分子構造学第一研究部門 125
文部科学省科学研究費補助金 新学術領域研究 ( 平成 23~27 年度 ) 領域略称名 : 有機分子触媒 領域番号 :2304 有機分子触媒による未来型分子変換 News Letter No Oct. 研究紹介 第一級
... はじめに Kagan らの手法にならい、遷移状態に関与 する触媒量を推定したところ、遷移状態におけるエノ ンと触媒は等量であることが分かった 2 。これを踏まえ、 触媒 1 とシクロヘキセノンから得られるイミンの構造 を DFT 計算によって求めた結果、イミン中間体におい てリチウムカチオンはイミンの窒素とカルボキシル基 の酸素の他に、シロキシ基の酸素と溶媒であるジメチ ...
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電子構造研究系 分子研リポート2002 | 分子科学研究所
... （この分野の国内，国外での研究分野としての重要度と今後の発展方向） 本研究分野では，基礎と応用の立場から，分子および分子集合体の化学反応をはじめとした種々の物理，化学過程 を研究対象としており，分子科学の基礎研究の中心的な分野となっている。近年のレーザー技術や理論計算法等の研 ...
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電子構造研究系 分子研リポート2005 | 分子科学研究所
... 大森賢治 , 「分子の内部量子状態を用いた光位相敏感メ モリ ー」 , 強光子場科学懇談会 , 浜松 , 2005年 1 月 . K. OHMORI, “Phase Sensitive Memory in Molecular Wave Packets; How to READ and WRITE with molecules,” Seminar at Pennsylvania University, ...
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電子構造研究系 分子研リポート2004 | 分子科学研究所
... -3) 研究活動の概略と主な成果 a) 芳香族分子は， 光励起によって多様な緩和過程や化学反応を示すが， これらは外部環境によって大きく影響される 場合も多い。 このような 「溶媒効果」 に対する微視的モデルとして気相クラスターを取り上げ， 周波数領域および実 時間領域の各種レーザー分光を併用することにより， 水素結合や分子の配列形態のような静的構造因子が， 無輻射 ...
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電子構造研究系 分子研リポート2003 | 分子科学研究所
... を用いて， 分子内の２個の波束の量子干渉を 100% のコントラストで完全制御し， 重粒子の純粋な波動性を抽 出する事に成功した。 また， この高精度量子干渉を量子論的な重ね合わせ状態の検証に応用した。 c) 光子場の位相情報を分子波束の量子位相として転写する分子メモリーの開発を行なった。 ここでは， フェムト秒光 パルス対によって分子内に生成した２個の波束間の量子位相差をサブ ...
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電子構造研究系 分子研リポート2002 | 分子科学研究所
... -3) 研究活動の概略と主な成果 a) 溶質 ・ 溶媒分子で構成される溶媒和クラスターは凝集相のミクロなモデルであり， その構造と反応性は凝集相での 反応 ・ 緩和や溶媒効果を分子論的に理解する上で理想的な試料系である。 同時に特に水素結合で形成される溶媒和 クラスターは溶液と同じく光励起プロトン移動反応をを起こすが， 反応活性にはクラスターサイズ依存性が有るこ とが知られている。 ...
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電子構造研究系 分子研リポート2005 | 分子科学研究所
... 私にとっては，系の主幹の，気相と固相とを繋げるであろう仕事を貫く研究の本筋に興味があります。混合系にお ける集中的な仕事を通して，その発見が科学者のコミュニティーに化学結合に関するこれまでになかった詳細な洞察 を与えるでしょう。ある場合には，凝縮相に於いてもその構造を保ったクラスターの集合体が存在し，物質の性質を ...
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電子構造研究系 分子研リポート2001 | 分子科学研究所
... ) 研究活動の課題と展望 【金属ク ラス ターのサイズ選択的合成】 E S I-T OF 質量分析装置が完成し， 金属ク ラス ターの合成やそのエレク ト ロスプレー イ オン化に関する ノ ウハウ もかな り 蓄積された。 その結果， 金属ク ラス ターの構造や生成過程に関して新しい情報が得られ つつあるが， 同時にい く つかの課題も明らかになった。 ①現在は， デン ドリ マーによ ...
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電子構造研究系 分子研リポート2000 | 分子科学研究所
... b) イオン化検出赤外分光法は独自に開発した高感度赤外分光法であり波長可変赤外レーザーで生じる振動励起分子 を紫外レーザーで選択的にイオン化して検出する二重共鳴分光法である。 赤外遷移をイオン検出すること及びバッ クグラウンドフリーであることから極めて高い検出感度を有し、 試料濃度が希薄な超音速ジェット中で吸収係数が 極めて小さな高次倍音を明瞭に観測できる。 ...
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電子構造研究系 分子研リポート1999 | 分子科学研究所
... ： 分子研では大学ではできない研究を行うという意味は，大学では買えない高価な装置で実験するという ことではない，と思っています。何年も鳴かず飛ばずになっても挑戦する研究姿勢を持たねばならない と思います。一方で，総研大学生は，ゼロから出発し３年間の内に博士論文にまで到達せねばならない という過酷な時間的制約を負っており， 余り挑戦的な課題を与えることができないのが現状と思います。 ...
