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ABI PRISM

®

_{310 Genetic Analyzer}

用途は広く

操作は簡単に

 ABI PRISM® _{310 ジェネティックアナライザの} 背後にある理念は実に単純です。つまり、DNA 電気泳動アプリケーションのすべてが行えるほど 用途が広く、操作が簡単で、その上、立ち上げて 即座にランできるようなシステムを提供すること です。  この理念を実現するために、弊社ではDNA解 析をあらゆる観点から見直して、煩雑で時間のか かる操作を特定し、その操作を省略あるいは自動 化することはできないかと考えました。そして、 まず最初に簡素化に成功したのがゲルの取り扱い です。従来のアガロースとアクリルアミドの代り に革新的なポリマーを使用して、キャピラリへ自 動充填できるようにしました。次に簡素化したの はサンプルのローディングです。ポリマーへ のサンプルローディングは自動的に行い ます。そして、あらかじめプログラム されたソフトウェアモジュールを開 発し、システム制御とデータ管理を簡 素化しました。最終的に、評判の高い 弊社のABI PRISM多色蛍光標識技術を 利用する使いやすいシステムとしてオプティ マイズしました。  このようにして完成したのが、初めて完全に自 動化されたこの遺伝子解析システムです。皆様の 各研究室において、多色法DNA解析の威力を発 揮することでしょう。  ABI PRISM 310 シ ステムは、DNAのサイ ジ ン グ・ 定 量・ シ ー ケ ンシングの全ての面を 自動化しました。ユー ザーにしていただくこ とは、サンプルを調製 し、サンプルトレーに のせ、使用したいプログラムモジュールを選択す ることだけです。あとはシステムが自動的にポリ マーをキャピラリに充填して、サンプルをユー ザーの指定通りにインジェクションし、ラン・分 離した後、データを解析します。その上、ABI PRISM 310 システムでは、これらのステップの 自動化のために信頼性や性能を犠牲にしてはおり ません。事実、解析結果は非常に正確であり、遺 伝子型決定・突然変異検出・配列アセンブリなど の専門プログラムに、データを直接転送すること ができるのです。  また、アプライドバイオシステムズでは、広い 用途を持つ ABI PRISM 310システムのあらゆる 長所を充分に、しかもできる限り簡単に活用して いただくために、トレーニングとサポートを提供 しております。 サンプルのロー ドは全自動です。

ABI PRISM 310 Genetic Analyzer

は、現在、アクリルアミドやアガロー スを使用して行われているアプリ ケーションを自動化しました。 従来の単一標識の方法では、レーン間の移動 度の差が生じやすくなります。ABI PRISM 310システムは多色蛍光標識法を採用してい ますので、レーン間の移動度の差がなく、デー タの正確さが向上します。 RT-PCR Long PCR マイクロサテライト解析 SSCP解析 ヘテロ接合体検出 DNAシーケンシング 4レーンシーケンシング 1レーンシーケンシング

ABI PRISM

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_{ジェネティックアナライザの内部構造} 検出ウィンドウ シリンジ ゲルブロック ステップ1： サンプル位置への移動 • オートサンプラーがX、Y、Z軸方向に移動し ます。 • 48サンプル用および96サンプル用トレーが あります。 • バ ッ フ ァ ー（ ポ ジ シ ョ ン1）、 精 製 水（ ポ ジ ション2）、廃液用バイアル（ポジション3） にも移動します。 ステップ2： 動電的サンプル注入と電気泳動 • キ ャ ピ ラ リ と 電 極 が 自 動 で サ ンプル中に挿入されます。 • 電圧をかけます。 • 負に荷電したDNAはキャピラ リに入り、正電極の方向へ移動 します。 ステップ3： 蛍光励起と検出 • 蛍光色素で標識されたDNAフラグメ ントが電気泳動により移動してレーザ ー光を通過します。 • レーザー光により蛍光色素が励起さ れ、 レーザー光よりも大きな波長で 蛍光を発します。 • 蛍光はCCDカメラにより検出されま す。 • ソフトウェアにより、蛍光シグナルを 色のピークに変換します。 キャピラリ ヒートプレート 電極 オートサンプラー

