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Sympsium エ n セ the chemistry エ f natural ユ prducts 5 今回, 本酵素に化学合成した 一カルバモイル安息香酸の CA チオエステルを開始基質として作用させた場合, 分子し マ n = ル CA ( またはメチルマロニル CA ) を順次縮合の後,6

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Academic year: 2021

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(1)

Symposium on the chemistry of natural products Symposlum  on  the  ohemlstry  of  natural  produots

15

植 物 ポリケイ ド合 成酵 素の潜 在 的触 媒能力 を活用 し た

   

非天 然型

規ア ル カ ロイ ド骨格の

出          (静岡 県 大 薬 1, 東 大院 薬 2 ) 山 下 誠 1, 鰐 渕 清 史 1 , 史  社 坡 2 , 森 田洋 行 Z , 野 口博司 1 ,

0

阿部 郁 朗 2

 

天然物の 基本 骨格を構 築す る二次 代 謝 酵 素の 中に は , 活 性 部位の 微 妙な構造の 違 い で反 応様式 が大 きく変 化す るもの が あ り, これが天 然 物の 分子多様性 を 生 み 出 す 大 きな要 因の 一つ と なっ て い る.一方, 一 般に酵 素の 基質 特 異性 は厳 密で 自 由度が 低い もの と され てい るが, 植 物ポ リフ ェ ノ ー 本 骨構 築す る型 ポ リケ タ イ ド合 成 酵素 (

PKS

) が 示 す 広範な 基

特 異 性 と触 媒 能 力は特筆に値す る 12) これ ら は, 反応の 立体化学が厳 密に制 御 された 「精巧な酵 素シ ステ ム 」 である とは 言い 難 く, む しろ単純 なア シ ル 基 転 移の 繰 り返 し に よ る 「炭 素 鎖伸 長マ シ ン」 と捉え る

こ とが で き る.

Cys

His

Asn

か らなる活性 中心触 媒残 基は , 全て の 皿型

PKS

に おい

て 例外 なく保 存 され て お り, 同 一の ケ ミス ト リーで, マ ロ ニ ル

CoA

の 脱 炭 酸 を伴っ た

Claisen

縮 合の り返 し に よる炭 素 鎖伸 長 反 応が進 行 するもの と考え られ る.従っ て , こ した酵 素が 示 す 寛容な 基 質特異性 と潜 在 的 触媒能 力 を活 用 し て,  一 連の 人 工 基 質 を 作 用 させ るこ と に よ り,非 天然型新 規化合 物の 効 率的な 生 産 が可 能 に な る. また,

C

, 

H

0

原子 で構

され る

純 な 「カル ボニ ル の 化

」 を触 媒 する

m

PKS

に, さらに

N

など ヘ テ ロ 原 子 を導入 した人 工 基質を作用 させ れ ば ,

N

原 子の 塩 基性 を利用 した 新 た な

C

N

あるい は

GC

結合の 形 成 も 可 能にな る. 反 応 性 に富 む β一ポ リケ トメチ レ ン 中間 体か らシ ッ フ 塩 基の 形 成

した分子 内環 化 反 応が進 行 して, 複 雑なアル カ ロ イ ドの 骨格を 一挙 に 効率 的に構

す る こ とができれ ば

m

PKS

酵 素触媒機 能の 可能性を さら に大 き く拡張 す るこ と に なる と考え,本 研究に 着手 し た. (

1

)含 窒 素 人工

質 を用いた非天然 型 新規ア ル カロ イ ド骨 格

 

当研 究室で ク ロ ーニ ン グに成 功 し た トウゲシ バ

Huperzia

 serrata 由来

PKS

 

I

比 較的 大 き な基 質 結合 部位を有 する新 規

III

PKS

であ り, クマ ロ イ ル

CoA

を開始 基 質 と し て

3

分子の マ ロ ニ ル

CoA

を順 次縮 合の , カル コ ン を 生 成 す る (

Fig

. 

