平成21年度税制改正について

一　上場株式等に係る配当所得の課税の特例の改正

１　改正前の制度の概要

⑴　上場株式等に係る配当所得の申告分離課税 居住者又は国内に恒久的施設を有する非居住 者（以下「居住者等」といいます。）が、平成 21年１月１日以後に支払を受けるべき上場株式 等の配当等を有する場合において、その上場株 式等の配当等に係る配当所得につきこの特例の 適用を受けようとする旨の記載のある確定申告 書を提出したときは、その上場株式等の配当等 に係る配当所得については、他の所得と区分し て、その年中のその上場株式等の配当等に係る 配当所得の金額に対し、上場株式等に係る課税 配当所得の金額（所得控除を適用した後の上場 株式等に係る配当所得の金額をいいます。）の 15％の税率により所得税を課する（個人住民税 は５％の税率）こととされています（措法８の ４①）。 ⑵　平成21年及び22年における税率の特例措置 居住者等が、平成21年１月１日から平成22年 12月31日までの２年間に支払を受けるべき上場 株式等の配当等に係る配当所得については、上 記⑴にかかわらず、その上場株式等に係る課税 配当所得の金額のうち100万円以下の部分につ いては、７％（居住者については、他に個人住

租税特別措置法等

（金融・証券税制関係）

の改正

目　　　　次 一　上場株式等に係る配当所得の課税の特 例の改正……… 123 二　上場株式等の配当等に係る源泉徴収税 率等の特例の改正……… 124 三　上場株式等を譲渡した場合の株式等に 係る譲渡所得等の課税の特例等の改正… 127 四　特定口座内保管上場株式等の譲渡によ る所得等に対する源泉徴収等の特例の改 正……… 128 五　源泉徴収選択口座内配当等に係る所得 計算及び源泉徴収等の特例の改正……… 129 六　特定口座内保管上場株式等の譲渡等に 係る所得計算等の特例の改正……… 131 七　特定管理株式が価値を失った場合の株 式等に係る譲渡所得等の課税の特例の改 正……… 138 八　投資信託等の収益の分配に係る収入金 額等の改正……… 141 九　株式等証券投資信託等の償還・解約金 に係る株式等の譲渡の対価の支払調書制 度等の改正……… 142 十　上場株式配当等の支払通知書等及び信 託の計算書の改正……… 147 十一　上場証券投資信託の償還金等に係る 課税の特例の創設……… 148 十二　上場会社等の自己の株式の公開買付 けの場合のみなし配当課税の特例の改 正……… 152 十三　先物取引の差金等決済に係る告知及 び支払調書制度の改正……… 152 十四　先物取引に係る雑所得等の課税の特 例等の改正……… 155 十五　国外公社債等の利子等の源泉徴収不 適用申告書に係る手続の簡素化……… 158 十六　配当控除の特例の改正……… 159

民税３％）の税率を適用することとされていま した（旧所得税法等の一部を改正する法律（平 成20年法律第23号。以下「平成20年改正法」と いいます。）附則32①）。 この結果、平成21年及び22年分の上場株式等 に係る配当所得の金額に対する所得税の税率は、 次のようにすることとされていました。 ①　上場株式等に係る課税配当所得の金額が 100万円以下である場合 上場株式等に係る課税配当所得の金額×７ ％ ②　上場株式等に係る課税配当所得の金額が 100万円を超える場合 （上場株式等に係る課税配当所得の金額− 100万円）×15％＋７万円

２　改正の内容

現下の厳しい経済金融情勢にかんがみ、金融市 場を活性化させる観点から、上記１⑵の特例措置 について、平成21年１月１日から平成23年12月31 日までの３年間に支払を受けるべき上場株式等の 配当等については、その年分の上場株式等に係る 課税配当所得の金額に対する税率を一律７％（他 に個人住民税３％）とすることとされました（平 成20年改正法附則32①）。

１　改正前の制度の概要

⑴　居住者又は国内に恒久的施設を有する非居住 者が支払を受ける上場株式等の配当等に対する 源泉徴収税率 ①　15％源泉徴収税率 居住者又は国内に恒久的施設を有する非居 住者（以下「居住者等」といいます。）が平 成15年４月１日以後に支払を受けるべき上場 株式等の配当等について所得税の源泉徴収を 行う場合に適用する所得税法等で定められて いる20％の税率は、15％（他に個人住民税５ ％）とすることとされています（措法９の３）。 ②　７％軽減税率 上場株式等の配当等が平成15年４月１日か ら平成21年３月31日までに支払を受けるべき ものであるときは、上記①の15％の税率に代 えて、７％（他に個人住民税３％）の軽減税 率を適用することとされていましたが、この 軽減税率の特例は、平成20年度改正において、 平成20年12月31日をもって廃止されています （平成20年度改正前の措法９の３②）。 ただし、特例措置として、平成21年１月１ 日から平成22年12月31日までの間に居住者等 が支払を受けるべき上場株式等の配当等につ いては、その源泉徴収税率を７％（他に個人 住民税３％）とすることとされていました（旧 平成20年改正法附則33③）。 （注）　上記①及び②の「上場株式等の配当等」とは、 所得税法第24条第１項に規定する配当等で次 に掲げるものをいいます（措法９の３）。 １　金融商品取引所に上場されている株式等 その他これに類するものの配当等（次の２ 又は３に掲げるものを除きます。）で、内国 法人から支払がされるその配当等の支払に 係る基準日においてその内国法人の発行済 株式の総数又は出資金額の100分の５以上に 相当する数又は金額の株式（投資口を含み ます。）又は出資を有する個人（いわゆる大 口株主等）以外の者が支払を受けるもの ２　公社債投資信託以外の証券投資信託でそ の設定に係る受益権の募集が一定の公募に より行われたもの（特定株式投資信託を除 きます。）の収益の分配に係る配当等 ３　特定投資法人の投資口の配当等

二　上場株式等の配当等に係る源泉徴収税率等の特例の改正

⑵　国内に恒久的施設を有しない非居住者又は内 国法人若しくは外国法人が支払を受けるべき上 場株式等の配当等に対する税率 ①　15％源泉徴収税率等 国内に恒久的施設を有しない非居住者（所 得税法第164条第１項第４号に掲げる非居住 者をいいます。）又は内国法人若しくは外国 法人が平成15年４月１日以後に支払を受ける べき上場株式等の配当等について所得税の源 泉徴収等を行う場合に適用する所得税法等で 定められている20％の税率は、15％（他に個 人住民税５％）とすることとされています（措 法９の３）。 ②　７％軽減税率 国内に恒久的施設を有しない非居住者又は 内国法人若しくは外国法人が平成15年４月１ 日から平成21年３月31日までの間に支払を受 ける上場株式等の配当等に対する所得税の源 泉徴収税率等は、上記①の15％の税率に代え て、７％軽減税率を適用することとされてい ましたが（平成20年度改正前の措法９の３②、 旧平成20年改正法附則33②）、平成20年度改 正においてこの特例は期限の到来をもって廃 止され、平成21年４月１日以後に支払を受け るべき上場株式等の配当等については、上記 ①の15％の税率を適用することとされていま した。 ⑶　平成21年１月１日から平成22年12月31日ま での間における申告不要の特例の適用 平成21年１月１日から平成22年12月31日まで の間の各年に居住者等がその年中に支払を受け るべき次の①から④までに掲げる上場株式等の 配当等の額の合計額が100万円を超える場合に は、その超える年における上場株式等の配当等 に係る配当所得の金額については、上場株式等 の配当等の申告不要の特例（措法８の５①）を 適用せず、その年中の上場株式等の配当等に係 る配当所得は、原則としてすべて確定申告をし なければならないこととされていました（旧平 成20年改正法附則33④、旧租税特別措置法施行 令の一部を改正する政令（平成20年政令第161号。 以下「平成20年改正措令」といいます。）附則９）。 ①　７％軽減税率により源泉徴収がされた上場 株式等の配当等（少額配当等に該当するもの を除きます。）の額（②及び③に該当するも のを除きます。） （注）　上記の「少額配当等」とは、その年中に 同一の支払者から支払を受けるべき金額の 総額が１万円以下である上場株式等の配当 等をいいます（旧平成20年改正法附則33④ 一）。 ②　平成22年において源泉徴収選択口座におけ る損益通算の特例（旧平成20年改正法附則46 ②）の適用を受けた源泉徴収選択口座内配当 等の額のうち、その源泉徴収選択口座におけ る少額配当等以外の配当等の額の総額からそ の源泉徴収選択口座内において生じた上場株 式等の譲渡損失の金額を控除した残額 ③　平成20年改正法附則第46条第４項の規定に より上場株式等の配当等の申告不要の特例 （措法８の５①②）を適用しないものとされ たその源泉徴収選択口座における少額配当等 の額の総額及び少額配当等以外の配当等の額 の総額 ④　上場株式等の配当等のうち国外において支 払われるものなど、その支払の際に所得税の 源泉徴収が行われない上場株式等の配当等の 額

