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九州大学学術情報リポジトリ

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(1)

九州大学学術情報リポジトリ

Kyushu University Institutional Repository

RFLP(制限酵素DNA断片長多型)を利用したイネの連鎖 地図作成に関する研究

出田, 収

九州大学農学研究科遺伝子資源工学専攻

https://doi.org/10.11501/3110821

(2)
(3)

爪 U

RFLP(制 限 酵 素DNA断 片 長 多 型 ) を 利 用 し た イ ネ の 連 鎖 地 図 作 成 に 関 す る 研 究

出 回 収

1996 

(4)

目 次

頁 緒 言

第1章 ト リ ソ ミ ッ ク ス を 利 用 し たRFLPク ロ ー ン の 座 乗 染 色 体 決

定 な ら び にRFLP分 析 に よ る 異 数 体 の 染 色 体 構 造 の 決 定 4  第1節 ト リ ソ ミ ッ ク ス を 利 用 し たRFLPク ロ ー ン の 座 乗 染 色 体

決 定 5 

第l項 日 印 交 雑 ト リ ソ ミ ッ ク Flを 利 用 し たRFLPク ロ ー ン の

座 乗 染 色 体 決 定 5 

材 料 お よ び 方 法 5 

結 果 お よ び 考 察 8 

第2項 RFLPを 不 さ な いDNAク ロ ー ン の 座 乗 染 色 体 決 定 14 

材 料 お よ び 方 法 14 

結 果 お よ び 考 察 15 

第2節 RFLPを 利 用 し た 異 数 体 の 染 色 体 構 造 の 推 定 19  第1項 一 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス の 交 雑 後 代 に 出 現 し た 二 次 ト リ ソ

ミ ッ ク ス 様 植 物 に つ い て 19 

材 料 お よ び 方 法 20 

結 果 お よ び 考 察 20 

第2項 染 色 体11に 関 す る 4型 の ト リ ソ ミ ッ ク ス のRFLP分 析 24 

材 料 お よ び 方 法 25 

結 果 お よ び 考 察 25 

第2章 従来の連鎖、地図と RFLP連 鎖 地 図 と の 統 合 29 

第1節 標 識 遺 伝 子 と RFLPマ ー カ ー と の 連 鎖 分 析 に よ る 統 合連 鎖 地 図 の 作 成

材料お よ び 方 法

30  30 

(5)

結 果 お よ び 考 察

第2節 イ ン ド 型 品 種IR24と 日 本 型 標 識 遺 伝 子 系 統 と の 交 雑 後 代 に 観 察 さ れ た 遺 伝 子 の 分 離 の 歪 み に つ い て

材 料 お よ び 方 法 結 果 お よ び 考 察 第3章 総 合 考 察

摘 要 謝辞

引 用 文 献 英 文 摘 要 附 図 ・ 附 表

32 

A

﹃︐コ戸コウ

H o o

' M O O

司 コ

ζ J ζ J

戸 ︑ J f o f O

II

I 0 0

(6)

緒 言

メ ン デjレ の 遺 伝 の 法 則 は 優 劣 の 法 則 , 分 離 の 法 則 , 独 立 の 法 則 か ら な る . こ の う ち , 独 立 の 法 則 に つ い て の 例 外 が 連 鎖 と 呼 ば れ る 現 象 で あ る . こ れ は 遺 伝 子 が 染 色 体 上 で 線 状 に 配 列 し て い る こ と に よ る も の で , 逆 に , 遺 伝 子 間 の 連 鎖 を 見 出 す こ と に よ っ て , 遺 伝 子 を 線 状 に 配 列 し た 地 図 を 作 成 す る こ と が で き る . こ れ を 連 鎖 分 析 と い う . 1900年 に メ ン デ ル の 法 則 が 再 発 見 さ れ て 以 来 , イ ネ に お い て も 連 鎖 分 析 が 行 な わ れ る よ う に な り , 1963年 に はNagao and Takahashiが 主 に 形 態 形 質 着 色 形 質 , 生 理 形 質 を 標 識 遺 伝 子 と し て , イ

ネ(2n=24)に期待される 12の 連 鎖 群 を 試 作 し た . そ の 後 , こ の12の 連 鎖 群 と 染 色 体 と の 対 応 関 係 を 決 定 す る た め に , 相 互 転 座 や ト リ ソ ミ ッ ク ス を 用 い た 分 析 が 行 な わ れ る よ う に な り , 連 鎖 、 群 の 改 廃 や 新 連 鎖 群 の 発 見 が な さ れ , 現 在 ,

イネの12の 染 色 体 に そ れ ぞ れ 対 応 す る 連 鎖 群 ま た は 標 識 遺 伝 子 群 が 明 ら か に されている(総説 Iwata1986). 

一 方 , 近 年 の 分 子 生 物 学 的 手 法 の 進 歩 に よ り , DNAの 多 型 を 容 易 に か つ 多 数 検 出 す る こ と が 可 能 に な っ た . こ のDNA多 型 は RFLP(Res triction Fragmen t  Length Polymorphism)と 呼 ば れ , な か で も , 核DNAのRFLPは メ ン デ ル の 法 則

に 従 っ て 遺 伝 す る の で , 標 識 遺 伝 子 と 同 じ よ う に , 連 鎖 分 析 の マ ー カ ー と し て利用できる.

RFLPを 連 鎖 、 分 析 の マ ー カ ー に 利 用 す る 場 合 , 従 来 の 標 識 遺 伝 子 と 比 較 す る と , 次 の よ う な 特 徴 が あ る . ま ず , 標 識 遺 伝 子 よ り も 容 易 に 多 数 の マ ー カ ー が 得 ら れ る . 次 に 標 識 遺 伝 子 は 一 般 に 完 全 劣 性 で あ る も の が 多 く , F2でヘ テ ロ 型 の 遺 伝 子 型 を 判 別 で き る も の は 少 な い が RFLPマ ー カ ー は , 大 部 分 の も の が 共 優 性 を 示 す の で F2で ヘ テ ロ の 遺 伝 子 型 を 判 別 で き , 精 度 の 高 い 組 換 価 が 算 出 で き る . さ ら に 標 識 遺 伝 子 の 場 合 形 質 が 脹 乳 や 幼 苗 で 発 現 す る も の か ら 成 熟 個 体 に 達 し な い と 発 現 し な い も の ま で あ り , 評 価 す べ き 時 期

(7)

が 限 ら れ て い る も の が 多 い . ま た , 表 現 型 が 生 育 環 境 の 影 響 を 受 け , 形 質 が 正 確 に 評 価 で き な く な る 可 能 性 が あ る . 一 方 , RFLPマーカーは, DNAの 塩 基 配 列 の 違 い を 認 識 す る も の な の で , DNAさ え 得 ら れ れ ば , ど の 生 育 段 階 に お い て も 評 価 が 可 能 で あ る . ま た , 生 育 環 境 に 左 右 さ れ ず に , 正 確 に 遺 伝 子 型 を把握できる.

こ の よ う な 特 徴 を も っRFLPは , 充 実 し た 連 鎖 、 地 図 を 作 成 す る の に 適 し て い る と 考 え ら れ る . 既 に , い く つ か の 植 物 種 に お い て , RFLPを 利 用 し た 連 鎖 地 図 が 作 成 さ れ , 育 種 学 的 , 遺 伝 学 的 あ る い は 分 類 学 的 な 応 用 が 期 待 さ れ て い る(総説 Tanksleyet al.  1989). イ ネ に お い て も McCouchet al. (1988), Saito et  al.(1991), Causse et al.  (1994)お よ びKurataet al.(1994)が そ れ ぞ れRFLPを利 用 し た 連 鎖 地 図 を 作 成 し て い る .

今 後 , 連 鎖 地 図 を 基 盤 と し た 遺 伝 ・ 育 種 学 的 な 研 究 を 進 め る に 当 た っ て は , 形 態 、 形 質 な ど を マ ー カ ー と し た 従 来 の 連 鎖 地 図 と RFLPを マ ー カ ー と し た

RFLP連 鎖 地 図 と の 両 方 の 情 報 を 利 用 す る こ と が 望 ま れ る . そ れ に は , 従 来 の 連鎖地 ~(Classical linkage map)とRFLP連 鎖 地 図(RFLPlinkage map)とを統合 した連鎖、地図,すなわち,統合連鎖、地図(Integratedlinkage map)の 作 成 が 必 要 で あ る . 既 に , シ ロ イ ヌ ナ ズ ナ で は 125の 標 識 遺 伝 子 と 350のRFLPマ ー カ ー と か ら 成 る 統 合 連 鎖 地 図 が 作 成 さ れ て い る(Haugeet  al.  1993). また, トマトに お い て は 染 色 体l(Balint‑Kurtiet al.  1995)および、染色体6(Weideet al.  1993)に つ い て 統 合 連 鎖 、 地 図 が 作 成 さ れ , 従 来 の 連 鎖 地 図 と RFLP連 鎖 地 図 と の 比 較 が 行なわれた.イネにおいても, Kishimoto et  al.  (1992)Yuet  al.  (1995)はい くつかの標識遺伝子とRFLPマ ー カ ー と の 対 応 づ け を 行 な い , ま た , Abenes et  al. (1994)は 染 色 体11に つ い て , 従 来 の 連 鎖 地 図 とRFLP連鎖、地図との方向づけ

を行なっている.さらに, C a u s s e e t al.  (1 994 ) は 様 々 な 連 鎖 分 析 の 結 果 に 基 づ

(8)

ま だ な さ れ て い な い . 今 後 , 従 来 の 連 鎖 地 図 と RFLP連 鎖 地 図 と が 統 合 さ れ て 充 実 し た 連 鎖 地 図 が 作 成 さ れ れ ば , イ ネ の 遺 伝 ・ 育 種 学 の 基 礎 的 , 応 用 的 研 究 に 資 す る と こ ろ は 大 で あ る と 考 え ら れ る .

