<モノマーSCC計算終了後>
• フラグメントの正電荷の中心 : + charge center
モノマーSCC計算の結果に無関係に、原子核の位置が指定された段階で決まる値。各フラグメントご とに出力される。
• フラグメントの負電荷の中心 : - charge center
モノマーSCC計算で得られた各フラグメントの電子密度から計算される。各フラグメントごとに出力 される。
<モノマー計算終了後>
• モノマーエネルギー 1: rhf ( E’ )
原子核のポテンシャルエネルギーおよび外部静電ポテンシャルとの相互作用エネルギーを含めたモノ マーのエネルギー。環境静電ポテンシャルからの寄与は除外されている。
E0HFI+ZuI
+ZI−ext (1.72)
• モノマーエネルギー 2: rhf ( E” )
モノマーエネルギー1から、外部静電ポテンシャルとの相互作用エネルギーを取り除いた値。外部静電 ポテンシャルが存在しない場合は、モノマーエネルギー1と同じ値となる。
E00HFI+ZuI
(1.73)
• FMO1–RHFエネルギー1: total
原子核のポテンシャルエネルギーおよび外部静電ポテンシャルとの相互作用エネルギーを含めたFMO1–
RHFエネルギー。
X
I
n
E0HFI+ZuI+ZI−exto
(1.74)
• FMO1–RHFエネルギー2: internal
FMO1–RHFエネルギー1から、外部静電ポテンシャルとの相互作用エネルギーを取り除いた値。外 部静電ポテンシャルが存在しない場合は、FMO1–RHFエネルギー1と同じ値となる。
X
I
n
E00HFI+ZuIo
(1.75)
• FMO1–RHFエネルギー3: external
FMO1–RHFエネルギー1のうち、外部静電ポテンシャルとの相互作用エネルギーのみの値。FMO1–
RHFエネルギー2とFMO1–RHFエネルギー3を足すとFMO1–RHFエネルギー1になる。外部静 電ポテンシャルが存在しない場合はゼロとなる。
X
I
n
T r DIVeI
+ZI−ext o
(1.76)
<ダイマー計算終了後>
• RHF–IFIE 1:rhf
原子核のポテンシャルエネルギーと外部静電ポテンシャルとの相互作用エネルギーを含めたIFIE。
∆EHFIJ+ZuI−J
(1.77)
• RHF–IFIE 2:rhf ( cp )
RHF–IFIE 1からBSSEの見積もり値を引いた値。
∆EHFIJ+ZuI−J−EHF−BSSEIJ (1.78)
• FMO2–RHFエネルギー1: total
原子核のポテンシャルエネルギーと外部静電ポテンシャルとの相互作用エネルギーを含めたFMO2–RHF エネルギー。
X
I
n
E00HFI+ZuI
+T r DIVeI
+ZI−ext o
+ X
I>J
n
E00HFIJ−E00HFI−E00HFJ
+T r(∆ ˜DIJ VIJ) +ZuI−J+T r(∆ ˜DIJVeIJ) o
(1.79)
• FMO2–RHFエネルギー2: internal
FMO2–RHFエネルギー1から、外部静電ポテンシャルとの相互作用エネルギーを取り除いた値。外 部静電ポテンシャルが存在しない場合は、FMO2–RHFエネルギー1と同じ値となる。
X
I
n
E00HFI+ZuIo + X
I>J
n
E00HFIJ−E00HFI−E00HFJ
+T r(∆D˜IJVIJ) +ZuI−Jo
(1.80)
• FMO2–RHFエネルギー3: external
FMO2–RHFエネルギー1のうち、外部静電ポテンシャルとの相互作用エネルギーのみの値。FMO2–
RHFエネルギー2とFMO2–RHFエネルギー3を足すとFMO2–RHFエネルギー1になる。外部静 電ポテンシャルが存在しない場合はゼロとなる。
X
I
n
T r DIVeI
+ZI−exto +X
I>J
T r(∆ ˜DIJVeIJ) (1.81)
表 1: グローバル変数との対応(FMO−RHFエネルギー関連)
変数名 次元数 値
rhf mon energy d フラグメント数 E0HFI
rhf mon trdv フラグメント数 T rn
DIVIo
rhf mon trdv e フラグメント数 T r
n
DIVeIo
rhf mon energy vac cp フラグメント数 EvacHF
I
rhf dim ifie フラグメントペア数 ∆EHFIJ
rhf dim trdv e フラグメントペア数 T rn
∆DIJVeIJo
rhf dim ifie cp フラグメントペア数 EHF−BSSEIJ
表 2: グローバル変数との対応(FMO−RHFエネルギー関連)
変数名 次元数 値
frag nuclear repulsion フラグメント数 ZuI
frag nuclear ext フラグメント数 ZI−ext
scc d mat フラグメント数* nbo2 D˜sX(a)
scc mulliken ba 基底関数の数 psB(a)
scc mulliken bo nbo
D˜sXS
λλ (a)
rhf mon nmo フラグメント数 分子軌道の数(b)
rhf mon moe フラグメント数* nbo 軌道エネルギー
rhf mon moe vac cp フラグメント数* nbo 軌道エネルギー(c)
rhf mon c mat フラグメント数* nbo2 係数行列
rhf mon c mat vac cp フラグメント数* nbo2 係数行列 (c)
(a)モノマーSCC計算で得られた値。各フラグメントごとに記録される。イタレーションごとに上 書きされ、最終的な値が残る。
(b)正準直交化を使う場合、nboと異なる可能性がある。
(c)真空中で計算された値(つまり、環境静電ポテンシャルを考慮せず計算された値)。BSSEの値 を見積もる際に使用される。