhisfigure,1.9kbp5,flankingDNAand23kbptranscriptionalregionwereshown・Therewere manyconsensussequencesofbindingsiteoftranscriptionalfactorsfOrretinaspecificopsingene(NRE,OIX1,CRX,E-opsin-1-like,
Retl/PCE-1-like)inthepresumedpromoterregionof5,flankingregion、Noteapartialomissionofnucleotidesequenceatposition-1493 to-794and-593to-344・ApresumedTATAboxwaspositionedat-54fiPomthecapsite・Thetranslationstartcodon,ATGwaspositionedat
+188,andthestopcodon,TAAwaspositionedat+2147.Noteapartialomissionofnucleotidesequenceofeachintron.
中 田
6
CRX
CRXCRX鯛ハ
TATAbox/oTX-1
NRE -24
-1943
-788‐601 -343 -1505
列~い‐54 -1913
exon4 exon5 exon6 exonlexon2exon3
+2335 -24
+’+1b8(ATG) |+2J14MAAA)
+2147(TAA)
Fig.5.Astructureofzebrafishpurpuringene・Stmctureof1.9kbp5,nankingDNAand23kbptranscriptionregionwasshownina reducedlengthThetranscriptionstartsitewaspositionedat+LThinverticalbarsinthe5,promoterregionshowretinaspecific consensussequencesandTATAbox・ClosedsquaresinthetranscriptionregionshowexonsThepurpuringenehad6exonsand5 intronsExonlwasuntranslationaLThetranslationstartcodonwaswithinexon2andthestopcodonwaswithinexon6・Notealong nucleotidesequence(1kbp)ofintron3ApolyadenylationsignalAATAAAwaspositionedat+2314inexon6.
80%であった.N末端に分泌シグナルを持っており(下線で示 す),またドットで示した28番目のセリンから43番目のリジン は金魚の抗プルプリンペプチド抗体の作製に使用した部位であ るが7),ゼブラフィッシュのその部位は金魚と全く同じであっ たそして,ゼブラフィッシュからヒトなど多種にわたって存 在が知られているレチノール結合タンパク質のタイプ411)と RBP41ikemRNAは45%の相同性であった.これらの結果から ゼブラフィッシュのRBPL41ikemRNAをプルプリンのゼブラフ
イッシュホモローグとして結論した.
I視神経切断後のゼブラフィッシュ網膜における早期か つ一過性のプルプリンmRNAの増加
ゼブラフィッシュ網膜の全RNAは視神経切断後0,1,3,5,
10日目を採取し,金魚全長cDNAをプローブとしてノーザンブ ロット法によりmRNAの発現変化をみた.プルプリンmRNA の発現レベルは損傷後3日で約3.2倍に増加し,その後漸減し 10日目にはほぼ正常レベルに戻った(図2A).mRNAの細胞局 在はゼブラフィッシュ全長cDNAをプローブとしてj〃s伽ハイ
ブリダイゼーション法によって検出した.コントロール網膜に おいて,mRNAのシグナルはかろうじて視細胞に検出できた (図2Ba).損傷後1日でそのシグナルが外穎粒層(outernuclear layer,ONL)で劇的に増加し(図2Bb),3日目でピークになっ た(図2Bc)そして,5日目でその発現は減少し(図2Bd),10 日目ではシグナルが消失した(図2Be).また,センス鎖プロー ブでは全くシグナルが検出されなかった(図2B0.
1視神経切断後のゼブラフィッシュ網膜における早期か つ一過性のプルプリンタンパク質の増加
プルプリンに対する抗ペプチド抗体の認識配列はゼブラフィ ッシュでも保存されていたので,この抗体をゼブラフイッシュ プルプリンタンパク質の発現や局在の検出に使用した.ウエス タンプロット法で,約22kDaのプルプリンタンパク質の発現 は視神経切断後3日で約1.8倍増加し,その後漸減し10日目に らcDNAライブラリーを作製し6),そこから813bpのそれをク
ローニングした7).ハイブリダイゼーションの手法はノーザン ブロット法と同様に行なった.メンブレンは2xSSC/0.1%SDS,
lxSSC/0.1%SDS,O5xSSC/0.1%SDS,2xSSCの順に60℃,
20分洗浄を行ない,X線フイルムにて検出した.そして,陽性 を示すファージプラークを回収し同様にして3次スクリーニン グまで行なった.
