BIOiPLUG16SrRNA菌叢解析機能について
糸状菌メロテルペノイドの複雑骨格構築に関わるα-ケトグルタル酸依存性ジオキシゲナーゼの構造機能解析
... 審 査 の 結 果 の 要 旨 氏名 中嶋 優 本学位論文において中嶋優は「糸状菌メロテルペノイドの複雑骨格構築に関わる α-ケトグルタ ル酸依存性ジオキシゲナーゼの構造機能解析」という題目で、糸状菌二次代謝経路に存在する複 数の α-ケトグルタル酸（αKG）依存性ジオキシゲナーゼに対する、X 線結晶構造解析及びその機 能解析を行った。 αKG ...
2
肺腺がんにおけるmiR-26a機能解析
... 32 次に、細胞の増殖速度に対する miR-26a の影響について検討を行った。 先ほどのアッセイ同様、H1299 細胞に miR-26a 発現ベクターをトランスフ ェクションした miR-26a 強発現細胞グループとコントロールベクターをト ランスフェクションしたコントロール細胞グループを用意した。それら細胞 を 96 well plate に播き、24 時間後、48 時間後、72 時間後にそれぞれ生細 ...
70
リボソームアッセンブリーにおけるrRNAメチル化修飾の機能解析
... rRNA 修飾はその化学的性質によって、RNA の局所的な構造形成に寄与していると考えられる。例えば、水 素原子の代わりにメチル基が入ることで、水素結合を弱めたり、疎水性相互作用を強めたりする効果がある。ま た、嵩高い置換基が入ることで、立体構造上の間隙を埋める効果も期待される。リボース 2’位のヒドロキシル基 はしばしばメチル化される（2’O メチル化修飾）ことが知られているが、この位置のメチル化により、リボースのコン ...
8
信州大学審査学位論文 小児感染症起因菌に関する細菌学的解析 2014 年 3 月 久保田紀子
... る発熱や白血球数の増加、 C-reactive protein: CRP 値の上昇等の変化がとらえ にくい 3) 。これらはすべて、感染起因菌に対する免疫系細胞の活性化の結果ひ きおこされる身体所見であるため、免疫系の未熟な低出生体重児であるほどそ の傾向は強い。そのため、感染症発症の予兆がとらえにくく、感染兆候を検出 したタイミングにはすでに感染が進行している場合もある。よって、感染症の ...
79
小細胞肺がんにおけるTGF-βシグナルの機能解析
... 【背景・目的】 小細胞肺がんは肺がん全体の約 15%を占め、肺がんの中でも予後不良のがんである。一方 で、 transforming growth factor-β (TGF-β)は細胞の増殖や分化の調節に関わる cytokine であり、 がんでは腫瘍抑制的もしくは腫瘍促進的に作用することが知られている。小細胞肺がんの 多くの細胞では TGF-β シグナルの伝達に不可欠な TGF-β type II receptor ...
3
小脳プルキンエ細胞におけるmTORシグナルの機能解析
... print 解析を行ったところ、L7-mTOR Tg マウスでは運動協調能に異常がある ことが確認された。オープンフィールドテストでは、Control マウスと比較して、L7- mTOR Tg マウスの行動時間および移動距離の減少が見られたが、不安様行動について は有意な差は認められなかった。Three chamber test では、L7-mTOR Tg マウスにお いて社会行動の異常は認められなかった。 ...
2
組織・器官形成におけるゼブラフィッシュDdx46 の機能解析
... 体が単離されていた。 Ddx46 変異体の表現型の解析を行った結果，消化器官や脳形成に異 常が起こる事，消化器官や脳の形成に必要な遺伝子の pre-mRNA スプライシングが異常 になる事が明らかとなった。ゼブラフィッシュ Ddx46 は，発生の初期においては胚全体で 発現しているが，発生が進むにつれて特定の組織・器官（消化器官や脳など）に発現が限 ...
3
目次 生命科学系の研究分野において主にゲノムデータ解析用の プラットフォームとして使われている Galaxy について オンデマンドクラウド機能を活用して解析環境を提供する 事例をご紹介します 1. データ解析プラットフォーム Galaxy とは 2. Galaxy によるNGSデータ解析について
... オンデマンドクラウド機能を活用して解析環境を提供する 事例をご紹介します。 1. データ解析プラットフォーム Galaxy とは 2. Galaxy によるNGSデータ解析について 3. クラスタ構成の Galaxy 環境 ...
26
網羅的遺伝子発現解析を用いた白色腐朽菌のリグニン分解酵素生産制御機構に関する研究
... LiP 遺伝子群はこれらのクラスターにすべて含まれていた。 5）遺伝子のアノテーション クラスター5、6 および 8 に含まれる合計 168 の遺伝子断片についてアノテーションを行 った結果、 140 の遺伝子断片が 138 の推定 CDS（Coding Sequence）にアノテートされた。 138 の Protein ID のうち、80 についてはタンパク質の機能が JGI の Gene ...
4
質量分析計を用いて腸内細菌叢が産生するD-アミノ酸を新発見―高感度ハイスループット・キラルアミノ酸解析でD-アミノ酸研究に新展開―
... 参考資料（５） 本研究で検出されたD-アミノ酸数が、盲腸内容物を解析した先行研究(Nat Nicrobiol 1: 16125, 2016)と比較して 大幅に多いのは、解析対象が結腸内容物と盲腸内容物で異なる点や腸内菌叢の差異に起因する可能性はあるも のの、本研究で用いたLC-MS/MSキラルアミノ酸高感度一斉分析法が、従来法と比較して、高感度に遊離D-アミノ ...
