Symposium on the chemistry of natural products Symposlum on the ohemlstry of natural produots
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植 物 ポリケタイ ド合 成酵 素の潜 在 的触 媒能力 を活用 し た非天 然型
新
規ア ル カ ロイ ド骨格の創
出 (静岡 県 大 薬 1, 東 大院 薬 2 ) 山 下 誠 1, 鰐 渕 清 史 1 , 史 社 坡 2 , 森 田洋 行 Z , 野 口博司 1 ,0
阿部 郁 朗 2天然物の 基本 骨格を構 築す る二次 代 謝 酵 素の 中に は , 活 性 部位の 微 妙な構造の 違 い で反 応様式 が大 きく変 化す るもの が あ り, これが天 然 物の 分子多様性 を 生 み 出 す 大 きな要 因の 一つ と なっ て い る.一方, 一 般に酵 素の 基質 特 異性 は厳 密で 自 由度が 低い もの と され てい るが, 植 物ポ リフ ェ ノ ール の 基本 骨格を構 築す る皿型 ポ リケ タ イ ド合 成 酵素 (
PKS
) が 示 す 広範な 基質
特 異 性 と触 媒 能 力は特筆に値す る 12). これ ら は, 反応の 立体化学が厳 密に制 御 された 「精巧な酵 素シ ステ ム 」 である とは 言い 難 く, む しろ単純 なア シ ル 基 転 移の 繰 り返 し に よ る 「炭 素 鎖伸 長マ シ ン」 と捉え るこ とが で き る.
Cys
−His
−Asn
か らなる活性 中心触 媒残 基は , 全て の 皿型PKS
に おいて 例外 なく保 存 され て お り, 同 一の ケ ミス ト リーで, マ ロ ニ ル
CoA
の 脱 炭 酸 を伴っ たClaisen
縮 合の 繰 り返 し に よる炭 素 鎖伸 長 反 応が進 行 するもの と考え られ る.従っ て , こ うした酵 素が 示 す 寛容な 基 質特異性 と潜 在 的 触媒能 力 を活 用 し て, 一 連の 人 工 基 質 を 作 用 させ るこ と に よ り,非 天然型新 規化合 物の 効 率的な 生 産 が可 能 に な る. また,C
,H
,0
原子 で構成
され る単
純 な 「カル ボニ ル の 化学
」 を触 媒 するm
型PKS
に, さらにN
など ヘ テ ロ 原 子 を導入 した人 工 基質を作用 させ れ ば ,N
原 子の 塩 基性 を利用 した 新 た なC
−N
あるい はGC
結合の 形 成 も 可 能にな る. 反 応 性 に富 む β一ポ リケ トメチ レ ン 中間 体か らシ ッ フ 塩 基の 形 成を介
した分子 内環 化 反 応が進 行 して, 複 雑なアル カ ロ イ ドの 骨格を 一挙 に 効率 的に構築
す る こ とができれ ば,m
型PKS
酵 素触媒機 能の 可能性を さら に大 き く拡張 す るこ と に なる と考え,本 研究に 着手 し た. (1
)含 窒 素 人工基
質 を用いた非天然 型 新規ア ル カロ イ ド骨 格の創
出当研 究室で ク ロ ーニ ン グに成 功 し た トウゲシ バ
Huperzia
serrata 由来PKS
I
は , 比 較的 大 き な基 質 結合 部位を有 する新 規III
型PKS
であ り, クマ ロ イ ルCoA
を開始 基 質 と し て3
分子の マ ロ ニ ルCoA
を順 次縮 合の 後, カル コ ン を 生 成 す る (Fig
.IA
) 3・4).(
A
) …曹
ぴ
3
漕
♂
KS1
冗
葱
゜ 冊濾
1
O mabnyi −C納 O O O OHc・uma 「°yic°A na・ing・nln齟 IC。n・
H
(
B
)
〔
〉
‡
1
:
い
2 漕
鳶
H O R3HorCH3 X=C齟2伽 ゾbenzo屮く)oA X=N’3rearbarnoyipgeolinyl−CoA o (c
)(
磯
急
・2
漕
H O
3rcarb臼rnoyl曹2.【aPhthoyiCeA
o
:
NH ’ n SEni X oRo O o
ζ 二
N同2s ,、, O O O ON O n NX 虹 I R R OH R=H or CH3 oζ Σ
・ ° 弧l OHFig
.1
H
.・serrata ・PKS
・1
が示 した潜 在的触媒能力 と非天然 型新 規アル カ ロ イ ド骨格の 創出Symposium on the chemistry of natural products
NII-Electronic Library Service Sym os エum セ chem エstry of natura ユ roducts
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今
回, 本酵 素に化 学合 成した2
一カル バ モ イル 安 息香
酸のCoA
チ オエ ス テル を開始基
質
と し て作
用 させ た場 合,2
分子し、マ n =ルCoA
(また は メ チル マ ロ ニ ルCoA
)を順 次縮 合の 後,
6
−5
−6
縮 合 環構 造を有 する3
環 性 非天然型新 規アル カ ロ イ ドを収 率80
%で 単一生成物 として 与 え るこ と を 見 出 した (Fig
.1B
,2A
).一方, これ と は 対 照的に, 後 述 する キ ダ チアロ az