Ⅶ、DNAシークエンス解析
スクリーニングにより得られたクローンの塩基配列は AppliedBiosystemsPRISMdyeterminatorkit(FosterCity,USA)
を用いてDNAシークエンサー(ABIPRISM310Genetic Analyzer;AppliedBiosystems,FosterCity,USA)で解析した
Ⅷ、統計学的分析
ノーザンブロット法とウエスタンプロット法において,ゼブ ラフィッシュのプルプリンmRNAとタンパク質の発現レベルは 一元配置分散分析後Scheffeの方法を用いて群間比較を行なっ た.危険率5%未満を有意差有りと判定した.
成績
1.ゼブラフィッシュプルプリンのcDNAクローン 金魚プルプリンcDNAのシークエンスデータを利用して,ゼ ブラフィッシュのcDNAデータベースからプルプリンを検索し た.得られたcDNAは854bpで,転写産物はレチノール結合タ ンパク質様のタイプ4(retinolbindingprotein-4,RBP-41ike mRNABCO59516クローン)であり,翻訳産物が同定されてい ない分子と高い相同性を示した.この分子は591bpのオープン リーディングフレーム(196個のアミノ酸)から成っていた.図 1に金魚プルプリンとゼブラフィッシュBCO59516クローンの 相同性を示す.RBP41ikemRNAの分子量は21.9kDaで金魚の それとほぼ同じであった.RBP-41ikemRNAと金魚およびヒヨ コプルプリンのアミノ酸レベルでの相同`性はそれぞれ94%と
ゼブラフイツシユプルプリン遺伝子とその発現 7
は正常レベルに戻った(図3A).免疫組織学的染色法では,免 疫活性はコントロールにくらべて(図3Ba),切断後3日目では ONLで弱い活性が,また神経節細胞層(ganglioncelllayer,
GCL)では強い活性が見られた(図3Bb).このGCLでの増加は 5日目まで続き(図3Bc),10日目にコントロールレベルに戻っ た(図3Bd).免疫前血清ではシグナルは検出されなかった.
Ⅳ.ゼブラフィッシュプルプリン遺伝子の単離とヌクレオ チドシークエンス
ゼブラフイッシュプルプリン遺伝子は金魚のプルプリン全長 cDNAをプローブにして,我々が今回作製したゼブラフィッシ ュ脳由来ゲノミックDNAライブラリーから単離した.1x106個 のファージプラークから7個の陽性クローンを得た.そのクロ ーンの一つを選び,シークエンス解析を行なった.図4にその ゼブラフイッシュクローンの4.2kbpのヌクレオチドシークエ ンスを示す.転写開始部位を+1として表示した.4.2kbpの DNAシークエンスは23kbpの転写領域とL9kbpの5,上流領域 から構成されていた.このクローニングしてきたヌクレオチド シークエンスはデータバンクに登録した(DDBJ,access number:AB242211).5,上流領域において,網膜特異的なオプ シン遺伝子の転写調節因子の結合サイト'2)があるか否かを検索 したその結果,多くの結合サイト(NRE,OTX-1,CRX,E‐
opsin-1-like,Retl/PCE-1-like)が5,上流領域に存在していた.推 定されるTATAboxは転写開始部位から上流54bpの位置にあ った.このプルプリン遺伝子は6つのエクソンと5つのイント ロンを有していた.エクソン1は62bp,エクソン2は118bp,
エクソン3は137bp,エクソン4は113bp,エクソン5は213bp,
エクソン6は197bpであった.また,イントロン3は1057bpと 長く,ほかのイントロンは94-124bpであった.図5にプルプリ ン遺伝子の4.2kbpのDNA断片の構造の簡略図を示す.推定さ れた網膜特異的な転写因子結合サイトやTATAbox,ポリAシ グナルを示した.翻訳開始コドン(ATG)はエクソン2に,翻訳 終了コドン(IAA)はエクソン6に含まれていた.
