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PubMed とは 医学関連分野の文献データベース MEDLINE の公開版 文献の書誌情報 ( タイトル 著者名 雑誌名 抄録など ) を収録 医学用語 著者 雑誌名などを手がかりに検索できる 各文献に MeSH が付与されている 主題 内容を表す統制されたキーワードで 階層構造になっている 2

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(1)

PubMed

PubMed

検索法

検索法

(入門編

(入門編

)

)

筑波大学中央図書館 筑波大学中央図書館 レファレンス係 レファレンス係 2005.10 2005.10

(2)

PubMedとは

医学関連分野の文献データベースMEDLINEの公 開版 文献の書誌情報(タイトル、著者名、雑誌名、 抄録など)を収録 医学用語、著者、雑誌名などを手がかりに検 索できる 各文献にMeSHが付与されている。 主題・内容を表す統制されたキーワードで、階層構造 になっている。 2

(3)

PubMedとは

提供元:アメリカ国立医学図書館(NLM)の 国立バイオテクノロジー情報センター

(NCBI:National Center for Biotechnology Information)

アメリカの国費で運用

世界各地から無料で24時間利用可能

(4)

収録範囲

4 収録対象誌 4800誌以上 世界約70カ国(アメリカ中心) 収録年:1950年~ そのうち、1950年~1965年=OLDMEDLINE (データ構造が異なる) MEDLINEに索引付けされる前の情報や 収録対象外の情報も含まれる

(5)

データ構造

別添の資料(MEDLINE形式の詳細表示)を 参照してください [TI][AB][MH]などはそれぞれのフィール ドを表す「タグ」 タグを使ってフィールドを指定して検索 することもできる 例:EPIをタイトルに限定する場合 EPI[TI] 5

(6)

PubMedへの接続

6 接続先:http://pubmed.gov/ Feature tabs Query box Side bar Query box キーワードを入力 Feature tabs 検索のための機能 を選択 Side bar Helpや自習プログ ラム、検索のため のさまざまな機 能、他のシステム へのリンクなど

(7)

基本的な検索

1)「Search」横のボックスはPubMedのまま、 クエリーボックスにキーワードを入力して、 2)右横の「Go」ボタンをクリックすると検索 が始まります。 (「Go」ボタンの代わりにEnterキーを押してもよい) 7

(8)

キーワード入力のポイント

大文字・小文字どちらでも可 2つ以上のキーワードを掛け合わせる場合  =スペースを挟んで並べて入力  (自動的にすべてを含む文献を検索) 複数の単語をフレーズとして入力したい場 合は、””(ダブルクォーテーション)で くくる 8

(9)

入力例(1)

「小児喘息の薬物治療に関する文献」 キーワードは 「小児喘息(child asthma)」と 「薬物治療(drug therapy)」 9 クエリーボックスへの入力は child asthma drug therapy

(10)

前方一致検索(Truncation)

単数形と複数形を一緒に検索するなど、 語尾変化のある単語をまとめて検索したい ときに利用 キーワードの最後に*(アスタリスク)を つけて検索。一文字に*をつけるのは不可 PubMedではバリエーションは600種類まで しか検索できない 一般にこのような検索を「トランケーション」 または「ワイルドカード検索」という このような検索に使うマークを「トランケーシ ョン記号」と呼ぶ(マークはDBにより異なる)  10  

(11)

ストップワード

検索の対象にならない単語のこと PubMedの主なストップワード: “a”“the”“of”“can” “that”など 一覧リスト サイドバーの Help → Appendics → Stopwords ストップワードを含む複数の単語をフレーズと して入力したい場合 ””で括る 11

(12)

特殊文字の入力

ギリシャ文字 ⇒英綴りで入力  例:α → alpha ハイフン ⇒スペースに置き換え アポストロフィ、! ? % などの記号 ⇒省略 ウムラウト、アクサンテギュ ⇒省略 分子式など  例:H2O, 39 degrees C 12

(13)

入力例(2)

「Journal of Cell Biology に掲載された  D.A. Starr氏の論文」

キーワードは

「Journal of Cell Biology」と 「Starr DA」

13

クエリーボックスへの入力は

(14)

雑誌名の入力

正式名、またはMEDLINEの略誌名、ISSNを入力 ISSNは “-”(ハイフン)を省略しない

ISSN:International Standard Serial Number (国際標準逐次刊行物番号)

個々の刊行物に与えられる固有の識別番号  例:ISSN 0028-0836 (Nature のISSN)

(15)

著者名の入力

姓△(スペース)名前のイニシャル

ファーストネームとミドルネームのイニシャルは 続けて入力する。

例:Howard Martin Temin → temin hm

特殊な著者名の例

St.Clair M → St Clair M (ピリオドは省略) Smith AB 3d, Smith AB III → Smith AB 3rd Vaat JM van der → van der Vaart JM

自動的に前方一致検索になるので、入力した著者名 だけを検索するには、@を使うか、 “ ”で囲む

O'brien J のみ検索し、O'brien JM、O'brien JD等 を検索しない → O'brien J@ 15

(16)

論理演算子を使った検索

AND(論理和)、OR(論理積)、NOT(論理差)が 使える 必ず大文字で入力 (小文字での入力はストップワードとして無 視される) 括弧( )を使って複雑な式をたてること もできる 例 (A OR B) AND (C OR D) 16

(17)

AND(論理和)を使う場合

C型肝炎の薬物治療

17

A:C型肝炎 B:薬物治療

(18)

OR(論理積)を使う場合

慢性腎不全か尿毒症

18

A:慢性腎不全 B:尿毒症

(19)

NOT(論理差)を使う場合

高齢者以外での褥瘡

19

A:褥瘡 B:高齢者

(20)

