マニュアル
PubMed
群馬大学附属図書館医学分館とは
MEDLINE
米国国立医学図書館(NLM)が1879年に創刊した索引誌Index Medicusが1960年から機械編 MEDLARS Medical Literature Analysis and集されるようになり、バッチでの機械検索システム (
。 、
Retrieval System) が開発された これが1970年代にオンラインでサービスされるようになり
( )となった。 年以降に登録された文献が収められている。世界
MEDLINE MEDlars onLINE 1966
約70カ国、4,000誌以上の医学関連雑誌に収載された文献を検索することができる。日本の 雑誌は170誌ほど。著者、キーワードなどを入力して検索することにより文献の書誌事項 (タイトル、著者名、雑誌名、ページ、抄録など)を調べることができる。
とは
PubMed
インターネットで無料公開しているMEDLINE。NLM内にある国立バイオテクノロジー情報センター (National Center for Biotechnology Information : NCBI)が作成するEntrez という統合型分子生 物学データベースの一部として公開されている。(メッシュ)とは
MeSH
の略。 が索引誌 の見出し語として作成し、
Medical Subject Headings NLM Index Medicus
のシソーラス(統制語)となっている用語。毎年改訂される。 MEDLINE さまざまな医学用語をできるだけ統一し、広い概念から狭い概念へと階層を作っている。 。 インデクサーは文献の主題を表わすできるだけ下位のMeSH用語を付与するようにしている (例) 「癌」を表わす言葉 ゙ 文献での表現 MEDLINEでのキーワート cancer carcinoma → neoplasms
neoplasm この下に bone neoplasms
など下位の階層がある skin neoplasms 著者が文中でどんな表現をしていても、neoplasms で検索すれば「癌」に関する文献を探すことがで きる。
のサブヘディング(
)
MeSH
Subheadings
文献がどのような観点から述べられているかを表わす言葉。 必ずMeSH用語と組になって付与される。 インデクサーは該当するサブヘディングがあれば付与する。 Hepatitis/therapyHepatitis/drug therapy Hepatitis/diagnosis
の特徴
PubMed
情報が早い
1.
などで提供されている は抄録作成、 用語の付与など編集
CD-ROM MEDLINE MeSH
作業がすんでから提供されるが、PubMedではその前段階のデータも含む。
毎日更新される。
機能
2. Automatic Term Mapping
自由語を入れても、システムの持つ同義語辞書からMeSH用語を探し、自動的に検索語 に加えてくれる。
各種リンク
3.
(関連文献 、電子ジャーナルへのリンクがなされている。 Related Article )基 本 的 な 検 索
.検索語の入力
1
自由語(思いついた単語)を入力する。広い範囲の検索はできるがノイズが多い。方法 1.
方法
2. MeSH Browser
の活用
最適なMeSHを探して検索することでノイズが減る。 但し、PreMEDLINEに含まれる新しい文献はまだMeSHが付与されていないので、 ヒットしない。絞り込み
2.
方法1.
Subheadings
や
メジャードメッシュ[
MAJR
]
で絞る。
文献の中心テーマである をメジャードメッシュといい、 メジャードメッシュとは .... MeSH 詳細表示のなかで、メジャードメッシュには*(アスタリスク)がつけられている。方法2.
Limits 機能
で絞る
よく使われる限定したい条件があらかじめ用意されている。
末尾にフィールドのタグ[LA][PT]などを入れて検索語として入力する手間を省く。
の例
Publication Type
Clinical Trial, Editorial, Letter, Meta-Analysis, Practice Guideline,
Randomized Controlled Trial, Review
この他に 実験対象の年齢、性別、論文の言語、出版年など
方法3.
History (履歴検索)
の利用
と のどちらの語も含む文献 #1 AND #2 #1 #2 または のどちらかを含む文献 #1 OR #2 #1 #2 を含むが を含まない文献 #1 NOT #2 #1 #2文献の表示
3.
