• 検索結果がありません。

確率過程と分子進化

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2021

シェア "確率過程と分子進化"

Copied!
2
0
0

読み込み中.... (全文を見る)

全文

(1)

確率過程 と分 子進化

名古屋市立大学自然科学研 究教育 セ ンター

  16年 前 の1月 、 国 立 遺 伝 学 研 究 所 の 木 村 資 生 博 士 が 、 名 古 屋 大 学 理 学 部 で 「数 学 者 の た め の 分 子 進 化 学 入 門 」 と い う講 演 を し て お ら れ る 。 私 の 分 子 進 化 に 関 す る 知 識 は 、 こ の 講 演 の 内 容 に つ き る と 言 っ て よ い 。    歴 史 的 に い え ば 、 遺 伝 学 と し て は 、1930年 代 にR. A.Fisher,  J. B. S. Haldane,  S. Wright等 の 古 典 的 研 究 が あ り 、1960年 代 、1970年 代 に 木 村 資 生 、 太 田 朋 子 、 丸 山 毅 夫 等 に よ り 古 典 を 基 礎 と しつ つ 分 子 レベ ル の い くつ か の 遺 伝 モ デ ル の 提 案 が お こ な わ れ た と 理 解 して い る 。   数 学 の 側 で も古 く か ら、 遺 伝 モ デ ル を 意 識 し た 研 究 が 行 わ れ て い る 。1930年 代 のA.N.  Kolmogorov-1.  G. Petrovskii-M.  Piscounovの 非 線 形 放 物 型 偏 微 分 方 程 式 の 解 の 伝 播 の 研 究 は 有 名 で あ る が 、 こ の 仕 事 は 実 は 集 団 遺 伝 学 を 動 機 と し た もの で あ っ た こ と は 今 日忘 れ ら れ て い る よ う に 思 わ れ る 。 も っ と も、 これ は 遺 伝 モ デ ル と し て は 、 今 日 意 味 を も た な い もの と な っ て い て 、 た だ 数 学 と して の み 生 き 残 っ て い る と い え よ う。 こ う い う例 は 他 に も あ る 。 木 村 資 生 先 生 に 直 接 伺 っ た と こ ろ で は 、R. A.Fisherの 遺 伝 学 上 の 仕 事 は 今 日 無 意 味 な も の と な っ て い る が 、 彼 の 残 し た 遺 伝 モ デ ル は 今 日 もWright-Fisherモ デ ル と して 残 っ て い て 、 分 子 レ ベ ル の 研 究 に も 基 礎 的 役 割 を は た し う る も の で あ る と い う こ と で あ る。   古 典 的 遺 伝 モ デ ル で は 、 対 立 遺 伝 子 の 数 は 有 限 個 で あ り 、 遺 伝 子 頻 度 の 変 化 の メ カ ニ ズ ム は 、mutation, natural  selection,  random  drift(遺 伝 的 浮 動 、 random mating),  migration等 に よ る 。 も と も と 、 マ ル コ フ 連 鎖 に よ っ て 記 述 さ れ る も の で あ り 、 個 体 数 は 各 世 代 一 定 で あ る と す る 。 こ の マ ル コ フ 連 鎖 を 時 間 、 空 間 が と も に 連 続 で あ る有 限 次 元 確 率 過 程(拡 散 過 程)で 近 似 す る 。 こ の 近 似 が 数 学 と し て 厳 密 に 正 当 化 さ れ た の は 意 外 に 新 し く、1970年 代 の 佐 藤 健 一 、S. N. Ethierの 仕 事 で あ る 。   新 し い 遺 伝 モ デ ル と し て は 、 無 限 中 立 ア レ ル モ デ ル 、 無 限 サ イ ト モ デ ル 、Ohta-Kimuraのladder  mode1, gene  conversion  model等 が あ り、 こ れ ら は い ず れ も 無 限 次 元 確 率 過 程(通 常Fleming-Viot過 程 、 あ る い は measure-valued  diffusion  processと 呼 ば れ る)と し て