 研究室ではさまざまな方法を採用して、DNA のサイジング・定量・スクリーニング・シーケン シングを行っています。今日までこれらの方法の ほとんどが、放射性標識化合物や臭化エチジウム 染色法を使用して手作業で行われてきました。し かし、ABI PRISM 310システムでは、こ れらの作業は不要です。めんどうなこ とは、ほとんど何もありません。  スラブゲルを注ぎ込む必要もなく なります。ABI PRISM 310 システ ムでは、アクリルアミドやアガロー スの代わりに流動性の高いポリマーを 使用して、このポリマーを各ランの前 にキャピラリに自動的に充填します。 ポリマーを使用することで自動化が可 能になったばかりではなく、ポリマー の保証された品質と均一な粘度が不確 定因子を解消して、再現性が確実に向 上しました。

 Performance Optimized Polymer（POP ™） は、すぐ使用できる状態でユーザーにお届けいた します。準備は全く必要ありません。ユーザーは、 ポリマーを装置にセットして、サンプルのランを スタートするだけでよいのです。  また、ABI PRISM 310 システムでは、サンプ ルローディングを自動で行います。ユーザーは、 反応チューブをサンプルトレーにのせて、そのサ ンプルトレーを装置にセットするだけでよいので す。あとはシステムが、ユーザーが指定した通 りの順序で各サンプルをキャピラリにインジェク ションします。キャピラリ１本で100サンプルの ランまで耐用できますし、交換はとても簡単です。  POP-4 ™ポリマーを用いたシーケンシングで は、約38分で1サンプルを解析できるので1日 に36サンプルまで解析可能です。 POP-6™ポ リ マ ー は、一塩基の差を分 離できるフラグメン ト分析用として特別 に設計されました。 ユーザーにやって いただくこと あとは、310システムが 行います サンプルの 調製 サンプル トレーを セット ソフトウェ アのセット アップ ラン スタート ポリマーの充填 サンプルの インジェクション 電気泳動 多色検出 データ解析

やさしい

遺伝子解析システムを

大切な時間とデータを

有効に 活用するための

自動化です

 ABI PRISM 310 ジ ェ ネ テ ィ ッ ク ア ナ ラ イ ザ に は、 作 動 条 件・ デ ー タ 収 集 お よ び 解 析 に 必 要 な 全 て を 自 動 的 に 遂 行 す る 制 御 ソ フ ト ウ ェ ア が あ り ま す の で、 デ ー タ の 収 集 が 迅 速・ 簡 単 で、 は る か に 能 率 的 に な り ま す。 全 て の 機 能 は、 簡 単 で 覚 え や す い ポ イ ン ト・ ア ン ド・ ク リ ッ ク コ マ ン ド と ポ ッ プ ア ッ プ メ ニューを使用して、コンピュータから制御するこ とができます。  コンピュータ上のサンプルシートとインジェク ションリストが、サンプルのランセットアップを 簡単にします。サンプル情報を入力して、インジェ クション順序を指定した後、あらかじめプログラ ムされている解析モジュールから、実行したいも のを選択するだけです。希望があれば、独自の解 析条件を入力することもできます。  あとはシステムによって、ラン温度・時間・お よび電圧が自動的にコントロールされます。装置 セッティング・解析条件・サンプルインジェクショ ン順序は、各ラン毎に全て保存されます。そして いつでも好きなときに、システムをモニタしたり、 リアルタイムで結果を表示させたりすることがで きます。  各サンプルからのデータが収集される毎に、結 果が自動的にABI PRISM アナリシスソフトウェ アに転送されて解析されます。サンプルの解析は 非常に高速で行われます。アプリケーションや要 求される分離能にもよりますが、最初のサンプル 分析結果は、サンプルのインジェクション時間か ら12分後という速さで得られます。しかも、す べてのランの終了を待たずにデータの解析は行わ れます。ABI PRISM 310 システムでは、前のラ ンのデータが解析されている間も、次のサンプル のランが続けられるのです。 高性能がさらに強化され ています。 多色標識から蛍光シグナ ルをCCDカメラで同時 に検出し、目的の波長を 抽出します。

ABI PRISM

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_{システムは、広範な遺伝子解析アプリケーションをサポートします}