著者名 論文のタイトル 雑誌名、発行年月、巻号、ページ * * * レコードの状態 *[PubMed−as supplied by publisher] 出版社から電子的に提供されてきたデータ。 [PubMed−in process] MEDLINEに収録するための索引作業中のもの。
[PubMed−indexed for MEDLINE] MEDLINEに収録されたもの。 MeSHが索引されている。
[PubMed]−MEDLINE収録対象誌の論文だが、内容的にMEDLINEの収載基準から はずれる
ため、MEDLINEには収録されない論文。
詳細表示
電子ジャーナルのあるものは表示がでる。群馬大学で契約してあってフルテキストが見られ るものは群馬大学の表示がでる。フリートライアル、無料提供のものもあるので、群馬大学 の表示がなくてもクリックしてみるとよい。但し、有料のものもあるので注意。
詳細表示の種類−
[
Display
]
の右のボックスで選択。
Abstract 基本設定は にすると、採択されている 用語が表示された形式となる。 MEDLINE MeSH 適合文献に付与されたMeSH用語を参考に再検索する場合に有用。 のボックスで を選び保存すると などで検索結果の整理、加工も可能。[Send to] File EndNote
1: Sindern E, et al. Expression of chemokine recep...[PMID:12458051]
□
MEDLINE文献番号
UI
- 22345920
→
PubMed文献番号
PMID- 12458051
→
DA
- 20021129
→ (NLMでの使用)
DCOM- 20021209
→ (NLMでの使用)
IS
- 0165-5728
→
ISSN
(International Standard Serial Number)
VI
- 131
→
巻
(Volume)
IP
- 1-2
→
号
(Issue)
DP
- 2002 Oct
→
出版年
(Publication Date)
TI
- Expression of chemokine receptor CXCR3 on cerebrospinal fluid T-ce
lls is related to active MRI lesion appearance in patients with
タイトル
relapsing-remitting multiple sclerosis.
→
ページ
PG
- 186-90
→
AB
- We evaluated CXCR3 expression on T-cells and levels of its ligand
CXCL10 in blood and cerebrospinal fluid (CSF) of 22 patients with
relapsing-remitting multiple sclerosis (RR-MS) in association with
magnetic resonance imaging (MRI) disease activity. CXCL10 was stro
ngly released intrathecally, but did not change in association
with MRIactivity. CXCR3 expression on T-cells was lower in the
peripheral blood (PB) of RR-MS patients compared to healthy
抄録
acute attacks, as illustrated by...→
AD
- Department of Neurology, Ruhr University, BG-Kliniken Bergmannsheil,
Burkle-de-la-Camp Platz 1, 44789, Bochum, Germany.
[email protected]
→
所属
(Affiliation)
著者名
FAU - Sindern, Eckhart
→
著者名(略)
AU
- Sindern E
→
FAU - Patzold, Tanja
AU
- Patzold T
FAU - Ossege, Ludgera Manuela
AU
- Ossege LM
言語
LA
- eng
→
PT
- Journal Article
→
出版形態
(Publication Type)
出版国
CY
- Netherlands
→
TA
- J Neuroimmunol
→
略誌名
(Journal Title Abbreviation)
JID - 8109498
RN
- 0 (Antigens, CD3)
RN
- 0 (CXC chemokine IP-10)
化学物質Registry番号
RN
- 0 (CXC chemokine receptor 3)
→
RN
- 0 (Chemokines, CXC)
RN
- 0 (Receptors, Chemokine)
SB
- IM
MeSH用語
MH
- Adult
→
MH
- Antigens, CD3/analysis
MH
- Chemokines, CXC/blood/cerebrospinal fluid
MH
- Female
MH
- Human
MH
- Magnetic Resonance Imaging
MH
- Male
MH
- Middle Age
MH
- Multiple Sclerosis, Relapsing-Remitting/cerebrospinal
fluid/*immunology/pathology
MH
- Receptors, Chemokine/*metabolism
MH
- Support, Non-U.S. Gov't
MH
- T-Lymphocytes/*immunology
PubMed追加日
EDAT- 2002/11/30 04:00
→
MeSH追加日
MHDA- 2002/12/10 04:00
→
文献番号
AID - S0165572802002631 [pii]
→
PST - ppublish
印刷
4.
ブラウザの機能を使う。 検索結果画面の[send to]でtext表示にして印刷すると用紙の節約となる。応 用 検 索
熟語の検索
1.
