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PDF 原生動物園 Vol 1 (2010年度号) 原生動物園

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(1)

画 像 処 理 ン 画 素

age を用いた ル画像処理

~ age 基本操作~

西上幸範 Yukinori NISHIGAMI

1. じめに

1. じめに

1. じめに

1. じめに

画像処理 行う あ 画像処理 いえ ば や 有 あ 非常

高価 あ 無料 機能的 充実 い 日本語版 い教 書 い 初

使う際 時間 浪 こ こ 連載 者 実際 用い 様々 使い方 基本的 こ 実践的 こ

行うこ 一通 使え う こ 目標 い 使い方以外 画像処理 い 知識 時

得 う 明 加 え 本 連 載 活 用 基 本 的 画 像 処 理 知識 や 使 い 方 理 解 う え 本 家 あ 使い方 参照 ば 短時間 使いこ こ 可能

期待さ 本連載 使う人 一助 ば幸い あ

ウンロ イン ル

ウンロ イン ル

ウンロ イン ル

ウンロ イン ル

用い 手持 コン ン 必要 あ あ

自 合 ン ン 行う こ 組 込 い 使用予

定 コン ン さ い い場合 時 ン 親 こ 付属 様

ン 可能 あ こ い あ 付録 私自身 述 手順 入手

あ いう 用い い こ 顕微鏡 画

像 処理 便利 ン付録 ン 最初 用意さ い 以 用い 明 行う 述

移動 ン 可能 基本的 用い

ほ 様 操作 扱うこ 用い い 用い 場合 コン キ コ

ン キ キ ョン キ 替え ば ほ 問題 い

使用前 設定

使用前 設定

使用前 設定

使用前 設定

ン 完了後 起動 図 う ン 開

こ ニ ュ 図

快適 用い 使用前 い 設定 必要 あ

ニ ュ → 選ぶ図 キ

サ 用 い い 場 合 あ → →

設 定 行 う 図 図 ン ニ ュ 最 新

ョ ン 選 択 自 動 的 終 了

次 回 起 動 時 最 新 ョ ン 扱 う こ

図 ン ニュ 選択 こ 以前 ョン

ン こ 可能 あ

現 用い い ョン → 図 や

図 こ 確 認 こ

際 現 用い い ョ ン 使用可能 び使用 い

容 表示さ こ 使用 可能 容 任 意 変更

こ → → & 使

用可能 最大値 設定 こ 図 こ 時

最 大 値 搭 載 い 7 5 % 超え い う 設 定

現 使用 い 容 表示

→ → 行う図

図 ン

ン ン ニ ュ

ニュ 様々 機能 実行 際 選択

選択 や拡大 縮小 行 う際 用い 赤

い矢 尻 あ コ ン 右 こ 異 表

示さ こ 示 画像 持 い

標 画素 値 表 示さ

こ 現 用 い い や

ョンや 使用 い 容 表示さ こ 出来 行 う 処 理 進 行 合 い 表 約

一 以内 処理 終わ 場合 表示さ い

(2)

図 更新

→ ン ニュ

目 的 ョ ン 選 択 次 回 起 動

時 更新 ョ ン 扱え 赤線 現

ョン 示

図 キ サ 設定

キ サ ン ネ 接続 い 場合

→ → 表示さ ン

キ サ 入 力

サ 管理者 聞

4 ImageJ バー ョン 確認

現在 ImageJ バー ョン Help→About ImageJ 新しい ン に 示 さ (a) ま た テ ー タ バ ー を す こ

確認 (b1参照)

図 使用 容 変更

使 用 可 能 容 変 更 → →

& 選び 値 適 変化さ

図 使用 容 表示

現 時 使 用 い 容 確 認 →

→ 行う 使用中 容 使用可能容

対 割合 表示さ

(3)

基本操作

基本操作

基本操作

基本操作

扱う 用い 基本的 操作 以

. .

. . 開く 開く 開く 開く

標準状態 様々 形式 画像 や 動画非 縮

開 可 能 あ ン 追加 こ さ 多 形 式 画像 対 応 こ 可能 あ 付録 参

照 実際 画像 開 → 目的 選択 目的

. .