２　改正の内容

⑴　居住者等が支払を受ける上場株式等の配当等 に対する７％軽減税率の延長 上記１⑴②の居住者等が支払を受ける上場株 式等の配当等に対する源泉徴収税率を７％とす る特例措置の適用期限が１年延長され、平成21 年１月１日から平成23年12月31日までの間に支 払を受けるべき上場株式等の配当等に対する源 泉徴収税率について、７％（他に個人住民税３ ％）の軽減税率を適用することとされました（平

成20年改正法附則33②）。 ⑵　国内に恒久的施設を有しない非居住者又は内 国法人若しくは外国法人が支払を受けるべき上 場株式等の配当等に対する７％軽減税率の適用 円滑な源泉徴収事務の実施に対する配慮や対 内投資の促進を図る等の観点から、国内に恒久 的施設を有しない非居住者又は内国法人若し くは外国法人が平成21年４月１日から平成23年 12月31日までの間に支払を受けるべき上場株式 等の配当等に対する源泉徴収等の税率について、 引き続き７％の軽減税率を適用することとされ ました（平成20年改正法附則33②）。 ⑶　平成21年１月１日から平成22年12月31日ま での間における申告不要の特例の適用に関する 措置の廃止 上場株式等に係る配当所得の申告分離課税の 特例措置が平成21年１月１日から平成23年12月 31日までの間の各年分については一律７％（個 人住民税は３％）とされたことに伴い、上記１ ⑶の年間の上場株式等の配当等の額の合計額が 100万円を超える場合に上場株式等の配当等に 係る申告不要の特例を適用しないこととする措 置が廃止されました（旧平成20年改正法附則33 ④）。 【参考】上場株式等の配当等に係る源泉徴収税率等 【改正前】 支払を受ける者 〜H20 _〜H21.3.31H21.1.1 _〜H22.12.31H21.4.1 H23 H24〜 個　　　　 人 居　住　者 _{［旧措法９の３②］}７％（住３％） _{［20年改正法附則33③］}７％（住３％） 15％（住５％）_{［措法９の３］} 国内に恒久的施設を 有する非居住者 ［旧措法９の３②］７％ ７％ ［20年改正法附則33③］ 15％ ［措法９の３］ 国内に恒久的施設を 有しない非居住者 _７％ ［旧措法９の３②］ ７％ ［旧措法９の３②、 20年改正法 附則33②］ 15％ ［措法９の３］ 内国法人・外国法人 【改正後】 支払を受ける者 〜H20 H21 H22 H23 H24〜 個　　　　 人 居　住　者 _{［旧措法９の３②］}７％（住３％） _{［20年改正法附則33②］}７％（住３％） 15％（住５％）_{［措法９の３］} 国内に恒久的施設を 有する非居住者 ［旧措法９の３②］７％ ［20年改正法附則33②］７％ ［措法９の３］15％ 国内に恒久的施設を 有しない非居住者 _７％ ［旧措法９の３②］ ７％ ［20年改正法附則33②］ 15％ ［措法９の３］ 内国法人・外国法人 ※　大口株主等である個人が支払を受ける上場株式等の配当等に対する源泉徴収税率は、上記のいずれの期 間も20％（住民税なし）となる《改正なし》。

三　上場株式等を譲渡した場合の株式等に係る

譲渡所得等の課税の特例等の改正　　　　

１　改正前の制度の概要

⑴　上場株式等を譲渡した場合の株式等に係る譲 渡所得等の課税の特例 居住者又は国内に恒久的施設を有する非居住 者（以下「居住者等」といいます。）が平成15 年１月１日から平成20年12月31日までの間に上 場株式等の金融商品取引業者等への売委託に基 づく譲渡、金融商品取引業者に対する譲渡その 他一定の譲渡をした場合には、その上場株式等 の譲渡による上場株式等に係る課税譲渡所得等 の金額に対する税率は、15％（他に個人住民税 ５％）の税率に代えて、７％（他に個人住民税 ３％）の軽減税率とすることとされていました が（平成20年度改正前の措法37の11①）、この 特例は平成20年度改正において廃止されました。 （注）　「上場株式等」とは、金融商品取引所に上場 されている株式等、店頭売買登録銘柄として 登録された株式等及び外国金融商品市場にお いて売買されている株式等並びに株式等証券 投資信託でその設定に係る受益権の募集が一 定の公募により行われたものの受益権及び特 定投資法人の投資口をいいます。 ⑵　平成21年及び22年の上場株式等に係る譲渡 所得等に対する特例措置 居住者等が、平成21年１月１日から平成22年 12月31日までの２年間に一定の上場株式等の譲 渡をした場合には、その上場株式等の譲渡によ る上場株式等に係る課税譲渡所得等の金額のう ち500万円以下の部分については、７％（他に 個人住民税３％）の税率を適用することとされ ていました（旧平成20年改正法附則43②）。 この結果、平成21年及び22年分の上場株式等 に係る譲渡所得等の金額に対する所得税の税率 は、次のようにすることとされていました。 ①　上場株式等に係る課税譲渡所得等の金額が 500万円以下である場合 上場株式等に係る課税譲渡所得等の金額× ７％ ②　上場株式等に係る課税譲渡所得等の金額が 500万円を超える場合 （上場株式等に係る課税譲渡所得等の金額 −500万円）×15％＋35万円

２　改正の内容

現下の厳しい経済金融情勢にかんがみ、金融市 場を活性化させる観点から、平成20年度改正にお いて廃止された上記１⑴の上場株式等の課税譲渡 所得等に対する７％軽減税率の特例の適用期間を 実質的に延長することとされました。 具体的には、上記１⑵の特例措置について、平 成21年１月１日から平成23年12月31日までの３年 間に一定の上場株式等の譲渡をした場合には、そ の年の上場株式等の譲渡による上場株式等に係る 課税譲渡所得等の金額に対する税率は一律７％ （他に個人住民税３％）の軽減税率を適用するこ ととされました（平成20年改正法附則43②）。

