BBBB CCC
=> S L# TI ・・・・・・AB ・・・・・・
IT XXX-XX-X YYY-YY-Y
RN XXX-XX-X CN AAAAAA BBBB CCC
=> SEL L# CHEM => S E#/○○
=> TRA L# CHEM /○○
TI ・・・・・・
AB ・・・BBBB・
・・・・・・
・BBBB・・・
E#
D 化学物質関連情報の検索
■ 検 索 例 ： 下 記 の部 分 構 造 を含む物 質 の文 献 情 報 ，毒 性 情 報 について調 査 する．
・ REGISTRY ファイルで化 学 物 質 を検 索 する．
=> FILE REGISTRY
=>
Uploading C:\Users\xxxxx\Documents\STN Express 8.6\Queries\Queries_D1.str L1 STRUCTURE UPLOADED
=> D QUE
L1 STR
Structure attributes must be viewed using STN Express query preparation.
=> S L1 ← サ ン プ ル 検 索 を 実 行 FULL FILE PROJECTIONS: ONLINE **COMPLETE**
BATCH **COMPLETE**
PROJECTED ITERATIONS: 252750 TO 266410 PROJECTED ANSWERS: 1400 TO 2600 L2 50 SEA SSS SAM L1
=> D L2 SCAN
L2 50 ANSWERS REGISTRY COPYRIGHT 2016 ACS on STN
IN 6H-Purin-6-one, 1,9-dihydro-9-[(1R,3S)-3-(hydroxymethyl)cyclopentyl]- MF C11 H14 N4 O2
Absolute stereochemistry. Rotation (-).
**PROPERTY DATA AVAILABLE IN THE 'PROP' FORMAT**
HOW MANY MORE ANSWERS DO YOU WISH TO SCAN? (1):END
=> S L1 FUL ← フ ル フ ァ イ ル 検 索 を 実 行 L3 1877 SEA SSS FUL L1
N
N N N
O
Cb
O
N N
N N
H R S OH
・ 使 用 ファイル
- CAplus ファイル ： 化 学 文 献 情 報 - RTECS ファイル ： 毒 性 データ
- EMBASE ファイル ： 医 学 ・薬 学 文 献 情 報
D 化学物質関連情報の検索
65
① REGISTRY → CAplus ファイル
・ CAplus ファイルは，化 学 ・化 学 関 連 分 野 の文 献 ・特 許 を収 録 するファイルである．化 学 物 質 を CAS 登 録 番 号 で索 引 しているため，L 番 号 のクロスオーバー検 索 が有 効 である．
=> FILE CAPLUS ← CAplus フ ァ イ ル に 入 る
=>
S L3
← L3 を ク ロ ス オ ー バ ー 検 索 す る L4 2951 L3=> D BIB ABS HITSTR ← 1 番 目 の 回 答 の 書 誌 情 報 ， 抄 録 ， ヒ ッ ト し た 物 質 の 構 造 を 表 示
L4 ANSWER 1 OF 2951 CAPLUS COPYRIGHT 2016 ACS on STN AN 2016:165866 CAPLUS Full-text
TI Relationship between serum HBV DNA, HBeAg and ALT titers and treatment effect entecavir in chronic hepatitis B patients
AU Zhu, Xiao-hui
CS Yangzhou City Jiangdu District Binjiang People's Hospital, Yangzhou, 225211, Peop. Rep. China
SO Xiandai Jianyan Yixue Zazhi (2015), 30(2), 142-143 CODEN: XJYZB4; ISSN: 1671-7414
DOI 10.3969/j.issn.1671-7414.2015.02.045 PB Xiandai Jianyan Yixue Zazhi Bianjibu DT Journal
LA Chinese
AB This paper is to evaluate the treatment effect of entecavir in chronic hepatitis B(CHB) patients. 60 cases of patients were treated with entecavir 0.5 mg/day. The neg. rates of HBV DNA and ALT after 3, 6 and 12 mo were observed Immune chemiluminescence was used to observe the HBeAg titer after medication. The neg. rates of ALT and HBeAg, HBeAg conversion rate were 91.7%, 86.7% and 16.7%, resp. The titer of HBeAg was low at baseline, and the patients would had higher HBeAg seroconversion; there were significant differences with other groups. The patients with HBeAg titer decrease 90% was significantly higher HBeAg-neg. conversion rate than the patients with HBeAg titer decrease <90% on the 3 mo.