そ こ で , 本 研 究 で は , ま ず , 農 林 水 産 省 と 九 州 大 学 農 学 部 育 種 学 教 室 と の 共同研究によるRFLP連鎖地図を完成させるために, ト リ ソ ミ ッ ク ス を 利 用 し て, RFLP連 鎖 群 と イ ネ の12の 染 色 体 と の 対 応 づ け を 行 な っ た . つ い で , 標 識 遺伝子とRFLPマ ー カ ー と の 連 鎖 分 析 を 行 な い , 従 来 の 連 鎖 地 図 と RFLP連 鎖 地図との統合を試みた.

な お , 本 論 文 中 で は , 従 来 の 連 鎖 地 図 と は 九 州 大 学 農 学 部 育 種 学 教 室 で 作 成 さ れ て き た イ ネ の 連 鎖 地 図 (Iwata et al.  1984, 1989a, 1989b) (Appendix 1  参照)を指し, RFLP連 鎖 地 図 と は Saito  et  al.  (1991)  (Appendix  2参照)の RFLP連鎖地図を指すこととする.また, S ai to e t al.  (199 1 )のDNAクローンは 番号にNpbを 付 し て 表 し , そ の ク ロ ー ン に 由 来 す る 連 鎖 地 図 上 の 座 位 あ る い は マ ー カ ー は 番 号 にXNpbを 付 し て 表 し た . 同 ー の ク ロ ー ン に 由 来 す る 複 数 の 座 位 あ る い は マ ー カ ー は 枝 番 号 で 示 し た . 例 え ば ,XNpb681(染色体8)と XNpb682(染 色 体6)とはともにNpb68に 由 来 す る . さ ら に , 染 色 体1,3, 4, 

5, 8, 9および12に つ い て は , 川 崎 ら (1991)お よ び 野 々 村 ら (1994お よ び 未 発 表)が染色体腕と連鎖、群との対応関係が明らかにしているので,短腕側が左側

も し く は 上 側 に な る よ う に 連 鎖 地 図 の 作 図 を 行 な っ た .

(9)

1

章 ト リ ソ ミ ッ ク ス を 利 用 し た

RFLP

ク ロ ー ン の 座 乗 染 色 体 決 定 な ら び に

RFLP

分 析 に よ る 異 数 体 の 染 色 体構 造 の 推 定

正 常 植 物 に 比 べ 染 色 体 を1本 過 剰 に も つ 植 物 を ト リ ソ ミ ッ ク ス と い う . イ ネ (2n=24)に お い て も 12種 類 の ト リ ソ ミ ッ ク ス の シ リ ー ズ が 作 出 さ れ て い る (I

w a t a  a n d  Omura 1 9 8 4 ) .  

ト リ ソ ミ ッ ク ス を 利 用 し て 行 な う 遺 伝 分 析 を ト リ ソ ミ ッ ク 分 析 と い う . 従 来 , 主 と し て 標 識 遺 伝 子 に つ い て , ト リ ソ ミ ッ ク ス と の 交 雑 後 代 に お け る 分 離 の 様 式 か ら , そ の 座 釆 染 色 体 を 同 定 す る 分 析 が 行 な わ れ て き た . 現 在 , イ ネ の12の 染 色 体 の そ れ ぞ れ に 対 応 す る 連 鎖 群 ま た は 標 識 遺 伝 子 群 が 明 ら か に さ れ て い る が , ト リ ソ ミ ッ ク 分 析 が イ ネ の 連 鎖 地 図 作 成 に 果 た し た 役 割 は 大 き い ( 総 説

I w a t a1 9 8 6 ) .  

さらに近年, ト リ ソ ミ ッ ク ス は

RFLP

ク ロ ー ン の 座 乗 染 色 体 を 決 定 す る こ と に も 使 わ れ る よ う に な っ た .

S  a i  t o  

e t a.l 

( 1  9 9 1  

)は, ト リ ソ ミ ッ ク ス の 交 雑 後 代 における

RFLP

マ ー カ ー の 分 離 比 が ダ イ ソ ミ ッ ク ス の 交 雑 後 代 に お け る 分 離 比 と 異 な る こ と を 利 用 し て

RFLP

ク ロ ー ン

4

個 の 座 釆 染 色 体 を 決 定 し た . ま た ,

u  n 

g e t al.  ( 

1  9  8 7  

)はトマトで,

McCouch 

et  al.(1988)な ら び に

Sa i t o  

et  al. 

( 1 9 9 1 )

は イ ネ で , そ れ ぞ れ ト リ ソ ミ ッ ク ス の 遺 伝 子 量 効 果 を 利 用 し て ,

RFLP 

ク ロ ー ン の 座 乗 染 色 体 を 決 定 し た .

また,一旦,

RFLP

連 鎖 地 図 が 構 築 さ れ れ ば ,

RFLP

マ ー カ ー を 使 っ て 染 色 体 の 重 複 ・ 欠 失 を 遺 伝 子 量 効 果 に よ り 検 出 し 二 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス , 三 次 ト

リ ソ ミ ッ ク ス あ る い は ア ク ロ ト リ ソ ミ ッ ク ス な ど の 異 数 体 の 染 色 体 構 造 を 推 定 す る こ と も 可 能 で あ る .

本研究では, ト リ ソ ミ ッ ク ス の 遺 伝 子量 効 果 を 利 用 し て , い く つ か の

RFLP

ク ロ ー ン の 座 乗 染 色 体 を 決 定 し た . ま た

RFLP

連 鎖 地 図 上 に 位置 づ け られた

(10)

1

節 ト リ ソ ミ ッ ク ス を 利用 した

RFLP

クロー ン の 座 乗 染 色 体 決 定

ai 

t o  

e t al.  ( 

1 9 9 1  

)はイネの

RFLP

連 鎖 群 作 成 の 際 , ま ず , イ ネ に 期 待 さ れ る 12の 連 鎖 群 を 試 作 し た . そ の う ち の 6群は,

RFLP

マ ー カ ー と 座 乗 染 色 体 既 知 の 標 識 遺 伝 子 や ア イ ソ ザ イ ム マ ー カ ー と の 連 鎖 を 指 標 に し て , 対 応 す る 染 色 体 が 決 定 さ れ た

( K i s h i m o t o

et al.  1989)が , 残 り の6群 は 染 色 体 と の 対 応 関 係 が 不 明 で あ っ た . そ こ で , 本 研 究 で は , ト リ ソ ミ ッ ク ス の 遺 伝 子 量 効 果 を 利 用

して,

RFLP

連 鎖 群 と 染 色 体 と の 対 応 関 係 を 調 査 し た .

1項 目 印 交 雑 ト リ ソ ミ ッ ク

F l

を 利 用 し た

RFLP

ク ロ ー ン の 座 乗 染 色 体 決 定

McCouch 

et  al.(1988)は , イ ネ の

RFLP

連 鎖 、 地 図 作 成 の 際 , イ ン ド 型 イ ネ の ト リ ソ ミ ッ ク ス に ジ ャ ワ 型 イ ネ を 交 配 し て 得 た ト リ ソ ミ ッ ク

F l

の 遺 伝 子 量 効 果を利用して,

RFLP

連 鎖 群 と 染 色 体 と を 対 応 づ け た . 本 実 験 で も こ れ に 準 じ た 分 析 を 行 な っ た .

材 料 お よ び 方 法

(1)供 試 イ ネ

日 本 型 品 種 目 本 晴 由 来 の ト リ ソ ミ ッ ク ・ シ リ ー ズ ( Iwataand Omura 

1 9 8 4 )

に イ ン ド 型 品 種IR24を 交 配 し て 得 ら れ た ト リ ソ ミ ッ ク

F l

の シ リ ー ズ を 用 い た .

ま た , イ ン ド 型 品 種IR24の ト リ ソ ミ ッ ク ス ( 小 川 ら 未 発 表 ) に 日 本 型 品 種 ト ヨ ニ シ キ を 交 配 し て 得 ら れ た9型 の ト リ ソ ミ ッ ク

F l

も 用 い た . こ の9型 の ト リ ソ ミック

F l

は そ れ ぞ れ 染 色 体 1,

5

, 

6

, 

7

, 

8

, 

9

, 10, 11お よ び 12を 過 剰 染 色 体 と す る も の で あ っ た .