低く,視神経損傷後は非常に高い(3.2倍)のに対して,金魚の mRNAの発現レベルはコントロールでは高く,視神経損傷後は それほど高くなかった(2倍)7).ゼブラフィッシュ網膜におい てタンパク質の免疫活性は比較的GCLに限局していたが,金 魚の場合は網膜全層にわたって拡散していた7).mRNAやタン パク質の発現時期が金魚にくらべてゼブラフィッシュの方が1-
2日早かった.これらの相違に対する答えとして,我々は以下 の点を考えた.金魚と比較してゼブラフィッシュのプルプリン mRNAの元々の発現量が低いのは両者の体長の違いによるのか もしれない.ゼブラフィッシュの体長は45cmで停止するのに 対して,金魚はそれ以上に成長することが知られている'5).プ ルプリンは分泌シグナルを持っているため,視細胞から容易に 分泌される.そのため,ゼブラフィッシュで視神経切断後の GCLにおけるプルプリンの免疫活性が強いのは,軸索が損傷し た神経節細胞へプルプリンがより効率的に蓄積されることを反 映しているのかもしれない.金魚と比較してゼブラフィッシュ の網膜ではプルプリンmRNAとタンパク質の発現が1-2日早く 見られたのは,ゼブラフィッシュの視神経再生過程が早いため であろうことが考えられる(加藤,未発表データ).このように,
網膜特異的なプルプリンはゼブラフィッシュの視神経損傷後網 膜においても再生初期に誘導される分子であり,それゆえゼブ ラフィッシュでも視神経再生のトリガー分子になりうると考え られる.我々7)は,プルプリンはレチノールと結合してレチノ イン酸合成を高め,軸索伸展に関わるレチノイン酸レセプター を転写因子とする様々な遺伝子を活性化し,損傷した神経節細 胞から突起伸展を促進しているのではないかと仮定している.
Iゼブラフィッシュプルプリン遺伝子の特徴
ゼブラフィッシュプルプリンcDNAのヌクレオチドシークエ ンスは金魚プルプリンと90%の相同性があったので,我々は 金魚のプルプリン全長cDNAをプローブとしてゼブラフィッシ ュのゲノミックライブラリーからプルプリンDNAをクローニ ングした.1つの陽性クローンは4.2kbpで2.3kbpの転写領域 とL9kbpの5,上流領域を含んでいた.プルプリンの転写領域 は6つのエクソンと5つのイントロンから成っていた(図4).う ちイントロン3は1kbpと長く,その他は94-124bpと短いもの であった開始コドンのATGはエクソン2に,終止コドンの TAAはエクソン6にあった(図4,5).L9kbpの5,上流領域に は,推定されるRNAポリメラーゼ結合サイMrATAbox)が転 写開始部位から上流54bpに存在した.また5,上流の転写調節 領域に様々な転写因子結合サイトの有無を検索した.プルプリ
ンとオプシンは網膜特異的なタンパク質で視細胞に限局してい るので,ゼブラフイッシュプルプリン遺伝子にも,オプシン遺 伝子に特異的なNREl6),OTX-1l7),E-opsin-118),CRX'9),
Retl/PCE-12o)などのコンセンサスな結合サイトがあるか否か検 索した.検索した結果,NRE(TGCTGAAITAGCA;-1913--1901),
OTX1(rGATrAA;-1505-1499),CRX(rAATCA;-787‐-782, -601‐-597,‐81-76),EOpsin-1-like(CAACCTAA;-343-335),
Retl/PCE1-like(AGAAGCCAGITA;-163-153)がL9kbpのプ ルプリン遺伝子の上流にそれぞれ存在した更に我々がクロー ニングした42kbpのヌクレオチドシークエンスはゲノミック DNAシークエンスのzk30k6mleSangerlnstitute,Daniorerio sequenceprOject)と98.5%一致し,それは21番染色体に存在 していることが報告されている.これらの事実から,我々が得 たゲノミッククローンは実際,ゼブラフイッシュプルプリン遣 考察
1.視神経切断後網膜におけるゼブラフィッシュプルプリ ンmRNAとタンパク質の挙動
以前の研究で,我々は金魚視神経再生の初期過程において発 現が増加するプルプリンcDNAを単離した7).網膜特異的なプ ルプリンはヒヨコの発達期網膜で細胞接着や生存に関わる分泌 型のレチノール結合タンパク質として初めてSchubertら'3)によ り同定された分子である.金魚やヒヨコの網膜では,プルプリ ンmRNAは視細胞にのみ発現した7114).我々は金魚プルプリ
ンcDNAのシークエンスデータからゼブラフィッシュのcDNA