四　特定口座内保管上場株式等の譲渡による

所得等に対する源泉徴収等の特例の改正

１　改正前の制度の概要

⑴　源泉徴収選択口座における源泉徴収 居住者又は国内に恒久的施設を有する非居住 者（以下「居住者等」といいます。）に対し国 内においてその営業所に開設されている特定口 座に係る特定口座内保管上場株式等の譲渡の対 価又はその特定口座において処理された上場株 式等の信用取引等の決済に係る差益に相当する 金額の支払をする金融商品取引業者等は、その 居住者等から、その年最初にその特定口座に係 る特定口座内保管上場株式等の譲渡をする時又 はその特定口座において処理された上場株式等 の信用取引等につきその年最初に差金決済を行 う時のうちいずれか早い時までに、その金融商 品取引業者等のその特定口座を開設する営業所 に特定口座源泉徴収選択届出書の提出があった 場合において、その年中に行われたその特定口 座（以下「源泉徴収選択口座」といいます。） に係る特定口座内保管上場株式等の譲渡又はそ の源泉徴収選択口座において処理された上場株 式等の信用取引等に係る差金決済により源泉徴 収選択口座内調整所得金額が生じたときは、そ の譲渡の対価又はその差金決済に係る差益に相 当する金額の支払をする際、その源泉徴収選択 口座内調整所得金額に15％（他に個人住民税５ ％）の税率を乗じて計算した金額の所得税を徴 収し、その徴収の日の属する年の翌年１月10日 までに、これを国に納付しなければならないこ ととされています（旧措法37の11の４①）。 ⑵　源泉徴収選択口座における還付 居住者等の源泉徴収選択口座を開設している 金融商品取引業者等は、その源泉徴収選択口座 においてその年中に行われた源泉徴収選択口座 に係る特定口座内保管上場株式等の譲渡又はそ の源泉徴収選択口座において処理された上場株 式等の信用取引等に係る差金決済（以下「対象 譲渡等」といいます。）により、その対象譲渡 等に係る源泉徴収口座内通算所得金額（その対 象譲渡等の時以前までのその源泉徴収選択口 座内における譲渡所得等をいいます。）が源泉 徴収口座内直前通算所得金額（その対象譲渡等 の時前までのその源泉徴収選択口座内における 譲渡所得等をいいます。）に満たないこととな った場合には、その都度、その居住者等に対し、 その満たない部分の金額に15％を乗じて計算し た金額に相当する所得税（他に個人住民税５％） を還付しなければならないこととされています （旧措法37の11の４④）。 ⑶　平成21年又は22年における源泉徴収税率等 の特例措置 平成15年１月１日から平成20年12月31日まで の間は、上記⑴及び⑵の15％の税率は７％（他 に個人住民税３％）の軽減税率とされていまし たが、この軽減税率の特例は平成20年度改正に おいて廃止されました（平成20年改正前の措法 37の11の４②⑤）。 ただし、平成21年１月１日から平成22年12月 31日までの期間（以下「経過期間」といいます。） 内に上場株式等を譲渡した場合おけるその上場 株式等に係る課税譲渡所得等の金額のうち500 万円以下の部分については７％（他に個人住民 税３％）の税率を適用することとされた（旧平 成20年度改正法附則43②）ことに伴い、経過期 間内に生ずる源泉徴収選択口座における源泉徴 収選択口座内調整所得金額に対する源泉徴収税 率及び還付の際の税率については、７％（他に 個人住民税３％）とされていました（旧平成20 年改正法附則45①②）。

１　改正前の制度の概要

この特例は、大きく次の⑴及び⑵の２つの制度 から構成されており、他に平成22年分の経過措置 として⑶の内容が定められています。 ⑴　源泉徴収選択口座内配当等に係る配当所得の 区分計算 源泉徴収選択口座を有する居住者又は国内に 恒久的施設を有する非居住者（以下「居住者等」 といいます。）が支払を受ける源泉徴収選択口 座内配当等については、その源泉徴収選択口座 内配当等に係る配当所得の金額と源泉徴収選択 口座内配当等以外の配当等に係る配当所得の金 額とを区分して、これらの金額を計算すること とされています（措法37の11の６①、措令25の 10の13①）。 ⑵　源泉徴収選択口座内配当等に係る源泉徴収に 関する特例 金融商品取引業者等が居住者等に対してその 年中に交付した源泉徴収選択口座内配当等につ いて徴収して納付すべき所得税の額を計算する 場合において、その源泉徴収選択口座内配当等 に係る源泉徴収選択口座において上場株式等に 係る譲渡損失の金額があるときは、その源泉徴 収選択口座内配当等について徴収して納付すべ き所得税の額は、その源泉徴収選択口座内配当 等の額の総額から上場株式等に係る譲渡損失の 金額を控除（損益通算）した残額に対して源泉 徴収税率を乗じて計算した金額とすることとさ れています（措法37の11の６⑥、措令25の10の 13⑧）。 この場合に、居住者等に対して支払われる源 泉徴収選択口座内配当等について、その年中に

五　源泉徴収選択口座内配当等に係る所得計算及び

源泉徴収等の特例の改正　　　　　　

⑷　経過期間内における源泉徴収選択口座におけ る上場株式等に係る譲渡所得等の申告不要の特 例の適用 経過期間内の各年において、居住者等が有す る源泉徴収選択口座における上場株式等に係る 譲渡所得等の申告不要の特例（措法37の11の５ ①）を適用しないで計算したその年中の上場株 式等に係る譲渡所得等の金額が500万円を超え る場合には、その居住者等が源泉徴収選択口座 （その者が二以上の源泉徴収選択口座を有する 場合には、それぞれの源泉徴収選択口座）にお いて有する特定口座内保管上場株式等の譲渡に よる譲渡所得等の金額及び信用取引等に係る上 場株式等の譲渡による雑所得等の金額（これら の金額の合計額が零を超える場合におけるこれ らの金額に限ります。）については、申告不要 の特例を適用せず、その上場株式等に係る譲渡 所得等の金額は、すべて確定申告をしなければ ならないこととされていました（旧平成20年改 正法附則45③）。

２　改正の内容

上場株式等に係る譲渡所得等に対する申告分離 課税の税率が、平成21年１月１日から平成23年12 月31日までの３年間は一律７％（他に個人住民税 ３％）の軽減税率を適用することとされたことに 伴い、この特例について以下の改正が行われまし た。 ⑴　上記１⑶の源泉徴収選択口座内における源泉 徴収税率及び還付の際の税率に対する７％（他 に個人住民税３％）軽減税率の特例措置の適用 期限が平成23年12月31日まで１年延長されまし た（平成20年改正法附則45①②）。 ⑵　上記１⑷の年間の上場株式等に係る譲渡所得 等の金額が500万円を超える場合には源泉徴収 選択口座における上場株式等に係る譲渡所得等 の申告不要の特例を適用しないこととする措置 が廃止されました（旧平成20年改正法附則45③）。

