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[PDF] GST融合タンパク質バッチ精製プロトコール

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Academic year: 2021

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Glutathione Sepharose 4B, 4FF を用いた

GST 融合タンパク質のバッチ精製プロトコール

1、予め準備する試薬と装置

・ Glutathione Sepharose担体 製品名 包装単位 コード番号 Glutathione Sepharose 4B 10 ml 17-0756-01 Glutathione Sepharose 4B 3×10 ml 72-0239-03 Glutathione Sepharose 4B 5×10 ml 72-0239-05 Glutathione Sepharose 4B 100 ml 17-0756-05 Glutathione Sepharose 4B 300 ml 17-0756-04 Glutathione Sepharose 4 Fast Flow 25 ml 17-5132-01 Glutathione Sepharose 4 Fast Flow 100 ml 17-5132-02 Glutathione Sepharose 4 Fast Flow 500 ml 17-5132-03 必要な担体量は、下記の表を参考にして計算してください。 表1. GST 融合タンパク質の発現に必要となる培養液・試薬の量 精製したいGST 融合タンパク質量(mg) 50 10 1 培養量(L) 20 4 0.4 細胞破砕後の液量(ml) 1000 200 20 Glutathione Sepharose 担体量(ml)※1 10 2 0.2 1 回の洗浄に必要な結合バッファー(PBS)(ml)※2 100 20 2 1 回の溶出に必要な溶出バッファー(ml)※3 10 2 0.2 ※1 : Glutathione Sepharoseは、50%懸濁液(スラリー)で用います。50%スラリーの液量は、担体量の2倍になりま すので、ご注意ください(50%スラリー1 mlには、担体が0.5 ml含まれます)。 ※2 : 1回の洗浄に必要な量です。本プロトコールでは、1サンプルあたり3回の洗浄を行います。 ※3 : 1回の溶出に必要な量です。本プロトコールでは、1サンプルあたり4~5回の溶出を行います。 ・ 結合バッファー: PBS (140 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 10 mM Na2HPO4, 1.8 mM KH2PO4), pH 7.3 ・ 溶出バッファー: 50 mM Tris-HCl, 10 mM reduced glutathione, pH 8.0

※結合バッファーおよび溶出バッファーに、1~10 mMのDTTを入れると、GST融合タンパク質とGlutathione Sepharoseとの結合性が改善されることがあります。

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2、担体の準備

Glutathione Sepharoseは約75%の懸濁液(スラリー)状態で出荷されます。精製を行う前に、下記 のプロトコールに従って、50%スラリーに調製します。 1、スラリーの均一化 Glutathione Sepharose の入った容器を振り、担体を再懸濁します。 2、担体量の計算 表1 を参照して、精製に必要な Glutathione Sepharose の量を計算し、広口 のピペットやメスシリンダーを使って必要量のスラリーを適切な容器に移し ます。 例) Glutathione Sepharose は 75 %懸濁液(スラリー)状態で出荷されるため、担体が 2 ml 必要な場合は、ボトルの中から 2.66 ml のスラリーを取ります。 3、エタノールの除去 500×gで5分間、遠心して担体を沈降させます。 上清を注意深く除去します。 4、洗浄 Glutathione Sepharose 担体 1 ml(ステップ2 で用いた 75 %スラリー1.33 ml に相当)に対して10 ml の PBS を加え、転倒混和してスラリーを均一にします。 例) 担体を 2 ml(スラリー2.66 ml 相当)用いた場合、20 ml の PBS を加えます。 500×g で 5 分間、遠心して担体を沈降させ、上清を注意深く除去します。 NOTE:エタノールが残っていると、タンパク質の精製に影響を与える恐れがあるため、エタノールが完全に 除去できるまで、この操作を繰り返します。 5、平衡化 Glutathione Sepharose 担体 1 ml(ステップ2 で用いた 75 %スラリー1.33 ml に相当)に対し1 ml の PBS を加え、転倒混和してスラリーを均一にします。 例) 担体を 2 ml 用いた場合、2 ml の PBS を加えます。 NOTE:この操作により、Glutathione Sepharose のスラリー濃度は 50%になります。 500×g 5 min 500×g 5 min

