。
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Guanine H
8・Aza伊lanine (8AG) 7・Methylguanine (7MG)
Guanine 8AG 7MG
CH30
CH30
3,4-Dimethoxyphenylglyoxal
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HBr ...__色 CH3Q
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06-Methylguanine
(06MG) Guanine CH30
Expected t1uorophore (Ex 400 nm, Em 520 nm)
Fig.4・1 Demethylation and f1uorescence derivatization of guanine derivatives
民10bile phase C H3CN ( 2-18 % ) in 20 mM Na圃acetate buffer (pH 3.75)
4 MNaOH in 0.5 M Na-acetate
buffer (pH 6.0)
50 mM DMPG in 20 % methylcellosolve in 0.5 M Na- acetate buffer ( pH 6.0) 4加IHBr
High pressure pump
Fluorescence detector Ex 400 nm,
Em510 nm 0.8 mL/min
p
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0.4 mL/min
CJ唱。コ
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ColumnI吋ector TSK- geIODS-120T Reaction bath (110 0 C)
1司1aste Fig.4・2 Schematic diagram of the post-column fluorescence derivatization HPLC system
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クロマトグラム
Fig. 4-3 (A)にモデル化合物5種の混液(各25nmol/mL)の クロマトグ
ラムを示す。 これらの物質は18 分以内に良好に分離された。 一方、 Fig. 4-3 (B)にHBr添加後、 脱メチル化用の反応コイルを通さず直ちにアルカリ溶液
を加え、 DMPG試薬による蛍光誘導体を行った時に得られたクロマトグラ ムを示す。 06MG由来のピークは全く検出されず、 06MGの検出にはHBr
による脱メチル化反応が必要であることが分かった。
4-2
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脱メチル化反応条件の検討
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06MGをDMPGと反応可能なGuanineに導く ための脱メチル化反応条件 N
の検討を行った。
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(%)NJ�J (1) 反応温度
反応コイルの加熱温度を80-110OCの範囲で検討した。 ただし、 機器の構 成上蛍光誘導体化反応の温度も脱メチル化反応と同じになる 。 反応温度の上 昇に従って蛍光も増加した。 120t以上では気泡の発生によりベースライン の乱れが見られた。 従って 、 反応温度は1100Cに設定した。
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HBr濃度
06MGの脱メチル化 時に用いる酸性溶媒として種々の濃度のHI、 HBr、
HCl、 HCI04及びHN03について検討した(Fig. 4-4) 。 検討した溶媒の中 では4MHIが最も良い結果を与えた。 しかし、 HIは非常に酸化されやすく 扱い難いため 、 本研究ではHBrを用いた。 また、 HBr濃度が高いほど06MG 由来のピークも高い値を示した。 本法では4MHBrを使用した。
54
(2)
HBr (4 M) HBr (3 M) ID(4M) ID(3M) E百αM) HCI (4加の HCI04(4加の HN03(4 M)
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Peak height (arbitrary unit)
Fig.4・4 Effect of the acids on the conversion of 06-methylguanine into guanine
56
(3) コイル長さ
脱メチル化反応に 使用する反応コイルの長さを0-30 mの範囲で検討し た(Fig. 4-5 ) 0 06MG由来のピークは、 反応コイルが長くなるに従い脱 メチル化反応が進行し増加した。 本法では30 mに コイル 長さを設定した。
なお、 30 mのコイルは約5分の反応時間に相当する。
一方、 Guanine、 8AG、 7MGのピークは、 コイルが長くなるに従い若干 低くなるが、 GMPのピークはコイル長さ が10 mの時 に最大 となった。 GMP はHBr存在下加熱に よりリボース5 -リン酸部位が切れ、 DMPG との反応性 の高 い Guanineになったものが蛍光誘導体化されるものと 考えられた。
4- 4 蛍光誘導体化条件の検討
(1) pH
蛍光誘導体化反応に おけるpHの検討を行 った(Fig. 4- 6) 0 pH 5.5以 上では、 ベースラインノイズが著しく増大した。 そのためpH が4.6-5.2 になるように試薬の流量を設定した。 本システムは、 高濃度の酸及びアルカ リを使用するため厳密に pHを固定できないが、 pH4.5以降は、 検討した
グアニン類の蛍光ピークの挙動はほぼ同じであるため 、 メチルグアニン類の 測定の際は既知の濃度の GMP、 8AGなどを内標準物質として添加し、 蛍光 誘導体化反応時のばらつきを補正した。
(2) 試薬濃度
DMPG試薬濃度を0-50mMで検討した(Fig. 4-7) 0 GMP、 Guanine、
06MGはDMPG濃度 が40mMでほぼ一定 となった。 一方、 8AG、 7MG は DMPG濃度の増加 と共に 増加した。 試薬の可溶性を考慮し、 DMPG濃度を
50mM に 設定した。
4- 5 検量線及び検出限界
検量線 (0-1 nmol/HPLC注入量)はすべて原点を通る直線を示した。 相 関係数は、 γ= 0.9989- 0.9996 であった。 GMP、 Guanine、 8AG、 7MG及 び06MGの検出限界(S/N = 3 )は、 それぞれ4.2 、 1.7, 18 、 22及び2.3 pmol/HPLC注入量であった。
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Reaction coillength (m)
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Fig.4・5 E住ect of the reactioo coil Ieogth (0.5 mm i.d.) 00 the demethylatioo of 06-methylguaoioe
Curves: l=Guanine; 2=06.Methylguanine; 3=GMP;
4=8・Azaguanine; 5=7・MethyIguanine.