IA

) 3・4)

A

) …

3

KS1

゜ 冊

1

    O      mabnyi −C納       O  O        O  OH

  c・uma 「°yic°A         naingnln ICn

                            H

B

1

2 漕

H       O       R3HorCH3   X=C齟2伽 ゾbenzo屮く)oA   X=N’3rearbarnoyipgeolinyl−CoA       o (

c

2

 

H       O

  3rcarb臼rnoyl曹2.【aPhthoyiCeA

o

 

NH ’ n   SEni X   oRo  O       o

ζ 二

N同2s ,、,       O   O   O   ON        O n   NX   虹 I  R   R   OH R=H or CH3       o

ζ Σ

・ °       弧l         OH

Fig

1

 

H

.・serrata

PKS

1

示 した潜 在的触媒能力 と非然 型新 規 ロ イ ド骨格の

(2)

Symposium on the chemistry of natural products

NII-Electronic Library Service Sym  os エum      セ    chem エstry  of  natura ユ  roducts

15

 今

回, 本酵 素に化 学合 成した

2

一カル バ モ イル 安 息

酸の

CoA

チ オエ ス テル を開始

と し て

用 させ た場 合

2

子し、マ n =

CoA

た は メ チ マ ロ ニ ル

CoA

を順 次縮 合の

6

5

6

縮 合 環構 造を有 する

3

環 性 非天然型新 規アル カ ロ イ ドを収 率

80

%で 単一生成物 として 与 え るこ と を 見 出 した (

Fig

1B

2A

).一方, これ と は 対 照

的に, 後 述 する キ ダ チアロ az 

Aloe

 arborescens 由来オ クタ ケ タイ ド合成 酵 素 (

OKS

) では ,

2

一カル バ モ イ ル 安 息香 酸

CoA

は ほ とん ど開始 基 質 と して け 入 れ られ ず,

8

分子 の マ ロ ニ ル

CoA

縮合

によ りオ ク タ ケ タ イ ド

SEK4

SEK4b

が 主 生

物とし て

, また,

2

一カル バ モ イル 安 息 香 酸

CoA

3

分子 の マ ロ ニ ル

CoA

が縮 合 し た ラク トン が 副 生成 物 と して 得 られ るの みであっ た (

Fig

2B

),   次に,

2

一カル バ モ イル 安 息 香 酸

CoA

の 芳香 環を, ピ リジン 環やナ フ タ レン 環で 置

し た

修飾基質

を化

学合成

し, トウゲシ バ 由

来 PKS1

用 させ た場

, 同様に し て,

2

分子 の マ ロニ ル

CoA

を順 次 縮 合の 閉環が進 行 し て ,

3

環 性お よ び

4

環 性 の 非天然 型 新 規アル カ ロ イ ドを単…生 成物 と し

す る と を見 出 した (

Fig

, 

IB

, 

IC

).い ずれ の 場 合 も, トリケ タイ ド中間 体 へ 炭 素

鎖伸

後 , シ ッ フ 塩 基の 形 成 を介 して, 酵 素 的 に

C

N

結 合 形 成 と閉環 反応 が 進 行 す る もの と考え ら れ る (

Fig

3

).

A

 

H

.serrata  

PKSI

        o

 

 

 

2

          0 戀 嘱   ON    NH2 di       SEni   O  O  O 聖 4 膈 繭 騨 晒 山 o   oN 弧 〃   OH (

B

A

.arborescens  

OKS

        ロ

 

 

 

¢

3

        0       0       o

 

 

 

 

 

 

c

…       0   0   0  0       SEK4b 、   NH2 ノ             o

 

o

  lM

       EK4

 

 

 

1

\証

 

_   oN    NH2          h       みへ .’、、       6            n      /の       if       .号       T      騨       ,弗rFtt十