実 現 さ れ る 。 こ の 方 向 の 厳 密 な 研 究 の 歴 史 は さ ら に 新 し い 。 部 分 的 に は 、1970年 代 のW.J.  Ewens,  P. A. P. Moran,  J.F.  C. KingmanやG.  A. Wattersonの 仕 事 が 応 用 の 面 で 有 名 で あ る が 、 無 限 次 元 確 率 過 程 と して の 数 学 的 な 研 究 が 行 わ れ た の は 私 は1980年 代 の 中 頃 か ら だ と思 っ て い る 。 私 も2、3の 論 文 を 書 い て い る が 、 主 と し てS.N.  Ethier,  T. G.Kurtz,  D. A. Dawsonや 志 賀 徳 造 の 研 究 に 負 う 。   mutationとrandom  driftの み を 考 え た 無 限 次 元 確 率 過 程 に つ い て は 、 ほ ぼ 解 明 さ れ た と 言 っ て 良 い 。 こ の 他 にnatural  selectionを と り い れ る と 数 学 的 に は 数 段 難 し く な る。 ま ず 、 こ の よ う な 確 率 過 程 が エ ル ゴ ー ド的 (定 常 状 態 が た だ 一 つ 存 在 し、 時 間 平 均 と 空 間 平 均 が 一 致 す る)か ど う か 十 分 に 解 明 さ れ て い る と は 言 い 難 い 。 何 人 か の 人 達 は こ の 問 題 の 解 明 に と り くん で い る 。 ま た 、 定 常 状 態 が た だ 一 つ 存 在 す る場 合 そ の 定 常 分 布 は ど の よ う な も の か 明 らか に す る こ と も 重 要 で あ る 。 一 方 、E. B.Dynkin等 は よ り 抽 象 的 な 無 限 次 元 確 率 過 程 の 数 学 的 研 究 を 発 展 さ せ て い る 。

  私 自 身 は 、 最 近 は 、mutation,  random  drift, migrationを 含 む 無 限 サ イ トモ デ ル を 記 述 す る 無 限 次 元 確 率 過 程 の 系 図 学 的 研 究 、mutation,  random  drift, migrationを 含 む 無 限 ア レ ル モ デ ル を 記 述 す る 無 限 次 元 確 率 過 程 の 定 常 状 態 の 研 究 を 行 っ て き た 。 これ ら は い ず れ も 一 段 落 し た と 思 わ れ る 。 最 近P.Donnelly-T.  G. Kurtzの 提 案 して い る 無 限 粒 子 系 の 方 法 を 用 い て 、 か っ て 少 し調 べ た こ と の あ るgene  conversionを 含 む モ デ ル を 表 す 確 率 過 程 の 系 図 学 に つ い て 今 後 詳 し く研 究 しよ う と 思 っ て い る 。 参 考 文 献   1993年 以 前 に 出 版 さ れ た も の は 、 殆 ど 次 の 総 合 報 告 に 収 録 さ れ て い る 。

S.N.  Ethier  and  T. G. Kurtz.  Fleming-Viot  processes in  population.genetics.  SIAM  J.  Control  and Optimization  31,395-386(1993).

(2)

P.

Donnelly

and

T. G.

Kurtz.

A

countable

representation

of the Fleming-Viot

measure-valued

diffusion.

Annales

of

Probability

24,

698-742

(1996).

参照

関連したドキュメント

Theorem 2 If F is a compact oriented surface with boundary then the Yang- Mills measure of a skein corresponding to a blackboard framed colored link can be computed using formula

As explained above, the main step is to reduce the problem of estimating the prob- ability of δ − layers to estimating the probability of wasted δ − excursions. It is easy to see

Abstract The representation theory (idempotents, quivers, Cartan invariants, and Loewy series) of the higher-order unital peak algebras is investigated.. On the way, we obtain

Using the pathwise embedding of the standard Λ-coalescent in the Fleming-Viot process provided by the modified lookdown construction (see (2.7) below) we see that in the first case,

The main technical result of the paper is the proof of Theorem 3.3, which asserts that the embeddability of certain countable configurations of elements into some model of the

We consider the new class of the Markov measure-valued stochastic processes with constant mass.. We give the construction of such processes with the family of the probabilities

Here we associate Hecke algebras to general number elds, realize them as semigroup crossed products, and analyze their representations.. 1991 Mathematics Subject Classication:

In this section, we recall the tree-valued Fleming–Viot process given as the unique solution of a martingale problem on the space of marked metric measure spaces... We only