金融商品取引業者等がその源泉徴収選択口座内 配当等の交付の際に既に徴収した所得税の額が これにより計算した所得税の額を超えるときは、 その金融商品取引業者等は、その居住者等に対 し、その超える部分の金額に相当する所得税を 還付しなければなりません（措法37の11の６⑦）。 ⑶　平成22年における源泉徴収選択口座におけ る上場株式等の配当等と譲渡損失の損益通算の 特例に対する経過措置 源泉徴収選択口座における上場株式等の配当 等と譲渡損失の損益通算は平成22年からの適用 とされていますが（平成20年改正法附則46①）、 平成22年１月１日から同年12月31日までの期間 （以下「特例期間」といいます。）において、源 泉徴収選択口座内配当等のうちその年中に同一 の支払者から支払を受けるべき上場株式等の配 当等の総額が１万円以下であるもの（少額配当 等）について、以下のような経過措置が講じら れていました（旧平成20年改正法附則46②〜④、 旧平成20年改正措令附則25①〜⑦）。 ①　特例期間における源泉徴収選択口座内にお ける損益通算 特例期間内に、金融商品取引業者等が、居 住者等が支払を受けるべき源泉徴収選択口座 内配当等に係る源泉所得税の額を計算する場 合において、その源泉徴収選択口座内配当等 に係る源泉徴収選択口座に上場株式等に係る 譲渡損失の金額があるときは、その源泉徴収 選択口座内配当等について徴収して納付すべ き所得税の額は、源泉徴収選択口座内配当等 を㋑少額配当等と㋺少額配当等以外の配当等 とに区分した上で、これらの配当等の額から その上場株式等に係る譲渡損失の金額を控除 した金額に対して源泉徴収税率を乗じて計算 した金額とすることとされていました。 ②　源泉徴収選択口座内配当等に係る申告不要 の特例の適用 特例期間内における居住者等が有する源泉 徴収選択口座内配当等についての上場株式等 の配当等に係る申告不要の特例（措法８の５ ①）の適用は、その年中に支払を受けるべき 次の源泉徴収選択口座内配当等の区分に応じ それぞれ次に定める金額に係る配当所得の金 額ごとに行うこととされていました。 イ　その年中に支払を受けるべき源泉徴収選 択口座内配当等の額のうち、少額配当等に 該当するもの　その少額配当等の額の総額 ロ　その年中に支払を受けるべき源泉徴収選 択口座内配当等の額のうち、少額配当等以 外の配当等に該当するもの　その少額配当 等以外の配当等の額の総額 ③　損益通算の対象となった譲渡損失が申告不 要とならなかった場合の配当等の取扱い 源泉徴収選択口座における損益通算の特 例（措法37の11の６⑥）により金融商品取引 業者等が源泉徴収選択口座内配当等について 徴収して納付すべき所得税の額の計算上その 居住者等が有する源泉徴収選択口座内配当等 の額から控除した上場株式等に係る譲渡損失 の金額につき特定口座内保管上場株式等に 係る譲渡所得等の申告不要の特例（措法37の 11の５）の適用を受けない場合には、その源 泉徴収選択口座内配当等に係る配当所得の金 額については、上場株式等の配当等に係る申 告不要の特例（措法８の５①②）を適用し ないこととされていますが（措法37の11の６ ⑩）、特例期間においては、源泉徴収選択口 座内配当等を少額配当等と少額配当等以外の 配当等とに区分して損益通算を行うこととさ れていたため、上場株式等の配当等に係る申 告不要の特例の適用ができない配当等につい ても、次に掲げる譲渡損失の金額の区分に応 じて、それぞれ次に定める配当等ごとに認識 することとされていました。 イ　控除した譲渡損失の金額のうち少額配当 等の額から控除した金額　その居住者等が その源泉徴収選択口座内配当等に係る源泉 徴収選択口座において有する少額配当等の 額の総額

ロ　控除した譲渡損失の金額のうち少額配当 等以外の配当等の額から控除した金額　そ の居住者等がその源泉徴収選択口座内配当 等に係る源泉徴収選択口座において有する 少額配当等以外の配当等の額の総額

２　改正の内容

上記１⑶の平成22年中の源泉徴収選択口座に係 る経過措置は、平成21年及び22年の上場株式等の 配当所得については、上場株式等に係る課税配当 所得の金額のうち100万円以下の部分についての み７％（他に個人住民税３％）の税率を適用する こととされていたことを踏まえ、少額配当等に対 する特例として、その年中の上場株式等の配当等 の額の合計額が100万円を超える場合であっても、 少額配当については課税関係を７％（他に住民税 ３％）の源泉徴収のみで終了することを可能とす るために設けられていたものです。 今回の改正において、平成21年１月１日から平 成23年12月31日までの間は、上場株式等に係る配 当所得の金額について一律７％（他に個人住民税 ３％）の軽減税率を適用することとされたことに 伴い、少額配当についてのみこのような特例を設 ける必要性がなくなったことから、上記１⑶の経 過措置は廃止されました（旧平成20年改正法附則 46②〜④、旧平成20年改正措令附則25①〜⑦）。

六　特定口座内保管上場株式等の譲渡等に係る

所得計算等の特例の改正　　　　　　　　

１　改正前の制度の概要

⑴　居住者又は国内に恒久的施設を有する非居 住者（以下「居住者等」といいます。）が、特 定口座（その者が二以上の特定口座を有する場 合には、それぞれの特定口座）に上場株式等保 管委託契約に基づき振替口座簿（社債、株式等 の振替に関する法律に規定する振替口座簿をい います。以下同じです。）に記載若しくは記録 がされ、又は保管の委託がされている上場株式 等（以下「特定口座内保管上場株式等」といい ます。）の譲渡をした場合には、その特定口座 内保管上場株式等の譲渡による事業所得の金額、 譲渡所得の金額又は雑所得の金額とその特定口 座内保管上場株式等の譲渡以外の株式等の譲渡 による事業所得の金額、譲渡所得の金額又は雑 所得の金額とを区分して、これらの金額を計 算することとされています（措法37の11の３①、 措令25の10の２①前段）。 ⑵　信用取引又は発行日取引（以下「信用取引等」 といいます。）を行う居住者等が、上場株式等 信用取引等契約に基づき上場株式等の信用取引 等を特定口座において処理した場合には、信用 取引等に係る上場株式等の譲渡による事業所得 の金額又は雑所得の金額とその信用取引等に係 る上場株式等の譲渡以外の株式等の譲渡による 事業所得の金額又は雑所得の金額とを区分し て、これらの金額を計算することとされていま す（措法37の11の３②）。 ⑶　特定口座とは、居住者等が、上記⑴又は⑵の 特例の適用を受けるため、金融商品取引業者（第 一種金融商品取引業を行うものに限ります。）、 登録金融機関又は投資信託委託会社（以下「金 融商品取引業者等」といいます。）の営業所に、 その口座の名称、その口座に設ける勘定の種類、 上記⑴又は⑵の特例の適用を受ける旨その他一 定の事項を記載した特定口座開設届出書を提出 して、その金融商品取引業者等との間で締結し た上場株式等保管委託契約又は上場株式等信用 取引等契約に基づき設定された上場株式等の振 替口座簿への記載・記録若しくは保管の委託又 は上場株式等の信用取引等に係る口座（その口 座においてこれらの契約及び上場株式配当等受 領委任契約に基づく取引以外の取引に関する事 項を扱わないものに限ります。）をいうことと されています（措法37の11の３③一）。