(ダブルクオーテーション)で囲んで検索する。 " "(例)infection control の検索結果 31,210件 単語infectionとcontrolを含む文献
の検索結果 件 熟語 を含む文献
"infection control" 12,923 infection control
語尾のあいまいなものは
で調べる。
2.
Preview/Index 機能
完全誌名、略誌名、雑誌情報は
で調べる。
書誌事項の一部から求める文献を探すには
を利用する。
4.
Single Citation Matcher
著者、収載誌がわかっていてページがわからない。 etc タイトル、著者がわかっていて収載誌がわからない。
エビデンスの高い文献を探す。
5.
(
)とは
Evidence-Based Medicine EBM
医療情報の広がりとともに、患者の側の意識も変化し、経験や直感だけに頼らず、科学的根 拠に基づいた最適な診断、治療などが求められるようになってきた。こうした時代背景から 生まれたのがEBMであり 「診ている患者の臨床上の疑問点に関して、医師が関連文献等を、 検索し、それらを批判的に吟味した上で患者への適用の妥当性を評価し、さらに患者の価値 観や意向を考慮した上で臨床判断を下し、専門技能を活用して医療を行うこと」と定義され ている (平成。 11年3月医療技術評価推進検討会報告書による)
の
つのステップ
EBM
4
目の前の患者から臨床上の疑問点を抽出する 1. 疑問点に関する信頼性の高い文献の検索 2. 文献の妥当性を評価する 3. 文献の結果を患者に適用することが適切かどうかを判断する 4.の
機能
PubMed
Clinical Queries
研究の観点(category)と検索の精度(emphasis)を選択し、Evidenceの高い文献を簡単に検索 する機能。ただし、目的のテーマについて網羅的に文献を探したい場合は不向き。
短時間で精度の高い文献をいくつか探したい場合に有効。
(治療)
(診断)
(病因)
(予後)
category
therapy
, diagnosis
, etiology
, prognosis
(感度)
再現率−広めの検索
emphasis
sensitivity
で指定する方法
Publication Type
Meta-analysis
複数の臨床試験データを集めて解析したもの。 質の高いメタアナリシスは診療行為の指針として最もエビデンスが高いとされている。 ランダム化比較試験Randomized Controlled Trial RCT
(
)
被験者を無作為に医学的介入(薬、外科手術、検査、看護、教育、サービスなど) を行う群と行わない群にわけ、評価を行う臨床試験の方法。研究者の恣意や、 対象者の希望を排除し、医学的介入が最も適正に評価される臨床試験の方法。
[参考]
エビデンスの高い文献を探すためのその他のデータベース
は膨大なデータベースであり、そこから適合文献を見つけるにはある程度の検索の知識 MEDLINE や経験、時間がかかる。そこで、あらかじめ妥当性の高い情報だけが集められた情報源から、関連 性の高い情報を検索するほうが、時間がかからない。Cochrane Library
国際的な医療評価プロジェクトであるコクラン共同計画が提供するデータベース。 主に次の4つのデータベースがある。 ( )1. CDSR The Cochrane Database of Systematic Reviews
の中心となるデータベース。共同レビューグループが同じ研究テーマについての研 Cochrane Library
究結果をもれなく集め、評価、要約、解析し、定期的に編集、更新する。
( )
2. DARE The Database of Abstracts of Reviews of Effectiveness
イギリスのヨーク大学のNHSレビュー普及センターが吟味し、選択したレビューのデータベース。
( )
3. CCTR The Cochrane Controlled Trials Register
Randomized Controlled Trial RCT Controlled
コクラン共同計画によって登録された ( )と
( )の書誌情報。
Clinical Trial CCT
( )
4. CRMD The Cochrane Review Methodology Database の方法論に関する論文の書誌情報。 Systematic Review
関連
Web
サイト
http://www.cochrane.org/
http://cochrane.umin.ac.jp/
Up To Date
アメリカの主要な学会が作成するデータベース。各領域の専門医が平易な文章で信頼できる 診療指針を提供する。CD-ROMとオンラインがある。Best Evidence
ACP Journal 主要な医学雑誌の論文を批判的に吟味し、質の高い論文の抄録を集めた雑誌Club American College of Physician( 発行)と Evidence-Based Medicine(British Medical Journal 発行) の内容を提供する。