GeneMapper

®_{ソフトウェア}

SNaPshot

®

_Multiplex

_キット

Process Based Quality Values（PQV）システムでは、サイズコーリングおよびアレ ルコーリングのプロセスごとにクオリティ値が計算されます。クオリティに問題のあ るアレルコールは、再処理が簡単に行えるように表の上位に移動します。このPQVシ ステムを利用することにより、クオリティの高いデータセット、再処理が必要なデー タセット、および破棄すべきデータセットを区別することができます。クオリティチ ェックの結果、Pass（ ）、Check（ ）、Low Quality（ ）の3つのレベルに 分類されます。

GeneMapper®_{ソフトウェア上でビン情報がオーバーレイされたSNaPshot}® _{Multiplexコントロールサンプル。このコン}

トロールサンプルは、36 cmキャピラリとPOP-4 ™ポリマーをセットアップした310システムで、GeneScan ™ -120 LIZ®_{サイズスタンダードとともにランしたものです。}

GeneMapperのGenotypeページにおけるPQVフラグ

ADO = allele display overflow (check box)

AEH = allele edit history (check box)

SHP = sharp peak ANE = allele number error OBA = one base pair allele SPA = single peak artifact BIN = out of bin allele PHR = peak height ratio LPH = low peak height

SPU = spectral pull-up BD = broad peak SP = split peak OS = offscale CC = control concordance OP = overlap NB = narrow bin DP = double peak GQ = genotype quality

SeqScape

®_{ソフトウェア} SeqScape®_{ソフトウェアは最先端のリシーケンシング用ツールであり、リファレンスシーケンス（バリアン} ト情報を含む）に基づいてデータを解析します。SeqScape®_{ソフトウェアでは高度なアルゴリズムが採用さ} れており、塩基の検出、クオリティ値の算出、コンセンサスシーケンスの決定のほか、リファレンスシーケン スとの比較によるシーケンスのアライメントや方向づけも可能です。このツールは、塩基またはサンプルご とにクオリティ値を算出したり、ヘテロ接合などの遺伝子多型を高精度で検出したりするなどのユニークな 機能を備えています。また、プロジェクトテンプレートや、解析結果が元のエレクトロフェログラムとリンク している統合レポートを使用することにより、解析時間を短縮し、エラーを削減することができます。

多方面に広がる

多色標識法の可能性

 ABI PRISMの多色蛍光標識技術が、自動遺伝 子解析の正確さと感度において、新基準を構築し ました。ABI PRISMの標識法は安全で、迅速か つ簡単です。その上、ラン間の再現性が良く、定 量的な結果が得られます。   多 色 標 識 に よ る 正 確 な 結 果 を 得 る た め に、

ABI PRISM 310 シ ス テ ム で は、ABI PRISM GeneMapper ソ フ ト ウ ェ ア、 ま た はDNA Sequencing Analysisソフトウェアを使用しま す。どちらのプログラムも自動遺伝子解析専用に 開発されたもので、世界中の何千もの研究所にお いて使用されており、高い評価を得ています。  GeneMapper®_{ソフトウェアは、サイズコール} からアレルコールまでを自動で行うジェノタイピ ングソフトウェアです。SNP解析をはじめ、マ イクロサテライト解析などの様々なアプリケー ションに対応します。API PRISM 310は多色検 出ですから、複数のサンプルとインターナルスタ ンダードを同一レーン内でランできます。

 DNA Sequencing Analysisソフトウェア は、 多 色シーケンスデータから正 確・明 瞭に塩 基を 同定します。まず、それぞれの塩基に対応するよ うに異なる色素で標識し、それを同時に泳動しま す。その後ソフトウェアが、自動的に塩基を同定し、 結果を表示・印刷、保存します。得られたシーケン スデータは、SeqScape®_{ソフトウェアに転送して、} ミ ュ ー テ ー シ ョ ン 検 出、SNP検 出 等 の Comparative Sequencingが可能です。 ABI PRISMシス テムは、多色蛍光 標識法と1レー ン検出における 正確さの基準と なっています。

