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歯周炎患者のゲノムワイド関連解析

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Academic year: 2021

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北海道医療大学学術リポジトリ

歯周炎患者のゲノムワイド関連解析

著者 清水 伸太郎, 長澤 敏行, 古市 保志

雑誌名 北海道医療大学歯学雑誌

巻 34

号 1

ページ 48‑48

発行年 2015‑06‑30

URL http://id.nii.ac.jp/1145/00010339/

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図:関連解析

[最近のトピックス]

歯周炎患者のゲノムワイド関連解析

清水 伸太郎

,長澤 敏行

,古市 保志

)北海道医療大学歯学部口腔機能修復・再建学系 歯周歯内治療学分野

)北海道医療大学歯学部総合教育学系 臨床教育管理運営分野

歯周炎は,成人の歯の喪失の主要な原因として生活の 質に重篤な影響を及ぼしている.これまでの歯周炎の遺 伝子要因に対する研究では,疾患の発症機序等の前提を 考慮し, IL ,IL ,IL ,IL ,FcR,TLR ,TLR , VDR,MMP等が候補遺伝子とされてきた.しかし未だ 結果については議論の余地があると考えられている

. 近年では,疾患の発症機序等の前提を考慮せず,ゲノム 全体を網羅的に調べ,疾患と関連する遺伝子を同定する 研 究 手 法 で あ る Genome Wide Association Study

(GWAS)が注目されている.個人のDNAには 万〜

, 万のSingle Nucleotide Polymorphism(SNP)が存在 すると言われているが,GWASとは一般的に 人当たり

〜 万か所以上のSNPをDNAマイクロアレイを用い て調べ,ケース・コントロール間でSNPのアレル頻度が 異なる領域を探す手法である.これまでに,糖尿病やが ん等の多くの疾患でゲノムワイド関連解析により多数の 疾患関連遺伝子が同定されている.GWASの利点として は,網羅的であるため,これまでに考えられなかった疾 患と遺伝子の関連を見出すことができることである.し かし,欠点として数十万ものSNPを調べるため,低いP 値を示すSNPが大量に出現する,多重比較等の問題があ る.これを避けるために有意水準を厳しく補正する必要 があり,GWAS有意水準はP≦ .×

とされている.

この様な有意水準を満たすための統計力を得るには,大 量の検体を必要とする.

現在までに欧米人の歯周炎を対象としたGWASが行わ

れており

),),),)

,GWAS有意水準を満たした感受性遺伝

子が つ(GLT D ),GWAS有意水準を満たさない までも関連の示唆される遺伝子がいくつか( NCR , AKAP ,NPY,ANRIL,CDKL , NIN,EMR −VAV , DEFB ,ERC )報告されている.また我々は日本人の 歯周炎を対象としたGWASを行い,関連の示唆される遺 伝子(KCNQ ,GPR )を報告した

.各報告で歯周 炎の病型分類は異なっているものの,関連を認められた SNPは異なっており,他の集団では再現性を確認されて

いない.しかし重複して関連が示唆された遺伝子領域は 存在する(NIN,ERC ).今後の歯周炎を対象とする遺 伝子研究では,感受性遺伝子を同定し,そのSNPや遺伝 子領域の疾患との関わりを研究することで,その成果を 医療に還元できれば,臨床現場での理解も進むと考えら れる.

参考文献

)Laine ML, et al. 2012 Periodontol 2000 58 : 37−68.

)Schaefer AS, et al. 2010 Hum Mol Genet 19 : 553−62.

)Divaris K, et al. 2013 Hum Mol Genet. 22 : 2312−24.

)Teumer A, et al. 2013 J Clin Periodontol 40 : 977−85.

)Shaffer JR, et al. 2014 G3 (Bethesda) 4 (2) : 307−14.

)Shimizu S, et al. 2015 J Dent Res 94 (4) : 555−61.

北海道医療大学歯学雑誌 ! 平成 年

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第34巻1号   4C150 1C133/本文 ※31‐1から組体裁変更 OTF/048     トピックス 清水  2015.07.07 18.50.29  Page 48 

参照

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