⑷　上場株式等保管委託契約とは、上記⑴の特例 の適用を受けるために居住者等が金融商品取引 業者等と締結した上場株式等の振替口座簿への 記載若しくは記録又は保管の委託に係る契約で、 その契約書において次の事項が定められている ものをいいます（措法37の11の３③二、旧措令 25の10の２⑦⑧⑩〜⑳）。 ①　上場株式等の振替口座簿への記載若しくは 記録又は保管の委託はその記載若しくは記録 又は保管の委託に係る口座に設けられた特定 保管勘定において行うこと ②　その特定保管勘定においてはその居住者等 の次に掲げる上場株式等のみを受け入れるこ と イ　特定口座開設届出書の提出後に、その金 融商品取引業者等への買付けの委託等によ り取得をした上場株式等又はその金融商品 取引業者等から取得をした上場株式等で、 その取得後直ちにその口座に受け入れるも の ロ　その金融商品取引業者等以外の金融商品 取引業者等に開設されているその居住者等 の特定口座（以下「他の特定口座」といい ます。）から、他の特定口座に係る特定口 座内保管上場株式等の全部又は一部の移管 がされる場合のその移管がされる上場株式 等 ハ　贈与、相続（限定承認に係るものを除き ます。以下同じです。）又は遺贈（包括遺 贈のうち限定承認に係るものを除きます。 以下同じです。）により取得したその贈与者、 被相続人又は包括遺贈者（以下「被相続人 等」といいます。）の開設していた特定口 座に係る特定口座内保管上場株式等であっ た上場株式等（引き続きその口座（以下「相 続等口座」といいます。）に係る振替口座 簿に記載若しくは記録がされ、又はその相 続等口座に保管の委託がされているものに 限ります。以下同じです。）で、その相続 等口座からその相続等口座が開設されてい る金融商品取引業者等に開設されているそ の被相続人等に係る受贈者、相続人又は包 括受遺者（以下「相続人等」といいます。） の特定口座へ移管されるもので次の要件を 満たすもの イ　贈与により取得した上場株式等 贈与により取得した上場株式等のうち 同一銘柄の上場株式等はすべて相続等口 座から相続人等の特定口座へ移管がされ、 かつ、その移管がされる上場株式等がそ の相続等口座に係る上場株式等の一部で ある場合には、相続人等の特定口座にお いてその移管がされる上場株式等と同一 銘柄の上場株式等を有していないこと ロ　相続又は遺贈により取得した上場株式 等 相続又は遺贈により取得した上場株式 等のうち、同一銘柄の上場株式等はすべ て相続等口座から相続人等の特定口座へ 移管がされること ニ　贈与、相続又は遺贈により取得した上場 株式等で異なる金融商品取引業者等に開設 された相続等口座から相続人等の特定口座 に移管がされるもの（上記ハイ又はロの上 場株式等の区分に応じ、それぞれ上記ハイ 又はロに定める要件を満たすものに限りま す。） ホ　特定口座内保管上場株式等につき株式分 割若しくは併合、株式無償割当て、一定の 合併、一定の分割型分割、一定の株式交換 等により取得する上場株式等で、特定口座 への受入れを振替口座簿に記載又は記録を する方法により行うもの ヘ　特定口座内保管上場株式等につき所得税 法第57条の４第３項の規定による課税繰延 べ要件を満たす取得請求権付株式の請求権 の行使、取得条項付株式の取得事由の発生、 全部取得条項付種類株式の取得決議又は取 得条項付新株予約権が付された新株予約権 付社債の取得事由の発生により取得する上

場株式等で、特定口座への受入れを振替口 座簿に記載又は記録をする方法により行う もの ト　特定口座内保管上場株式等に付された新 株予約権（旧商法の転換社債の転換権を含 みます。）若しくは特定口座内保管上場株 式等について与えられた株式の割当てを受 ける権利若しくは特定口座内保管上場株式 等について与えられた新株予約権の行使又 は特定口座内保管上場株式等について与え られた取得条項付新株予約権の所得税法第 57条の４第３項の規定による課税繰延べ要 件を満たす取得事由の発生若しくは行使に より取得する上場株式等で、特定口座への 受入れを振替口座簿に記載又は記録をする 方法により行うもの チ　その他一定の上場株式等 ③　特定口座内保管上場株式等の譲渡は、その 金融商品取引業者等に対する売委託による方 法、その金融商品取引業者等に対してする方 法、会社法の規定に基づいて行う単元未満株 式の発行会社に対する譲渡に係る請求をその 特定口座を開設する金融商品取引業者等の営 業所を経由して行う方法により行うことその 他一定の事項

２　改正の内容

特定口座制度について、以下の改正が行われま した。 ⑴　特定口座に受入れ可能な上場株式等の範囲の 改正 平成21年５月31日までは、特例上場株式等（い わゆるタンス株）の特定口座への保管の委託に 関する特例措置を利用することにより、特定口 座以外で管理している上場株式等についても特 定口座への受入れが可能となっていましたが、 この特例は期限の到来をもって廃止されること となりました（下記⑵を参照）。 この特例の廃止により、特定口座以外で管理 している上場株式等については特定口座への受 入れが原則的にはできなくなることを踏まえ、 特定口座の利便性を高める観点から、次に掲げ る上場株式等を特定口座に受け入れることを可 能とする改正が行われました。 ①　相続等により取得したその被相続人等の開 設していた特定口座以外の口座で管理されて いた上場株式等で、その口座が開設されてい る金融商品取引業者等にその相続人等が開設 している特定口座に移管されるもの 贈与、相続又は遺贈により取得したその被 相続人等の開設していた特定口座以外の口座 （以下「相続等口座」といいます。）に係る振 替口座簿に記載若しくは記録がされ、又はそ の口座に保管の委託がされていた上場株式等 （引き続きその口座に係る振替口座簿に記載 若しくは記録がされ、又はその口座に保管の 委託がされているものに限ります。）で、そ の相続等口座からその相続等口座が開設され ている金融商品取引業者等に開設されている 相続人等の特定口座に移管されるもの（以下 「相続上場株式等」といいます。）が、特定口 座に受け入れることができる上場株式等の範 囲に追加されました（措令25の10の２⑮三）。 この場合には、上記１⑷②ハの特定口座であ った相続等口座から特定口座への移管の場合 と同様に、上記１⑷②ハイ又はロの上場株式 等の区分に応じ、それぞれ上記１⑷②ハイ又 はロに定める要件を満たすことが必要とされ ています。 （注）　上記の「相続」は限定承認に係るものを、「遺 贈」は包括遺贈のうち限定承認に係るもの を除きます。以下同じです。 また、相続上場株式等の移管を行う場合に は、相続人等は、相続等口座を開設している 金融商品取引業者等の営業所の長に対し、相 続上場株式等移管依頼書（相続上場株式等を 被相続人等の特定口座に移管することを依頼 する旨、移管する相続上場株式等の種類、銘柄、 数その他一定の事項を記載した書類をいいま