. . 拡大、縮小 拡大、縮小 拡大、縮小 拡大、縮小

画像 拡大 縮小 → → 虫眼鏡 選択 左 拡大 右 縮小

行う 拡大 画像 さ 選択 キ

特定 領域 拡大 目的 領域 選択後付録 : → → 選択

. .

. . 複製 複製 複製 複製

画像 複製 Image→Duplicateを行う 選択 を用い 特定 領域を複製す 可能

. .

. . 切 切 切 切 抜き 抜き 抜き 抜き

画像 切 抜 Image→Cropを行う こ 際 選択 ー を用い 事 特定 領域を切 抜くこ 可能 あ

.

.

.

. 回転 回転 回転 回転

画 像 回 転 Image→Transform→Rotateを 行 う Angleに 回 転 角 度 を Grid Line 補 助 線 数 を 決 こ 出 来 previewにチ を入 操作後 状態を表示す 出来

.

.

.

. 明 明 明 明 さ、コン さ、コン さ、コン さ、コン ラ ラ ラ ラ

画像 明 さ コン 変換 Image→Adjust→Brightness/contrastを行う 表示さ イン 最上部に ム 示さ い (付録4:ヒ ム) Brightness Contrast バーを変化させ こ 明 さ コン を変化させ こ 出来 Applyを す こ 変更を画像に採用す

.

.

.

. カッ カッ カッ カッ 、コピ 、コピ 、コピ 、コピ 、貼 、貼 、貼 、貼 付け 付け 付け 付け

画像 コ 付け → 実行 こ 行え 用い ば画像 一部

い 行うこ 出来

.

.

.

. 文 文 文 文 矢印 矢印 矢印 矢印 図形 図形 図形 図形

画像 文 入力 中 キ 選択 画像 文 入力 後

→ → → こ 行う付録 : ン や文

大 さ キ → → 変更出来 矢印 場合 直線選

択 右 選択後 行う

. .

. . 保 保 保 保

画像 保 → 行 う 画像 自動的 形式 保 さ 以外 形式 保 い場合 →

目 的 形 式 選 択 こ 用 い 際 こ 保 こ 勧 い う

使用 節約 通常 比較 戻 → 機能 著 制限さ い 前回保

画像 戻 → ョ 行 う

(4)