データベースを検索し,その結果854bpのcDNAクローン (RBP-41ike,BCO59516)を見つけた.金魚のプルプリンcDNA とアミノ酸レベルでは94%,ヌクレオチドレベルでは90%と 非常に高い相同性を示したので,854bpのRBPL41ikemRNAは ゼブラフィッシュのプルプリン全長cDNAであると結論した (図1).金魚と同様,ゼブラフィッシュのプルプリンcDNAは 591bpのオープンリーディングフレームを持っていた.視神経 切断後のプルプリンmRNAとタンパク質の発現レベルや局在は 金魚プルプリンと同様であった7)(図2,3).金魚とゼブラフィ ッシュの問でプルプリンmRNAとタンパク質の発現の相違は,
ゼブラフィッシュでのmRNAの発現レベルがコントロールでは
中 田
伝子であることが強く示唆された.将来プルプリンのゲノミッ クDNA情報はゼブラフィッシュ視神経再生における初期過程 の分子メカニズムを理解し,ひいては魚類のCNS再生関連遺 伝子の転写調節因子を見つける上で必須の情報となることは疑
う余地がない.
phasesofgoldfishbehavioraftertransectionoftheopticnerve revealedbyacomputerimageprocessingsystemNeuroscience 93:907-914,1999
4)MatsukawaT,AraiK,KoriyamaY,LiuZW,KatoSAxonal regenerationofopticnerveafterinjury・BiolPharmBull27:445‐
451,2004
5)Villegas-PerezMP,Vidal-SanzM,RasminskyM,BrayGM,
AguayoAJ、Rapidandprotractedphasesofretinalganglioncell lossfOllowaxotomyintheopticnerveofadultrats・JNeurobiol 24:23-36,1993
6)LiuZW,MatsukawaT,AraiK,DevadasM,NakashimaH,
TanakaM,MawatariK,KatoSNa,KArPasea3subunitinthe goldfishretinaduringopticnerveregenerationJNeurochem80:
763-770,2002
7)MatsukawaT,SugitaniK,MawatariKKoriyamaY,Liu ZW,TanakaMKatoS、Roleofpurpurinasaretinol-binding proteiningoldfishretinaduringtheearlystageofopticnerve regeneration:itsprimingactiononneuriteoutgrowthJ Neurosci24:83468353,2004
8)SchubertDLaCorbiereM、Isolationofanadhesion‐
mediatingproteinfiPomchickneuralretinaadherons,JCellBiol lO1:1071-1077,1985
9)StreisingerG,WalkerC,DowerN,KnauberD,SingerR Productionofclonesofhomozygousdiploidzebrafish (Brachydaniorerio)Nature291:293-296,1981
10)BradfordMM・Arapidandsensitivemethodforthe quantitationofmicrogramquantitiesofproteinutilizingthe principleofprotein-dyebin.ing・AnalBiochem72:248254,1976 11)StrausbergRL,FeingoldEA,GrouseLH,DergeJG,
KlausnerRD,CollinsFS,WagnerL,ShenmenCM,SchulerGD,
AltschulSFbZeebergB,BuetowKH,SchaeferCEBhatNK,
HopkinsREJordanH,MooreT,MaxSI,WangJ,HsiehF,
DiatchenkoL,MarusinaK,FarmerAA,RubinGMHongL, StapletonM,SoaresMB,BonaldoMECasavantTL,ScheetzTE, BrownsteinMJ,UsdinTB,TbshiyukiS,CarninciP,PrangeC,