す。以下同じです。）を提出しなければなら ないこととされています（措令25の10の２⑯ 前段）。この場合に、相続上場株式等が特定 口座以外の口座で管理されていたものである 場合には、相続上場株式等移管依頼書に次に 掲げる書類を添付しなければならないことと されています（措令25の10の２⑯後段、措規 18の11⑪・⑰）。 （注）　その相続上場株式等の取得が贈与による ものであるときは、次に掲げる書類の他に、 その相続上場株式等が贈与により取得した ものである旨を証する書類も添付しなけれ ばならないこととされています（措令25の 10の２⑯後段）。 イ　被相続人等が次の書類において取得者 （その書類においてその株式を取得した者 とされている者をいいます。）とされてい る場合におけるこれらの書類のうちいずれ かの書類で、その贈与、相続又は遺贈があ った時においてその被相続人等が有してい た上場株式等（特定口座で管理されていた ものを除きます。）のうちその移管がされ る相続上場株式等と同一銘柄のすべての上 場株式等に係るもの イ　その上場株式等につき作成された契約 締結時交付書面、取引報告書、取引残高 報告書、受渡計算書その他これらに相当 する書類（その上場株式等の取得に要し た金額、取得年月日、銘柄、数、取得者 の氏名その他の事項の記載があるものに 限ります。） ロ　顧客勘定元帳等の写し（その上場株式 等の取得に要した金額、取得年月日、銘 柄、数、取得者の氏名その他の事項の記 載があるものに限ります。） ハ　払込みにより取得したその上場株式等 を発行した法人又はその法人の株主名簿 管理人等が作成した書類でその上場株 式等の取得に要した金額及び取得の日 を証するもの（その上場株式等の払込金 額、払込年月日、銘柄、数、取得者の氏 名その他の事項の記載があるものに限り ます。） ニ　上記イからハまでに掲げるもののほか、 金融商品取引業者等又は信託会社（金融 機関の信託業務の兼営等に関する法律に より信託業務を営む金融機関を含みま す。）が作成した書類でその上場株式等 の取得に要した金額及び取得の日を証す るもの（その上場株式等の取得に要した 金額、取得年月日、銘柄、数、取得者の 氏名その他の事項の記載があるものに限 ります。） ホ　その上場株式等の取得に係る売買契約 書（その上場株式等の取得に要した金額、 取得年月日、銘柄、数、取得者の氏名そ の他の事項の記載があるものに限りま す。）の写し ヘ　上場株式等償還特約付社債（いわゆる EB債）の償還に関する事務の取扱いを した金融商品取引業者等が作成した書類 でその償還により取得した上場株式等の 取得の日を証するもの（その上場株式等 の取得年月日、銘柄、数、取得者の氏名 その他の事項の記載があるものに限りま す。） ト　その上場株式等を発行した法人又はそ の法人の株主名簿管理人等が作成した書 類でその上場株式等の取得の日を証する もの（その上場株式等の払込み又は名義 書換の年月日、銘柄、数、取得者の氏名 その他の事項の記載があるもの（その上 場株式等の取得の日を名義書換の日とし ているものの場合には、その名義書換の 日がその贈与、相続又は遺贈があった日 前10年以内の日であるものを除きます。） に限られ、ハの書類に該当するものは除 かれます。） ロ　相続人等が所得税法第60条第１項の規定 により引き続き所有していたものとみなさ

れるその上場株式等の所得税法施行令の規 定に基づき計算した一単位当たりの取得価 額に相当する金額（総平均法に準ずる方法 により計算される上場株式等の譲渡所得等 の金額の計算上控除される取得費に相当す る金額）を記載した明細書（その被相続人 等がその上場株式等の取得をした日、種類、 銘柄、数、取得に要した金額その他の事項 の記載があるものに限ります。） （注１）　特定口座への受入れに際して上記イ ヘ又はトに掲げる書類を提出する場合 の上記ロの書類における一単位当たり の取得価額に相当する金額の計算は、 上記イヘ又はトの書類に記載された取 得の日におけるその相続上場株式等の 価額（その取得の日の終値など、上場 株式等の取得費の特例（措法37の11の ２）によるみなし取得費の計算の基礎 となる金額の算出方法に準じて算出し たその取得の日における価額に相当す る金額をいいます。）に相当する金額を 基礎として行うこととされています（措 規18の11⑱）。 （注２）　特定口座に受け入れる上場株式等の 取得価額は、上記ロの明細書に記載さ れる取得価額に相当する金額となりま す。 なお、相続上場株式等の移管がされる場合 に、相続等口座を開設している金融商品取引 業者等の営業所の長からその移管を受ける相 続人等の特定口座を開設している金融商品取 引業者等の営業所の長に上記イ及びロの書類 の写し、贈与により取得した旨を証する書類 その他一定の書類の送付がない場合には、相 続人等の特定口座を開設している金融商品取 引業者等の営業所の長は、その相続上場株式 等の移管を受けないものとされています（措 令25の10の２⑱）。 ②　特定口座内保管上場株式等について課税繰 延べ要件を満たさない取得請求権付株式の請 求権の行使等により取得する上場株式等 特定口座内保管上場株式等について、所得 税法第57条の４第３項の規定による課税繰延 べ要件を満たさない次に掲げる事由が生じた ことにより取得する上場株式等が、特定口座 に受け入れることができる上場株式等の範 囲に追加されました（措令25の10の２⑮十一、 十二）。 イ　取得請求権付株式に係る請求権の行使 ロ　取得条項付株式に係る取得事由の発生 ハ　全部取得条項付種類株式に係る取得決議 ニ　取得条項付新株予約権が付された新株予 約権付社債に係る取得事由の発生 ホ　特定口座内保管上場株式等について与え られた取得条項付新株予約権に係る取得事 由の発生 （注）　課税繰延べ要件を満たさない事由により 取得した上場株式等については、その取得 の基因となった株式（旧株）に係る譲渡益 について一旦課税された上で新株を取得す ることとなるため、特定口座への受入れ価 額（取得価額）は、取得に通常要する価額（時 価）となります（所令109①五）。 ③　上場株式等以外の株式等で、上場等の日の 前日において有するその株式等と同一銘柄の 株式等のすべてを、その上場等の日に受け入 れるもの 上場株式等以外の株式等で、その株式等に 係る金融商品取引所への上場等の日の前日に おいて有するその株式等と同一銘柄の株式等 のすべてを、その上場等の日に特定口座に係 る振替口座簿に記載又は記録をする方法によ り受け入れるものが、特定口座に受け入れる ことができる上場株式等の範囲に追加されま した（措令25の10の２⑮十七、措規18の11⑪）。 この場合の特定口座は、その特定口座を開 設している金融商品取引業者等の営業所の長 に対し、次に掲げる書類を提出した場合にお

けるその特定口座に限られます。 イ　上記①イイからホまでのいずれかの書類 又はその写し ロ　その上場株式等以外の株式等が贈与、相 続又は遺贈により取得したものであり、か つ、その被相続人等が上記①イイからホま での書類において取得者とされている場合 におけるこれらの書類のうちいずれかの書 類で、その贈与、相続若しくは遺贈があっ た時においてその被相続人等が有していた 株式等のうちその移管がされる株式等と同 一銘柄のすべての株式等に係るもの又はそ の写し及び次の書類 イ　その贈与に係る契約書、その相続に係 る財産分割協議書（その相続に係るすべ ての共同相続人及び包括受遺者が自署し、 自己の印を押しているものに限ります。）、 その遺贈に係る遺言書その他これらに類 する書類でその株式等の受入れをしよう とする居住者等がその株式等を贈与、相 続又は遺贈により取得したものであるこ とを確認できるもの又はその写し ロ　その株式等の受入れをしようとする居 住者等が、所得税法第60条第１項の規定 により引き続き所有していたものとみな されるその株式等の所得税法施行令の規 定に基づき計算した一単位当たりの取得 価額に相当する金額（総平均法に準ずる 方法により計算される上場株式等の譲渡 所得等の金額の計算上控除される取得費 に相当する金額）を記載した明細書（そ の被相続人等がその上場株式等の取得を した日、種類、銘柄、数、取得に要した 金額その他の事項の記載があるものに限 ります。） ハ　その株式等を発行した法人から交付を受 けたその居住者等が金融商品取引所への上 場等の日前２月以内の一定の日において有 するその株式等と同一銘柄の株式等（その 一定の日からその上場等の日の前日までの 間にその株式等と同一銘柄の株式等を取得 した場合には、その取得した株式等を含み ます。）の数を証する書類 （注１）　イ及びロの書類（ロイ及びロの書類を 除きます。）には、その株式等が、株式分割・ 併合、一定の会社合併、一定の会社分割、 一定の株式交換・移転（以下「株式分割等」 といいます。）により取得したものである 場合のその取得の基因となった株式等に 係るイ及びロの書類が含まれますが、こ れらの書類に記載された取得をした株式 等の数（その書類に記載された取得年月 日後にその株式等につき、株式分割等が あった場合には、それらの事由が生じた 後に取得者が有することとなった株式等 の数とし、ロの書類の場合にはそれらの 数のうち特定口座に株式等の受入れをし ようとする居住者等が上記①の贈与、相 続又は遺贈により取得をした株式等の数） の合計額がハに掲げる書類に記載された 株式等の数以上であるものに限られてい ます。 （注２）　特定口座に受け入れる上場株式等の取 得価額は、上記ロロの明細書に記載され る取得価額に相当する金額となります。 ④　保険会社の組織変更により割当てを受ける 株式で、その割当てを受ける株式のすべてを その株式の上場等の日に受け入れるもの 保険会社の相互会社から株式会社への組織 変更によりその保険会社から割当てを受ける 株式で、その割当てを受ける株式のすべてを、 その株式の金融商品取引所への上場等の日に 特定口座（その特定口座を開設している金融 商品取引業者等の営業所の長に対し、その保 険会社から交付を受けた割当てを受ける株式 の数を証する書類の提出をした場合における その特定口座に限ります。）に係る振替口座 簿に記載又は記録をする方法により受け入れ るものが、特定口座に受け入れることができ る上場株式等の範囲に追加されました（措令