Aloe
arborescens 由来オ クタ ケ タイ ド合成 酵 素 (OKS
) では ,2
一カル バ モ イ ル 安 息香 酸CoA
は ほ とん ど開始 基 質 と して 受け 入 れ られ ず,8
分子 の マ ロ ニ ル
CoA
の縮合
によ りオ ク タ ケ タ イ ドSEK4
!SEK4b
が 主 生成
物とし て, また,
2
一カル バ モ イル 安 息 香 酸CoA
に3
分子 の マ ロ ニ ルCoA
が縮 合 し た ラク トン が 副 生成 物 と して 得 られ るの みであっ た (Fig
.2B
), 次に,2
一カル バ モ イル 安 息 香 酸CoA
の 芳香 環を, ピ リジン 環やナ フ タ レン 環で 置換
し た修飾基質
を化学合成
し, トウゲシ バ 由来 PKS1
に作
用 させ た場合
, 同様に し て,2
分子 の マ ロニ ルCoA
を順 次 縮 合の 後,閉環反応が進 行 し て ,3
環 性お よ び4
環 性 の 非天然 型 新 規アル カ ロ イ ドを高収 率で単…生 成物 と して生成
す る こ と を見 出 した (Fig
,IB
,IC
).い ずれ の 場 合 も, トリケ タイ ド中間 体 へ 炭 素鎖伸
長の 後 , シ ッ フ 塩 基の 形 成 を介 して, 酵 素 的 にC
−N
結 合 形 成 と閉環 反応 が 進 行 す る もの と考え ら れ る (Fig
.3
).(
A
)
H
.serrataPKSI
o磯
訟
・2
避
窟
0 戀 嘱 ON NH2 di SEni O O O 聖 4 膈 繭 騨 晒 山 o oN 弧 〃 OH (B
)
A
.arborescensOKS
ロ¢
島
・3
廼
窟
0 0 oc
転
… 0 0 0 0 SEK4b 、 NH2 ノ oo
lM
EK4,
1
!
\証
畝
一_ oN NH2 h みへ .’、、 6 卩 n /の if .号 T 騨 ,弗rFtt十
Fig.2 H . serrrata PKS 1とA . arborescens
OKS
との酵素反応生成物 (HPLC
)の 比 較 O i t ヤ n N、貝 > X 眠 〃O o O 皿 証 ) o O 酬 rH 、 ノ ( ▼ oe 卿 Q O O h ”髄噛「酬ゆ偽 「 OH //”._1
SEnz enanimaFig
.3
予想 され るH
. serrataPKS1
酵 素反応 トリケタイ ド中 間体と 閉環反応機構86
N工 工一Eleotronlo LlbrarySymposium on the chemistry of natural products Symposlum on the ohemlstry of natural produots
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(2
)結 晶構 造に基づ く非天 然型 新規C21
カル コ ンおよびClg
ス チル ベ ン骨格の創
出 上述し た キ ダチ ア ロ エ 由来OKS
は,8
分 子の マ ロ ニ ルCoA
の 繰 り返 し縮 合に よ りCt6
芳 香族オク タケ タ イ ドSEK41SEK4b
の 骨格
を構築
す る新規 皿型PKS
である (Fig
.4A
)5).既 に我々 は , 本 酵 素のX
線 結 晶構造解 析に2
.6
A
の 分解 能で成功 し て お り, 同 じ く8
分子 の マ ロ ニ ルCoA
の 縮合を 触媒す る キ ダ チア ロ エ 由 来 ペ ン タ ケ タ イ ド ク ロ モ ン合 成 酵素 (PCS
)のM207G
変 異 型 酵 素 と 、ほぼ同一の 大 き さ と形状か らなる 活 性 中心 キャ ビテ ィ を もつ こ とを明らか に した 6・D. ま た, 活性 中心Cys174
を 起 点 とし て ポ リケ タ イ ド鎖が伸 張 し て い く際に壁 と な るAsn222
残 基 に ラン ダム 変 異を導入 し た結果,Gly
置 換 体で マ ロ ニ ルCoA
縮合 数が10
分 子 まで 拡大 して ,非 天然型C
,。ベ ン ゾフェ ノン 誘 導 体SEK15
を単 一生 成物 と して与 える こ とを見 出し て い る (Fig
.4B
)9・”). さ ら に,OKS
N222G
変異型酵素につ い て も,X
線 結 晶構 造解
析 に成功 し, 変異の 導入 に よ り実際に 活 性 中心キャ ビ テ ィ が拡 大 す るこ と も確 認 した .(
A
)
(
B
}Sx
°“ASY 【Y
(坩 o o mebn 屮eoA10x
螂Y
¥ °H O O mnbr }yi−(tOAOKS
O Sεn 署 00KS
堕
慌
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鞠
町〔
謀
。・・ tu ・
Ct6
SEK 4 SεK 4b 瓢l
l
“
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0 9 翩 稽♀
H ° °w 鮒 .C
じ
H CH3 HK) 爆osεK15
C20
OKS
WT
Ye2N
し
_
‘籌.,馳 脚 ηOKS
N222G
V351 C143tT204〔
r
ゾ
s.lvYe2 ..”−ty: t6 SubS町a竃e ε葡 an◎o 266F27SN21fi “Fig.
