並列プログラミングの基本（MPI）
マルチコア時代の並列プログラミング
... Sequence lock Optimistic lock (楽観的なロック) 任意のデータ + counter 読み込みスレッドだけなら lock-free 書き込みスレッドは lock が必要 Counter が偶数なら解放、奇数なら占有状態 counter data 1.. Read counter と読んで、 1が奇数か、 1≠3なら失敗。 data を破棄して[r] ...
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C プログラミング演習 1( 再 ) 2 講義では C プログラミングの基本を学び 演習では やや実践的なプログラミングを通して学ぶ
... 今回のプログラミングの課題 次のステップによって、徐々に難易度の高いプログラムを作成する (参照用の番号は「よくわかるC言語」のページ番号） 1. キーボード入力された整数10個の中から最大のものを答える ...
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C プログラミング 1( 再 ) 第 5 回 講義では C プログラミングの基本を学び演習では やや実践的なプログラミングを通して学ぶ
... 3． メモリへの読み書き CPUでの計算 レジスタ：電卓の「メモリ」(記憶場所)に相当 主記憶からデータを「 アドレス 」によって取り出す → レジスタにデータを取り込む（読み込み） →計算する（計算結果はレジスタに残る） ...
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講義の流れ 並列プログラムの概要 通常のプログラムと並列プログラムの違い 並列プログラム作成手段と並列計算機の構造 OpenMP による並列プログラム作成 処理を複数コアに分割して並列実行する方法 MPI による並列プログラム作成 ( 午後 ) プロセス間通信による並列処理 処理の分割 + データの
... ＭＰＩの利点と欠点 利点１．高速化に向けた細かいチューニングが可能 通信のタイミングや転送するデータの大きさ、さらに処理のプロセスへの分担のさせ方 やデータの配置方法等、性能に影響する事項をプログラムで直接指示できるので、慣 れれば高い性能を得られやすい。 ...
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スパコンに通じる並列プログラミングの基礎
... CUI の操作 = 執事 (shell) への命令． CUI は遠隔操作でよく使われる． CUI で使われるエディタは事実上 Emacs か vi に限られている． コマンドは沢山あるが，今回紹介したものがわかれば充分戦える． 薄いものでいいので Unix の本を買って持っておこう． ...
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1. 薬物や機能性化合物デザインの基本と環境の変化 2. 多変量解析 / パターン認識に基づく インシリコスクリーニングとインシリコデザインの基本原理 3. 並列創薬 ( 複数特性の同時最適化 ) の提案 4. 並列創薬 と 逐次創薬 の開発成功確率に基づく比較シミュレーション 5. 分類 / 予測
... ４． Ames Ames 変異原性試験予測（某国立研究所様との共同研究：ＭＯＤＥＬＢＵＩＬＤＥＲ利用） 変異原性試験予測（某国立研究所様との共同研究：ＭＯＤＥＬＢＵＩＬＤＥＲ利用） ５．皮膚感作性試験予測（某公立研究所様との共同研究：ＭＯＤＥＬＢＵＩＬＤＥＲ利用） ５．皮膚感作性試験予測（某公立研究所様との共同研究：ＭＯＤＥＬＢＵＩＬＤＥＲ利用） ...
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OpenMP/OpenACC によるマルチコア メニィコア並列プログラミング入門 Fortran 編第 Ⅱ 部 :OpenMP 中島研吾 東京大学情報基盤センター
... 件にしていない（調達時に加点すらしない） • 利用者にももちろん推奨していない • OpenMP が MPI より簡単ということはない – データ依存性のない計算であれば，機械的に OpenMP 指 ...
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2018/10/18 講習会 :MPI 基礎 1 第 105 回お試しアカウント付き並列プログラミング講習会 MPI 基礎 : 並列プログラミング入門 東京大学情報基盤センター 内容に関するご質問は cc.u-tokyo.ac.jp まで お願いします
... • 筑波大学計算科学研究センター • 東京大学情報基盤センター • 東京大学柏キャンパスの東京大学情報基盤センター内に、両機関の教 職員が中心となって設計するスーパーコンピュータシステムを設置し，最 先端の大規模高性能計算基盤を構築・運営するための組織 ...
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2020/10/6 スパコンプログラミング (1) (Ⅰ) 1 並列数値処理の基本演算 東京大学情報基盤センター准教授塙敏博 2020 年 10 月 6 日 ( 火 )10:25-12:10
... 10. [L30] BLASの互換ライブラリでオープンソースソフトウエアで ある、 BLIS (BLAS-like Library Instantiation Software framework) について調査せよ。 特に、どのような仕組みで BLISを実装しているのか、BLAS ...
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RobotCでの基本プログラミング
... 今まで扱ってきたプログラムでは 1 つのタスクによって実行してきたが，NXT では複数のタス クを同時に実行させることができる．複数のタスクを扱う場合の書式は次のようになる． main( )の中で start taskname とすることで，複数のタスクを実行させることができる．stop taskname ...