The detection of HBeAg titer decrease can early predict HBeAg serum conversion rate in HBeAg-pos. CHB patients after ETV treatment.
IT INDEXING IN PROGRESS IT 142217-69-4, Entecavir
RL: PAC (Pharmacological activity); THU (Therapeutic use); BIOL (Biological study); USES (Uses)
(relationship between serum HBV DNA, HBeAg and ALT titers and treatment effect entecavir in chronic hepatitis B patients)
RN 142217-69-4 CAPLUS
CN 6H-Purin-6-one, 2-amino-1,9-dihydro-9-[(1S,3R,4S)-4-hydroxy-3- (hydroxymethyl)-2-methylenecyclopentyl]- (CA INDEX NAME)
Absolute stereochemistry. Rotation (+).
CH2
N OH
OH NH
N O N
H2N S R
S
L 番 号
D 化学物質関連情報の検索
② REGISTRY → RTECS ファイル
・ RTECS ファイルは化 学 物 質 の毒 性 情 報 を収 録 するデータベースである．CAS 登 録 番 号 の 収 録 率 が高 いため，L 番 号 のクロスオーバー検 索 が有 効である．
・ REGISTRY フ ァ イ ル で の ヒ ッ ト 件 数 が 多 い 場 合 に は ， /LC フ ィ ー ル ド を 利 用 し て ， あ ら か じ め RTECS ファイルに収 録 されている物 質 に限 定 することができる．
=> FILE REGISTRY
=> S L3 AND
RTECS/LC
← RTECS フ ァ イ ル に 収 録 さ れ て い る 物 質 に 限 定 (任 意 ) L5 6 L3 AND RTECS/LC=> D IDE (参 考 ) RTECS/LC で 限 定 し た 回 答 の 確 認
L5 ANSWER 1 OF 6 REGISTRY COPYRIGHT 2016 ACS on STN RN 142217-69-4 REGISTRY
ED Entered STN: 03 Jul 1992
CN 6H-Purin-6-one, 2-amino-1,9-dihydro-9-[(1S,3R,4S)-4-hydroxy-3- (hydroxymethyl)-2-methylenecyclopentyl]- (CA INDEX NAME) OTHER CA INDEX NAMES:
CN 6H-Purin-6-one, 2-amino-1,9-dihydro-9-[4-hydroxy-3-(hydroxymethyl)-2- methylenecyclopentyl]-, [1S-(1,3,4)]-
OTHER NAMES:
CN 2-Amino-1,9-dihydro-9-[(1S,3R,4S)-4-hydroxy-3-(hydroxymethyl)-2- methylenecyclopentyl]-6H-purin-6-one
CN Baraclude CN BMS 200475 CN Entecavir CN ETV CN SQ 34676 ：
LC STN Files: ADISINSIGHT, ADISNEWS, BIOSIS, BIOTECHNO, CA, CAPLUS, CASREACT, CBNB, CHEMCATS, CHEMLIST, CIN, EMBASE, IMSRESEARCH, IPA, MEDLINE, PATDPASPC, PS, RTECS*, TOXCENTER, USPAT2, USPATFULL (*File contains numerically searchable property data)
Absolute stereochemistry. Rotation (+).
