2014.4
PubMed の使い方
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?otool=ijputmlib PubMed東大
初め PubMed - - - p.2 PubMed コ つい - - - p.3 PubMedへ アク - - - p.4
．基本 検索
主題 検索 - - - p.5 著者名 検索 - - - p.6 雑 名 検索 - - - p.6 検索 目を限定した検索 - - - p.7
．拡張機能を用いた検索
Filter機能を用いた検索 - - - p.7 Search Builderを用いた検索 - - - p.8
History機能を用いた検索 - - - p.8
．MeSH用語を用いた検索
MeSH - - - p.9
MeSH用語 検索方法 - - - p.9
．検索結果画面
検索式 確 - - - p.11
検索結果･ コ 書 情報 見方
- - - p.12
表示形式 件数 並び 変更- - - p.13
保存 メ 転送 - - - p.13
印刷 - - - p.14
．フ テキ 入手方法
電子 ャ フ テキ を入手
す - - - p.14 図書館 文献を入手す - - - p.15
文献を取 寄せ - - - p.15
．便利 関連サ ビ
Journals in NCBI Databases - - - p.16 Single Citation Matcher - - - p.16 Clinical Queries - - - p.16
．My NCBI
～PubMedをカ タマイ し 使う
初期登録 - - - p.17 サインイン - - - p.17 検索式 保存 メ 送信設定 - - p.17
検索 コ 保存 - - - p.18
確 各種変更 - - - p.18 サインアウ - - - p.18
マ ュア 参考書 - - - p.18
学 書館PubMed http://www.lib.m.u-tokyo.ac.jp/manual/pubmedmanual.pdf
PubMed
PubMed NLM 米国国立 学 書館 National Library of Medicine 内 NCBI 国立生物 科学情報 ン National Center for Biotechnology Information 作成 い
統合検索 Entrez NCBI作成 一部 提供 世界 主要 学系雑 等 掲載 文献 検索
MEDLINE Non-MEDLINE MEDLINE 載 い
整備前 出 社 直 接提供 等
ソ い
MEDLINE ン
PubMed 主 構 成 要 素 い 学 文 献 1965 年 以 前 OLD
MEDLINE 1966年以降 MEDLINE い MEDLINE PubMed以外 様々 利 用 例 え ば 東 京 大 学 附 属 書 館 入 い 料
OVID SP EBSCO host 利用
※日本語 雑 74 的 録 い 中 Web 録中 含 約6,000
録雑
List of Journals Indexed for MEDLINE 現在MEDLINE 録 い 雑
MEDLINE®/PubMed® Resources Guide http://www.nlm.nih.gov/bsd/pmresources.html JOURNALS List of Journals Indexed for MEDLINE
List of All Journals Included in PubMed® http://www.nlm.nih.gov/bsd/serfile_addedinfo.html PubMed 録 一覧 MEDLINE OLDMEDLINE MEDLINE 録外 各 現在索引 い い
含
List of Serials Indexed for Online Users http://www.nlm.nih.gov/tsd/serials/lsiou.html
PubMed MEDLINE く知 い
MEDLINE®/PubMed® Resources Guide http://www.nlm.nih.gov/bsd/pmresources.html Factsheets http://www.nlm.nih.gov/pubs/factsheets/pubmed.html
MEDLINE, PubMed, and PMC (PubMed Central): How are they different? http://www.nlm.nih.gov/pubs/factsheets/dif_med_pub.html
録 野
生物 学 biomedicine health
学 看護学 歯学 獣 学 薬学 健康科学 護 含
録 約5,700 37言語 90 以 英語2010年時点
録期間 1946年～現在
更新 出 社 届く 時 索引作業済 5回 火～土曜日
ン 通 世界中 利用
IndexCat
http://indexcat.nlm.nih.gov/ 古い 学系文献 検索 MEDLINE 前身 あ Index-Catalogue ン ン録期間 1880年 1961年
録対象 61万冊 学位論文47万件 含
<2013.9現在>
PubMed 基礎知識
PubMed Status 状態
PubMed 検索 論文情報 そ次 う 番 状態 変化 い
番 状態 状態表示
1 雑 出 社 提供 ば [PubMed – as supplied by publisher]
2 整備作業中 書 事 確
索引付け MeSH用語 付 等 行わ
[PubMed – in process]
3 MEDLINE 録
整備作業 終わ
[PubMed – indexed for MEDLINE]
他 MEDLINE 録 い [PubMed]
PubMed 提供 う MEDLINE 扱う 決 2
作業 時点 専門 論文情報 索引付け ワ 付 行い
MeSH ば ソ 基 い 文献 主題 表 ワ MeSH用語 付
MEDLINE 以外 索引付け 。
構造
PubMed 集 い 論文情報 そ次 う 構造 い
PMID- 20080893 STAT- MEDLINE
IS - 1535-5667 (Electronic) IS - 1535-5667 (Linking) DP - 2009 Jan 15
TI - In Vivo Measurement of Vesicular Monoamine Transporter Type 2 Density in Parkinson Disease with 18F-AV-133.