(11)

(2)DNAク ロ ー ン

Saito et  aI.  (1991)がRFLP連 鎖 地 図 作 成 に 用 い た ク ロ ー ン の中から, 日本 晴 とIR24との間,または, IR24と ト ヨ ニ シ キ と の 間 で 適 当 な 多 型 を 示 し た も の を56個 選 ん で 用 い た . さ ら に , RFLP連 鎖 地 図 に 位 置 づ け ら れ て い な い 若 干 の ク ロ ー ン ( 斎 藤 ら 未 発 表 ) も 用 い た . こ れ ら は ク ロ ー ン の 番 号 にNpbを 付 し て 表 し た . ま た , イ ン ド 型 品 種IR24の ゲ ノ ムDNAに 由 来 す る 新 た な ク ロ ー ン ( 吉 村 ら 未 発 表 ) に つ い て も い く つ か を 本 実 験 に 供 し た . こ れ ら は ク ロ ー ン の 番 号 にKyを 付 し た . 以 上 を 一 括 し てTable111に示した.

(3)サ ザ ン ハ イ プ リ ダ イ ゼ ー シ ョ ン

供 試 イ ネ か ら のDNA抽出は, CTAB(臭 化 セ チ ル ト リ メ チ ル ア ン モ ニ ウ ム ) を 利 用 し た 方 法(Murrayand Thompson 1980, Rogers and Bendich 1988)に 準 じ

て 行 な っ た . 抽 出 し たDNAは, 9種 類 の 制 限 酵 素BamHI, BglII, DraI, EcoRI, 

EcoRV, HindIII, SacI, ScaIお よ びXbaIの い ず れ か に よ っ て 消 化 し た 後 , 各 レーン2μgずつ0.8%ア ガ ロ ー ス ゲ ル 電 気 泳 動 に か け , ナ イ ロ ン メ ン プ ラ ン に 固 定 し た . プ レ ハ イ ブ リ ダ イ ゼ ー シ ョ ン 処 理 に は4XSSPE,l%SDS, 0.5%ス キムミルク, 0.5mg/ml  Herring  DN A, 50%ホ ル ム ア ミ ド を 含 む 緩 衝 液 を 用 い た . 処 理 温 度 は42

o C

, 処 理 時 間 は2時 間 な い し 一 晩 と し た . プ レ ハ イ ブ リ ダ イ ゼ ー シ ョ ン 後1 ラ ン ダ ム プ ラ イ マ 一 法 (Feinberg and  Vogelstein  1983)により 32p‑dCTPで 標 識 し たDNAク ロ ー ン を プ ロ ー プ と し て , ハ イ ブ リ ダ イ ゼ ー シ ョ ン 処 理 を 行 な っ た . 処 理 温 度 は420C, 処 理 時 間 は6時 間 な い し一晩 と し た . ハ イ プ リ ダ イ ゼ ー シ ョ ン 後 の 洗 浄 は , 420Cの0.2%SDSを含む 6X SSCで30分2回, 0.2%SDSを含む2XSSCで60分1回 と し た . た だ し , オ ー ト ラ ジ オ グ ラ ム 上 で

の シ グ ナ ル の 弱 い プ ロ ー プ を 用 い た 場 合 に は , O.2%SDSを含む2X SSCで の 洗

(12)

Tab1e 1‑1‑1.  Chromosoma1  assignment of RFLP  c10nes by 

risomic gene dosage ana1ysis  Chromosome  RFLP c10ne  (Npb) 1) 

54  96  130  147  252  314  802Ky33

42  58  223  227  250  349  48  51  173  249  392 

114  120  203  311  722Ky43

105  139  292  297 

12  135  172  209  342  832Kyl13

20  22  117  338  502

126  278  397  398  684

13  36  47  108  Ky73

10  37  127  291  333  685 896

11  44  52  78  183  189  12  88  124  148  193  336 

1)  RFLP  c10nes mapped on the RFLP  1 inkage map  (Sai to et  al. 

1991) . 

2)  Unmapped clone  (Saito  et al . unpublished). 

3)  New c10ne  (Yoshimura  et  al. unpub1ished). 

4)  By dosage analysis  in Nipponbare hybrid trisomics  alone. 

5)  By dosage analysis  inR24 hybrid trisomics  alone. 

6) ndica alle1e ofR24 hybridrisomics for chromosome  10  was missing probab1y due to de1E~tion of a DNA segment. 

(13)

SDSを含む2XSSCで30分2回 お よ び60分 l回 の 洗 浄 を 行 な っ た . 洗 浄 後 の ナ イ ロ ン メ ン プ ラ ン は オ ー ト ラ ジ オ グ ラ ム 用 の カ セ ッ ト に 増 感 紙 , X線 フ ィ ル ム と ともに装填し, ‑80tで3日 な い し は し 2週 間 感 光 さ せ て オ ー ト ラ ジ オ グ ラ ム をとった.

(4)遺 伝 子 量 効 果 の 検 出

日 本 型 品 種 目 本 晴 由 来 の ト リ ソ ミ ッ ク ス に イ ン ド 型 品 種IR24を 交 配 し て 得 ら れ た ト リ ソ ミ ッ クFlの 場 合 , 過 剰 染 色 体 部 分 で は , 日 本 晴 由 来 のDNAと IR24由来のDNAとが2:1の 割 合 で 存 在 す る . 従 っ て , そ の 過 剰 染 色 体 に 座 乗 す

るRFLPク ロ ー ン を 用 い て サ ザ ン ハ イ ブ リ ダ イ ゼ ー シ ョ ン を 行 な う と , オ ー ト ラ ジ オ グ ラ ム 上 の 日 本 晴 型 の バ ン ド と IR24型 の バ ン ド と の シ グ ナ ル 量 の 比 が 2: 1に な る と 期 待 さ れ る . 一 方 , RFLPク ロ ー ン が 過 剰 染 色 体 に 座 乗 し な い と

き に 期 待 さ れ る 日 本 晴 型 の バ ン ド とIR24型 の バ ン ド と の シ グ ナ ル 量 の 比 は1:1  で あ る . そ こ で , こ の 日 本 晴 型 の バ ン ド の シ グ ナ ル 量 の 相 対 的 な 差 を オ ー ト ラジオグラム上に見出すことにより, RFLPク ロ ー ン の 座 乗 染 色 体 を 決 定 し た . イ ン ド 型 品 種IR24の ト リ ソ ミ ッ ク ス に 日 本 型 品 種 ト ヨ ニ シ キ を 交 配 し て 得 た

トリソミックFlを 用 い た 場 合 も 同 様 に し た .

結 果 お よ び 考 察

本 研 究 で 用 い たDNAクローンは,主として, Saito et  al.  (1991)が イ ン ド 型 品種Kasalathと 日 本 型 標 識 遺 伝 子 系 統FL134と の 聞 にRFLPを見出して連鎖、地 図 作 成 に 利 用 し た も の で あ る . 本 研 究 で は , イ ン ド 型 品 種 にIR24を用い,ま た , 日 本 型 イ ネ に は 様 々 の 品 種 お よ び 系 統 を 用 い た の で , 実 験 に 先 立 っ て ,

(14)

ては日本晴とIR24と の 問 で も 多 型 が 見 出 さ れ た が , 残 り 25個 で は 見 出 さ れ な かった.本項では, RFLPの 見 出 さ れ た147個 の ク ロ ー ン の 中 か ら , 主 と し て ,

シ ン グ ル コ ピ ー の も の を56個 選 ん で 用 い た .

本 項 の 結 果 の 一 例 をFig. 111に示した.これは日本晴, IR24, ダ イ ソ ミ ツ クFl, お よ び , 日 本 晴 の ト リ ソ ミ ッ ク ス にIR24を 交 配 し て 得 ら れ た12型のト リソミツク FlのDNAを 制 限 酵 素EcoRVで 消 化 し て 各 レ ー ン に 配 し , RFLPクロ ーンNpb126を プ ロ ー プ と し て ハ イ ブ リ ダ イ ズ さ せ て 得 ら れ た オ ー ト ラ ジ オ グ ラ ム で あ る . 本 例 で は , 染 色 体8を 過 剰 染 色 体 と す る ト リ ソ ミ ッ ク Flの レ ー ン に お い て , 日 本 晴 型 の バ ン ド の シ グ ナ ル の 量 がIR24型 に 比 べ て 増 加 し て い た . よって, RFLPクローンNpb126は 染 色 体8に 座 乗 す る と 同 定 さ れ た . 同 様 に し て , 各 染 色 体 ご と に4個 か ら 6個 , 合 計56個 のRFLPク ロ ー ン に つ い て 座 乗 染 色 体 を 同 定 し た . 結 果 はFig.11‑2に ま と め て 示 し た .

本 実 験 に よ り , 染 色 体1,5, 7, 8, 9, 10に 対 応 す るRFLP連 鎖 群 が 新 た に 判 明 し た . ま た , 標 識 遺 伝 子 等 を 指 標 に し て , 対 応 す る 染 色 体 が 決 定 ま た は 推 定 さ れ て い たRFLP連 鎖 、 群 に つ い て も , そ の 結 果 を 再 確 認 す る こ と が で き た . 以 上 の 結 果 に よ り , イ ネ の12の 染 色 体 の そ れ ぞ れ に 対 応 す る 連 鎖 群 が す べ て 明らかになった.さらに, RFLP連 鎖 地 図 上 に 位 置 づ け ら れ て い な いNpb50, Npb72, Npb80, Npb83, Ky3, Ky4, Ky7お よ びKy11の 合 計8個 の ク ロ ー ン

に つ い て も 座 乗 染 色 体 を そ れ ぞ れ 推 定 す る こ と が で き た .