遺伝子解析の

あらゆるニーズを

ひとつのシステムで

 アプライドバイオシステムズは、遺伝子解析の 分野にもっとも総合的・専門的な技術とサポート を提供しております。  ABI PRISM ファミリーには、ユーザーの遺伝 子解析の手腕を拡大する製品が全領域にわたって 取り揃えられています。その中には、遺伝子型決 定やDNA配列解析用にすぐ使用できるラベル化 キットや試薬類、強力なアプリケーションソフト ウェアなどがあります。  ABI PRISM 310 システム用の試薬類は、定評 あるプロトコールと分 子 生物学 手法の標 準に基 づいております。また、広範囲に選択できるABI PRISM DNAシーケンシングキットを利用すれば、 1本鎖や2本鎖DNAを含む、DNAテンプレート の全領域にわたってシーケンシングを簡単に行う ことができます。弊社にはABI PRISM レーンス タンダードや、PCRプライマー及びPCRプロダ クトのダイレクトラベル化試薬が揃っています。  さらに、ABI PRISM 310システムにWindows® 仕様が登場しました。データをはじめ試薬やアク セサリ等はMacintosh仕様と互換性があります。 また、各ソフトウェアの最新バージョンを入手で きます。   ま た、 専 用 の 遺 伝 子解析ソフトウェアを 使用することで、ABI PRISM 310 シ ス テ ム の データ解析性能を簡単に拡張す ることができます。

 ABI PRISM GeneMapper®_{およびSeqScape}®

ソフトウェアはいずれもWindows®_仕様のABI PRISM 310システムからデータを読み込むこと ができます。もちろん、他の商品化されている遺 伝子解析ソフトやパブリックドメイン遺伝子解析 ソフトウエアパッケージにも同様に読み込むこと ができます。 ABI PRISM 310 システムは、ユーザーを遺伝 子解析の最前線にご案内します。  ABI PRISM 310 ジェネティックアナライザに 興味をお持ちになったら、どうぞお近くのアプラ イドバイオシステムズ営業所にお電話ください。 自動遺伝子解析がどれほど簡単で広い用途を持っ ているか、お分かりいただけると存じます。 全ての遺伝子解析アプリケー シ ョ ン の た め に、 サ ン プ ル を 簡 単 に ラ ベ ル 化 す るABI PRISM キットや他の商品が幅 広く用意されています。

 検出ユニット   蛍光波長525nm∼650nmまでをCCDカメラによりモニタ   ABI PRISMケミストリ用に最適化されたバーチャルフィルター  光学ユニット   アルゴンイオンレーザーによる励起   （波長：488nmおよび514nm、出力：10mW）  電気泳動パワーサプライ   電圧範囲は100∼15,000ボルト  ゲルポンプ   キャピラリへポリマーをロード  サンプルトレイ   48または96サンプル保持  キャピラリヒートプレート   室温∼60℃の範囲でコントロール  寸法・重量   電気泳動ユニット（本体のみ、コンピュータは含まない）    横幅609.6mm× 奥行558.8mm× 高さ863.6mm 重量    94.5kg    （ドアの開閉のため、本体右側に127mmの余裕が必要です。）  電源等    100/120V, 50/60Hz, 15A, 1500W    ※本体専用の電源を使用して下さい。

ハードウェア

知識の統合

ABI PRISM

プラットフォームを所 有 す る こ と の メ リ ッ ト の 一 つ は、

10,000

以上にも及ぶ世界中のユー ザーとデータベースを共有できる点 です。すなわち、知識を共有し、互 いの経験を分かち合い、成功基盤を 構築できるのです。

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システムは、アプライドバイオ システムズの卓越した技術革新と比 類のないカスタマーサポートの伝統 から生まれた、業界で最も高い信頼 性と汎用性を備えるキャピラリ電気 泳動遺伝子解析システムであり、今 や 確 固 た る 地 位 を 築 い て い ま す。

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_{システムは、現} 在市販されているどのキャピラリ電 気泳動遺伝子解析システムと比べて も、そのユーザー層の規模、評価、 性能において他の追随を許しませ ん。科学者や研究者のユーザーがま す ま す 増 え て い る 中 で、

ABI

PRISM

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_{シ ス テ ム は 遺 伝 子} 解析のための最も優れたプラット フォームとして選ばれています。 確立された評価と実績

ABI PRISM

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_{システムの多用} 性、信頼性、有用性は著名な文献に おいても頻繁に引用されており、多 くのユーザーがこのシステムを利用 して新しい知見を得たことが知られ ています。

ABI PRISM

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_シス テムの用途の広さは、このシステム が貢献した数々の研究事例によって 端的に証明することができます。そ の一端をご紹介します。

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chromatin-remodeling protein is required for gene-expression and the

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