：
=> FILE RTECS
=> S L5 ← RTECS/LC で 限 定 し た 回 答 L5 を ク ロ ス オ ー バ ー す る L6 6 L5
CH2
N OH
OH NH
N O N
H2N S R
S
こ の 物 質 の CAS 登 録 番 号 が RTECS フ ァ イ ル に 収 録 されている
(= L 番 号 をクロスオーバーすると回 答 が得 られる) L 番 号
D 化学物質関連情報の検索
67
=> D 1-6 FA ← 全 件 の 収 録 デ ー タ を 確 認
L6 ANSWER 1 of 6 RTECS COPYRIGHT 2016 U.S. GOVERNMENT on STN Code Field Name
---+--- RN CAS Registry Number
CN Chemical Name MF Molecular Formula RTN RTECS Number SO Source ：
L6 ANSWER 3 of 6 RTECS COPYRIGHT 2016 U.S. GOVERNMENT on STN Code Field Name
---+--- RN CAS Registry Number
CN Chemical Name CI Class Identifier MF Molecular Formula RTN RTECS Number SO Source
TOX Toxicity Data ← 毒 性 デ ー タ の 収 録 あ り
：
=> D 3 IDE TOXFULL ← 3 番 目 の 回 答 に つ い て 化 学 物 質 同 定 情 報 と 毒 性 デ ー タ を 表 示
L6 ANSWER 3 of 6 RTECS COPYRIGHT 2016 U.S. GOVERNMENT on STN CAS Registry Number (RN): 98873-79-1 RTECS
RTECS Number (RTN): UP0799900 Molecular Formula (MF): C11 H14 N4 O3 Formula Weight (FW): 250.29
Chemical Name (CN): 6H-Purine-6-one,
1,9-dihydro-9-(2,3-dihydroxy-4-methylcyclopentyl)-, (1R-(1-alpha,2-beta,3-beta,4-alpha))-;
Asteromycin M;
9-((1R,2S,3R,4S)-2,3-Dihydroxy-4-methylcyclopentan-1- yl)hypoxanthine
Class Identifier (CI): Drug; Natural Product Entry/Update Date (DATE): Dec 1992
Character Count: 540
Absolute stereochemistry.
TOXICITY DATA (TOX):
Route |Organism| Dose | Source RTE | ORGN | DOSE | SO
===============+========+=========+==========
intraperitoneal|Mouse |LD50 >400|JANTAJ 毒 性 デ ー タ と 出 典 情 報 | |mg/kg |38,981,198
| | |5
TOXICITY DATA REFERENCES:
JANTAJ Journal of Antibiotics (Japan Antibiotics Research Assoc., 2-20-8 Kamiosaki, Shinagawa-ku, Tokyo, 141, Japan) V.2-5, 1948-52; V.21- 1968-
Me OH
N OH
NH N O N
R SR S
RTECS ファイルの主 な収 録 データ
・ IRR ： 刺 激 性 データ
・ MUT ： 変 異 原 性 データ
・ REP ： 生 殖 試 験 データ
・ TOX ： 毒 性 データ (主 に急 性 毒 性 )
・ TUM ： 腫 瘍 原 性 データ
・ OMUL ： その他 の毒 性 データ
TOXFULL の よ う に コ ー ド に FULL を つけると詳 細 な出 典 情 報 も表 示 される
D 化学物質関連情報の検索
③ REGISTRY → EMBASE ファイル
・ EMBASE ファイルは生 物 医 学 ・薬 学 分 野 の文 献 を収 録 するファイルである．CAS 登 録 番 号 の収 録 率 は比 較 的 高 いが完 全ではないため，化 学 物 質 名 称 による検 索 も併 用 するとよい．
・ 化 学 物 質 名 称 も含 めて検 索 する場 合 は，SELECT コマンドや TRANSFER コマンドを利 用 し て，REGISTRY ファイルに収 録 されている CAS 登 録 番 号 と名 称 を抽 出 して検 索 する．
- TRANSFER CHEM を実 行 すると，デフォールトでは基 本 索 引 (/BI) で検 索 が実 行 される．
検 索 フィールドを指 定 する場 合 は，L 番 号 の後 にスペースを空 けて入 力 する．
(=> TRA L# CHEM /○○)．
=> FILE EMBASE ← TRANSFER コ マ ン ド 実 行 前 に EMBASE フ ァ イ ル に 入 る
=>
TRA L3 CHEM
L7 TRANSFER L3 1- CHEM : 2150 TERMS L8 7616 L7
=> D 1 20 ALL ← 1 番 目 と 20 番 目 の 回 答 を ALL 表 示 形 式 で 表 示
L8 ANSWER 1 OF 7616 EMBASE COPYRIGHT (c) 2016 Elsevier B.V. All rights reserved on STN
AN 20160062484 EMBASE Full-text
TI Persistent T large granular lymphocytosis in a patient with
refractory pure red cell aplasia, celiac disease, and chronic hepatitis B infection.