RahaSS,LoquellanoNA,PetersGJ,AbramsonRD,MullahySL BosakSA,McEwanEJ,McKemanKLMalekJA,GunaramePH,
RichardsS,WorleyKC,HaleS,GarciaAMGayLJ,HulykSW,
VillalonDKMuznyDM,SodergrenEJ,LuX,GibbsRA,FaheyJ,
HeltonE,KettemanM,MadanA,RodriguesS,SanchezA,
WhitingMMadanA,YOungAC,ShevchenkoY,BouffardGG, BlakesleyRW,TouchmanJW,GreenEUDicksonMC,
RodriguezAC,GrimwoodJ,SchmutzLMyersRM,Butterfield YS,KrZywinskiMLSkalskaU,SmailusDE,SchnerchA,Schein JE,JonesSIMarraMAGenerationandinitialanalysisofmore thanl5,000full-lengthhumanandmousecDNAsequences ProcNatlAcadSciUS.A、99:16899-16903,2002
12)KennedyBN,VihtelicTS,CheckleyL,VaughanKI】Hyde DRIsolationofazebrafishrodopsinpromotertogeneratea transgeniczebrafishlineexpressingenhancedgreennuoresent proteininrodphotoreceptorsJBiolChem276:14037-14043, 2001
13)SchubertD,LaCorbiereM,EschFAchickneuralretina adhesionandsurvivalmoleculeisaretinol-bindingproteilLJ 結論
金魚の視神経再生初期過程において発現が増加するプルプリ ンは視神経再生のトリガー分子の可能性が示唆された7).この 分子がゼブラフィッシュにおいても同様であるか否かを精査す るため,プルプリンmRNAとタンパク質の発現レベルと時期を 調べた.更にはプルプリン遺伝子のより詳細な分子メカニズム の解明のため,金魚プルプリン全長cDNAを用いてゼブラフィ ッシュのゲノミックDNAライブラリーからゼブラフイッシュ プルプリン遺伝子のクローニングを行なった.その結果は以下 に要約できる.
1.金魚のプルプリンとアミノ酸レベルで94%,ヌクレオチ ドレベルで90%の相同性を示すcDNAクローン(RBP-41ike mRNABCO59516)をゼブラフィッシュのプルプリンcDNAホ モローグとして初めて同定した
2.プルプリンmRNAの発現量は,視神経切断後3日目でコン トロールと比較して約3.2倍に増加し,10日でほぼ正常レベル に戻った.また,その発現は視細胞に限局していた.
3.プルプリンタンパク質の発現量は視神経切断後3日でコン トロールと比較して約1.8倍に増加し,10日でほぼ正常レベル に戻った.免疫活性は切断後3日目ではONLで弱く,GCLで 強く見られた.
4.視神経切断後のゼブラフィッシュ網膜におけるプルプリン mRNAとタンパク質の発現時期は,金魚のそれと比較して1-2
日早かった.
5.金魚のプルプリンcDNA全長をプローブとして,ゼブラフ イツシュゲノミックライブラリーから2.3kbpの転写領域とL9 kbpの5,上流領域を含む4.2kbpのDNAヌクレオチド断片をク
ローニングできた.転写領域部位には6つのエクソンと5つの イントロンがあった.5,上流領域には網膜特異的なオプシン遺 伝子の上流に存在が知られている様々な転写調節因子の結合サ
イトが存在した.
謝辞
稿を終えるにあたり,御指導と御高閲を賜りました金沢大学大学院医 学系研究科脳医科学専攻脳情報分子学の加藤聖教授に深甚なる謝辞を表 します.また,有益なご指導,ご助言,ご協力を賜りました同教室の松 川通講師を始め,浦野たみさん,加野朝子さん,太田景子さん,金沢大 学大学院医学系保健学専攻の馬渡一浩助教授に深く感謝します.そして,
多くの支援ならびに協力を頂いた金沢大学大学院医学系研究科脳医科学 専攻脳情報分子学の皆様に感謝いたします.