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ppopen-hpc の概要とシミュレーション基本的流れ体験 松本正晴 東京大学情報基盤センター 第 62 回お試しアカウント付き並列プログラミング講習会 ライブラリ利用: 科学技術計算の効率化入門 2016 年 9 月 6 日 ( 火 )~7 日 ( 水 )
... プロファイラの利用 43 自分でプログラムを実装し，実行，可視化ができるようになってくると，より計 算効率のよいコードとなるように，コードの最適化を行いたい場合がある。 プロファイラは性能解析ツールであり，関数呼び出しの頻度や，それにかか る時間，ハードウェアの情報等，プログラム実行時の各種情報を収集する。 ...
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第100回お試しアカウント付き並列プログラミング講習会 REEDBUSH スパコンを用いたGPUディープラーニング入門 ディープラーニング基礎 山崎和博 NVIDIA, ディープラーニング ソリューションアーキテクト
... ディープラーニングの学習フロー トレーニングデータ 1.入力されたデータに したがい結果を出力 4.誤差が小さくなる まで繰り返す 3.誤差を用いて ネットワークを更新 出力 “dog” “cat” “human” “tiger” 正解ラベル “cat” “dog” “monkey” “lion” 誤差 2.期待結果との違い を誤差として計算... ディープラーニングの[r] ...
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内容に関する質問は まで 第 1 講プログラム高速化の基礎 東京大学情報基盤センター 片桐孝洋 1 座学 並列プログラミング入門 in 金沢
... １秒間に 0.１京（けい）回の浮動小数点演算の能力がある。 「京コンピュータ」（ 2012年9月共用開始、11.2PFLOPS、 現在 TOP500で4位 ） PCの演算能力は？ 3.3GHｚ（１秒間に3.3G回のクロック周波数）として、もし１クロックあたり１回の 浮動小数点演算ができれば 3.3GFLOPS。 ...
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C プログラミング 1( 再 ) 第 4 回 講義では C プログラミングの基本を学び 演習では やや実践的なプログラミングを通して学ぶ 1
... これらを「表現する」にはどうするか？ よくある方法は、¥n ¥t ¥r ¥f のように、 「￥とアルファベットの組み合わせ」を用いて表す ￥は(環境によっては＼) 「次の文字を特別扱いせよ」を表す ...
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東京大学情報基盤センターお試しアカウント付き並列プログラミング講習会 京都大学学術情報メディアセンター 平石拓 /3/12
... --cancelなしでジョブ名を指定すると，実行中のジョブのみ キャンセルし，完了したジョブはキャンセルされない xcryptdel --clean は ， 実 行 中 の 全 て ジ ョ ブ を （qdel等で）キャンセルし，全ての実行履歴を忘れる ...
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並列プログラミング入門（OpenMP編）
... （並列実行領域に入る前でも利用できます。） omp_get_num_threads integer 現在の並列実行領域を 実行中 のスレッド数を返しま す。 omp_in_parallel logical 活動状態の並列実行領域内から呼び出された場合 「 .true.」、それ以外は「.false.」を返します。 ...
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SGI AltixUV1000 並列化プログラミング講習会
... 環境変数OMP_NUM_THREADSを並列実行数に設定します。 OpenMPのプログラム中でMKLを使う場合、OMP_NUM_THREADSで 設定されたスレッド数で実行されます。また、OpenMPのスレッド数とは 違うスレッド数で実行したい場合はOMP_NUM_THREADS以外に MKL_NUM_THREADSを設定します。 ...
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並列計算プログラミング超入門
... て の プ ロ セ ス を 含 ん で い る MPI_COMM_WORLD を 使 用 し ま す 。 自 分 で プ ロ セ ス の 別 の 束 ね 方 を 指 定 し て communicator を作るということもできますが、これはかなり凝った処理をする場合に必要 でしょう。 ...
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Stage 並列プログラミングを習得するためには : 1 計算機リテラシ, プログラミング言語 2 基本的な数値解析 3 実アプリケーション ( 例えば有限要素法, 分子動力学 ) のプログラミング 4 その並列化 という 4 つの段階 (stage) が必要である 本人材育成プログラムでは1~4を
... 本人材育成プログラムでは，①，②のレベルは各学部・研究科の既存の講義に任せるものと するが，③，④に役立つような内容を含めたガイドラインを作成する。③，④については，手 法（有限要素法，差分法，有限体積法，境界要素法，分子動力学など）ごとに基礎的なプログ ラミングとその並列化を教える講義・演習を新たに開講する。有限要素法は情報理工学系，有 ...
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スパコンに通じる並列プログラミングの基礎
... 並列計算のまとめ ハードウェアによって並列化の方法が異なるので，ソフトウェアも それに合わせて選択する． 他のソフトウェアに比較すると， MPI はプログラムを書く人が並 列化を考えねばならず，やや敷居が高い． ...
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