25の10の２⑮十八）。 （注）　特定口座への受入れ価額（取得価額）は、 取得に通常要する価額（時価）となります（所 令109①五）。 ⑤　持株会契約等に基づき取得した上場株式等 で、特定口座への受入れをその持株会等口座 からその特定口座への振替の方法により行う もの 居住者等が締結した持株会契約等に基づき 取得した上場株式等で、特定口座への受入れ をその持株会契約等に基づき開設された口座 （以下「持株会等口座」といいます。）からそ の特定口座への振替の方法により行うものが、 特定口座に受け入れることができる上場株式 等の範囲に追加されました（措令25の10の２ ⑮十九）。 イ　持株会契約等の意義 「持株会契約等」とは、次の契約をいい ます（措令25の10の２⑮十九、措規18の11 ⑫⑬）。 イ　上場株式等の発行会社又はその発行会 社と資本関係、人的関係若しくは取引関 係を有する会社でその発行会社が指定し た会社の役員又は従業員（以下「従業員 等」といいます。）が、他の従業員等と 共同して、その発行会社が発行する上場 株式等の買付けを一定の計画に従って個 別の投資判断に基づかずに継続的に行う ことを約する契約 ロ　金融商品取引法第35条第１項第７号に 規定する累積投資契約のうち、給与等か ら控除された金銭をその給与等の支払を する者を経由して払い込む方法により行 う証券投資信託の受益権の買付けであっ て、その買付けを一定の計画に従って個 別の投資判断に基づかずに継続的に行う ことを約する契約 ロ　受入れ可能な特定口座の範囲 持株会契約等に基づき取得した上場株式 等を受け入れることができる特定口座は、 その持株会契約等により取得した上場株式 等をその取得の日から引き続きその持株会 等口座に係る振替口座簿への記載又は記録 をしている金融商品取引業者等その他一定 の金融商品取引業者等の営業所において開 設されているものに限られます。 この「その他一定の金融商品取引業者等」 とは、持株会等口座に係る振替口座簿への 記載又は記録をしている金融商品取引業者 等の発行済株式等（議決権のあるものに限 ります。以下同じです。）の総数等の50％ を超える数等の株式等（議決権のあるもの に限ります。以下同じです。）を直接に有 する関係にある会社が、その発行済株式等 の総数等の50％を超える数等の株式等を直 接に有する関係にあるその持株会等口座を 開設している金融商品取引業者等以外の金 融商品取引業者等をいいます（措規18の11 ⑭）。 （注１）　特定口座に受け入れる上場株式等の取 得日は持株会等口座から特定口座に振替 の方法により受け入れた日とされ（措令 25の10の２⑭）、取得価額はその上場株式 等の取得に通常要する価額（持株会等口 座で管理されていた金額）となります。 （注２）　持株会等口座から特定口座に受け入れ る上場株式等の取得価額は持株会等口座 を管理している金融商品取引業者等が管 理しているため、その特定口座を開設し ている居住者等が取得価額を証する書類 を提出する必要はありません。この取得 価額は、持株会等口座から特定口座へ振 替の方法により移管される際に引き継が れます。 ⑵　特例上場株式等（いわゆるタンス株）の特定 口座への保管の委託に関する特例措置の廃止 居住者等が有する上場株式等で金融商品取引 業者等に開設されているその居住者等の有価証 券の保管の委託に係る口座に保管の委託がされ

ていないもの（いわゆるタンス株）を、平成17 年４月１日から平成21年５月31日までの間に実 際の取得日及び取得価額で特定口座に受け入れ ることができることとする特例が講じられてい ましたが（租税特別措置法施行令の一部を改正 する政令（平成17年政令第103号）附則11）、こ の特例措置が、適用期限（平成21年５月31日） の到来をもって廃止されました。

３　適用関係

⑴　上記２⑴①の改正は、贈与、相続又は遺贈に より平成21年４月１日以後に特定口座に受け入 れる上場株式等について適用し、同日前に特定 口座に受け入れた上場株式等については、従前 どおりとされています（改正措令附則12②）。 ⑵　上記２⑴②の改正は、平成21年４月１日以後 の請求権の行使、取得事由の発生又は取得決議 により取得する上場株式等について適用し、同 日前の請求権の行使、取得事由の発生又は取得 決議により取得した上場株式等については、従 前どおりとされています（改正措令附則12③④）。 ⑶　上記２⑴③の改正は、金融商品取引所への上 場等の日が平成21年４月１日以後の日である株 式等について適用されます（改正措令附則12⑤）。 ⑷　上記２⑴④の改正は、金融商品取引所への上 場等の日が平成21年４月１日以後の日である株 式について適用されます（改正措令附則12⑥）。 ⑸　上記２⑴⑤の改正は、平成21年４月１日以後 に特定口座に受け入れる持株会契約等に基づき 取得する上場株式等について適用されます（改 正措令附則12①⑦）。

七　特定管理株式が価値を失った場合の株式等に係る

譲渡所得等の課税の特例の改正　　　　　　　　

１　改正前の制度の概要

⑴　居住者又は国内に恒久的施設を有する非居住 者（以下「居住者等」といいます。）について、 その有する特定管理株式が株式としての価値を 失ったことによる損失が生じた場合とされる清 算結了等の一定の事実が発生したときは、その 事実が発生したことはその特定管理株式の譲渡 をしたことと、その損失の金額はその特定管理 株式の譲渡をしたことにより生じた損失の金額 とそれぞれみなして、所得税関係の法令の規定 を適用することとされています（旧措法37の10 の２①）。 ⑵　この特例の対象となる特定管理株式は、特定 口座内保管上場株式等が上場株式等に該当しな いこととなった内国法人の株式につき、その上 場株式等に該当しないこととなった日以後引き 続きその特定口座を開設する金融商品取引業者 等に開設される特定管理口座に係る振替口座簿 に記載若しくは記録がされ、又は特定管理口座 に保管の委託がされているその内国法人の株式 とされていました（旧措法37の10の２①）。 ⑶　特定管理株式が株式としての価値を失った ことによる損失が生じたものとされる「一定の 事実の発生」とは、次のいずれかの事実の発生 とされていました（旧措法37の10の２①一・二、 旧措令25の８の２②）。 ①　特定管理株式を発行した株式会社（以下「特 定株式会社」といいます。）が解散（合併に よる解散を除きます。）をし、その清算が結 了したこと。 ②　特定株式会社が破産手続開始の決定を受け たこと。 ③　特定株式会社がその発行済株式の全部を無 償で消却することを定めた更生計画認可の決 定を受け、その消却をしたこと。 ④　特定株式会社がその発行済株式の全部を無 償で消却することを定めた再生計画認可の決 定を受け、その消却をしたこと。 ⑤　特定株式会社が預金保険法の特別危機管理