AB - PET provides a noninvasive means to evaluate the functional integrity of the presynaptic monoaminergic system in the living human brain. 以 略 .
AD - Department of Nuclear Medicine and Centre for PET, Austin Health, Melbourne, Victoria, Australia; Mental Health Research Institute, University of Melbourne, Melbourne, Victoria, Australia.
AU - Mulligan RS 以 略 LA - eng
PT - Journal Article DEP - 20090115 TA - J Nucl Med
JT - Journal of nuclear medicine : official publication, Society of Nuclear Medicine SO - J Nucl Med. 2009 Jan 15.
MH - Case-Control Studies MH - Cohort Studies MH - Dopamine/*metabolism
MH - Parkinson Disease/*enzymology/*genetics/pathology ISSN
出 年 日
先頭 部 黄色 情報 目 表
論文 い 情報 目 整理 録
論題
抄録
第一著者 住所等
著者 言語
出
雑 PubMed
Unique Identifier
MeSH用語 (索引語
整備作業 論文 ワ MeSH用語 付
PubMed
MEDLINE形式 面表示例 一部抜粋 内容 加
○ ン 接 東大専用URL あ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?otool=ijputmlib
学 書館HP PubMed ン ボ ン 利用く い
東大専用 URL 利用 (東京大学学術論文 ン ) 表示 電子
等 容易
○CSLS Search 東京大学生 科学構造化 ン http://www.csls.c.u-tokyo.ac.jp/
PubMed 専門用語 日本語表示機能 機能 搭載 高機能検索
PubMed 面構成
使い方 多く
情報資源
用PubMed
特定論文 簡単検索
複数 論文 書 一括検索
臨床 学領域 け EBM文
献検索
特定 絞 検索
MeSH Journals 臨床試験情報
E-Utilities( ン 利
用 込 )
ン
論文 入手方法
FAQ
自己学習 最新情報
検索ボ
細検索
個人向け PubMed
基本 検索
検索ボ 思い く用語 学用語 疾患 薬品 雑 著者 ワ
入力 Search 大文 文 構い
Automatic Term Mapping 自動 ン 機能 働 入力 ワ 自動的 索引語
あ MeSH用語や雑 変換 検索 く
論理演算子 AND NOT OR 用い 検索
大文 入力 括弧 利用可
主題 検索
入力形 明
asthma 入力 検索式 あ 場合 自動的 識
※語 識
ips cells
“ips cells” “ ” ン 必 検索 行い
語 指定 序 出現 検索
egg AND allergy egg allergy 識 回 避 場 合 論 理 演 算 子 AND,OR,NOT 大文 使 け 指示 明確
nurs* * ワ 後 け 前方一致検索
→nurse, nurses, nursing… 語尾変化 意識 い検索
※ 自動 ン 機能 MeSH 位語 含 検索 explode 行わ
parkinson disease therapy
ワ 複数あ 場合 入力 自動的
AND検索 parkinson disease AND
(infant OR newborn)
論理演算子 括弧 用い 複雑 検索式 作成
通常 処理 右 行わ 用い 優先 位 変
更
#1 OR #2 論理和
#1 NOT #2 論理差
#1 AND #2 論理積
論理演算子 基本 確
語尾変化 600 ン 以 あ 場 合 警 告
表示
候補語表示機能 Auto Suggest
検索 ボ 入 力 語 類 推 検 索