本実験の目的は, K i s h i m e t al.  ( 1 9 8 9 )の試作した 12のRFLP連 鎖 群 と イ ネの12の 染 色 体 と の 対 応 関 係 を 明 ら か に す る こ と で あ っ た . こ れ ら 12のRFLP 連鎖、群のうち, 6群 に つ い て は 座 乗 染 色 体 既 知 の 標 識 遺 伝 子 や ア イ ソ ザ イ ム

マ ー カ ー を 指 標 に し て , 染 色 体2,3,4,6,11, 12と の 対 応 関 係 が 決 定 さ れ ていた(Fig.112参 照 ) が , 本 実 験 の 結 果 , 染 色 体4の連 鎖 群は 染 色 体7の連 鎖 群 と 誤 り 結 ば れ て 1連 鎖 群 を 形 成 し て い た こ と が 明 ら か に な っ た . ま た , 染 色 体 と の 対 応 関 係 の 決 定 さ れ て い な か っ た6群のうち, 5群 は 本 実 験 で そ れ ぞ

(15)

PIP2 D 1 2 3 4 5 6 7 8 9 101112 

Fig.  1‑1‑1.  An autoradiogram  showing  the  gene  dosage  effec in Nipponbare  hybrid  trisomics.  An RFLP  clone  Npb126  was  assignedo chromosome  8 as エndicated by he increased  signal  for  the  Japonica  allele  inriplo 8.  DNAs  were  digesed wih EcoRV.  Pl:  Japonica  diploid  paren Nipponbare

, 

P2 : 工ndica diploid  parent

, 

IR24

, 

0:  a hybrid disomics  as he conrol.

Each  figure  represenS he exra chromosome  of  hybridrisomics (lanes  1‑12). 

(16)

2  3  5  6  7  8  9  10  11  12 

250  chl‑l  203  292  209  Rc  278  rDlDl  78  193 

338  20 

96  36 

3 .

139  124‑1 

48 

42  398  47  88 

336 

E.t‑2 

11:

311  117  44 

252  249 

126  13  108  397  ‑ Ky7 

Sdh‑l  .P 

105  22  183  172  ....  50  58  114 

127  148 

314  227  120 

Ph  189 

52  51  19  12 

Lap 

M 4

0J

q d  

  297 

223  349 

135  342  147 

130‑1 

トー..  ト...... 

I10cM 

83 

‑Ky11  ..;.. i 73 

54

‑ 80 

‑Ky3 

Fig.  1‑1‑2.  RFLP  markers  assigned  to their  respec七ive chromosomes  by七risomic gene  dosage  analysis.  The  prefix XNpb are  omitted.  50

, 

72

, 

80 and 

83 are  unlocated clones  (Saio et al.  unpublished).  Ky3

, 

Ky4

, 

Ky7  and Kyll are new genomic clones  (Yoshimura  et al. unpublished). 

(17)

れ 染 色 体

1

5

, 

8

, 

9

, 

1 0

に 対 応 づ け ら れ た が , 残 り の

1

群 は 染 色 体

4

に 対 応 す る こ と が 分 か っ た . 従 っ て , 染 色 体

4

に は 独 立 の

2RFLP

連 鎖 群 が 対 応 し て い た こ と が 判 明 し た . さ ら に , 染 色 体7については, Saito et  al.  (1991)の連鎖群と は独立に ,XNpb50‑XNpb178な る 連 鎖 群 ( 斎 藤 ら 未 発 表 ) が 見 出 さ れ た . 以 上のことから,

RFLP

連 鎖 地 図 は 多 数 の マ ー カ ー を 有 す る も の の , 連 鎖 関 係 の み に 依 存 し た 連 鎖 群 の 形 成 に は 限 界 が あ る こ と , ま た ,

RFLP

連 鎖 地 図 に ま だ 拡 充 の 余 地 の あ る こ と が 推 察 さ れ た .

近 年 , イ ネ に お い て も 組 換 自 殖 系 の 集 団 に よ る

RFLP

連 鎖 地 図 が 整 備 さ れ

(Tsunematsu et  al. 

1 9 9 3

, Xiao et  al.  1995),新 た な

RFLP

ク ロ ー ン の 座 位 を 決 定 す る こ と も 容 易 に な っ た . しかし,

RFLP

連 鎖 地 図 が イ ネ の ゲ ノ ム 全 領 域 に 対 応 で き て い る か ど う か は ま だ 明 ら か で な い の で , 既 存 の 連 鎖 地 図 に 位 置 づ けられている

RFLP

ク ロ ー ン と の 聞 に 連 鎖 の 検 出 さ れ な い

RFLP

ク ロ ー ン の 見 出 さ れ る 可 能 性 は ま だ 残 さ れ て い る . こ の よ う な

RFLP

ク ロ ー ン の 座 乗 染 色 体 を 決 定 す る の に , 本 項 で 述 べ た , 遠 縁 交 雑 に よ る ト リ ソ ミ ッ ク

F l

の 遺 伝 子 量 効 果 を 利 用 し た 方 法 は 有 用 で あ る と 考 え ら れ る .

な お , 日 本 型 品 種 目 本 晴 の ト リ ソ ミ ッ ク ・ シ リ ー ズ に イ ン ド 型 品 種

IR24

を 交 配 し て 作 出 し た ト リ ソ ミ ッ ク

F l

の シ リ ー ズ は い ず れ も 日 本 晴 の ト リ ソ ミ

ックスよりも生育旺盛で, DNA抽 出 用 の 成 葉 の 採 取 は 容 易 で あ っ た . これは 遠 縁 交 雑 後 代 に 見 ら れ る 雑 種 強 勢 で あ る と 考 え ら れ た . ま た , 過 剰 染 色 体 の 種 類 に よ る 植 物 体 の 形 態 的 特 徴 は 概 ね 日 本 晴 の ト リ ソ ミ ッ ク ス の シ リ ー ズ に 一 致 し た の で , 分 離 集 団 か ら の ト リ ソ ミ ッ ク ス の 選 抜 は こ れ に よ っ た . 過 剰 染 色 体 の 種 類 に よ る ト リ ソ ミ ッ ク ス の 形 態 的 特 徴 は , 日 印 交 雑 に よ っ て も , 基 本 的 に は 変 化 し な い と 考 え ら れ た .

本 研 究 で は , 日 本 型 品 種 日 本 晴 の ト リ ソ ミ ッ ク ス に イ ン ド 型 品 種

IR24

を交

(18)

F l

を利用した. こ れ ら 両 方 の ト リ ソ ミ ッ ク

F l

を 用 い て 座 乗 染 色 体 の 決 定 を 行 な っ た 際 に , い く つ か のRFLPク ロ ー ン に つ い て は , 以 下 に 述 べ る よ う な 相 違 が見出された.

染 色 体1では, Npb96, Npb252, Npb147お よ びNpb54の4クローンについて,

日 本 型 品 種 目 本 晴 の ト リ ソ ミ ッ ク ス に イ ン ド 型 品 種IR24を 交 配 し て 得 ら れ た トリソミツク

F l

の シ リ ー ズ , な ら び に , イ ン ド 型 品 種IR24の ト リ ソ ミ ッ ク ス に 日 本 型 品 種 ト ヨ ニ シ キ を 交 配 し て 得 ら れ た9型 の ト リ ソ ミ ッ ク

F l

の 両 方 を 用 い て , 座 乗 染 色 体 の 決 定 を 行 な っ た . 日 本 晴 の ト リ ソ ミ ッ ク ス にIR24を 交 雑

し て 得 ら れ た ト リ ソ ミ ッ ク

F l

を 用 い た 場 合 に は 4ク ロ ー ン と も に , 染 色 体1 に 関 し て 遺 伝 子 量 効 果 が 検 出 さ れ た が , IR24の ト リ ソ ミ ッ ク ス に ト ヨ ニ シ キ を 交 雑 し て 得 ら れ た ト リ ソ ミ ッ ク

F l

を用いたときには, Npb96とNpb252とで 遺 伝 子 量 効 果 が 検 出 さ れ な か っ た . こ れ はIR24の 染 色 体1の ト リ ソ ミ ッ ク ス の 過 剰 染 色 体 に 欠 失 が 起 こ っ て い る た め で あ る と 考 え た .

染 色 体11では, Np b78および、Npb44について, IR24の ト リ ソ ミ ッ ク ス に ト ヨ ニ シ キ を 交 雑 し て 得 ら れ た ト リ ソ ミ ッ ク

F l

を3個 体 用 い て 遺 伝 子量効 果 の 検 出 を 行 な っ た が , こ の 中 の1個体は, Npb44を プ ロ ー ブ と し た 場 合 に , 遺 伝 子 量 効 果 が 検 出 さ れ な か っ た . こ れ はIR24の 染 色 体11に 関 す る ト リ ソ ミ ッ ク ス

に 欠 失 の あ る 過 剰 染 色 体 を 有 す る も の が 存 在 す る た め で あ る と 考 え ら れ た . また, Np b68に つ い て は , 日 本 晴 の ト リ ソ ミ ッ ク ス 由 来 の ト リ ソ ミ ッ ク

F l

を 用 い た 場 合 は 染 色 体8に, IR24の ト リ ソ ミ ッ ク ス 由 来 の ト リ ソ ミ ッ ク

F l

を用 い た 場 合 は 染 色 体10に , そ れ ぞ れ 遺 伝 子 量 効 果 が 検 出 さ れ た . IR24の 染 色 体8

に 関 す る ト リ ソ ミ ッ ク ス の 過 剰 染 色 体 に 欠 失 が あ り , そ の 一 方 で , 染 色 体10

に 関 す る ト リ ソ ミ ッ ク ス の 過 剰 染 色 体 に 染 色 体8の 一 部 が 転 座 し て い た と す れ ば , こ の よ う な 結 果 の 得 ら れ る 可 能 性 が あ る .

