Top PDF 計算科学計算機科学

計算機生命科学の基礎II_

... • DNA binding, E-box binding, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific DNA binding, core promoter proximal region sequence-specific DNA binding, double-strande[r] ...

42

Microsoft PowerPoint - 計算機科学入門2014.pptx

... 講義の目的目的：計算機科学に興味を持ってもらう背景：卒業研究を始めるまでは，基礎的な勉強が主で，そこで学んだことがどう役に立つのか，何か面白いことができるのかが分かりにくい ...

7

計算科学研究センターの将来構想分子研リポート2001 | 分子科学研究所

... 将来計画及び運営方針 253 5-3-1 現在の計算機システムと運用２００２年２月現在の計算機システムの概要を下図に示す。図の左側は２０００年３月に導入されたスーパーコンピュータシステムであり，来年度に更新が予定されている汎用高速演算システムが右側に示されている。 ...

4

理論・計算分子科学研究領域

... c). 量子ドット列における励起子ダイナミクスの理論 d). 金属クラスターの電子物性 A -3). 研究活動の概略と主な成果 a). 理論や計算手法の開発と計算機能力の飛躍的な向上のおかげで，次世代量子デバイス候補となり得るナノ構造体の個々の物性の理解は格段に進んでいる。しかしその一方で，大容量，超高速，超極小，高効率，新規化学反応性等， ...

33

理論・計算分子科学研究領域

... フィリングの有機導体で電荷秩序を有し，光誘起融解ダイナミクスがよく調べられている a - ( B E D T - T T F ) 2 I 3 の初期過程に注目した。電荷秩序を安定化するのに最も重要なのはクーロン相互作用である。光照射後数百フェムト秒の時間スケールでは分子配置の変化に対応する格子振動との結合が見えていた。光照射直後数十フェム ...

33

理論・計算分子科学研究領域

... b). G T P 結合タンパク質 R as は，細胞増殖に関わるタンパク質である。我々は，G T P 加水分解反応前後の揺らぎや構造変化が，どのように反応（機能発現）に影響しているか分子動力学法，電子状態計算を用い調べている。GT P 結合型， G D P 結合型など R as の様々な状態における揺らぎを解析し，R as の構造の多様性を明らかにした。また，それらの ...

31

計算科学研究センター（3ページ）分子研リポート2012 | 分子科学研究所

... 研究施設の現状と将来計画　319 タベース研究会の活動を支援し，同会から提供された量子化学文献データベースをホームページから検索できるようにしている。これまでに合計 118,989 件のデータが収録され，世界 91 カ国から利用されている。共同利用に関しては，２０１２年度は 190 研究グループにより，総数 697 名にもおよぶ利用者がこれらのシステムを ...

3

理論・計算分子科学研究領域

... b) 量子−古典混合系近似に基づいて，水溶液中における分子内プロトン移動の量子動力学シミュレーションによる検討を進めている。状態間デコヒーレンスの速い系を有効に記述し得るサーフィスホッピングの枠組みの中で，シミュレーションに用いられる運動方程式に関して，前年の透熱表示に引き続き，今年度は断熱表示による書き下し等方法論の確立に努めた。モデル系に対する予備的な計算では， ...

31

理論・計算分子科学研究領域

... (3)　この分野の国内，国外での研究分野としての重要性本研究分野は量子力学，統計力学，分子シミュレーションを中心とした分子科学分野の理論・方法論を基礎として，分子およびその集合体の構造，物性，化学反応，相転移，ダイナミクスなど物質が示す様々な現象を電子・原子レベルから理論的に考究する学術分野であり，計算機科学の発展とも相俟って，現在，急速にその重要性に対する認識が ...

10

Microsoft PowerPoint - 阪大計算科学特論A pptx

...  経験的には、 PCの１０００倍高速で、１０００倍大容量なメモリをもつ計算機  輸出貿易管理令別表第一及び外国為替令別表の規定に基づき貨物又は技術を定める省令（平成二十九年十二月六日公布（平成二十九年経済産業省令第八十七号）改正） ...