Fig.2  H . serrrata  PKS 1A . arborescens  

OKS

との酵素応生成物 (

HPLC

)の 比 較       O i  t     ヤ     n   N、 >  X   〃O       o O   皿 証 ) o       O 酬     rH 、 ノ (   ▼ oe 卿         Q  O     O      h ”髄噛「酬ゆ偽 「  OH //”._

1

      SEnz       enanima

Fig

3

 予想 され る

H

. serrata  

PKS1

酵 素リケイ ド中 間と 閉環反応機

86

N工 工一Eleotronlo  Llbrary  

(3)

Symposium on the chemistry of natural products Symposlum  on  the  ohemlstry  of  natural  produots

15

2

)結 晶構 造に基づ く非天 然型 新規

C21

カル コ ンよび

Clg

ス チル ベ ン骨格

 上述し た キ チ ア ロ エ

OKS

8

分 子の マ ロ ニ ル

CoA

の 繰 り縮 合に よ り

Ct6

芳 香族オク タケ タ イ ド

SEK41SEK4b

を構

す る新規 皿型

PKS

である (

Fig

4A

)5) , 本 酵 素の

X

線 結 晶構造解 析に

2

6

 

A

の 分解 能で成功 し て お り, 同 じ く

8

分子 の マ ロ ニ ル

CoA

の 縮合を 触媒す る キ ダ チア ロ エ 由 来 ペ タ ケ タ イ ド ク ロ モ ン合 成 酵素 (

PCS

)の

M207G

変 異 型 酵 素 と 、ほぼ同一の 大 き さ と形状か らなる 活 性 中心 キャ ビテ ィ を もつ こ とを明らか に した 6・D. ま た, 活性 中心

Cys174

を 起 点 とし て ポ リケ タ イ ド鎖が伸 張 し て い く際に壁 と な る

Asn222

残 基 に ラン ダム 変 異を導入 し た結果,

Gly

置 換 体で マ ロ ニ ル

CoA

縮合 数が

10

分 子 まで 拡大 して ,非 天然型

C

,。ベ ン ゾフェ ノン 誘 導 体

SEK15

を単 一 成物 と して与 える こ とを見 出し て い る (

Fig

4B

)9・”). さ ら に, 

OKS

 

N222G

変異型酵素につ い て も, 

X

線 結 晶構 造

析 に成功 し, 変異の 導入 に よ り実際に 活 性 中心キャ ビ テ ィ が拡 大 す るこ と も確 認 した .

A

B

Sx

 °“ASY 【

Y

(坩       o  o       mebn 屮eoA

10x

Y

¥ °H         O  O       mnbr }yi−(tOA

OKS

      O       Sεn 署       0

0KS

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        O

 

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Ct6

    SEK 4           SεK 4b 瓢

l

l

_

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  0          9          翩         稽

 

H ° °w 鮒 .

C

 

H         CH3 HK)  爆o

 

sεK15

 

C20

OKS

 

WT

 

Ye2N

_

    ‘籌.,馳    脚        η

OKS

 

N222G

V351 C143tT204

r

  s.lvYe2 ..”−ty: t6 SubSae ε葡 an◎o 266F27SN21fi “

Fig.

4

 A ,arborescens ・

OKS

生型 及び

N222G

変異型酵素の 活 性部位 構造と 反応機 構

(4)

Symposium on the chemistry of natural products

NII-Electronic Library Service Symposlum  on  the  ohemlstry  of  natural  produots

15

 今 回, 本 来

8

分子の マ ロ ニ ル

CoA

を縮 合 する

OKS

に クマ ロ イル

CoA

を開始 基 質

として 作 用 させ た 場合, クマ ロ イル

CoA

5

分 子 あ るい は

6

分子の マ ロ ニ ル

CoA

が縮 合, ポ リケ タイ ド鎖が伸 長の 後, アル ド ー 型縮 合 に よ り

環 を形 成 した, これ まで に例の ない ,非天然型 新規

C21

カル コ ン 及 び

C

、g ス チル ベ ン骨 格が 生成す る こ とを見 出 し た (

Fig

5

)9)た だ し , 収率は芳しくなく, さす が に 基質が これ だ け 嵩 高くなる と酵 素反応が うま く進 行 しない の も当然に 思 わ れ た .し か し, 上述 した, 結晶構造に基づ き活性 中心 キャ ビテ ィ を拡 大 した