さらに, IR24の 染 色 体10に関する ト リ ソ ミ ッ ク ス 由 来 の ト リ ソ ミ ッ ク

F l

は, 染 色 体10に 座 乗 す るNpb89をプロ ー ブ と し た 場 合に, IR24型 の バ ン ド が オ ー

(19)

ト ラ ジ オ グ ラ ム 上 に 現 れ な か っ た . こ れ は , 染 色 体10に 関 す る IR24の ト リ ソ ミ ッ ク ス の 染 色 体 か ら , Npb89に 相 当 す る DNA配 列 が 欠 失 し て い る た め で あ る と 考 え ら れ た .

第2項 RFLPを 示 さ な いDNAク ロ ー ン の 座 乗 染 色 体 決 定

Young et  al.  (1987)は ト マ ト のRFLP連 鎖 地 図 を 作 成 す る た め のDNAク ロ ー ン の 座 乗 染 色 体 を 純 系 の ト リ ソ ミ ッ ク ス を 用 い て 決 定 し た . そ の 際 , トリソ ミ ッ ク ス の 遺 伝 子 量 効 果 を 検 出 す る た め に , 以 下 の よ う な 方 法 を と っ て い る . す な わ ち , 別 の 染 色 体 に 座 乗 し , か つ , オ ー ト ラ ジ オ グ ラ ム 上 で の バ ン ド の 位 置 の 異 な る ク ロ ー ン を 数 個 , 同 時 に サ ザ ン ハ イ ブ リ ダ イ ゼ ー シ ョ ン に 供 し ,

あるDNAク ロ ー ン に 由 来 す る バ ン ド の シ グ ナ ル 量 の 変 化 を , 別 のDNAク ロ ー ン に 由 来 す る バ ン ド の シ グ ナ ル 量 を 指 標 に し て 見 出 す 方 法 で あ る . 本 項 で は , こ の 方 法 に 準 じ , 前 項 で 述 べ た ト リ ソ ミ ッ ク スFlの 両 親 で あ る 日 本 型 品 種 目 本 晴 あ る い は ト ヨ ニ シ キ と イ ン ド 型 品 種IR24と の 間 で 多 型 を 示 さ な いDNAク

ロ ー ン に つ い て , 座 乗 染 色 体 の 決 定 を 行 な っ た .

材 料 お よ び 方 法

(1)供試イネ

イ ン ド 型 品 種IR24の ト リ ソ ミ ッ ク ス ( 小 川 ら 未 発 表 ) に 日 本 型 品 種 ト ヨ ニ シ キ を 交 配 し て 得 ら れ た9型 の ト リ ソ ミ ッ クFlを 用 い た . こ の9型 の ト リ ソ ミ ッ 夕 刊 は そ れ ぞ れ 染 色 体1,S, 6, 7, 8, 9, 10, 11お よ び12を 過 剰 染 色 体 と す る も の で あ っ た .

(20)

(2)DNAク ロ ー ン

IR24と ト ヨ ニ シ キ と の 問 でRFLPの 手 会 出 さ れ な か っ た ク ロ ー ン あ る い は 制 限 酵 素 と ク ロ ー ン と の 組 合 せ を 利 用 し た . い ず れ も , オ ー ト ラ ジ オ グ ラ ム 上 の バ ン ド の 位 置 が 互 い に 重 な ら な い よ う に ク ロ ー ン を 2個選択し, こ れ を 混 合 し て 標 識 し , サ ザ ン ハ イ プ リ ダ イ ゼ ー シ ョ ン に 供 し た .

(3)サ ザ ン ハ イ ブ リ ダ イ ゼ ー シ ョ ン は 前 項 に 準 じ た .

(4)遺 伝 子 量 効 果 の 検 出

イ ネ は 二 倍 体 で あ る の で , あ るDNAク ロ ー ン に 相 当 す るDNA量 を2とすると,

ト リ ソ ミ ッ ク ス の 過 剰 染 色 体 に 座 乗 す るDNAク ロ ー ン に 相 当 す るDNA量 は3で ある.従って, ト リ ソ ミ ッ ク ス よ り DNAを抽出し, DNAク ロ ー ン を プ ロ ー ブ と し て サ ザ ン ハ イ ブ リ ダ イ ゼ ー シ ョ ン を 行 な っ た 場 合 , そ のDNAク ロ ー ン が 過 剰 染 色 体 に 座 乗 す る な ら ば オ ー ト ラ ジ オ グ ラ ム 上 に 期 待 さ れ る バ ン ド の シ グ ナ ル 量 は3 座 乗 し な い な ら ば2で あ る . そ こ で , オ ー ト ラ ジ オ グ ラ ム 上 で , 選 択 し た2個 のDNAク ロ ー ン に 由 来 す る2種 類 の バ ン ド の シ グ ナ ル 量 を 同 一 レ ー ン 内 で 相 互 に 比 較 し , バ ン ド の シ グ ナ ル 量 の 相 対 的 な 差 を 見 出 す こ と

により, ト リ ソ ミ ッ ク ス の 過 剰 染 色 体 に 起 因 す る 遺 伝 子 量 効 果 を 検 出 し た .

結 果 お よ び 考 察

本 項 の 結 果 の 一 例 をFig.11‑3に 示 し た . こ れ はIR24, トヨニシキ,および,

IR24の ト リ ソ ミ ッ ク ス に ト ヨ ニ シ キ を 交 配 し て 得 た9型 の ト リ ソ ミ ッ ク Flの DNAを 制 限 酵 素HindIIIで 消 化 し て 各 レ ー ン に 配 し , DNAク ロ ー ンNpb25(上)

とNpb27(下 ) と を 併 せ て プ ロ ー プ と し て , ハ イ ブ リ ダ イ ズ さ せ て 得 ら れ た オ ー ト ラ ジ オ グ ラ ム で あ る . 本 例 で は , Npb25とNpb27と の バ ン ド の シ グ ナ ル量の

(21)

Pl P2 1 6 5 12  7 B 9 10 11 

RJ

4

b b  

p p  

N N  

Fig.  1‑1‑3.  An autoradiograrn  showinghe gene dosage  effec in IR24  hybrid trisornics.  DNA clones  Npb25  and Npb27  were  assignedo chrornosomes  5 and  6 respecively as  indicaed byhe increased  signals.  DNAs  were  digesed with HindIII. Pl:  Indica  diploid paren

IR24

, 

P2:  Japonica  diploid  paren Toyonishiki.

Each  figure  represenS he exra chrornosorne  of  hybrid trisornics. 

(22)

比 を レ ー ン ご と に 比 較 す る と , 染 色 体5を 過 剰 染 色 体 と す る ト リ ソ ミ ッ ク Flの レーンにおいて, Np b25の バ ン ド の シ グ ナ ル 量 に 増 加 が 認 め ら れ た . よ っ て ,

Npb25は 染 色 体5に 座 乗 す る こ と が 判 明 し た . ま た , Npb27は 染 色 体6を 過 剰 染 色 体 と す る ト リ ソ ミ ツ ク Flの レ ー ン に シ グ ナ ル 量 の 増 加 が 認 め ら れ , 染 色 体6に 座 乗 す る こ と が 判 っ た . 同 様 に し て , Npb121お よ びNpb88も , そ れ ぞ

れ 染 色 体 lお よ び 染 色 体12に 座 乗 す る こ と が 確 認 さ れ た(Table1‑12). 

こ れ ま で , イ ネ のRFLP連 鎖 地 図 作 成 に 当 た っ て は , RFLPを 検 出 し や す い よ う に 日 印 交 雑 の 後 代 を 用 い て い る が , そ れ で も , ゲ ノ ミ ッ ク ラ イ ブ ラ リ ー か ら 選 抜 し た ク ロ ー ン の 中 に は , RFLPの 検 出 さ れ な い も の が 多 く 含 ま れ る .