AUPB Sreedharanunni, S.; Sachdeva, Mus; Prakash, G.; Das, R., Prof.
(correspondence)
AU Sreedharanunni, S.; Sachdeva, Mus; Das, R., Prof. (correspondence)
CS Department of Hematology, Post Graduate Institute of Medical Education and Research, Chandigarh, Punjab and Haryana, India. [email protected] AU Prakash, G.
CS Department of Internal Medicine, Post Graduate Institute of Medical Education and Research, Chandigarh, Punjab and Haryana, India.
SO Journal of Postgraduate Medicine, (January-March 2016) Vol. 62, No. 1, pp.
40-43.
Refs: 10
ISSN: 0022-3859; E-ISSN: 0972-2823 CODEN: JPMDA3 ：
CT Medical Descriptors:
adult
antiviral therapy aplastic anemia Article
blood transfusion bone marrow biopsy ：
REGISTRY ファイル
RN XXXXX-XX-X CN AAAAAAAAAA OTHER NAMES:
CN BBBBB CN CCCCCC CN DDD1234 CN EE-EEEEEE
：
EMBASE ファイル
TI ・・・・・・・・・・・・
AB ・・・BBBBB・・・・
・・・・・・・・・・・・
CT ・・・・・・
BBBBB ・・・・・
RN 収 録 な し
=> TRA L# CHEM
*L3 の全 件 から CAS 登 録 番 号 と名 称 を抽 出 し，
EMBASE ファイルの基 本 索 引 で検 索 する TRA CHEM
* CHEM ： CA 索 引 名 を除 くすべての 名 称 と CAS 登 録 番 号
名 称 でヒット！
D 化学物質関連情報の検索
69 *chronic hepatitis B: DT, drug therapy disease association
disease severity flow cytometry
*gamma delta T lymphocyte hepatomegaly
human
immunophenotyping iron chelation
large granular lymphocyte
*large granular lymphocytosis: TH, therapy *lymphocytosis: TH, therapy
male
middle aged pallor
*pure red cell anemia: DT, drug therapy refractory anemia: TH, therapy
reticulocytopenia CT Drug Descriptors:
entecavir: DT, drug therapy iron
prednisolone: DT, drug therapyＤ
ST Celiac disease (CD); large granular lymphocyte (LGL); pure red cell aplasia (PRCA); T cell
RN (entecavir) 142217-69-4, 209216-23-9; (iron) 14093-02-8, 53858-86-9, 7439-89-6; (prednisolone) 50-24-8
L8 ANSWER 20 OF 7616 EMBASE COPYRIGHT (c) 2016 Elsevier B.V. All rights reserved on STN
AN 20160007866 EMBASE Full-text
TI The current treatment situation and definitions of a cure for chronic HBV infection.
AUPB Demma, Shirin; Dusheiko, Geoffrey (correspondence) AU Demma, Shirin; Dusheiko, Geoffrey (correspondence)
CS UCL Institute of Liver and Digestive Health, Royal Free NHS Foundation Trust, London, United Kingdom. [email protected]
AU Demma, Shirin
CS Hepatology Unit, Department of Medical and Pediatric Sciences, University of Catania, Via S. Sofia No 78, Catania, 95123, Italy.
SO Future Virology, (January 2016) Vol. 11, No. 1, pp. 79-92.