頻度 高い用語 例示 目的 語
検索 実行
※ 候補語 適 検索結果 得 限
文 入力～応用編
文 英語綴 入力 α→alpha β→beta 2010年9 以降 新規
そ 文 識
(ä) ン é ン 記号 省略 a,e 入力
‐ ン 代わ 入力
! ? % 記号 省略
子式 次 う H2O→H2O 39℃→39 degrees C
数 文 入力 →ⅰ Ⅸ→ⅸ
parkinson disease[mh] AND japanese[la]
検索 目 限定 [ ] 利用 検索
→p.7 検索 目 限定 検索
著者 検索
姓 ( ) 記入
自動的 前方一致検索
著者 入力形 明
清水 孝雄 shimizu t 姓
入力 姓 間
け 入力 Paul E. O'Brien O’brien PE
Andrew J. Baker Alissa C. Baker
Baker A 姓 Baker 前 頭文 A 著者 検索
Baker AJやBaker AC あ 場合 含
Alison Baker Amanda Baker
Baker A@ あ 著者 検索
Baker A け 限定 St. Clair M St clair M
そ 他 特殊 著者 入力
Smith AB 3d Smith AB
Smith AB 3rd
Vaart JM van der Van der Vaart JM
※2002 年以降出 文献 原著 記載 あ ば 検索
先 検索可能
※2000年以降 全著者 録 い そ 以前 刊行年 録著者数 限
あ
雑 検索
入力例 明
New England journal of medicine 式 of 必要 The 抜く
N Engl J Med 省略形
0028-4793 ISSN 雑 付 8桁 国際標準番号
真 中 “- ン ” 必要
cell [ta] 検索 目 雑 限定 [ta] 付
雑 確 場合 Journals in NCBI Databases 確 →p.16
検索 目 限定 検索
特定 目 対象 検索 い 検索 目 指定 け 検索
検索 目 入力例 明
affiliation [ad] university of tokyo[ad] bunkyo-ku[ad]
原著 示 い 第一著者 所属や
住所等 検索 author
first author
[au] [1au]
fish[au] fish[1au]
著者
第一著者 限定 検索
journal title abbreviation [ta] science[ta] 雑 略 ISSN language [la] english[la] 文献 記述 言語 Mesh Subject Headings
Mesh Major Topic
[mh] [majr]
asthma[mh] asthma[majr]
索引語 (MeSH用語) →p.9
論文 中心的主題 表 索引語→p.9 publication date [dp] 2007[dp] 文献 表 日付
publication type [pt] clinical trials[pt] 出
unique identifiers [uid] 19920236[uid] PubMed文献番号 各 付
主 Publication Type 出
Case Reports 症例報告 Letter 論文
Clinical Trial 臨床試験 Meta-Analysis
Controlled Clinical Trial 比較臨床試験 Practice Guideline 診療 ン Guideline ン Randomized Controlled Trial ン 化比較試験
Journal Article 雑 記事 Review 論文
拡張機能 用い 検索
Filter 絞 込 機能 用い 検索 検索結果 面 側 使用 →p.11参照
条件 追加 検索 以外 目 Show additional filters 表示
記事 種類
雑 野や
記事
ン 検索 目 指定 出 時期 限定
電子 無料電子
抄録 あ 文献 限定
動物
※PubMed ン あ う
絞 込 東大 電子
契約 映
性別
対象年齢
載 種類
参加者 付 ン 無
絞 込 い 目
入 Show
言語
Filter 設定 解除 全 検索 適用 検索結果 面 く 件 数 Clear all 各 目 Clear 時変更 く い