Yano et  al.  (1990)は ,Pst 1ゲ ノ ミ ッ ク ラ イ ブ ラ リ ー か ら 選 抜 し た ク ロ ー ン に つ い て , 日 本 型 標 識 遺 伝 子 系 統FL134お よ び イ ン ド 型 品 種KasalathのDNAと4

種 類 の 制 限 酵 素 と の 組 合 せ でRFLPの 検 出 を 行 な っ た 結 果 , オ ー ト ラ ジ オ グ ラ ム 上 に バ ン ド の 現 れ る472クローンの内, 210ク ロ ー ン がRFLPを 示 さ な か っ た と 報 告 し て い る . 現 在 の と こ ろ , こ の よ う な ク ロ ー ン は 連 鎖 地 図 作 成 に 用 い る こ と が で き な い が , 近 年 , 栽 培 稲 と 野 生 稲 と の 交 雑 後 代 を 用 い たRFLP連 鎖 地図(Huangand Kochert 1994, Jena et al.  1994, Causse et al.  1994)が 作 成 さ れ て い る よ う に , 連 鎖 地 図 作 成 の 材 料 も 多 様 化 し て い る の で , 今 後 , 日 印 間 でRFLPの 見 ら れ な い ク ロ ー ン で も 栽 培 稲 と 野 生 稲 と で は 新 た にRFLPが 見 出 さ れ , 連 鎖 、 地 図 作 成 の マ ー カ ー た り 得 る こ と も 考 え ら れ る . こ の よ う な 場 合 に は ? 本 項 で 述 べ た 方 法 で ク ロ ー ン の 座 乗 染 色 体 を 決 定 す る こ と が 有 効 で あ る . な お , 異 数 性 半 数 体 や テ ト ラ ソ ミ ッ ク ス 等 の 遺 伝 子 量 効 果 の 大 き い 異 数 体 を 利 用 す れ ば RFLPを 示 さ な い ク ロ ー ン の 座 釆 染 色 体 を 更 に 簡 明 に 決 定 す る こ と が で き る(Wan g e t al.  1995). また, RFLPが 不 安 で あ る の で , 純 系 の 異 数 体 に お い て 遺 伝 子 量 効 果 を 検 出 し そ の 染 色 体 の 重 複 ・ 欠 失 を 推 定 す る 際 に も , こ の 方 法 は 有 効 で あ る と 考 え ら れ る .

(23)

Tab1e 1‑1‑2. Chromosoma1  assignment  of monomorphic  c10nes  by trisomic  gene  dosage  ana1ysis  identified  by  "within‑1ane"  comparison  between  the  hybridizaion signa1s  of  different  size  derived from respective DNA c10nes 

Chromosome 

14RdUι

司 ム

C10ne  (Npb)  121 

25  27  88 

(24)

第2節 RFLPを 利 用 し た 異 数 体 の染 色体構 造の推 定

第1節では, ト リ ソ ミ ッ ク ス の 遺 伝 子 量 効 果 を 利 用 し てRFLPクロ ーンの座 乗染色体を決定し, RFLP連 鎖 群 と 染 色 体 と の 対 応 関 係 を 明 ら か に し た が , 一 旦, RFLP連 鎖 地 図 が 構 築 さ れ れ ば , 逆 に , RFLPマ ー カ ー を 使 っ て 染 色 体 の 重 複 ・ 欠 失 を 遺 伝 子 量 効 果 に よ り 検 出 し , 異 数 体 や 染 色 体 構 造 変 異 体 の 染 色 体 構 造 を 推 定 す る こ と も 可 能 で あ る と 考 え ら れ る . 本 節 で は , 若 干 の 異 数 体 について, RFLPを 利 用 し た 分 析 を 行 な っ た の で , そ れ に つ い て 述 べ る . な お , 本 節 で は , 二 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス 等 , 他 の 種 類 の ト リ ソ ミ ッ ク ス と の 区 別 を 明 確 に す る た め に , こ れ ま で 単 に ト リ ソ ミ ッ ク ス と 称 し て き た も の に つ い て , 一 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス の 語 を 用 い る こ と に す る .

第1項 一 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス の 交 雑 後 代 に 出 現 し た 二 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス 様 植 物 について

染 色 体8を 過 剰 染 色 体 と す る 日 本 型 品 種 日 本 晴 の 一 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス に イ ン ド型品種IR24を 交 配 し て 得 ら れ たFl個 体 群 の 中 に , 染 色 体8の 一 次 ト リ ソ ミ ッ クFlとは形態、のやや異なる変異体が 1個 体 出 現 し た . 一 次 ト リ ソ ミ ッ クFlに比 べ 草 丈 は 低 く , 穂 、 は 小 さ く , 粒 は や や 小 さ く , 全 体 的 に 見 て や や 小 型 で あ っ

た . ま た , 葉 の 捲 き 方 の 程 度 が や や 大 き く 種 子 稔 性 は 一 次 ト リ ソ ミ ッ クFl が約38%で あ っ た の に 対 し , 変 異 体 は 約6%で あ っ た . そ こ で こ の 変 異 体 に つ い て , 減 数 分 裂 第 一 中 期 に お け る 染 色 体 観 察 を 行 な う と と も に , RFLP分 析 を行な っ て 遺 伝 子量効 果 を 検 出 し , 通 常 の一次 ト リ ソ ミ ッ クFlと比較 した.

(25)

材 料 お よ び 方 法

(1)供試イネ

染 色 体8を 過 剰 染 色 体 と す る 日 本 型 品 種 目 本 晴 の 一 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス に イ ン ド型品種1R24を 交 配 し て 得 ら れ たFlに 出 現 し た 変 異 体 , お よ び , 同 交 配 で 得 ら れ た 一 次 ト リ ソ ミ ッ クFlを供試した.

(2)DNAクローン

Saito et al.  (1991)のRFLP連 鎖 地 図 で 染 色 体8の 連 鎖 群 に 所 属 す るRFLPクロ ーンを 12個 用 い た . 配 列)1¥買にこれを示すと, Npb278, Npb68, Npb330, 

Npb38, Npb41, Npb104, Npb369, Npb398, Npb126, Npb187, Npb56お よび、Npb397である.

(3)サ ザ ン ハ イ ブ リ ダ イ ゼ ー シ ョ ン , (4)遺 伝 子 量 効 果 の 検 出 は 本 章 第1節 第1項 に準じた.

(5)染 色 体 観 察

ア セ ト カ ー ミ ン 押 し 潰 し 法 に よ っ た .

結 果 お よ び 考 察

ま ず , 今 回 出 現 し た 変 異 体 , お よ び , 染 色 体8を 過 剰 染 色 体 と す る 一 次 トリ ソ ミ ッ 夕 刊 の 減 数 第 一 分 裂 中 期 に お け る 染 色 体 観 察 を 行 な っ た . そ の 結 果 は

Table 1‑2‑1 に ま と め た . 変 異 体 は 染 色 体 数 が25で あ っ た の で トリソミック

(26)

t ..... 

Table  1‑2‑1.  Chromosomal  configuration  a meaphase 1 inhe hybrid primary 

risomics for chromosome  8 and a related varian a secondary‑

trisomic  like plan

Chromosome  confguration a mataphase 1  Number of cells  1111 + 1111  1211 + 11  observed 

Primary trisomics  27  (52宅) 25  (48毛) 52 

Varian 13  (32毛) 28  (68宅) 41 

(27)

た が , そ の 頻 度 に は 違 い が 見 ら れ た . す な わ ち , 一 次 ト リ ソ ミ ッ ク Flで は 1111+1111が52%,1211+11が48%で あ っ た が , 変 異 体 で は そ れ ぞ れ320/0,68% 

で あ っ て , 三 価 染 色 体 の 形 成 頻 度 が 低 く , 一 価 染 色 体 の 形 成 頻 度 が 高 く な っ て い た . こ の こ と か ら , 今 回 出 現 し た 変 異 体 で は , 過 剰 染 色 体 の 構 造 に 何 ら か の 変 化 の 生 じ て い る こ と が 推 察 さ れ た .

次 に , こ の 変 異 体 に つ い てRFLP分 析 を 行 な っ た . 結 果 は Fig. 1‑2‑1にまと め て 示 し た . 右 側 に 示 し た オ ー ト ラ ジ オ グ ラ ム は , 日 本 晴 , IR24,ダイソミ ツクFl, 染 色 体8に 関 す る 一 次 ト リ ソ ミ ッ 夕 刊 な ら び に 今 回 出 現 し た 変 異 体 を 各レーンに配し, RFLPクローンNpb369お よ びNpb398を プ ロ ー ブ と し て 得 た サ ザ ン ハ イ プ リ ダ イ ゼ ー シ ョ ン の 結 果 で あ る .

Npb369を プ ロ ー プ と し た 場 合 , 一 次 ト リ ソ ミ ッ クFlの レ ー ン で は 日 本 晴 型 の バ ン ド の シ グ ナ ル 量 に 増 加 が 認 め ら れ た が , 変 異 体 の レ ー ン で は , 日 本 晴 型 の バ ン ド の シ グ ナ ル 量 が , 一 次 ト リ ソ ミ ッ クFlに 期 待 さ れ る シ グ ナ ル 量 よ

りも,著しく増加していた.これと同様の結果が ]~pb278 , Npb68, Npb330,  Npb38, Npb41お よ びNpb104に つ い て も 得 ら れ た .

一方, Npb398を プ ロ ー プ と し た 場 合 , 一 次 ト リ ソ ミ ッ クFlの レ ー ン で は Npb369の 場 合 と 同 じ く , 日 本 晴 型 の バ ン ド の シ グ ナ ル 量 に 増 加 が 認 め ら れ た が , 変 異 体 の レ ー ン で は こ の よ う な シ グ ナ ル 量 の 変 化 は 認 め ら れ ず , ダ イ ソ ミック Flと 同 じ 結 果 で あ っ た . こ れ と 同 様 の 結 果 がNpb126,Npb187,  Npb56および、Npb397についても

f

尋られた.