141

... A -3) 研究活動の概略と主な成果 a) サイズの大きい分子が与える外部空間および内部空間は新しい機能発現として有用である。このために，金属内包フラーレンの L a 2 @ C 80 のシリル化による内包金属の二次元ホッピング運動，S c 2 C 2 を内包した C 80 フラーレンの新規な構造と化学修飾，一次元に並んだ K n C 60 を内包したカーボンナノチューブの構造と電子特性，ナフタレンなど ...

24

理論・計算分子科学研究領域

... A -3). 研究活動の概略と主な成果 a). 当研究グループでは，「電子と電子との複雑な多体相互作用の複雑な量子効果」を根源とする化学現象や化学反応をターゲットに，その高精度な分子モデリングを可能とするような量子化学的な手法開発を目指している。特に着目するのは，多重化学結合と解離，ナノグラフェン，有機磁性体，生体反応中心などの共役分子の光化学・スピン物性，金属化合 ...

32

計算科学研究センターの現状と今後分子研リポート2003 | 分子科学研究所

... 266 将来計画及び運営方針スーパーコンピュータシステムは，富士通製 V PP5000 と S GI 製 Origin から構成されている。V PP5000 は 1 C PU 当たりの最高演算性能が 9.6 Gflops のベクトル演算装置 30 台から構成され，各 C PU に 8 ∼ 16 GB の主記憶装置をもつベクトル並列計算機である。一方， S GI Origin は 1 C PU ...

4

計算科学研究センター（3ページ）分子研リポート2011 | 分子科学研究所

... 一方，高性能分子シミュレータは，演算サーバ，ファイルサーバ，フロントエンドサーバおよびネットワーク装置から構成される。演算サーバは，日立製作所製の S R 16000 であり，1. C PU コアあたり 18.8. G fl ops の演算性能を持ち， 1 ノードが 32.C PU コアと 256.GB yte メモリを有する共有メモリ型スカラ計算機である。理論総演算性能は 5.4.T flops， ...

3

計算科学研究センター分子研リポート2006 | 分子科学研究所

... ２００７年１月現在の計算機システムの概要を下図に示す。システムは大きく分けて２系統からなる。最初のものは共同利用に供している超高速分子シミュレータと汎用高速演算システムからなり，前者は今年度，２００６年７月に新たに導入され，後者は２００３年３月に更新されて山手地区に設置されている。もうひとつは，次世代スーパーコン ...

2

_計算科学が拓く世界.key

... 気候変動とその機構を解明大気モデルを用いた数値実験や、長期間の気象海洋観測データ、現業数値天気予報データの解析理学研究科地球惑星科学専攻の協力講座、大気科学分科に所属 ...

48

計算科学研究センター分子研リポート2004 | 分子科学研究所

... (d)アプリケーション利用キューを新設し，機種に依存しない W eb からの標準入力で，量子化学計算で最も利用頻度が高い Gaussian プログラムの効率的実行を初心者にも簡便に実行可能にした。これらの変更により，これまでと比較して格段に大規模な計算が実行できるようになった。たとえば，HF /6-31G(d) 法で，原子数 338，基底関数 4,238 の分子系の S C F（21 回）+force ...

3

計算科学研究センター分子研リポート2004 | 分子科学研究所

... 先端の研究拠点としての役割を担ってきた。同様に分子科学研究所の計算機センターは最新の計算機を分子科学の研究者に提供することにより，わが国における計算化学，シミュレーション研究に多大の貢献をしてきた。特に創立後の１０ ...

5

理論・計算分子科学研究領域

... c) 数 nm 程度以下の固体表面担持金属ナノクラスターは，有用な触媒として働くことが多くの研究において指摘されている。しかし，貴金属やレアメタル等の非常に高価な原子を使っていることが多く，豊富に存在する安価な原子で代替した触媒の開発が望まれている。本研究課題では第一原理（カー・パリネロ）分子動力学計算を用いて，固体表 ...

20

理論・計算分子科学研究領域

... c) 固体表面担持金属クラスター触媒の第一原理分子動力学計算 d) 金属クラスターの光電子物性 A -3) 研究活動の概略と主な成果 a) 最近のナノテクノロジーの飛躍的な進展のおかげで，極めて精緻な高次ナノ構造体を数 nm 程度以下の精度で作成することが可能となってきた。この様なナノ構造体と光が相互作用すると，従前の光応答では見られなかった光励 ...

21

計算科学 計算機科学

関連した話題

計算科学計算機科学