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3、 GST融合タンパク質のバッチ精製プロトコール

1、担体とサンプルの混和 2.担体の準備」で準備したGlutathione Sepharose の 50 %スラリー2 ml(担 体量1 ml)を、培養液から回収した菌体の抽出液 100 ml に加えます。 2、 GST 融合タンパク質 と担体の反応 室温で30分間、ローテーターなどで穏やかに転倒混和します。 NOTE:この時点で、洗浄や溶出のステップを簡略化するために、融合タンパク質が吸着した担体を適切 なサイズのカラム(PD-10 Empty Column17-0435-01など)に充填することもできます。 3、担体の添加 500×gで5分間遠心し、上清を除去します。 NOTE:上清は捨てずに取っておきます。 4、洗浄 担体の10倍量(50%スラリーの5倍量)のPBSを加え、転倒混和します。 500×gで5分間遠心し、上清(洗浄画分)を除去します。 この操作を2回繰り返します(計3回行います) NOTE:素通り画分や洗浄画分は、精製ステップが完了するまで保存しておきます。担体に対するタンパク 質の結合効率を測定するため、SDS-PAGEなどで分析を行ってください。 * この時点で、プロテアーゼによりGST部分を切断し、目的タンパク質を溶出させることも出来ます(切り出 し精製)。切り出し精製を行う場合は、下記のステップを行わず、「4. プロテアーゼによるGST融合タンパク質 の切り出し精製」に進んでください。 5、溶出バッファーの添加 担体1 ml(50%スラリー2 ml)につき 1 ml の溶出バッファーを加えます。沈降し た担体に結合している融合タンパク質を溶出します。 室温で10分間、ローテーターなどで穏やかに転倒混和します。 6、GST 融合タンパク質 の溶出 500×g で 5 分間遠心し、担体を沈降させて、上清(溶出分画)を新しい遠心チ ューブに移します。 ステップ4~5を2回繰り返します(計3回)。3回の溶出で得られた溶出液をそれ ぞれチェックし、精製タンパク質が含まれている溶出液を保存します。 500×g 5 min 500×g 5 min 500×g 5 min

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4、プロテアーゼによるGST融合タンパク質切り出し精製

【PreScission Proteaseの場合】

「3. GST融合タンパク質のバッチ精製プロトコール」のステップ4までは同一です。ステップ5以降を、下

記の方法で行ってください。 必要な試薬

・27-0843-01 PreScission Protease 500 units

・PreScission切断バッファー:50 mM Tris-HCl、150 mM NaCl、1 mM EDTA、1 mM DTT、pH 7.5

PreScission Proteaseによるタグの切断および精製

※GST融合タンパク質8 mgが担体1 mlに結合すると仮定しています。 5、切断バッファーへの平 衡化 担体の10倍量のPreScission切断バッファーで、Glutathione Sepharose担体を 再懸濁します。 6、プロテアーゼ溶液の調

Glutathione Sepharoseの担体量1 mlに対し80 μl(160ユニット)のPreScission Proteaseと、920 μlのPreScission切断バッファーの混合液を5℃で調製します。

7、担体の添加 500×gで5分間遠心し、上清を除いてから、「ステップ6.プロテアーゼ溶液の調 整」で用意したPreScission Protease溶液を、Glutathione Sepharoseに加えま す。 懸濁液を穏やかに振盪または転倒混和します。 8、プロテアーゼ反応 5℃で4時間反応させます。 9、溶出バッファーの添加 500×gで5分間遠心し、上清を注意深く別のチューブに移します。 NOTE:目的タンパク質は上清に含まれますが、融合タンパク質のGST部分とPreScission Proteaseは Glutathione Sepharose担体に結合した状態で沈降します。 500×g 5 min 500×g 5 min

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【Thrombinの場合】

「3. GST融合タンパク質のバッチ精製プロトコール」のステップ4までは同一です。ステップ5以降を、下

記の方法で行ってください。 必要な試薬 ・27-0846-01 Thrombin 500 unit *Thrombin溶液は、あらかじめ4℃に冷やしておいた0.5 mlのPBSに500ユニットのThrombinを溶 かし、穏やかに撹拌します。活性を保つために、溶液を分注し-80℃で保存します。

・Thrombin切断バッファー:PBS(140 mM NaCl、2.7 mM KCl、10 mM Na2HPO4、1.8 mM KH2PO4、pH 7.3)

Thrombinによるタグの切断および精製

※GST融合タンパク質8 mgが担体1 mlに結合すると仮定しています。 5、切断バッファーへの平 衡化 担体の10倍量のPBSで、Glutathione Sepharoseを再懸濁します。 6、プロテアーゼ溶液の調