以 上 の 結 果 か ら , 今 回 出 現 し た 変 異 体 の 過 剰 染 色 体 に は , 重 複 と 欠 失 と が 存 在 す る と 考 え ら れ た . こ れ を RFLP連 鎖 地 図 上 で 表 す と , 重 複 部 分 は XNpb278‑XNpb68l‑XNpb330‑XNpb38‑XNpb41‑XNpbl04‑

X Npb369の 領 域 で あ り , 欠 失 部 分 はXNpb398‑XNpb126‑XNpb187‑

(28)

278  68‑1 

330  38  41 

104 

369  398 

126  187 

Qd η 

画 ︑

J11

3h 

b  P  N 

Npb~~98

Pl  P2  D  T  V 

Pl:  Nipponbare  P2:  R24

I 0 I

cM  disomic Fl 

56  hybridriplo 8 

397  v  varian

Fig.  1‑2‑1.  RFLP  gene  dosage  analysis  of  a  variant:  a  secondary一七risomic like  plan for chromosome  8.  RFLP  clones  used  in  this  sudy are  shown  by  the 

locus name without XNpb. 

仁コ

no dosage effect 

‑ 圃

more increased dosage effec

(29)

今 回 出 現 し た 染 色 体8に 関 す る 二 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス 様 植 物 は , 同 染 色 体 に 関 す る 日 本 型 品 種 日 本 晴 の 一 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス に イ ン ド 型 品 種IR24を 交 配 し て 得られたFlに 偶 発 し た も の で あ っ た . そ の 後 , 同 様 の 交 配 を 行 な っ て 反 覆 実 験を試みたところ,

1 1 6

個 体 のFlの 中 に 同 様 の 変 異 体 が

1

個 体 出 現 し た . こ れ の

RFLP

分 析 を 行 な っ た と こ ろ , 染 色 体

8

に 関 す る 二 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス 様 植 物 に 一 致 す る 結 果 が 得 ら れ た . こ の こ と か ら , 染 色 体8に 関 す る 二 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス 様 植 物 は , 同 染 色 体 に 関 す る 一 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス の 後 代 に , 一 定 の 割 合 で 出 現 す る 可 能 性 の あ る こ と が 考 え ら れ た .

Belling and Blakeslee (1924)は , シ ロ パ ナ ヨ ウ シ ュ チ ョ ウ セ ン ア サ ガ オ に お い て , 一 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス の 後 代 よ り 二 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス を 得 て い る の で , 今 回 出 現 し た 二 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス 様 植 物 が 二 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス で あ る 可 能 性

は 高 い . 二 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス に は 特 異 的 な 染 色 体 対 合 像 が 知 ら れ て い る ( Khush 1973 ) の で , 今 回 出 現 し た 二 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス 様 植 物 が 二 次 ト リ ソ ミ

ッ ク ス で あ る こ と を 確 認 す る た め に は , 今 後 , 染 色 体 対 合 像 の 観 察 が 必 要 で ある.

2

項 染 色 体

1 1

に関する

4

型 の ト リ ソ ミ ッ ク ス の

RFLP

分 析

1 w a a e t al.  ( 1 97 0 ) は , 日 本 型 イ ネ を 用 い て , 同 質 三 倍 体 な ら び に 相 互 転 座 ヘ テ ロ 個 体 の 後 代 よ り , イ ネ に 期 待 さ れ る 12型 の ト リ ソ ミ ッ ク ス を 成 熟 期 の 形 態 的 特 徴 に よ っ て 分 離 ・ 同 定 し , そ れ ぞ れ に ア ル フ ア ベ ッ ト の 一 文 字 を 冠 してA‑‑‑L型 と 名 づ け た . しかし,その後, Kurata et  al.  (1981)は こ れ ら の ト リ ソ ミ ッ ク ス の 過 剰 染 色 体 の 同 定 を 行 な い , G型 1型 J型 お よ びK型 の4型 が , い ず れ も 染 色 体11を 過 剰 染 色 体 と し て い る こ と を 見 出 し た . し か し , 同

(30)

行 な い , 遺 伝 子 量 効 果 を 検 出 す る こ と に よ っ て 過 剰 染 色 体 の 構 造 を 調 査 し た . ここで, 1 w a t a e t al.  ( 1 970)の記載に従って, 0型, 1型, J型 お よ びK型 の4型 の ト リ ソ ミ ッ ク ス の 形 態 的 特 徴 を 述 べ れ ば , 以 下 の よ う で あ る .

G型 : や や 濃 緑 葉 , 出 穂 、 晩 , 籾 や や 粗 剛 , 輝 黄 色 粒 , 脱 粒 易 高 稔 性 で ダ イ ソ ミ ッ ク ス か ら の 判 別 困 難 .

I型 : 草 丈 低 , 出 穂 晩 .

J型 : や や 細 稗 , 黄 褐 着 色 稗 , 出 穂 後 葉 身 に 褐 斑 を 生 ず る .

K型 : 草 型 ほ ぼ 正 常 で ダ イ ソ ミ ッ ク ス か ら の 判 別 困 難 , 出 穂 、 や や 晩 .

材料および、方法

(1)供 試 イ ネ

日 本 型 品 種 愛 国 の 同 質 三 倍 体 に 由 来 す る G型'. 1型 J型 お よ びK型 の4型 の ト リ ソ ミ ッ ク ス に イ ン ド 型 品 種IR24を 交 配 し て 得 ら れ た そ れ ぞ れ の 型 の ト

リソミックFlを 供 試 し た .

(2)DNAクローン

S ai to  e al.  ( 1991 )のRFLP連 鎖 地 図 で 染 色 体11の 連 鎖 群 に 所 属 す るRFLPク ロ ー ン の う ち , 愛 国 とIR24と の 間 で 適 当 な 多 型 を 示 し た10個 を 用 い た . 連 鎖 地 図 で の 配 列 順 に こ れ を 示 す と Npb389,Npb78, Npb85, gmZ410, Npb202, 

Npb44, Npb183, Npb205, Npb189お よ びNpb52で あ っ た .

(3)サ ザ ン ハ イ ブ リ ダ イ ゼ ー シ ョ ン は 第1章に, (4)遺 伝 子 量 効 果 の 検 出 は 本 章 第1節 第1項 に 準 じ た .

(31)

結 果 お よ び 考 察

愛国, IR24, ダ イ ソ ミ ッ ク Flお よ び2個 体 ず つ のG型 1型 J型, K型 の 各 トリソミツク Flを 各 レ ー ン に 配 し , RFLPク ロ ー ンNpb78,Npb202お よ び Npb44を ハ イ ブ リ ダ イ ズ し て 得 た 結 果 を Fig. 1‑2‑2に 示 し た . 以 下 , ク ロ ー ン 毎 に 結 果 を 述 べ る .

(l)Npb78 

G型 の レ ー ン で は , 一 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス に 期 待 さ れ る 遺 伝 子 量 効 果 が 検 出 さ れたが, 1型 お よ びK型 で は 検 出 さ れ な か っ た . さ ら に , J型 で は 一 次 ト リ ソ ミ

ッ ク ス に 期 待 さ れ る よ り も 過 剰 な 遺 伝 子 量 効 果 が 検 出 さ れ た . Npb389,  Npb85および、gmZ410で も 同 様 の 結 果 が 得 ら れ た .

(2)Npb202 

G型 の レ ー ン で は , 一 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス に 期 待 さ れ る 遺 伝 子 量 効 果 が 検 出 さ れ た が , 残 り のI型 J型 お よ びK型 で は 検 出 さ れ な か っ た . Np b202以 外 に 同 様 の 結 果 の 得 ら れ た ク ロ ー ン は な か っ た .

(3)Npb44 

G型, 1型 お よ びK型 の レ ー ン で は , 一 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス に 期 待 さ れ る 遺 伝 子 量 効 果 が 検 出 さ れ た が , J型 で は 検 出 さ れ な か っ た . Npb183, Npb205,  Npb189および、Npb52で も 同 様 の 結 果 が 得 ら れ た .

以 上 の 結 果 を ま と め る と 以 下 の よ う に な る(Fig.1‑2‑2). G型 は 供 試 し た ク ロ

(32)

389 78  85‑2 

gmZ410 

202  44 

183  205 

189  52 

Npb78  Pl P2 D 

Npb202  Pl.P2 D 

Npb44  Pl P2 D 

Pl:  Aikoku  P2: R24

D  disomic Fl 

r1 

r‑‑1 

J K 

r1  r1  r1 

J

r‑,  r rー寸

J

i r‑・,.‑,

G

, 工 ,

J and K: risomicypes

Fig.  1‑2‑2.  RFLP  gene  dosage  analysis  of  4  types  of  trisomics

, 

G

, 

1

, 

and K

, 

having  chromosome  11  as  an  exra chromosome.  RFLP  clones  used  in  this  study  are  shown  by  the  locus  name  without XNpb. 