Search Builder 用い 検索 Advanced Search 面 利用
検索 目 選 検索語 一部 入力 Show index list 候補語 表示
語尾 変化 用語 あい い 補助 利用
History機能 用い 検索 Advanced Search 面 利用
そ 検索 歴 検索語 検索結果数 見 歴 利用 論理演
算子 AND, OR, NOT 用い 検索集合 組 合わ 容易
検 索 式 作 成 後 Search 検 索 結 果 文 献 表 示 Add to
history 歴欄 検索式 文献数 Items found 表示 文献数
検索結果 表示 件数 見 検索式 作成 検討 際 利用
便利
文 入 力
候補語 表示
ン 希 望 検 索 目
選
Search 検索 Add to history
部 検索 歴 追加
/ 後 副標目 Subheading 表 検索結果 面例 Filter 設定 い 場合
History 面例
Add to history 歴 検索内容
文献数 Results 表示
検索結果 面 移行
検索式 番号 必 け
論理演算子(AND,OR,NOT) 利用や
Delete 一覧 式 削除 行え
番目 番目 番目 検索式 論理積 AND
検索結果 文献 表示
MeSH 用語 用い 検索
MeSH
NLM 米国国立 学 書館 作成 ソ Medical Subject Headings 学主題見出
略称 ソ 様々 学用語 統一 位語 位語 整理 統 語辞書
MeSH 主題 構造 位 行くほ 用語 細
療や 学専門用語 変化 対応 定期的 更新 い
MeSH 構造 例 Skin Neoplasms
MEDLINE 録 い 書 情報 適 検索 う MeSH 基 い 索
引付け作業 行わ い 索引付け作業 論文 主題 表 検索語 ワ
MeSH用語 学主題見出 用語 付 1文献 約10～20語 そ 中 中心
的主題 表 ワ Major Topic ば 2～3語付
MeSH用語 検索方法
MeSH用語 検索 方法 記 3 あ
自動 ン 機能 利用 →p.5 主題 検索
MeSH用語 限定 検索 →p.7 検索 目 限定 検索 [mh] [majr] MeSH用語 選 検索 MeSH Database 利用 →次頁
癌 扱 論文
表現
論文内容 表 言葉
MeSH用語 Neoplasms 付
ワ 統一
MEDLINE
の 載 対 象 レ コ ー ド Cancer
Tumor Neoplasm
統 管理
広い意味 ワ
位語
位語
当 用語 見
構造
狭い意味 ワ
Neoplasms 位語 展開
Skin and Connective Tissue Diseases
位語 展開
※ 例 う 1
用語 複数
在 場合 あ
MeSH用語 選 検索 MeSH Database 利用
ン MeSH 選択 検索
ボ ワ 入力 Search
ワ MeSH候補語 出
用語 細 面 開
Link 各 選択 検索実行
用語 細 面
MeSH 用語 論文 中心的主題 索引 い 文献 検索 副標目 Mesh用語 組 合わ 副次的用語
用語 使う以前 用 い 索引語
古い文献 検索 場合注意
用語 Major topic 論文
中心的主題 索引
文献 け 検索
用語 位語 含 い 検索
位語
位語 場合 位語 当 用語 見
NLM MeSH Browser
MeSH 用 語 関 細
情報 参照 精密
検 索 行 う 際
Annotation, Scope note
等 確 く い
MeSH用語 新設 年
簡単 明
各
ン 検索
MeSH Database 面
MeSH用語 け検索
構造
MeSH Major Topic け検索
ソ 位語 位語 表示
選 副標目 組 合わ 検索語
検索ボ 入力
Search PubMed 検索実行
検索結果 面
検索結果 Summary形式 PubMed 録日 降 1 20件
表示 Display settings 変更
検索式 確
う 検索 行わ 検索式 確
式 修 Search 再検索
See more… 検索式 細 面 表示
論文情報 Summary形式
書 事 論題 著者 雑 行年 巻号 頁 PubMed ID 各 固 番号
PubMed Status 各 状態 関連文献 Full Text ン 等
翻訳 検索式
ワ 入力 語
検索式 修 Searchボ ン 再検索
検索結果 面 明 Summary 形式