Glutathione Sepharose担体1 mlに対し80 μl(80ユニット)のThrombinと920 μl のPBSを混合します。 7、担体の添加 500×gで5分間懸濁液を遠心し、上清を除いてから、「ステップ6.プロテアーゼ 溶液の調整」で用意したThrombinを含む溶液を、Glutathione Sepharoseに加 えます。 懸濁液を穏やかに振盪または転倒混和します。 8、プロテアーゼ反応 室温(22~25℃)で2~16時間反応します。 9、溶出バッファーの添加 500×gで5分間遠心し、上清を注意深く他のチューブに移します。 NOTE:溶出液には目的タンパク質とThrombinが含まれていますが、融合タンパク質のGST部分は Glutathione Sepharose担体に結合した状態で沈殿します。

NOTE:Thrombinによる消化反応後に、HiTrap Benzamidine FF(high sub)を用い、ステップ9の上清から

Thrombinを除去することができます(「オプション:HiTrap Benzamidine FF(high sub)を用いた

ThrombinおよびFactor Xaの除去」参照)。

500×g 5 min

500×g 5 min

(6)

6

Factor Xaの場合】

「3. GST融合タンパク質のバッチ精製プロトコール」のステップ4までは同一です。ステップ5以降を、下

記の方法で行ってください。 必要な試薬 ・27-0849-01 Factor Xa 400 unit

*Factor Xa溶液:超純水をあらかじめ4℃に氷冷しておき、400ユニットのFactor Xaを溶かして(終 濃度1ユニット/μl)、穏やかに撹拌します。活性を保つために、溶液を分注して-80℃で保存します。 ・Factor Xa切断バッファー:50 mM Tris-HCl、150 mM NaCl、1 mM CaCl2、pH 7.5

Factor Xaによるタグの切断および精製

※GST融合タンパク質8 mgが担体1 mlに結合すると仮定しています。

5、切断バッファーへの平

衡化

担体の10倍量のFactor Xa切断バッファーでGlutathione Sepharose担体を再 懸濁します。

6、プロテアーゼ溶液の調

Glutathione Sepharoseのベッド体積1 mlに対し80 μl(80ユニット)のFactor Xa と920 μlのFactor Xa切断バッファーを混合します。 7、担体の添加 500×gで5分間懸濁液を遠心し、上清を移してから、沈降したGlutathione SepharoseにFactor Xa溶液を加えます。懸濁液を穏やかに振盪または転倒混 和します。 8、プロテアーゼ反応 室温(22~25℃)で2~16時間反応します。 9、溶出バッファーの添加 500×gで5分間懸濁液を遠心して、上清を注意深く別のチューブに移します。 NOTE:溶出液には目的タンパク質とFactor Xaが含まれていますが、融合タンパク質のGST部分は Glutathione Sepharose担体に結合したまま沈降します。

NOTE:Factor Xaによる切断後に、HiTrap Benzamidine FF(high sub)を用い、溶出したタンパク質から

Factor Xaを除去することができます(「オプション:HiTrap Benzamidine FF(high sub)を用いた

ThrombinおよびFactor Xaの除去」参照)

500×g 5 min

500×g 5 min

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5、切り出し精製後の担体の再生

「4.

プロテアーゼによるGST融合タンパク質の切り出し精製」を行った後、担体に結合したGSTおよび

PreScission Proteaseを溶出することで、担体を再利用できます。 1、溶出バッファーの添加 担体1 ml(50 %スラリー2 ml)につき 1 ml の溶出バッファーを加えます。沈降し た担体に結合している融合タンパク質を溶出します。 室温で10分間、ローテーターなどで穏やかに転倒混和します。 2、GST の溶出 500×g で 5 分間遠心し、担体を沈降させて、上清(溶出分画)を新しい遠心チ ューブに移します。 ステップ1~2を2回繰り返します(計3回) 3〃再平衡化 (または保存) (ただちに次の精製に利用する場合) 結合バッファーで平衡化します。 手順: 「2〃担体の準備」の手順4~5を行います。 (担体を保存する場合) 超純水に置換後、さらに20%エタノールに置換して冷所保存します。 手順:「2〃担体の準備」の手順4~5 を、超純水を使用して行います。その後、 同じく手順4~5 を、20%エタノールを使用して行い、4~30℃にて保管してくだ さい。 注意! 凍らせないようご注意ください。担体は凍結により構造が壊れ、使用 できなくなってしまいます。 500×g 5 min

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オプション:

HiTrap Benzamidine FF(high sub)を用いた

ThrombinおよびFactor Xaの除去

「4.

