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leaf hulk alginate lyase

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Academic year: 2018

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概 要

保存温度 : -20℃

本品は、          属細菌由来のアルギン酸リアーゼで、大腸菌

で発現・精製した組換え酵素です。アルギン酸を効率よく分解すること

ができます。アルギン酸はコンブ等の褐藻類に多く含まれる粘性の高い

多糖類です。褐藻類から核酸を抽出する際に、本酵素で処理することに

よって粘性がなくなり、効率的に核酸抽出を行うことができるようになります。

特 徴

内 容

起源 酵素形状 活性

       (Recombinant)

20 mmol/l Tris-HCl (pH 8.0), 100 mmol/l NaCl, 50% Glycerol ≧5,000 units/mg

Escherichia coli

1 unit は、0.1% アルギン酸ナトリウムを基質として、30℃において235 nmの値が1分間に0.1上昇する 酵素活性とする。

単位の定義

Flavobacterium

* HULKは Hokkaido University alginate Lyase for Kelp degradation の略です。

製品名

希望納入価格

*

容量

Code No.

HULKアルギン酸分解酵素

319-08261

5 mg

32,000円

* 希望納入価格に消費税は含まれておりません。

至適温度

50

至適

pH

7.8

8.0

至適

NaCl

濃度

100 mM

40

℃で

30

分加熱後も

95

%以上の活性を保持する。

基質に対する比活性は、アルギン酸=

PolyM

PolyMG

PolyG

褐 藻 類 か ら の 核 酸 抽 出 に 最 適

ハ   ル   ク

ハ   ル   ク

HULK

アルギン酸分解酵素

本  社 〒540-8605 大阪市中央区道修町三丁目1番2号 TEL:06-6203-3741 (代表) 東京本店 〒103-0023 東京都中央区日本橋本町二丁目4番1号 TEL:03-3270-8571 (代表)

フ リ ー ダ イ ヤ ル 0120-052-099 フリーファックス 0120-052-806 

〒930‐0834 富山市問屋町二丁目7番18号

TEL: 076‐451‐6548 FAX: 076‐451‐6547

(2)

製品の詳細情報はこちら ▶

http://www.nippongene.com/siyaku/

HULK

アルギン酸分解酵素

実験例2. 生マコンブからのDNA抽出

GM quicker 2 (Code No.310-06591) 穀物からのDNA抽出キット

プ ロ ト コ ー ル

*1

本実験に使用したマコンブは、国立大学法人 北海道大学・大学院水産科学研究院 井上 晶 博士よりご提供いただきました。   その他サンプル(乾燥コンブ)からの抽出プロトコールは、ニッポンジーンのホームページをご覧下さい。

粘性が高く、DNA抽出が困難であった生マコンブからも、HULKアルギン酸分解酵素を加えることで、効率良くDNAを抽出することができた。また、PCRを

阻害する夾雑物が除去され、高純度のDNAを得ることができた。

図2 抽出DNAのアガロースゲル電気泳動による比較

M: Gene Ladder Fast 2

Lane1-4: DNA溶液10 µl(抽出したDNAの1/5量) M  1  2  3  4

HULK- HULK+

M  1  2  3  4

HULK- HULK+

ミトコンドリアDNA(510 bp)

M  1  2  3  4 5  6  7  8  NC

HULK- HULK+

M  1  2   3  4 5  6  7  8  NC

核ゲノムDNA(6,661 bp)

M: Gene Ladder 100 Lane1-8: PCR反応液10 µl NC: negative control

M: Gene Ladder Wide 1 Lane1-8: PCR反応液10 µl NC: negative control

図3 抽出DNAを鋳型としたPCR増幅効率の比較(増幅鎖長:510 bp, 6,661 bp)

実験例1. アルギン酸分解酵素の活性比較

↓  15分間、60℃で加温

↓←85 µl のGE2-K Buffer(★)を添加し、ボルテックスミキサーにて混和

↓  遠心(≧13,000 x g, 5分間, 室温)

上清 400 µl を新しい 1.5 ml チューブに移す

↓←10 µl のRNase A(★)を添加

↓←20 µl のHULKアルギン酸分解酵素を添加

↓  15分間、37℃で加温

↓←150 µl のGB3 Buffer(★)を添加

↓←150 µl のイソプロパノールを添加し、10~12 回転倒混和 ペッスルですりつぶす

生コンブ(50 mg)を 2.0 ml容量マイクロチューブに入れる

↓←700 µl のGE1 Buffer (★)を添加

↓←20 µl のProteinase K(★)を添加

続き

↓  遠心(13,000 x g, 1分間, 室温)し、濾液は廃棄

↓←650 µl のGW Buffer(★)を Spin Column に添加

↓  遠心(13,000 x g, 1分間, 室温)し、濾液は廃棄

↓←50 µl の10 mM Tris-HCl(pH8.5)またはTE(pH8.0)(★)を滴下

↓  3分間室温で静置

↓  遠心(13,000 x g, 1分間, 室温)

回収した溶出液(Genomic DNA)

混合液を Spin Column(★)に全量移す

Spin Columnを新しい 1.5 ml チューブに移す

★ : GM quicker 2 の構成品

本酵素の活性測定方法を用いて活性を算出し、HULKアルギン酸分解酵素と 他社アルギン酸リアーゼの比活性を比較した。

活性測定の結果、HULKアルギン酸分解酵素は他社アルギン酸リアーゼと比較 して、30~80倍比活性が高かった。

0 2,000 4,000 6,000 8,000 10,000 12,000 14,000

u

n

it

s/

m

g

HULK A社 B社 図1 アルギン酸分解酵素の比活性

生マコンブ *1

50 mgから、DNA抽出キット「         」のコメDNA抽出プロトコールを用いてDNA を抽出した(n=4)。抽出工程でHULKアルギン酸分解酵素による処理を行わない場合(HULK-)と 行った場合(HULK+)のDNAの品質を電気泳動およびPCR法により比較した。

GM quicker 2

結 果

2% Agarose S 0.8% Agarose S

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