OKS

 

N222G

点変 異酵 素 (マ ロ ニ ル

CoA

の み を基質 と した 場 合 に は

10

分子縮合 に よ り

C

。ベ ン ゾフ ェ ノ ン

SEK

 

15

を 生 成す る)に クマ ロ

CoA

を開始 基 質 とし て作用 させ た場 合, 酵 素反応生成 物の 割 合が劇 的に変化 し て ,非天然型 新 規

C2

且 カル コ ン の 生成量 が 飛躍的 に増 大 し, 主 生成 物と し て与 える こ とを見 出した 9} c・Asrv °

 

6

・ 鰯

     O                  malonyi く)o《   couma 「oyK )QA   O  O       C・7rt>12         ジノ  7

  

°

⊃ 

。、       OH       HO o OH O +

5xc

°dS )

1

一 ヘ ガOH         O  O       mab 噸{)畝     00          SEni     Oo         OH C−6/C−11         黛         〃     HO OH

   

21 A ・ ° ⊃ ク

ζ

      OH     oO         SEnz     O   fO HO 転   0       8

ζ

1   0H

 

C19

OKS

 

WT

      SEK4b

_

−       25      go      36剛n       唱 m 25 30

Fig .5

 

A .arborescens  OKS が示 た潜在的触 媒能力 と非然型新 規ポ リケタ イ ド骨

 

以 上, 皿型

PKS

の 異例 とも言え る

容 な

基質

特 異性 と潜

的触 媒能 力 を活 用する こ とに よ り, ま た, 合理 的 な 人工基 質の 設計 と結 晶構 造に基づ く機能 改変 酵 素を組 み合わせ る こ とに よ り, 新規 生体 触 媒 と非天然 型 新規化合物 の 効 率 的な 生 産 が 可能 にな る.今 後,酵 素に よ る閉 環 ・芳香 環 形成反 応 機 構 の 明 と制御 を進 める と と も に, さ らな る複 雑 骨格を有 する アル ン、 ロ イ ド分子の 創 製へ 挑 戦 したい .

88

N工 工一Eleotronlo  Llbrary  

(5)

Symposium on the chemistry of natural products Symposium on thechemistry ofnatural products

15

rtl,

2.

3.

4.

5.

6.

7.

8.

9.

nt

(a)

pofzzasra,

e,retzrie

y

tr

ty

yr

FaJatpt#ohentueneo$upmt,,

eree,stefz

t#E

es-A;Elf,

66.

683

(2oo8).

(b)

I.

Abe,

"Chemistry

and

biochemistry

of type

III

polyketide

synthases",

IVat,

Prod.

Rep.,

in

preparation

(2009).

(c)

I.

Abe,

"Engineered

biosynthesis

of

plant

polyketides:

structure-based and

precursor-directed

approach",

7bpics

in

Current

Chemistry,

in

press

(2009).

I.

Abe,

H.

Morita,

A.

Nomura,

H.

Noguchi,

"Substrate

specificity of chalcone

synthase: enzymatic

formation

of unnatural

polyketides

from

synthetic

cinnamoyl-CoA analogs".

J.

Am,

Chem.

Soc.,

122,

1

1242

(2ooO).

K.

Wanibuchi,

P.

Zhang,

T.

Abe,

H.

Morita,

T.

Kohno,

G.

Chen,

H.

Noguchi,

I.

Abe.

"An

acridone-producing novel rnultifunctional type

III

polyketide

synthase

from

Huperzia

serrata",

FEBS

J.,

274,

1073

(2oo7).

H.

Morita,

S.

Kondo,

R.

Kato,

K.