Refs: 93
ISSN: 1746-0794; E-ISSN: 1746-0808 ：
CT Medical Descriptors:
*chronic hepatitis B: DT, drug therapy end stage liver disease
eradication therapy human
medical history morbidity nonhuman
priority journal reservoir
Review vaccination
CT Drug Descriptors:
alpha interferon: DT, drug therapy circular DNA: EC, endogenous compound nucleoside analog: DT, drug therapy
ST antiviral therapy; entecavir; HBsAg; hepatitis B; hepatitis B surface antigen; hepatitis B vaccination; immunomodulatory therapy; nucleoside analogs
CAS 登 録 番 号 と名 称 でヒット
こ の レ コ ー ド に は RN フ ィ ー ル ド が な く ， CAS 登 録 番 号 が 収 録 さ れ て い な い が ， 名 称 でヒットさせることができた
名 称 のみでヒット
D 化学物質関連情報の検索
化学物質の調査
■ 物 質 調 査 では REGISTRY ファイルだけでなく，構 造 検 索 可 能 な ReaxysFile，MARPAT ファイル 等 を併 用 すると網 羅 的 な調 査 ができる．
■ ReaxysFile ファイルと REGISTRY ファイルの関 係
・ ReaxysFile ファイルは，有 機 化 合 物 および無 機 化 合 物 の物 質 同 定 情 報 ，物 性 情 報 ，反 応 情 報 を収 録 するデータベースである．
・ 収 録 物 質 数 は REGISTRY ファイルの方 が多 いが，ReaxysFile ファイルは収 録 開 始 年 が古く，
REGISTRY ファイルにない物 質 も収 録 されている．
(2016 年 3 月 現 在 )
・ ReaxysFile ファイルに収 録 されている物 質 の CAS 登 録 番 号 収 録 率 は約 35%．
■ MARPAT ファイルと CA/REGISTRY ファイルの関 係
・ MARPAT ファイルは，CA 収 録 特 許 中 のマルクーシュ構 造を収 録 するデータベースである．
[特 許 公 報 ]
特 許 請 求 範 囲 実 施 例 ，特 許 請 求 範 囲 (一 部 )
・ MARPAT ファイルを利 用 すると，実 施 例 やクレーム中 に具 体 的 な化 合 物 としては記 載 されて いないが，マルクーシュ構 造 中 の組 み合 わせに含 まれる構 造 を検 索 できる．
REGISTRY ファイル
・ 1800 年 初 頭 ～ 現 在
・ 175,200,000 件 以 上
・ 有 機 化 合 物 ，有 機 金 属 化 合 物 ， 無 機 化 合 物 ，金 属 ，ポリマー，
タンパク質 ，核 酸 など
ReaxysFile ファイル
・ 1771 年 ～ 2011 年
・ 19,404,300 件 以 上
・ 有 機 化 合 物 ，有 機 金 属 化 合 物 無 機 化 合 物 ，金 属 など
一 般 式 で表 される構 造
マルクーシュ構 造
MARPAT に収 録
具 体 的 な化 合 物
CAplus/CA に索 引
REGISTRY に収 録
D 化学物質関連情報の検索
71
■ 検 索 例 ： 下 記 のような部 分 構 造 を含 む物 質の網 羅 的 な調 査 を行う．
・ 矢 印 の部 分 のヘテロ原 子 は何でもよいが，特 に S (硫 黄 ) である物 質 について調 査したい．
- REGISTRY，ReaxysFile，MARPAT ファイルを利 用 して構 造 検 索 する．
* 構 造 質 問 式 は複 数 のファイルで共 通 に利 用 できる．
参考 ： 作図上の注意点
■ 一 部 の官 能 基 などでは，データベース間 で作 図 方 法 が異なる場 合 もある．
例 ： -N3 (アジド基 ) のように何 通 りかの記 述 方 法 がある官 能 基 などは，ファイルによって作 図 ルールが異 なる場 合 がある．
■ MARPAT ファイルで検 索 する場 合 には，独 自 の属 性 により回 答 が異なるので注 意 する．
例 ： Me を作 図 したときに，Alkyl (C1-C3) のように一 般 式 で記 載 された特 許 も回 答 に含めるか どうかを，属 性 で指 定できる．
* 詳 細 は講 習 会 「構 造 検 索 を用 いた特 許 調 査 – MARPAT」 で紹 介 REGISTRY
* 環 はこれ以 上 縮 環 しない
* 作 図 方 法 が不 明 な場 合 は，サンプル検 索 や練 習 用 ファイルで検 索 してみるか，
ヘルプデスクに問 い合 わせる．
ReaxysFile
D 化学物質関連情報の検索
① REGISTRY ファイルでの検 索
=> FILE REGISTRY
=>
Uploading C:\Users\xxxxx\Documents\STN Express 8.6\Queries\Queries_D2.str L1 STRUCTURE UPLOADED