URL ボ ン 検 索 結 果 面 URL
Query Translation 式 追加
URL けば
け 再検索 簡単
数 検索結果 面 戻
表示形式 件数 並 変更 保 転送
表示件数 件数
検索結果 け
検索式 修 Search 再検索
細表示
検索式 確
検 索 結 果 の レ コ ー ド 論 文 情 報
parkinson disease MeSH用語 あ "parkinson disease" 索引語 含
" parkinson " " disease " 両方 全 目 含
"parkinson disease" いう語 全 目 含
索引語 MeSH用語 付 い MEDLINE 録 MeSH用
語 検索 行 け 検索漏 出 い 新 い概念 最新 情報 古い概念 検
索 そ 検索式 他 目 論題や抄録 用語 使用
い 論文 検索 い
検索結果 書 情報 見方
"parkinson disease"[MeSH Terms] OR ("parkinson"[All Fields] AND "disease"[All Fields]) OR "parkinson disease"[All Fields]
ワ 翻訳 MeSH用語
論題
著者
載 略 出 年 巻 号 掲載頁
略 ソ 合わ
式 称 見
Publication type Review 表示
Print 未掲載 電子 あ
出 社 提供 ば
[ ] 論題 英語 翻訳 本文 言語 英語以外
言語 英語以外 関連論文 ン PubMed Unique Identifier
各 固 番号
書 事 や MeSH用語 付
MEDLINE 録作業中
電子
MEDLINE 録 書 事
MeSH用語 付 済
*Limits 絞 込 指定 状態 検索
PubMed Status 状態
The Biochemical journal
検索式 細
入力 ワ
Summary形式 一覧 回 入力 ワ MeSH用語
異 場合 自動 ン 機能 MeSH用語 翻訳 検索
略語 薬品 検 索 際 う く い
い あ 注意 必要
表示形式 件数 並 変更
Display settings 表示設定 面 出 Format等 選択 Apply
事前 番号脇 入 対象
入 場合 全部 対象
text 形式 表示 印 利用
Abstract 細表示 抄録 MeSH 件 け 細表示 場合 文献 論題
MEDLINE 全 目 付 表示 RefWorks等 文献管理ソ 込 利用 PMID List PubMed ID 表示
保 転送
Send to 表示設定 面 出
希望 ン 選択
事前 番号脇 入 対
象 入 場合 全部
対象
ン
ボ
一時保 最大500件8時間 形式
ソ
Items Clipboard
保 表示
転送 最大200件
ソ
形式
ﾒ ﾄﾞ ｽ 件
防 像 証
印
PubMed 印 機能 あ
Display settings Text形式 表示等 変更 印 利用く い
表示 変更 印 必要 枠 像 印 注意く い
事前 番号脇 入 表示 変更 変
更 形式 表示
入 場合 表示 対象 適宜表示件数
増や 印 く い
入手方法
電子 入手
PubMed 検索結果 入手 場合 あ
東 大 専 用 URL 東京大学学術論文 ン 表示
文献 細表示 ン ン 表
Display settings Abstract表示 変更 例
抄録
展開
電 子 ン ン 表
示
料 表示
無料 Free, Open Access
表示 あ 事 多い
外部 ン
ワ 索引語
出
* 論 文 中 心 的 主 題 表 ワ MeSH Major Topic あ
示 い
料 東大 契約 い 場合
PDF 着く
PDF 書い あ 場所
UTokyo Article Link
電子 あ ば Full Text ン 様
電子 直接 ン
電子 い場合 他 情報源や
文献複写 寄 申込 面 ン 誘
ン 面 表示
細 次 覧く い
UTokyo Article Link 文献 検索結果 本文入手 案内 欲 い 論 文 表 示 ボ ン Google Scholar
検索や冊子 所蔵検索 書館 文献 寄 申込 面 ン 表示
UTokyo Article Link 面 利用手 ～
書館 文献 入手
東京大学OPAC 蔵書 検索 く い UTokyo Article Link手 一番 ン
文献 寄
学 書館HP 学部病院 方 文献 書 寄 覧く い