ル 挿入法

ル 挿入法

ル 挿入法

ル 挿入法

顕 微 鏡 画 像 挿 入

入 い 画像 図 条 件 撮影 対物

画 像 図 々 画 像 用 意

数 実際 サ 校正 行う 図 う

既知 長さ 測 定 部 拡 大 直 線

選択 選択 次 →

既知 距離 単位 入力 μ 際 入力

回 対 物 目 盛 図 d う

直線選択 選択 距離 μm う

入 力 次 入 こ 操 作 回

校 正 画 像 適用 こ 出 来 い

場 合 校 正 画 像 適 用 さ 次

入 い 画 像 選 択 後 → →

好 サ 入 力 回

μ さ う入力 図 最後

こ 挿入 図

終わ に

終わ に

終わ に

終わ に

回 用い 基本的 操作 い 明

こ 操作 け 顕微鏡写真 ン ョン用画像や 論 文 用 画 像 こ 可 能 あ 次 回 具 体 例 触 行 え 様々 画像処理 い 紹 い 予定 あ

付録

付録 付録

付録 age age age age ッ ッ ッ ッ

い い

特 殊 化 用 途 合 わ 調 整 開 発 さ い 作 い 基本的 操作法 ほ

変 わ い 自 用途 合 あ

場合 ン 用い ば い 以

特徴 い 簡単 示

: 使 用 単 純 化 い ン 付録 参

照 収録さ 画像 間 位置合わ や 合わ 特徴 出 次元画像 表示 特化 い

:顕微鏡画像用 知 顕微鏡

画像 処理 役立 多 ン 収録さ い

μ : 自 動 化 さ 顕 微 鏡 制 御

多 顕 微 鏡 や 周 辺 機 器 学 研 究 用 等 制 御

こ こ 用い 撮影や多 ンネ

画像 立体画 像構築 可能 あ こ 用い ば

高価 購入 必要 ほ い

: 文学 用い

:生態系 ン

図 挿入法

挿 入 画 像 条 件 撮 影 対 物

画像 用 意 次 直線選択 数

目 盛 ~ 数 十 目 盛 選 択 → 実 行 距 離

関係 校正 最後 → → 行 う

こ 図 挿入さ

付録

付録

付録

付録 プラ プラ プラ プラ イン イン イン イン

ン 言 語 書 コ ュ あ 特

定 機 能 発 揮 さ 基 本 単 位 指 こ

用い こ 機能 拡張 こ 可能 こ

多 人 様々 ン 開発 公開

多 無 料 入手 こ え ば 通 常

対応 い い 形式 画像 込 移動

い 粒子 軌跡 自動 画い コン ュ ョ ン画

像 取 除 い 出来 ン 配布さ

い こ う ン →

ン 入手可能 あ

(5)

付録

付録

付録

付録 : :RO : : RO RO RO

関 心 領 域 こ 言 い

あ 様々 選択 用い 画像 一部 選択 こ

他 部 区 い 選択 用い こ

け 対 様々 測定 → や 塗 ぶ

→ 付録 や 適用 →

以外 部 境界 色付け → こ

付録 付録

付録 付録 : : : : ラム ラム ラム ラム

理解 画像 何 い 理解

い こ 画像 基礎 い 簡単

ここ 撮影 白黒 花 写真 例 考え

拡大 あ 花 像 様々 濃さ 正方形 集 合 成 立 い こ わ あ う こ 一 一 正方形 こ

画 素 い う 実 際 先 ほ 写 真

キ 保 → → 次元

数 並 表 得 こ こ 逆 う 表 作 成 画

像 変 換 → → う 画像

得 こ こ こ 数 大 いほ 画像 明 いう

こ 気 付 い あ う 画 素 位 置 け 色 濃 さ : 画 素

値 輝 値 呼ぶ 標 け 数値 表さ い

い 黒 白 意 味 い こ 色 濃 さ

段 階 け こ う 図 一 般 的 画 像 言 う

= 画 像 = 段 階 や 画 像

= 段 階 一 部 機 能 制 限 さ 扱 う こ

こ → 相互変換可能 あ

こ う 画 像 画 素 値 集 合 あ 考 え こ

こ 画 素 値 布 表 あ 横 軸

画素値 縦軸 各画素値 出現頻 例

f 示 → 見 ば画像 明 さ

把握 画 像 適 撮影さ 断 見 や

い画像 変換 役立

(6)

具体例 コン や明 さ 変化さ 際 い 考え 図 右ほ コン 高い コン

昇 画素値 布 広 い こ h 図 右ほ 明 さ 高い 明 さ 昇 画素値 布

高いほう い こ こ 右 図 画素値 布 山 右側 出 い こ

出 部 画素値 認識さ い 様 こ 左や 右 図 こ い コン

や明 さ 過 変化さ こ 本来 画素値 情報 失わ う場合 あ 注意 必要 あ こ 種 画像処理

行 後 こ 習慣付け 方 い 一般的 画素値 広 布 い 画像 い 画像

言え

付録

付録 付録

付録 : : :O : O O O er ayと er ay er ay er ay と と とDra Dra Dra Dra 違い 違い 違い 違い

画像 透明 ぶ 文 や図形 描 方法 あ 一方 画像 直接 文 や

図形 描 行 場合 選択や キ 入力後 → → 透明 取 除

→ → こ 文 や図形 入力 前 画像 戻 こ 出来 さ 再び 被 →

→ 以前 描い 文 や図形 再び表示さ → → 透明

文 や図形 削除 こ 可能 あ 行 → 場合 画像 直接 文 や図形 書

込 う 一 書 込 削除 こ 出来 い 文 や図形 色 → →

新 表示さ ン 適当 色 選択 こ 変化さ こ 出来

西上幸範 兵庫県立大学 D1

ImageJ ーム http://rsbweb.nih.gov/ij/

図 更新  → ン ニュ 目 的 ョ ン 選 択 次 回 起 動 時 更新 ョ ン 扱え 赤線 現 ョン 示 図 キ サ 設定  キ サ ン ネ 接続 い 場合 → → 表示さ ン キ サ 入 力 サ 管理者 聞 図 4 ImageJ バー ョン 確認

参照

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