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実習資料 統計ソフトRを使った統計学実習

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Academic year: 2018

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(1)

情報・統計処理

     

統計パート 第

1

臨床試験管理センター西山毅(たけし)

(2)

ビタミン

E

は癌を減らす(かも)

 多くの動物実験などで、ビタミン E は様々な種類のがんの

発生を予防する効果が示されている。もっとも良く知られ ている作用は抗酸化作用であり、細胞の代謝過程で発生す るフリーラジカルを消去する働きがある。活性酸素などの 様々なフリーラジカルは細胞の機能に影響し、前立腺がん の発生にも影響を及ぼす。また前立腺がんの発生に関連し ているプロスタグランジンの働きを抑える作用も知られて いる。

 培養細胞を用いた研究で、ビタミン E が生理的濃度で、前

立腺がん細胞の細胞周期を停止させたり、細胞周期の調節 役である p27 の発現を高めることが示されている。

 Alpha-Tocopherol, Beta-Carotene Cancer Prevention Stud

(3)
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サントリーの反応

セサミン E プラスへのビタミン E 含有量について

日頃よりサントリーの健康食品にご愛顧賜り、厚く御礼申し上げます。 ビタミンEの過剰摂取に関する報道がございましたが、ビタミンEは、通 常の食品からも摂れる成分であり、サプリメントとしても長く利用され てきた実績もございます。

また、今回の研究はねずみ(ラット&マウス)を対象としておこなわ れた試験であり、その結果を以って、ヒトに当てはまるものではあり ません。セサミンEプラスには、お食事に加えて毎日摂っていただいても 、摂りすぎなどの心配なく、ご健康にお役立ていただける量(55mg(3 粒あたり))を配合しておりますので、ご安心していただければと存じ ます。 ←SELECT試験では毎日268mg

(6)

SELECT

試験の結果

This report includes 54 464 additional person-ye ars of follow-up and 521 additional cases of pro state cancer since the primary report. Compared with the placebo (referent group) in which 529 m en developed prostate cancer, 620 men in the vit amin E group developed prostate cancer (hazard r atio [HR], 1.17; 99% CI, 1.004-1.36, P = .008); as did 575 in the selenium group (HR, 1.09; 99% CI, 0.93-1.27; P = .18), and 555 in the selenium plus vitamin E group (HR, 1.05; 99% CI, 0.89-1.2 2, P = .46). Compared with placebo, the absolute increase in risk of prostate cancer per 1000 per son-years was 1.6 for vitamin E, 0.8 for seleniu m, and 0.4 for the combination.

(7)

SELECT

試験の結果

統計学がわからないと研究結果が理解できない

どうやってグラフが 描かれているの?

(8)

個別事例の統計解析

統計ソフ ト

ソフト セミナ

ー テキス

ト 詳しい

統計知識

セミナ ー テキス

ト 詳しい

統計の助っ 人

統計家

(9)

個別事例の統計解析

統計ソフ ト

セミナ ー テキス

詳しい 人 ソフト

統計知識

セミナ ー テキス

ト 詳しい

統計の助っ 人

統計家

DM

統計ソフ

ト 統計知識

(10)

個別事例の統計解析

統計知識

セミナ ー テキス

ト 詳しい

人 統計ソフ

セミナ ー テキス

詳しい 人 ソフト

統計の助っ 人

統計家

(11)

個別事例の統計解析

統計知識

セミナ ー テキス

ト 詳しい

人 統計ソフ

セミナ ー テキス

詳しい 人 ソフト

統計の助っ 人

統計家

DM

(12)

統計学の習得法

 紙とエンピツを使った学習とソフトウェアを

使った学習は車輪の両輪

 テキストや講習会については,ウェブテキストの表

(13)

どの統計ソフトを使うべきか?

 広く流通するソフトを使うべき

 テキスト・セミナーが入手しやすい

 詳しい人に教えてもらえる

 販売中止となったソフトは使うべきでない

STATVIEW はダメ

 継続して使い続けられるソフトを選ぶ

 途中で他のソフトに切り替えるのは大変

ずっと大学にいるか 金持ちか

(14)

製品名 販売会社 OS 価格 日本語化

SAS SAS Win, UNIX ( Linux, \620,000 次年度よ

り \200,000/ 年 あり

JMP SAS Win, Mac ¥78,000 あり

SPSS IBM Win, Mac, Linux \14,300 ( graduate pack )

, \350,000 あり

Stata ライトストーン Win, Mac, Linux, UNIX \22,050 (grad plan) \84,000 なし

S-PLUS 数理システム Win, UNIX( Linux, ¥19,950 あり

R ― Win, Max, Linux ¥0 あり

STATISTIC

A スタットソフト Win ¥159,600 あり SYSTAT HULINKS Win ¥61,845 あり

MINITAB 構造計画研究所 Win ¥39,800 あり

Prism エムデーエフ Win, Mac ¥107,163 あり

SigmaStat HULINKS Win 販売終了 なし

(15)

市場シ

ェア

:メーリングリストの投稿数

15

GUI 作のソ フトは少ない

SAS R

複数の ML が あるから本当

はもっと多い

The Popularity of Data Analysis Software (http://r4stats.com/popularity)

(16)

市場シ

ェア

ディ

スカ

ッショ

ン・サイトの

投稿数

 Software   

Stack

Overflow Discussions

Cross

Validated Discussions

 R 10,606   1,612

 SAS  509  90

 SPSS  95  145

 Stata  55  95

 All others  0  <10

(17)

市場シ

ェア

調

会社の調

結果

(18)

18

市場シ

ェア

 

論文

中の

記載数

Google Scholar の検索の不正確

さあり

SAS SPSS 2005 年にピー

(19)

市場シ

ェア

 

論文

中の

記載数

(続)

トップ2を除い た

ランキング

R と STATA は最

(20)

 メジャーな5大ソフトを選ぶべき

 SAS, SPSS, JMP, STATA, R(S-PLUS)

 価格

 SAS >> SPSS >> STATA≒JMP > S-PLUS >> R

 機能

 臨床研究に必要な統計解析なら,どれでも同じ

論文中のシェア

SPSS > SAS > R > STATA> JMP

これから使うなら R OK .今まで使いれたソ フトがあり,

今後も使い続けられそうなら他に変えるまでもない

これから使うなら R OK .今まで使いれたソ フトがあり,

今後も使い続けられそうなら他に変えるまでもない

(21)

さあ

R

を使おう

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eofr/

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