=> S L1 ← サ ン プ ル 検 索 を 実 行
FULL FILE PROJECTIONS: ONLINE **COMPLETE**
BATCH **COMPLETE**
PROJECTED ITERATIONS: 2512 TO 4048 PROJECTED ANSWERS: 0 TO 0 L2 0 SEA SSS SAM L1
=> S L1 FUL ← フ ル フ ァ イ ル 検 索 を 実 行 L3 2 SEA SSS FUL L1
=> D 1-2 ← IDE 表 示 形 式 で 表 示
L3 ANSWER 1 OF 2 REGISTRY COPYRIGHT 2016 ACS on STN RN 861258-89-1 REGISTRY
ED Entered STN: 22 Aug 2005
CN 4-Benzoxazolecarboxylic acid, 6-cyano-2-[(2,3-dichlorophenyl)amino]- (CA INDEX NAME)
MF C15 H7 Cl2 N3 O3 SR CA
LC STN Files: CA, CAPLUS, TOXCENTER, USPATFULL
：
L3 ANSWER 2 OF 2 REGISTRY COPYRIGHT 2016 ACS on STN RN 861258-67-5 REGISTRY
ED Entered STN: 22 Aug 2005
CN 1H-Benzimidazole-7-carboxylic acid, 5-cyano-2-[(2,3-dichlorophenyl)amino]- (CA INDEX NAME)
OTHER CA INDEX NAMES:
CN 1H-Benzimidazole-4-carboxylic acid, 6-cyano-2-[(2,3-dichlorophenyl)amino]- (9CI)
MF C15 H8 Cl2 N4 O2 SR CA
LC STN Files: CA, CAPLUS, TOXCENTER, USPATFULL
： NC
CO2H
Cl Cl
N
O NH
NC
CO2H
Cl Cl
N H
N NH
・ REGISTRY ファイルでは，ヘテロ原 子 が酸 素 および窒 素 である誘 導 体 が 2 件ヒットした．
・ ヘテロ原 子 が硫 黄 であるベンゾチアゾール体 は見 つからなかった．
→ ReaxysFile ファイル，MARPAT ファイルでも検 索 する．
ヘテロ原 子 が窒 素 ヘテロ原 子 が酸 素
D 化学物質関連情報の検索
73
② ReaxysFile ファイルでの検 索
=> FILE REAXYSFILE ← ReaxysFile フ ァ イ ル に 入 る
=> S L1 ：
FULL FILE PROJECTIONS: ONLINE **COMPLETE**
：
L4 0 SEA SSS SAM L1
=> S L1 FUL ← フ ル フ ァ イ ル 検 索 を 実 行 L5 3 SEA SSS FUL L1
=> D 1-3 IDE ← IDE 表 示 形 式 で 表 示
L5 ANSWER 1 OF 3 REAXYSFILE COPYRIGHT 2016 Elsevier Properties SA. on STN
Accession Number (AN): 14438347
Chemical Name (CN): 6-cyano-2-(2,3-dichloro-phenylamino)-3H-be nzoimidazole-4-carboxylic acid methyl ester
Lin. Struct. Formula (LSF): C16H10Cl2N4O2
：
：
L5 ANSWER 2 OF 3 REAXYSFILE COPYRIGHT 2016 Elsevier Properties SA. on STN
Accession Number (AN): 12360864
Chemical Name (CN): 6-cyano-2-(2,3-dichloro-phenylamino)-3H-be nzoimidazole-4-carboxylic acid
Lin. Struct. Formula (LSF): C15H8Cl2N4O2
：
：
L5 ANSWER 3 OF 3 REAXYSFILE COPYRIGHT 2016 Elsevier Properties SA. on STN
Accession Number (AN): 12360803 Lin. Struct. Formula (LSF): C15H7Cl2N3O3
：
： N N
O O N
N Cl
Cl
N
N O O
N
N
Cl Cl
N
O
O O
N N
Cl Cl
サンプル検 索 を実 行 する
* 構 造 質 問 式 は，REGISTRY，ReaxysFile 共 通 で使 用 できる
REGISTRY フ ァ イ ル でも ヒットした物 質
REGISTRY フ ァ イ ル でも ヒットした物 質
REGISTRY フ ァ イ ル で は ヒットしなかった物 質 メチルエステル体
・ ReaxysFile ファイルでは，REGISTRY ファイルに収 録 されていない物 質 もヒットした．
・ ヘテロ原 子 が硫 黄 である化 合 物 は見 つからなかった．