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pH
Fig.4・6
Effect of pH 00 the post-columo f1uoresceoce derivatization of guanine and its methylated compounds with
DMPG
Curves: l=Guanine; 2=06-Methylguanine; 3=GMP;
4=8・Azaguanine; 5=7・Methylguanine.
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DMPG
concentration(mM) Fig.4・7
4-6 メチル化DNAの調製(in vitro)
DNA溶液(Salrnon t e stis : 4 .0 mg/mL)にメチル化剤 である20mM Nも1e thyl- N-nitr osou r ea (MNU ) 溶液を加え、 37 tでインキュベートし た。 メチル化反応終了後、 冷エタノールを加え、 沈殿した メチル化DNAを 0.1 Mリン酸 溶液中 70t、 6 0分間 加水分解した。 加水分解した DNA溶液 10μLに 0.2 M酢酸ナト リウム緩衝液(pH 6 .5 ) 5μLを加え、 内部標準 物質として 20 n rnol/mL GMP溶液 5μLを加えHPLCに附した。
4- 7 メチル化DNAの調製(in vivo) 2
3
Spragu e -Dawley ラット (雄、 70-100 g)に 50mg/kgMNUを腹腔内投 与した。 対象には MNUの代わりに生理食塩水を腹腔内投与した。 投与後、
肝臓を取りだし-8 0tで保存した。 メチル化されたラット肝臓 DNA は市販 のDNAアイソレーションキット (フナコシ社製 )を用い単離した(Table 4- 1 )。 加水分解 は4-6と同様に行った。
4
5
4-8 メチル化DNAの計測
50
(1) in vitro
基準操作に従って処理し得られたクロマト グラムをFig. 4-8に示す。 メ チル化剤添加後直ちに 加水分解した試料は、 DNA中のグアニン含有ヌクレ オシド、 ヌクレオチドはリン酸による加水分解によりすべてGua nin eに変
換し、 他のグアニン類は全く検出されなかった(Fig. 4-8(B))。
一方、 メチル化剤添加後37 t、 120分間 インキュベートした試料は、 MNU 添加による7MG 及び06MGの生成が確認できた(Fig. 4-8 (A)) 。
次に、 MNU添加におけるインキュベーション時間及び添加 濃度について 調べた(Fig.4-9)0 7MG、 06MGの生成は インキュベーション時間 と共に 増加した。 120分の インキュベーション時間におけるMNU濃度を検討した ところ、 濃度の増加に伴い 7MG, 06MGの生成量は増大した。 20mMMNU のメチル化条件における7MG、 06MGの生成量は、 DNA 1 rng あ たりそれ
ぞれ4 nmol及び 496 prnolであった。
E町ect of DMPG concentration
00the post-column
t1uorescence derivatization of guanine and i臼methylated compounds
Curves: I=Guanine; 2 =06-Methylguanine; 3=GMP;
4=8・Azaguanine; 5=7・Methylguanine.
Carcinogen treatment and DNA isolation from rat Iiver usingGNO恥fE™ DNA ISOLATION KIT
Table 4-1
0.4 rnL 0.1 rnL 5 mg/mL methylated
DNA
(in 0.1 M Phosphoric acid) 500 nmoVrnL 8AG (IS)
勉盟副皇 ↓
DNA hvdrolvsis Protocol
Sprague-Dawley rat (Mail, 70・100g)
I
�一一I.P .injection of 50 m時g N-Meth句旬剛1りザ刷yμr}ト-N-n凶itrosoωu山ueaI
2,4, 8, 1凶6and 2μ4hRat liver ;200 mg 70 oC, 60 min
1.48 mL
SamDle for HPLC 40μL
RNase MIXX 唱‘一一一
16μL 4μL Sample
1
M
_�
a-acetate buffer pH 6.0↓
Apply to HPLC 80μL
20μL 400μL SALT OUT MIXTURE
4 oC, 10 min Centrifuge, 10 min Supernatant
1.6mL 10m島1 Tris-HCI bufTer pH 7.5
(containing 1 mM EDTA)
6.4 rnL (Eliminate the excess EtOH by blotting or air drying the