4
A ,arborescens ・OKS
野生型 及びN222G
変異型酵素の 活 性部位 構造と 反応機 構の比較Symposium on the chemistry of natural products
NII-Electronic Library Service Symposlum on the ohemlstry of natural produots
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今 回, 本 来
8
分子の マ ロ ニ ルCoA
を縮 合 するOKS
に クマ ロ イルCoA
を開始 基 質として 作 用 させ た 場合, クマ ロ イル
CoA
に5
分 子 あ るい は6
分子の マ ロ ニ ルCoA
が縮 合, ポ リケ タイ ド鎖が伸 長の 後, アル ド ール 型縮 合 に よ り芳香
環 を形 成 した, これ まで に例の ない ,非天然型 新規C21
カル コ ン 及 びC
、g ス チル ベ ン骨 格が 生成す る こ とを見 出 し た (Fig
.5
)9).た だ し , 収率は芳しくなく, さす が に 基質が これ だ け 嵩 高くなる と酵 素反応が うま く進 行 しない の も当然に 思 わ れ た .し か し, 上述 した, 結晶構造に基づ き活性 中心 キャ ビテ ィ を拡 大 したOKS
N222G
点変 異酵 素 (マ ロ ニ ルCoA
の み を基質 と した 場 合 に は10
分子縮合 に よ りC
,。ベ ン ゾフ ェ ノ ンSEK
15
を 生 成す る)に クマ ロ イルCoA
を開始 基 質 とし て作用 させ た場 合, 酵 素反応生成 物の 割 合が劇 的に変化 し て ,非天然型 新 規C2
且 カル コ ン の 生成量 が 飛躍的 に増 大 し, 主 生成 物と し て与 える こ とを見 出した 9}. c・Asrv °:
6
・ 鰯窟
O malonyi く)o《 couma 「oyK )QA O O C・7rt>12 ジノ 7°
⊃
。、 OH HO o OH O +5xc
°dS )1
一 ヘ ガOH O O mab 噸{)畝 00 SEni Oo OH C−6/C−11 黛 〃 HO OH21 A ・ ° ⊃ ク
ζ
OH oO SEnz O fO HO 転 0 8ζ
1 0HC19
OKS
WT
SEK4b/
_
⊥
− 25 go 36剛n 唱 m 25 30聖
Fig .5
A .arborescens OKS が示 した潜在的触 媒能力 と非天然型新 規ポ リケタ イ ド骨格の 創出
以 上, 皿型
PKS
の 異例 とも言え る寛
容 な基質
特 異性 と潜在
的触 媒能 力 を活 用する こ とに よ り, ま た, 合理 的 な 人工基 質の 設計 と結 晶構 造に基づ く機能 改変 酵 素を組 み合わせ る こ とに よ り, 新規 生体 触 媒 と非天然 型 新規化合物 の 効 率 的な 生 産 が 可能 にな る.今 後,酵 素に よ る閉 環 ・芳香 環 形成反 応 機 構 の 解明 と制御 を進 める と と も に, さ らな る複 雑 骨格を有 する アル ン、 ロ イ ド分子の 創 製へ 挑 戦 したい .88
N工 工一Eleotronlo LlbrarySymposium on the chemistry of natural products Symposium on thechemistry ofnatural products
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of unnatural novel chalcone, stilbene, andbenzophenone
scaffoldsby
plant
Symposium on the chemistry of natural products
NII-Electronic Library Service Symposium
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on the chemistry of natural products
Enzymatic
Synthesis
of
Unnatural
Novel
Alkaloida1
Scaffolds
by
Plant
P(
lyketide
Synthases
Makoto
Yamashitai
,Kiyofumi
Wanibuchii
,Shepo
Shi2,
Hiroyuki
Morita2,
Hiroshi
Noguchii,
Ikuro
Abe2
'
School
ofPhar:maceutical
Sciences,
University
cvFShizuoka2
Graduate
School
ofPharmaceutical
Sciences,
71he
Uhiversity
of
7bkyo
Plant
typeIII
polyketide
synthases(PKSs)
exhibit unusuallybroad,
promiscuous
substratespecificities;
the
structurally simplehomodimeric
proteins
accept a variety ofnonphysiological substrates,
including
aromatic and aliphaticCoA
thioesters,
toproduce
anarray of chemically and structurally
divergent
unnaturalpolyketides.
Here
wepresent
mostrecent examples
including
enzymaticformation
of(i)
tricyclicand tetracyclicunnaturalnovel
alkaloidal
scaffoldsby
PKS1
from
Ehtperzia
serrata, and(ii)
aC,,
hexaketide
stilbeneand a
C2,
heptaketide
chalconeby
octaketide synthase(OKS)
from
Atoe
arborescens.Manipulation
of the enzyme reactionsby
combination of theprecursor
directed
biosynthesis
and structure-guided engineering of the enzyme would thus
lead
tofurther
production
ofunnatural novel