Wanibuchi

,

H.

Noguchi,

S.

Sugio,

I.

Abe,

T.

Kohno,

"Crysta11ization and

preliminary

crystallographic analysis of an acridone-producing

novel multifunctional type

III

polyketide

synthase

from

HLiperzia

serrata",

Acta

Crystallogr.,

F63,

576

(2007).

I.

Abe,

S.

Oguro,

Y.

Utsumi,

Y.

Sano,

H.

Noguchi,

"Engineered

biosynthesis

of

plant

polyketides:

chain

length

control

in

an octaketide-producing

plant

type

III

polyketide

synthase".

J.

Am.

Chem.

Soc.,

127,

12709

(2005).

H.

Morita,

S.

Kondo,

R.

Kato,

K.

Wanibuchi

,

H.

Noguchi,

S.

Sugio,

I.

Abe,

T.

Kohno,

"Crysta11ization

and

preliminary

c

lstallographic

analysis of an octaketide-producing

plant

type

III

polyketide

synthase".

Acta

Crystallogn,

F63,

947

(2007).

H.

Morita,

S.

Kondo,

S.

Oguro,

H.

Noguchi,

S.

Sugio,

1.

Abe,

T.

Kohno,

"Structural

insight

into

chain

length

control and

product

specificity of

pentaketide

chromone

synthase

from

Aloe

arborescens".

Chem.

Biol.,

14,

359

(2007).

I.

Abe,

H.

Morita,

S.

Oguro,

H.

Noma,

K.

Wanibuchi,

N.

Kawahara,

Y.

Goda,

H.

Noguchi,

T.

Kohno,

"Structure-based

engineering of a

plant

type

III

polyketide

synthase:

formation

of an unnaturai nonaketide naphthopyrone".

J.

Am.

Chem.

Soc.,

129,5976

(2oo7).

S.-R

Shi,

K,

Wanibuchi,

H.

Morita,

K.

Endo,

H.

Noguchi,

I.

Abe,

"Enzymatic

formation

of unnatural novel chalcone, stilbene, and

benzophenone

scaffolds

by

plant

(6)

Symposium on the chemistry of natural products

NII-Electronic Library Service Symposium

15

on the chemistry of natural products

Enzymatic

Synthesis

of

Unnatural

Novel

Alkaloida1

Scaffolds

by

Plant

P(

lyketide

Synthases

Makoto

Yamashitai

,

Kiyofumi

Wanibuchii

,

Shepo

Shi2,

Hiroyuki

Morita2,

Hiroshi

Noguchii,

Ikuro

Abe2

'

School

ofPhar:maceutical

Sciences,

University

cvFShizuoka

2

Graduate

School

ofPharmaceutical

Sciences,

71he

Uhiversity

of

7bkyo

Plant

type

III

polyketide

synthases

(PKSs)

exhibit unusually

broad,

promiscuous

substrate

specificities;

the

structurally simple

homodimeric

proteins

accept a variety of

nonphysiological substrates,

including

aromatic and aliphatic

CoA

thioesters,

to

produce

an

array of chemically and structurally

divergent

unnatural

polyketides.

Here

we

present

most

recent examples

including

enzymatic

formation

of

(i)

tricyclicand tetracyclicunnatural

novel

alkaloidal

scaffolds

by

PKS1

from

Ehtperzia

serrata, and

(ii)

a

C,,

hexaketide

stilbene

and a

C2,

heptaketide

chalcone

by

octaketide synthase

(OKS)

from

Atoe

arborescens.

Manipulation

of the enzyme reactions

by

combination of the

precursor

directed

biosynthesis

and structure-guided engineering of the enzyme would thus

lead

to

further

production

of

unnatural novel

polyketide

and alkaloid scaffolds.

Fig. 4   A , arborescens ・ OKS 野 生型 及 び N222G 変異 型 酵 素 の 活 性 部位 構造 と 反 応機 構 の 比 較

参照

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