仁 コ

no dosage effect 

f7J:  trisomic gene dosage: effec 園田 more increased dosage effec

(33)

型 お よ び K型 は , と も に ,XNpb44‑XNpb183‑XNpb205‑XNpb189‑

XNpb52の 領 域 で , 一 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス に 期 待 さ れ る 遺 伝子 量 効 果 が 検 出 さ れ たが ,XNpb389‑XNpb78‑XNpb852‑gmZ410‑XNpb202の 領 域 で は ダ イ ソミツクFlと 同 様 の 結 果 で あ っ た . よって 1型 お よ びK型は, と も に , 過 剰 染色体のXNpb389‑XNpb78‑XNpb852‑gmZ410 ‑XNpb202部 分 の 欠 失 し た ア ク ロ ト リ ソ ミ ッ ク ス 様 植 物 , あ る い は , テ ロ ト リ ソ ミ ッ ク ス 様 植 物 で あ ると考えられた.さらに, J型 は

X

Npb38 

9  ‑X 

Npb78 ‑

Npb85 

‑2‑

gmZ41 0の 領 域 で 一 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス に 期 待 さ れ る よ り も 過 剰 な 遺 伝 子 量 効 果 が 検 出 さ

れ,XNpb44 ‑

Npb183 ‑

Npb205 ‑XNpb189 ‑

Npb52の 領 域 で は ダ イ ソ ミックFlと 同 様 の 結 果 で あ っ た . よ っ て , J型 は 過 剰 染 色 体 のXNpb389‑ XNpb78‑XNpb852‑gmZ410部 分 の 重 複 し た 二 次 ト リ ソ ミ ッ ク ス 様 植 物 で あ

ると考えられた.

以 上 述 べ た よ う に , 染 色 体11に関して4型 の ト リ ソ ミ ッ ク ス が 存 在 す る の は , 過 剰 染 色 体 に 生 じ た 重 複 ・ 欠 失 の た め で あ る と 考 え ら れ た . 1型 と K型 と で RFLP分 析 の 結 果 が 同 じ で あ っ た の は , 今 回 供 試 し たRFLPク ロ ー ン だ け で は 検 出 さ れ な い ほ ど の 狭 い 領 域 , あ る い は , RFLP連 鎖 地 図 の 包 含 し て い な い 領 域 で の , 過 剰 染 色 体 の 欠 失 あ る い は 重 複 に よ る と 考 え ら れ る . ま た , Npb202 

の結果は, 1型, J型 お よ びK型 の 過 剰 染 色 体 に 起 こ っ て い る 欠 失 が 原 因 で あ る と 考 え ら れ る . こ れ ら の 結 果 に つ い て は 更 な る 検 討 が 必 要 で あ る .

な お , 本 実 験 で 用 い たG型, 1型,

J

型 お よ びK型 の ト リ ソ ミ ッ クFlの そ れ ぞ、 れ の 植 物 体 の 形 態 的 特 徴 は , 交 配 親 で あ る 日 本 型 品 種 愛 国 の G型 1型, J型お

よびK型 の ト リ ソ ミ ッ ク ス の 形 態 的 特 徴 に 概 ね 一 致 し た . 過 剰 染 色 体 の 種 類 や 重複 ・欠失による形態、的特徴は,遠縁交雑を行なった場合でも, 基本 的 に は 変化 し な い と 考 え ら れ た .

(34)

第2章 従 来 の 連 鎖 地 図 とRFLP連鎖 地図との統 合

イ ネ の 連 鎖 分 析 は 古 く か ら 行 な わ れ , 現 在 で は , 12の 染 色 体 す べ て に つ い て , 形 態 形 質 , 葉 緑 体 形 質 , 着 色 形 質 , 生 理 形 質 等 の 標 識 遺 伝 子 か ら 成 る連 鎖地図(従来の連鎖地図, Clas sical  linkage map)が 作 成 さ れ て い る(Iwataet  al.  1984, 1989a, 1989b). 一方,近年に至って, DNAの 多 型 を マ ー カ ー と し た 連鎖地図(RFLP連鎖地図, RFLP linkage  map)が イ ネ に お い て も い く つ か 作 成 されている(McCouchet  al.  1988, Saito et  al.  1991, Kurata et  al.  1994,  Causse et al.  1994). 

現 在 の と こ ろ , 従 来 の 連 鎖 地 図 とRFLP連 鎖 地 図 と は , そ れ ぞ れ 独 立 に 存 在 し て い る が , こ れ ら の 連 鎖 地 図 が 統 合 さ れ れ ば , イ ネ の 遺 伝 子 連 鎖 地 図 が 充 実するだけでなく, RFLPマ ー カ ー を 指 標 と し た 有 用 形 質 の 間 接 選 抜 や 染 色 体 歩 行 に よ る 遺 伝 子 の 単 離 等 , 遺 伝 ・ 育 種 学 上 の 基 礎 的 ・ 応 用 的 研 究 の 発 展 に 寄 与 す る と こ ろ は 大 で あ る と 考 え ら れ る .

イネにおいては,これまでにも, S a i t e t al.  ( 1 9 9 1 ) や Kishimotoet  al.  (1992 )がいくつかの標識遺伝子と RFLPマ ー カ ー と の 連 鎖 分 析 を 行 な っ て お り ,

さらに, Yu et  al.  (1995)は 近 似 同 質 遺 伝 子 系 統 を 用 い て , 標 識 遺 伝 子 とRFLP マーカーとを対応づけている.また, Abenes et  al.  (1994)は 染 色 体11につい て標識遺伝子とRFLPマーカーとの配列を明らかにし, Causse et  al.  (1994)は 様々な連鎖分析の結果に基づいて,従来の連鎖、地図とRFLP連鎖地図との対応、

づ け を 試 み た . し か し な が ら , 従 来 の 連 鎖 地 図 とRFLP連 鎖 地 図 と の 全 染 色 体 に わ た る 対 応 づ け は 未 だ に な さ れ て い な い .

そこで,第1節 で は 九 州 大 学 農 学 部 育 種 学 教 室 で 作 成 さ れ て き た 従 来 の連 鎖地図(Iwataet  al.  1984, 1989a, 1989b)(Appendix  1参照)と Saito  et  al.  (1991 )のRFLP連 鎖 地 図(Appendix 2参照)との統合を試みた.分離集団にはイ

ンド型品種IR24と 日 本 型 標 識 遺 伝 子 系 統 と の 交 雑

F 2

あ る い は お を 用いたが,

(35)

日 印 交 雑 の 後 代 で は 遺 伝 子 が 異 常 な 分 離 を 示 す こ と が あ る の で , 遺 伝 子 の 分 離 の 歪 み に つ い て , 第2節 で 考 察 を 加 え た . な お , Appendix  3に は , 本 章 で 用 い た 標 識 形 質 の 写 真 を 示 し た .

第l節 標 識 遺 伝 子 とRFLPマ ー カ ー と の 連 鎖 、 分 析 に よ る 統 合 連 鎖 地 図 の 作 成

本節では,イネの従来の連鎖、地図(Iwataet  al.  1984, 1989a, 1989b)に 位 置 づけられている標識遺伝子と, S aito et  al.  (1991)のRFLP連鎖、地図に位置づけ られているRFLPマ ー カ ー と の , 連 鎖 分 析 に よ る 統 合 連 鎖 地 図 の 作 成 に つ い て 述 べ る . 始 め に , 材 料 と 連 鎖 分 析 の 方 法 と に つ い て ま と め , 次 い で , 染 色 体

ご と に 結 果 お よ び 考 察 を 述 べ た .

材 料 お よ び 方 法

(1)供試イネならびに標識遺伝子

イ ン ド 型 品 種IR24と 日 本 型 標 識 遺 伝 子 系 統 と の 交 雑F2集 団 を 用 い た . 交 雑 組 合 せ な ら び に 標 識 遺 伝 子 は 一 括 し て Table2‑1‑1に 示 し た . こ れ ら の わ 集 団 を 常 法 に 従 っ て 栽 培 し , 適 宜 , 標 識 形 質 の 分 離 を 調 査 し た . ま た , 出 穂 期 頃 に 成 葉 を 採 取 , 凍 結 保 存 し てDNA抽出に供した.ただし, IR24 / 88F126の交 雑 組 合 せ に つ い て はF2各 個 体 よ り お 系 統 を 育 成 し て 標 識 形 質 の 調 査 や 成 業 の 採取を行なった.

(2)RFLPマ ー カ ー

S ai to  e t al.  (1 99 1 )がRFLP連 鎖 地 図 に 位 置 づ け たRFLPマーカーの中から,

(36)

Tab1e 2‑1‑1.  F2 popu1ations observed for  1inkage ana1ysis  Chromosome  Cross combination  Marker genes tested 

R24 / FL293  d‑18, fs‑2 

R24/88F1261 eg, spl‑6, rl‑2  R24/ FL150  d‑2 

R24/ FL274  bl‑l , tri  R24 / FL235  spl‑2 

FL303 /工R24 chl‑l , fc‑l, spl‑3  R24 / 90Fl023  dl, st (七)(CM120)2)  R24 / FL151  19, d‑ll , Ph 

R24 / 89F92  spl‑7, nl‑l , st (七)(CM37)  R24 /89F920  d‑l 

R24 / FL314  dp‑l, spl‑4  R24 / 90Fl023  dp‑l , Cl 

R24 / 90F93  v‑ll , d‑6, g‑l , spl‑5  R24/ 90F1211  v‑8, sug 

R24 / FL260  Dn‑l, drp‑2, dp‑2  FL303 /工R24 I‑Bf 

10  R24 /89F921  pgl, spl‑l0  11  R24 / 90Fl036  z‑2 , v‑9  12  R24 / 89F919  spl‑l 

89F424 /工R24 rl‑l 

1)  F3  1ines derived from F2  individua1s were used. 

2

)  Assigned to chromosome  3 in this  study. 

3)  Assigned to chromosome  5 by trisomic ana1ysis  (Satoh  et  al. unpub1ished). 

3) 

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