プロテアーゼによるGST融合タンパク質の切り出し精製」でThrombinまたはFactor Xaを用いた

場合、HiTrap Benzamidine FF (high sub)を用いてプロテアーゼを除去することができます。

必要な試薬

・HiTrap Benzamidine FF (high sub)

製品名 包装単位 コード番号

HiTrap Benzamidine FF (high sub) 5×1 ml 17-5143-01 HiTrap Benzamidine FF (high sub) 2×1 ml 17-5143-02 HiTrap Benzamidine FF (high sub) 1×5 ml 17-5144-01 ・結合バッファー:0.05 M Tris-HCl、0.5 M NaCl、pH 7.4

・溶出バッファー:下記のいずれかを選択します。 (1) 0.05 M glycine-HCl、pH 3.0

(2) 10 mM HCl、0.5 M NaCl、pH 2.0

(3) 0.05 M Tris-HCl、0.5 M NaCl、pH 7.4、20 mM p-Aminobenzamidine (4) 8 M Ureaまたは6 M 塩酸グアニジン 下記はHiTrapをシリンジに接続して精製する場合のプロトコールです。 1、コネクターとシリンジの 準備 超純水で満たしたシリンジに下記のルアーコネクターを取り付けます。 <ルアーコネクター 1/16”male/Luer female 18-1112-51>

※HiTrap Benzamidine FF (high sub)に1個付属しています。

シリンジを少し押し、ルアーコネクター先端から水滴が出た状態にして気泡 を押し出します。 2、HiTrap カラムとシリンジ の接続 HiTrapカラムのトップストッパーを外し、HiTrapカラムの入口部分に、シリンジ のルアーコネクター先端部から超純水を何滴か滴下します。 入口が溶液で満たされた状態になったら、ルアーコネクターとHiTrapを接 続します。

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9 3、HiTrap カラムの準備 カラム下部のツイストオフエンドを折ります。 NOTE:ねじり切らないように注意してください。 これでHiTrapカラムの準備は完了です。 この後のステップは全て、ルアーコネクターに取り付けたシリンジを用いて平 衡化バッファーやサンプルを添加します。 4、保存バッファーの除去 5カラム体積の超純水をカラムに流し込みます。保存バッファー(0.05 M 酢 酸ナトリウム、pH 4を含む20%エタノール)を除去します。 5、平衡化 5カラム体積の結合バッファーで、カラムを平衡化します。 6、サンプルの添加 サンプルをカラムに添加します。サンプル添加時の推奨流速は、1 mlカラム の場合1 ml/min、5 mlカラムの場合5 ml/minです。 素通り画分を回収して保存します。 NOTE:素通り画分には目的タンパク質が含まれます。 7、洗浄 5~10カラム体積の結合バッファーでカラムを洗浄します。 280 nmの吸収を測定しながら、溶出液にタンパク質がなくなるまで1 mlカ ラムの場合は0.5~1 mlずつ、5 mlカラムの場合は1~3 mlずつ分取します。 NOTE:洗浄画分にもGST融合タンパク質が含まれている可能性があるため、保存しておきます。 8、カラムの再生 5~10カラム体積の溶出バッファーをカラムに流します。 9、平衡化または保存 結合バッファーでカラムを洗浄して、カラムを再使用できる状態にします。 NOTE:すぐに使用しない場合は、2~3カラム体積の超純水を流した後、2~3カラム体積の保存バッファ ー(0.05 M 酢酸ナトリウム、pH 4を含む20%エタノール)を流してから保存してください。

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付録: GST融合タンパク質精製 関連製品

■自然落下/遠心分離型カラム: PD-10空カラム

● 別売りのスピンアダプター使用で、遠心分離精製も可能 製品名 包装単位 コード番号 PD-10 Empty Columns※1 50 本 17-0435-01 PD-10 Spin Adapter※2 10 個 28-9232-45 ※1 空カラム本体のほか、上下キャップ各50個、フィルター100枚を含みます。 PD-10 Spin Adapterは付属していません。 ※2 PD-10カラムを遠心機で使用するためのアダプターです。

■シリンジ接続で簡単精製:

GSTrapシリーズ

● 目的に応じて三種類の担体(HP、FF、4B)を用意 ● シリンジ接続のほか、ペリスタルティックポンプやAKTAdesignなどのシステム接続にも対応 製品名 包装単位 コード番号 GSTrap HP 5×1 ml 17-5281-01 GSTrap HP 1×5 ml 17-5282-01 GSTrap HP 5×5 ml 17-5282-02 GSTrap FF 2×1 ml 17-5130-02 GSTrap FF 5×1 ml 17-5130-01 GSTrap FF 1×5 ml 17-5131-01 GSTrap FF 5×5 ml 17-5131-02 GSTrap 4B 5×1 ml 28-4017-45 GSTrap 4B 1×5 ml 28-4017-47 GSTrap 4B 5×5 ml 28-4017-48

参照

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