http://www.lib.m.u-tokyo.ac.jp/medicine/ill.html
電子 う く入手 い 具合 生 頁 抜け
い 問い合わ ASK
担当 書館職員 回答い
デ ー タ ベ ー ス で 見 つ け た 目 的 の 論 文 の 情 報
ン
目的 論文 電子 入手
※ 検索結果 直接電子
飛ば く ン
目的 論文 着け あ
論文 複数 録 い
あ
OAIsterやGoogle Scholar経由
本文 入手 可能性 あ
雑 所 蔵 調 ン 東京 大学
OPAC 検索 書館 入手
他 ン 寄 学内 寄
使 う 他 大学 寄 他大 学
論 文 入 手 ン 申 込 面
要利用申請
電子 提供
ン
東京大学OPAC ン
便利 関連
※ ～ PubMed 面 PubMed Tools い More Resources 選択可能 Advanced Search 面 一番 More Resources 選択
NLM Catalog
雑 知 い 利用
式 略 検索
Pubmed 面 方 More Resources Journals in NCBI
Databases 調 い 称 ISSN
等 入力 検索
Single Citation Matcher
書 情報 確 い 利用
載 著者 中 ワ
検索 断 的 情報 類推 文献
情報 見 け
Clinical Queries
目的 文献 短時間 数件 い 便利 臨床 学 文献検
索 想定 検索機能 疾患 い 病因や予後 診断 治療 い 簡単 検索
一 ワ 対 3種類 検索 け 一括 検索
検索語 入力
検索語
雑 表示
細
一
関 複 数 ン
化 比 較 試 験 統計 的 処 理 総 合 評 価 結 果
論文 検索
遺伝学関係 文献 検索
臨床予測指針 2) 1)
3) 2) 1)
3)
病因 診断 治療 予後
狭く 確 広く洩 く
ン 研 究
選 択 そ
最 適 遺伝 学
関係 ワ 自
動的 追加
M ｙ NCBI ～ PubMed 使う
NCBI 提供 い 各種 そ う 一 PubMed 使用方法 合
わ
主 機能
検索結果 検索式 保
保 検索式 検索結果 定期的 け
PubMed 各種設定 変更 Filter 検索結果 初期 面
検索結果 長期保 公開
初期 録
面右 あ Sign in to NCBI Sign in 面 移
ン 録後 設定 確 届
表示 URL 録完了
ン ン
面右 あ Sign in 録
ワ ン 右 表示 録 表示
検索式 保 送信設定
ン 録
検索式 保
検索式 称 け
録
検索 結果 定期
的 け
頻度 形式
送信時 追加
Google等 ン 持 い ばMyNCBI 使用
検索 保
恒常的 保 い け
Send to Collections 選択 保
確 各種変更
保 確 各種設定変更 My NCBI Home
行う
ン
右 Sign Out 終了
参考文献
PubMed Quick Start Guide PubMed
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?otool=ijputmlib
東邦大学 学 ン PubMed 使い方 (2008/9/4) http://www.mnc.toho-u.ac.jp/mmc/pubmed/index.htm
慶応義塾大学信濃 ン PubMed@KEIO : 基本 (2014/4/1)
http://www.med.lib.keio.ac.jp/pdf/ug/ug_pubmed.pdf
解PubMed 使い方 : ン 学文献 / 岩 愛, 山 共著 改訂第6 2013.11
ISBN 9784931222199
請求記号W:26.5:ZU 録番号4311325544
超!文献管理ソ ン : PubMed/ 中 検索 活用 / 讃岐美智義著 2011.6 ISBN 9784780908435
請求記号W:26.5:CH 録番号4311301503
阿部信一 MEDLINE/PubMed 索引 検索 情報 科学 技術 2008, vol. 4, p. 172-177. 阿部信一 知 いMeSH 検索法 EBM 2004, vol. 5, No.3, p. 100-105.
郷直樹 MEDLINE PubMed EBM 2004, vol. 5, No.1, p. 98-99.
確 変更
目
各自 変更
い 選択