5
イネ開花遺伝子Hd3aの機能解析
... 成 16 年 か ら 日 本 学 術 振 興 会 特 別 研 究 員 に 採 用 さ れ 、 研 究 奨 励 金 を 御 支 給 し て い た だ い た 日 本 学 術 振 興 会 に 深 く 感 謝 申 し 上 げ ま す 。 本 研 究 を 進 め る に あ た り 直 接 御 指 導 を 賜 り ま し た Wong Hann Ling 助 教 、岩 手 大 学 横 井 修 司 准 教 授 、農 業 生 物 資 ...
74
脂肪滴周囲蛋白Perilipin 1の機能解析
... て PLIN1c の発現が主として増強され、既報と同様 35 、PLIN1a は主に中性脂肪の 貯蔵に、PLIN1c は主にコレステロールエステルの貯蔵に機能している事を支持 する結果であった。 過剰発現系を用いた検討においては、PLIN1a、PLIN1c いずれの過剰発現系に おいても、PLIN1 の過剰発現によって Y-1 のプロゲステロン産生量は低下する結 果となった。この結果からは PLIN1 ...
59
粘膜免疫におけるFcα/μ受容体の機能解析
... 皮細胞への接着、侵入を防ぎ、粘膜免疫の中心的な働きを担っている(Maliszewski et al., 1990; Monteiro, 2010; Monteiro and Van De Winkel, 2003)。さらに腸管管腔側で中和抗体と して機能するだけでなく、IgA は小腸パイエル板の M 細胞に選択的に結合し、トラン スサイトーシスにより腸管管腔側から腸管関連リンパ組織 (gut-associated ...
69
[ 研究報告 ] * 大根塩漬けからの乳酸菌単離とスターターとしての検討 ** 玉川英幸 大根の一本漬は自然に起こる発酵を通して製造される日本の伝統漬物である 本研究では 塩漬け大根より乳酸菌の単離を試みた 乳酸菌菌叢の変化を解析した結果 漬込みの初期の発酵は Leuconostoc mesente
... は 16S rDNA 配列の相同性が 98.2%であり、系統分 類学的には極めて近しい菌種である 3, 5) 。 乳酸菌の系統分類学的な報告を行ったFelisとDellaglio の報告では、どちらも Lactobacillus sakei グループに属す る菌種として分類されている。 3 つの樽において同様の 微生物種が似たような増殖パターンを示したことから、 ...
5
粘膜免疫におけるFcα/μ受容体の機能解析
... 抗体は Fc 部分の違いにより IgM, IgG, IgA, IgE, IgD の 5 種類に分類される。免疫細胞上には 抗体の Fc 部分に対する受容体である Fc 受容体が発現しており、抗原複合体を形成した抗体との 結合の結果、様々な免疫応答を誘導することが知られている。これまでに複数の Fc 受容体が同定 され、貪食、細胞障害活性には IgG を介した反応が、アレルギ一反応には IgE を介した反応が必 ...
4
共起関係解析によるタンパク質の機能モジュール探索法の開発
... 目的 • 非常に多くのゲノム・プロテオームに関する情報の集積体（データ ベース）が構築されている。 • 疾病関連遺伝子やタンパク質の機能を示すドメインやモチーフ、薬剤 などの相互作用部位を現すリガンド相互作用サイト、タンパク質-タン パク質相互作用サイトなどが挙げられる。 ...
29
脂肪滴周囲蛋白Perilipin 1の機能解析 [全文の要約]
... Doc URL http://hdl.handle.net/2115/70565 Type theses (doctoral - abstract of entire text) Note この博士論文全文の閲覧方法については、以下のサイトをご参照ください。; 配架番号：2414 Note(URL) https://www.lib.hokudai.ac.jp/dissertations/copy-guides/ ...
5
枯草菌芽胞形成制御因子Spo0Mタンパク質の構造と機能に関する研究
... 1. 枯草菌芽胞形成制御因子Spo0Mの機能解析 枯草菌のゲノムDNAに存在するspo0M遺伝子をクローニングし、Spo0Mタンパク質 を大腸菌で大量発現した後に、その単離と精製を行った。同様にCcpAタンパク質と CcpAのエフェクター タンパク質である HPr-Ser-P（Ser46がリン 酸化された histidine- containing phosphotransfer ...
4
癌の進展におけるTGF-βシグナルの機能解析
... 導いただきました分子病理学分野の鯉沼代造准教授に深く感謝致します。腫瘍組織の 解析にあたり御協力いただきました分子病理学分野の森下保幸技術専門員、東京大学 医学部付属病院肝胆膵外科の青木琢講師、國土典宏教授に深く感謝致します。本研究 で使用したプラスミドや阻害剤をいただきました理研バイオリソースセンター細胞 運命情報解析技術開発サブチームの三好浩之博士、京都薬科大学創薬科学フロンティ ...
122
目次 1 SAP2000 概要 SAP2000 基本解析機能 SAP2000 の解析モデル要素機能 材料特性 ジョイント フレーム要素 シェル要素 平面 / 軸対称 / ソリッド要素
... 周期解析では、周期的な外力荷重として機械振動のような調和振動波形（SIN、COS 波）や、 風荷重や波浪荷重のような定常振動波形 （調和振動波形でなくてもかまいません）を与え、 モード重ね合せ法を適用して 1 周期分の線形応答値を計算します。 過渡応答解析では、地震荷重（地動加速度入力）やランダム振動荷重（ = 荷重条件 x 時間 変動関数）に対する応答値を、モード重ね合せ法または直接積分法 ...
16