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学 位 の 種 類 博士(歯学)

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Academic year: 2021

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(1)

ふ り が な

氏 名

なかい けいすけ

中井 啓介

学 位 の 種 類 博士(歯学)

学 位 記 番 号 甲 第 828 号 学 位 授 与 の 日 付 平成 30 年 3 月 9 日

学 位 授 与 の 要 件 学位規則第 4 条第 1 項に該当

学 位 論 文 題 目 Simple and rapid detection of

Rothia mucilaginosa

by loop-mediated isothermal amplification method (LAMP 法を応用した

Rothia mucilaginosa

の迅速・簡易検出法 の確立)

学 位 論 文 掲 載 誌

日本口腔検査学会雑誌

第 10 巻 第 1 号 平成 30 年 3 月

論 文 調 査 委 員 主 査 前田 博史 教授 副 査 山本 一世 教授 副 査 梅田 誠 教授

論文内容要旨

R. mucilaginosa

は口腔内、ならびに上気道部に生息するグラム陽性菌であり、近年、難治性の根尖性

歯周炎と関連することが報告されている。また、この細菌が造血幹細胞移植、肺嚢胞線維症、あるい は腹膜炎患者において重篤な感染症を引き起こすことが報告されるようになってきた。しかしながら、

これまで

R. mucilaginosa

は、病原性が弱いと考えられていたため、感染根管における分布状態、ある

いは病原性について不明な点を多く残している。本研究は、将来的に

R. mucilaginosa

の口腔内分布状 態、そして歯内疾患との関連性を解明するため、等温遺伝子増幅法(LAMP 法)を応用した迅速・簡 易検査法を確立しようとするものである。

LAMP

プライマー(FIP、BIP、

F3、B3

2

つのループ・プライマー)は

Primer Explorer version3(富

士通: the net Laboratory website)、ならびに

Genetyx software

による

alignment

解析によって設計した。標 的遺伝子は

R. mucilaginosa

16S rRNA

遺伝子とし、菌種特異的な配列が含まれるように、2 種類のプ ライマーセットを設計・合成した。遺伝子増幅は

Bst DNA Polymerase

を使用した

Loopamp DNA

Amplification Kit

によって行った。遺伝子増幅反応は

20

分あるいは

50

分の間、64℃の等温条件で行っ

た。設計したプライマー、ならびに

R. mucilaginosa ATCC 25296、DY-18、R. aeria JCM 11412、R.

dentocariosa ATCC 17931

をはじめとした

21

菌種を使用し、

LAMP

法の特異性と感度について解析し

た。

2

種類のプライマーセットのうち、1つのプライマーセットは特異的に

R. mucilaginosa

遺伝子を増幅 することができた。予想外に、もう一方のプライマー・セットは、他の

Rothia

種の遺伝子を増幅した。

検出感度は

50

分および

20

分の

LAMP

反応で、それぞれ

10、そして100 cells/reaction tube

であった。

(2)

遺伝子増幅産物はアガロース電気泳動、あるいは

SYBR-GREEN

添加による目視判定によって検出した が、両方法による検出感度に違いは見られなかった。さらに検査方法を単純化するために

Intact cell

を 鋳型にして

LAMP

法を行った。Intact cell を鋳型とした場合には

50

分の

LAMP

反応で

10 cells/reaction tube

が検出限界となった。

確立した

R. mucilaginosa

検出のための

LAMP

法は、迅速性と簡便性に優れており、有用な臨床診断ツ

ールとなる可能性がある

論文審査結果要旨

LAMP

法を応用した

Rothia mucilaginosa

の迅速・簡易検出法を確立しようとするものである。

LAMP

プライマー(FIP、BIP、F3、B3 と

2

つのループ・プライマー)は

Primer Explorer version3(富

士通: the net Laboratory website)、ならびに

Genetyx software

による

alignment

解析によって設計した。標 的遺伝子は

R. mucilaginosa

16S rRNA

遺伝子とし、菌種特異的な配列が含まれるように、2 種類のプ ライマーセットを設計・合成した。遺伝子増幅は

Bst DNA Polymerase

を使用した

Loopamp DNA

Amplification Kit

によって行った。遺伝子増幅反応は

20

分あるいは

50

分の間、64℃の等温条件で行っ

た。設計したプライマー、ならびに

R. mucilaginosa ATCC 25296、DY-18、R. aeria JCM 11412、R.

dentocariosa ATCC 17931

をはじめとした

21

菌種を使用し、

LAMP

法の特異性と感度について解析し

た。

2

種類のプライマーセットのうち、1つのプライマーセットは特異的に

R. mucilaginosa

遺伝子を増幅 することが示された。予想外に、もう一方のプライマー・セットは、他の

Rothia

種の遺伝子を増幅し た。検出感度は

50

分および

20

分の

LAMP

反応で、それぞれ

10、そして100 cells/reaction tube

であっ た。遺伝子増幅産物はアガロース電気泳動、あるいは

SYBR-GREEN

添加による目視判定によって検出 したが、両方法による検出感度に違いは見られなかった。さらに検査方法を単純化するために

Intact cell

を鋳型にして

LAMP

法を行った。

Intact cell

を鋳型とした場合には

50

分の

LAMP

反応で

10 cells/reaction tube

が検出限界となった。

以上の結果により、確立した

R. mucilaginosa

検出のための

LAMP

法は、迅速性と簡便性に優れてお

り、有用な臨床診断ツールとなる可能性があることを証明した点において、本論文は博士(歯学)の

学位を授与するに値すると判定した。

参照

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