文 献
l)AttardiDG,SpelTyRWPreferentialselectionofcentral pathwaysbyregeneratingopticnervefibersExpNeurol7:46 64,1963
2)BiihrM,BonhoefferFPerspectivesonaxonalregeneration inthemammalianCNS.'nPendsNeuroscil7:473-479,1994
3)KatoS,DevadasM,OkadaK,ShimadaY,OhkawaM,
MuramotoK,TakizawaN,MatsukawaT・Fastandslowrecovery
ゼブラフイツシユプルプリン遺伝子とその発現 9
CellBiollO2:22952301,1986
14)KatoS,NegishiK,TeranishiT,IshitaSTheuseofthe carpretinainneurobiology:itsuniquenessandapplicationfor neuralnetwolkanalysesoftheinnerretinaProginNeurobiol 37:287-327,1991
15)BennanP,GrayP,ChenEKeyserK,EhrlichD,KartenH,
LaCorbiereM,EschESchubertD・Sequenceanalysis,cellular localization,andeXpressionofaneuroretinaadhesionandcell survivalmoleculeCe1151:135-142,1987
16)KumarR,ChenS,ScheurerD,WangQDuhE,SungC,
RehemtullaA,SwaroopA,AdlerR,ZackDJThebZIP transcriptionfactorNrlstimulatesrhodopsinpromotoractivityin primaryretinalcellculturesJBiolChem271:29612-29618,1996 17)ChenS,WangQL,NieZ,SunH,LennonGCopelandNG,
GilbertDJ,JenkinsNA,ZackDJCrx,anovelOMikepaired‐
homeodomainprotein,bindstoandtransactivatesphotoreceptor cell-specihcgenes、Neuronl9:1017-1030,1997
18)AhmadLMash-1isexpressedduringrodphotoreceptor differentiationandbindsanE-box,E(opsin)-1intheratopsin gene、BrainResDevBrainRes90:184189,1995
19)MittonKP,SwainPK,ChenS,XuS,ZackDJ,SwaroopA TheleucinezipperofNRLinteractswiththeCRXhomeodomain、
Apossiblemechanismoftranscriptionalsynergyinrhodopsin regulationJBiolChem275:2979429799,2000
20)KennedyBN,GoldflamS,ChangMACampochiaroP,
DavisAA,ZackDLCrabbJW・Transcriptionalregulationof cellularretinaldehyde-bindingproteinintheretinalpigment epithelium,JBiolChem273:5591-5598,1998.
Thezebrafishpurpuringeneanditsexpressionintheretinaduringopticnerveregeneration MasayukiTanaka,
DepartmentofMolecularNeurobiology,GraduateSchoolofMedicine,KanazawaUniversity,Kanazawa920-8640-J JuzenMedSoc、,115,2-9(2006)
Keywordszebrafish,purpunngene,cloningretina,opticnerveregeneration
Abstract
Recently,weclonedgoldfishpulpurincDNA,whoseexpressionisupregulatedduringtheearlystageofopticnerve regeneration,asatriggermoleculefOrfishopticnerveregenerationHere,weidentifiedan854bpcompletezebrafish purpurincDNAcontaining591bpopenreadingframe(196aminoacidsresidues)fromhighsequencehomology(>90%)to goldfishpulpurincDNATheincreaseofpurpurintranscnptswasconfirmedinthezebrafishretinaafteropticnervemjury、
ThelevelofpurpurinmRNArapidlyincreasedl-3daysandthenrapidlydeclinedbylOdaysafternerveinjury・Thecellular localizationoftheincreasedmRNAlevelswaslimitedtothephotoreceptors・Thelevelofpulpurinproteinrapidlyincreased 3-5daysandthenrapidlydeclinedbylOdaysafteropticnervetransection・Theseresultsstronglysuggestthatthepurpurinis alsoacandidatemoleculefOrtriggeringtheopticnerveregenerationinzebrafishFurthennore,weclonedfOrthefirsttimea 4,ZkbpgenomicDNAfbrzebrafishpulpurinwiththegoldfishcDNAprobe、The42kbpgenomicDNAwasconstructedL9 kbp5,flankingupstreamregionand23kbptranscriptionalregionThepurpunngenehad6exonsand5introns、Exonlwas untranslationalandtheothers,exons2to6containedproteincodingregionlnthepresumedtlanscriptionregulatoIysiteof 1.9kbp5,flankingregion,thereweremanyconsensussequencesofretina-specificopsingenesuchasOTX-1,NRE,CRX,E- opsin-1andRetl/PCE-LTofUrtherelucidatethemolecularmechanismfOrtheinitiationoffishopticnerveregeneration,
suchagenomicinfOnnationoftheinterestinggeneinzebrafishmightbeessentiaL