Limits機能

検索フィールドや出版日などの限定、使用 言語の選択をする機能 1)検索語を入力する 2)クエリーボックス下の[Limits]タブを クリックして Limits画面を出す 3)各種選択・指定をする 4)“GO”をクリックする 20

(21)

Limits画面

出版形態 サブセット 検索フィールド 出版日または データ登録日 21

(22)

Limits画面の項目

検索フィールド データ構造のどこを検索するか指定する  別添の資料(MEDLINE形式の詳細表示)参照   出版形態  検索する論文の種類を指定する  (指定しなければすべてを検索する) Clinical Trial(臨床試験)、Editorial(社説)、 Letter(投書)、 Meta-analysis(メタアナリシス)、 Practice Guideline(臨床ガイドライン)、

Rondomoized Controled Trial(無作為抽出試験)、 Review(総説) 22

(23)

Limits画面の項目

サブセット

 収載誌の種類を選択する、データ範囲を指定する等

収載誌

Core Clinical Journals(主要誌)、

Dental Journals(歯科)、Nursing Journals(看護学)

データ範囲(主題)

AIDS(エイズ)、Bioethics(生命倫理)、Cancer(腫瘍)、 Complementary Medicine(補完医療・代替医療)、

History of Medicine(医学史)、Space Life Science (宇宙医学)、Toxicology(毒性)

その他

MEDLINE(索引済みのMEDLINEデータ)、

PubMed Central(無料電子ジャーナルが有効なもの)、 OLDMEDLINE for Pre 1966(遡及入力データ) 23

(24)

Limits画面の項目

年齢 取り上げられている症例の年齢を指定する 出版日・データ登録日  検索する論文の出版日、またはPubMedへの  登録日を指定 24

(25)

検索結果画面(全体)

検索結果は 新しく登録さ れたものから 順番に表示 されます チェックボックス Limits機能で範囲を限定中。 解除して新しい検索をする には“Limits”の隣のチェックを 外します。 25

(26)

検索結果画面(個別データ)

26 雑誌名、出版年月;巻(号)ページ. *誌名にカーソルを合わせると正式  タイトルが表示されます 本文言語(英語以外) 著者名 論題 (翻訳されたタイトルは[ ]でくくられています)

(27)

各データの最終行の意味

1)雑誌出版社からの提供データ

[PubMed - as supplied by publisher]

2)書誌事項の確認・索引付け中  [PubMed - in process]

3)MEDLINE データとして登録されたもの  [PubMed - indexed for MEDLINE]

4)PubMed データとして残す(MEDLINE収載対象外)

 [PubMed]

(28)

データの並べ替え、表示の変更、保存

プルダウンメニューから希望の形式を選びます 28 表示件数の変更 指定ページへ ジャンプ 表示形式の変更 チェックボックスで指定した文献があれば それのみが対象。 何も指定していなければ全検索結果が対象。 結果の保存 ソート順の指定 何も指定しなければ PubMed登録順に 新しいものから並ぶ

(29)

表示形式の変更

主な表示形式 Summary 書誌情報のみ Abstract 書誌情報・抄録・著者所属・Publication Type・電子ジャーナルへのリンク Citation Abstract形式+MeSH用語 MEDLINE  各文献の全データをタグ付きで表示(別紙参照) 印刷はブラウザの機能を使う 29

(30)

詳細表示[Abstract形式]

30 雑誌名、出版年 月:巻(号)ページ. アブストラクト 著者名 関連文献・教科書へのリンク 論題 電子ジャーナルへのリンク  筑波大学で契約しているものでなくても表示 されます。(契約外のタイトルは利用できません) 図書館ホームページの電子ジャーナルのリストも 参照してください。

(31)

結果の保存

1)必要な文献を選択し (チェックボックスにチェックしたものの みが対象) 2)表示形式・ソート順を変更してから 3)保存形式を選択する 31

(32)

結果の保存(形式)

Text 色や画像等のない、テキストのみの表示になる 印刷のとき利用すると紙の節約ができる File コンピュータに、指定した文献が指定した形式で ダウンロードされる ファイル名はデフォルトは“PubMedresult.txt” Clipbord チェックボックスで指定した文献がPubMedのク リップボード機能に保存される 500件まで、検索終了から8時間有効 クリップボードに保存した文献を一覧するには Clipbordタブをクリック 32

(33)

結果の保存(形式)

E-mail チェックボックスで指定したものか、指定しない ときは500件まで電子メールで送ることができる フォーマットやソート順、ファイル形式 (html/text)は送付先指定画面で選択できる ファイル形式を html にすると、PubMedの検索結 果に加えて、LinkOut、Related Articles等の付 加情報が加えられて送られる Order アメリカ国内の利用者が文献の依頼をするための 機能 利用するには登録が必要 33

(34)

文献の入手

(リンクから全文を見られなかった文献)

1)筑波大学内にあるか確認 図書館ホームページから、雑誌名で検索 電子ジャーナルのリスト OPAC 2)ほかの図書館からコピーを取り寄せ レファレンスデスクで申し込み(文献複 写申込書を提出) Webからの申し込み 3)ほかの図書館へ行って利用する 前もってレファレンスデスクで相談 34

(35)

例題(1)

2005年ノーベル医学生理学賞受賞者の 二人の共同研究を探してみましょう バリー・J・マーシャル (Barry J. Marshall) J・ロビン・ウォレン (J. Robin Warren) 著者名の入力方法に注意しましょう できたら、結果をクリップボードに追加し てみましょう 35

(36)

例題(2)

インターネットで見つけた以下の情報から 雑誌記事を探してみましょう 謎の微生物:筑波大の研究グループ、砂 浜で発見 2005年10月14日付の Science に発表さ れた Limits機能を利用してみましょう できたら、結果をメールで送信してみましょう 36

参照

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