開始決定を受けたこと。 ⑷　特定管理口座とは、特定口座内保管上場株式 等が上場株式等に該当しないこととなった内国 法人の株式につき、特定口座から移管されるそ の内国法人の株式のみがその特定管理口座に係 る振替口座簿に記載若しくは記録がされ、又は 保管の委託がされる口座であることその他一定 の要件を満たす口座をいいます（旧措法37の10 の２①、旧措規18の９の２①）。 また、居住者等が、特定管理口座に係る振替 口座簿に記載若しくは記録がされ、又は特定管 理口座に保管の委託がされている特定管理株式 の譲渡をした場合には、それぞれの特定管理口 座ごとに、その特定管理口座に係る特定管理株 式の譲渡による事業所得の金額、譲渡所得の金 額又は雑所得の金額とその特定管理株式以外の 株式等の譲渡による事業所得の金額、譲渡所得 の金額又は雑所得の金額とを区分して、これら の所得の金額の計算を行うこととされています （旧措法37の10の２②、旧措令25の８の２④）。

２　改正の内容

⑴　特例の対象となる株式の追加 平成21年１月５日からいわゆる株券の電子化 が実施されていますが、この株券の電子化の実 施に伴い、同日において株券等保管振替機構に おいて管理されていた株券がある株式について は、その株券は同日に無効となる（株券を発行 する旨の定款の定めを廃止する定款の変更の決 議をしたものとみなす）こととされています（株 式等の取引に係る決済の合理化を図るための社 債等の振替に関する法律等の一部を改正する法 律（平成16年法律第88号）附則６①）。これは、 同日において金融商品取引所に上場されている 株式のみに適用されるのではなく、同日前に既 に上場が廃止され特定管理口座で管理されてい た株式のうちその株券が引き続き株式等保管振 替機構で取り扱われているものについても、同 様に適用されます。 上場株式については、株券が無効となった後 は株券電子化の制度（振替制度）によって株式 が管理されることとなりますが、既に上場廃止 となっている特定管理株式は通常株券電子化の 制度に移行しないため、同日以後は株主名簿に よりその発行会社等が株式の管理を行うことと なります。このため、同日以後は特定管理株式 を金融商品取引業者等が特定管理口座において 管理することができなくなり、特定管理口座か ら払い出されることとなります。 これにより特定管理口座から払い出された株 式については、その払い出された時点で特定管 理株式には該当しないこととなるため本特例の 適用対象外となりますが、このようなことが生 じるのは投資家の責めに帰すべきものではない こと等が考慮され、株券の電子化に伴って特定 管理口座から払い出された株式であっても、一 定の要件を満たすものについては「特定保有株 式」として、本特例の適用対象とすることとさ れました。 （注）　特定管理株式のうち平成21年１月５日にお いて株券等保管振替機構において管理されて いる株券がない銘柄の株式については、同日 においてその株券が無効とされないため、同 日以後も引き続き特定管理株式として、本特 例の適用対象となります。 ①　特定保有株式の意義 この「特定保有株式」とは、平成21年１月 ４日において特定管理株式であった株式で同 年１月５日に特定管理口座から払い出された もののうち同日以後その株式と同一銘柄の株 式の取得及び譲渡をしていないものであるこ とにつき一定の証明がされたものをいいます。 この「一定の証明がされたもの」とは、こ の特例の適用を受けようとする年分の確定申 告書に、次の③イの書類を添付することによ り証明がされたものとされています（措規18 の９の２②）。 （注）　平成21年１月５日以後に特定管理口座か ら払い出された株式と同一銘柄株式の株式 の取得又は譲渡をした場合には、その同一

銘柄株式のすべてが特定保有株式に該当し ないこととなります。 ②　特定保有株式が株式としての価値を失った ことによる損失の金額 この特例により株式等の譲渡損失の金額と みなされる金額は、特定保有株式となった特 定管理株式であった株式が特定管理口座から 払い出された時において、租税特別措置法施 行令第25条の８の２第４項の規定に基づき特 定管理口座において管理されていたその特定 管理株式に係る一株当たりの金額に相当する 金額（取得価額）を算出した場合におけるそ の金額にその払い出された時において有する その株式の数を乗じて計算した金額です。た だし、その払い出された時後に残余財産の分 配や会社分割等によって金銭等の交付を受け、 租税特別措置法第37条の10第３項の規定によ り株式等に係る譲渡所得等に係る収入金額と みなされる金額から取得費として控除された 金額は、この特例の対象となる損失の金額か ら除くこととされています（措令25の８の２ ①二）。 ③　確定申告書への記載及び証明書等の添付要 件 この特例の適用を受けようとする居住者等 は、清算結了等の上記１⑶に掲げる事実が発 生した日の属する年分の確定申告書に、この 特例の適用を受けようとする旨を記載し、か つ、次に掲げる書類を添付しなければなりま せん（措法37の10の２③、措令25の８の２⑥、 措規18の９の２④）。なお、この場合に、こ の確定申告書への記載及び書類の添付要件等 については、特定管理株式の場合と同様に宥 恕規定が設けられています（措法37の10の２ ④）。 イ　その金融商品取引業者等の営業所の長が 次のイからハまでに掲げる事実の確認をし た旨を証する書類（その確認をした旨及び ニからトまでに掲げる事項の記載があるも のに限ります。） イ　その特定保有株式に係る特定株式会社 等（特定保有株式を発行した株式会社又 は投資法人をいいます。以下同じです。） について清算結了等の上記１⑶に掲げる 事実が発生したこと。 ロ　その特定保有株式に係る特定株式会社 等又はその特定株式会社等の株主名簿管 理人若しくは投資主名簿等管理人の作成 した株式（投資法人の投資口を含みます。 以下同じです。）の異動に関する事項を 証する書類に、その居住者等が平成21年 １月５日からその清算結了等の事実が発 生した日までの間においてその特定保有 株式と同一銘柄の株式の取得及び譲渡を していない旨が記載されていること。 ハ　特定保有株式が払い出された時後にお けるその特定保有株式についての措法第 37条の10第３項各号に規定する事由（残 余財産の分配又は会社分割等により株主 への金銭等の交付があったことその他一 定の事由をいいます。）の発生の有無 ニ　上記イの清算結了等その他の事実の内 容及びその発生年月日 ホ　上記ハに掲げる措法第37条の10第３項 各号に規定する事由の発生の有無及びそ の事由の発生がある場合には、その事由 及びその発生年月日 ヘ　その特定保有株式となった特定管理株 式であった株式に係る一株当たりの金額 に相当する金額及びその株式の数 ト　その居住者等の氏名及び住所 ロ　株式等に係る譲渡所得等の金額の計算に 関する明細書（特定保有株式とそれ以外の 株式等との別に、特定保有株式に係る上記 ②の損失の金額及び株式等に係る譲渡所得 等の金額の計算に関する明細の記載がある ものに限ります。） ⑵　投資法人に関する規定の整備 投資信託及び投資法人に関する法律に規定す