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第一原理分子動力学法による理想格子不安定解析
... 系において生じる局所変形（転位の発生）の開始が，局所の結晶格子が上述の横方向 非等方変形への不安定分岐を生じたことによって引き起こされていることを明らかに した． 上述のように，理想格子不安定解析は均一変形における安定限界を求めるものであ るが，より自由度の高い系における局所の不安定変形開始の指標となる可能性がある． しかしながら，これまでの格子不安定条件に関する検討は，基本的に原子間相互作用 ...
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北里大学理学部生体分子構造学 ( 物理学科 & 生物科学科 3 年生 ) 米田茂隆 北里大学理学部物理学科 神奈川県相模原市南区北里 生体分子の構造を決定 解析するための大規模研究施設 ( 左 )SPrin
... ウイルス外殻蛋白質 ウイルスは、そのライフサイクルのほとんどの時期において宿主細胞中に生息する。しかし、宿主 細胞を脱出して外界を移動して感染増殖する時期も必要であり、ウイルスは直径数十ナノメートル かそれ以上の大きさのウイルス粒子（Virion）と呼ばれる形態をとる。ウイルス粒子は、基本的に は、ウイルス核酸遺伝子(RNA か DNA のどちらか１種)、それを保護するための外殻タンパク質 ...
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ポリプロピレン－グラファイト界面接着強度に関する分子動力学研究
... セル中にランダムウォーク法により PP 分子鎖を配置し，20000[step]（=2000[fs]， 1[step]=0.1[fs]）緩和計算を行った．その後，2000[fs] かけてセルサイズを一辺 30[nm] まで圧縮し，さらに 2000[fs] 緩和計算を行いアモルファス PP 構造を作成した．分子鎖 は 1 分子鎖あたり 502[united ...
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理化学研究所計算科学研究機構研究部門量子系分子科学研究チーム殿 hp170163: 有機半導体 有機分子発光材料の全自動探索シミュレーションシステムの開発 高度化支援作業 2017 年 9 6 ( R405 般財団法 度情報科学技術研究機構利 援部 1
... • 各ライブラリを使用した場合のプログラム全体の実行時間の比較 • Scalapack と ELPA の全実行時間の比較 • electrons ルーチンの構造と実行時間の比較（Scalapack と ELPA） • 固有値ライブラリ（ zhegv）部分の FAPP性能分析 ...
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第一原理分子動力学法を用いたNi及びNi3Alの理想格子不安定性解析
... (23)(24) などが数多くなされているが，微視的な界面そのものの構造については不明な 点が多く残されている． 界面近傍の力学特性の解析を精密に行うには，異種原子間の相互作用を電子状態か ら計算する第一原理分子動力学法を用いるべきである．しかしながら，界面の変形挙 ...
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鎖状高分子のレプテーションならびに架橋に関する分子動力学的研究
... り，除荷時はこの応答をトレースするような可逆的な変化を示した．PI では，PE と 同様に引張を開始した直後 (ε zz = 0.2) において，構造変化による reptation 量がパル ス状に増加しており，引張方向への配向を生じていることが示唆される．一方，この 初期応答の後は単調に減少し，ひずみの増加とともに分子鎖が「動きにくく」なって いるものと推測される．除荷時には引張時よりも低い値をとるのも ...
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SiC上グラフェン生成と第一原理計算による界面構造の研究
... 表面やSiC上グラフェンの評価方法について述べた． 第3章では，グラフェン/4H-SiC(0001) の界面構造と，この構造におけるグラフェンの特 性を調べるため，第一原理計算を用いて計算を行った．初めに，基板となるSiCの結晶構造・ 表面構造モデルを作製し，SiC表面にSiの空孔がある場合の電子状態を評価した．SiC最表 面においては， ...
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Ni基超合金微細析出構造における転位の分子動力学解析
... 要 約 Ni 基単結晶超合金の機械的特性には，結晶内部に無数に存在する γ/γ ′ 界面および界面 会合部での微視的変形挙動，特に転位の挙動が重要な役割を果たしていると考えられ る．転位が主として運動する γ チャンネルの幅は 0.05µm 程度のものもあり，原子レベ ルの検討が必要なスケールとなっている．また，γ ′ 相を貫通する超転位など，Ni 基超 合金に特有なメカニズムを明らかにするためには，γ/γ ′ ...
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マウス小脳パンソー構造の分子解剖学的研究：パンソーはプルキンエ細胞の軸索初節に対してGABA作動性の化学的抑制を行うための分子解剖学的基盤を欠く
... 一方、パンソーを形成するバスケット細胞軸索には、細胞膜の過分極に関わるシェイカー型電 位依存性カリウムイオンチャネル K V 1.1 と K V 1.2 、これらの足場タンパクである PSD-95 が豊富 に発現していることが知られている。そこで、軸索初節周囲の軸索におけるこれら分子発現につ いて小脳と海馬で比較を行った。 パンソーでは、 バスケット細胞の軸索には Kv1.1 、 Kv1.2 、 PSD-95 ...
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分子動力学法によるカーボンナノコイルの構造・力学特性評価
... 第 4 章では，第 3 章で安定した大規模 SWCNC を対象に引張シミュレーションを行っ た．ひずみ速度は 1.0 × 10 −5 [/fs] と 1.0 × 10 −6 [/fs] の二つの条件で行った．いずれの CNC も，λ=1.5 程度までは線形的に応力上昇した．弾性変形領域では，振動には差が あるものの応力上昇の勾配に違いはほとんど見られなかった．一部，応力が二次曲線的 に上昇する硬化挙動を示す ...
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