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TPA 用 PRIMARY 行

ドキュメント内 DDBJ flatfile format guide (ページ 51-57)

2.15 REMARK 行

2.17.1 TPA 用 PRIMARY 行

ビ酷t酷取t止ミピ取 ッ度グ取 場合 ゲOゼゼゴソッ 行 サゴグッツ次ゴS 行 間 出力 る 取

固定バセジ行 後 組 ら成る行 連 出力 れる 取

条件 当 い場合 度次同ゼグ次ト 行自体 出力を行わ い 取 取

書式史取取

1取取取取6取取取11取取取16取取取ァ1取取取ァ6取取取ア1取取取ア6取取取ィ1取取取ィ6取取取イ1取取取イ6取取取61取取取66取取取ウ1取取取ウ6取取取拠1取 円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円取 度次同ゼグ次ト取取取取取ッ度グノS度グソ取取取取取取取取取取取取度次同ゼグ次トノ同コゴソッ同サ同ゴ次取度次同ゼグ次トノS度グソ取取取取取取取取ゲOゼ度取

取取取取取取取取取取取取存st酷メtノ下]-存ピ点ビノノノ下]取存酷ヒヒピss至為点ノ下ノ].存]取取存st酷メtノ下]-存ピ点ビノノノ下]取ヒ取 取取取取取取取取取取取取(酷)取取取取取取取(酸)取取取取取取取(ヒ)取取取取取取取取取取取取(ビ)取(ピ)取取取取取取取(フ)取取取取取取取(ブ)取 記述例史取取

1取取取取6取取取11取取取16取取取ァ1取取取ァ6取取取ア1取取取ア6取取取ィ1取取取ィ6取取取イ1取取取イ6取取取61取取取66取取取ウ1取取取ウ6取取取拠1取 円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円取 度次同ゼグ次ト取取取取取ッ度グノS度グソ取取取取取取取取取取取取度次同ゼグ次トノ同コゴソッ同サ同ゴ次取度次同ゼグ次トノS度グソ取取取取取取取取ゲOゼ度取

取取取取取取取取取取取取1拠拡拠6-1拡0ウァ取取取取取取取取取ケデ拡ア6ィイイ.拡取取取取取取取取取1拠拡拠6-1拡0ウァ取取取取取取取取取ヒ取 検証※テGS取取取1ァアィイ6ウ拠拡-1ァアィイ6ウ拠拡取ググググ011ァアィイ6ウ拠.1ァ取取1ァアィイ6ウ拠拡-1ァアィイ6ウ拠拡取ヒ取 検証※コッグ取取取1ァアィイ6ウ拠拡-1ァアィイ6ウ拠拡取ッ同1ァアィイ6ウ拠拡01ァアィイ6取1ァアィイ6ウ拠拡-1ァアィイ6ウ拠拡取ヒ取 取取取取取取取取取取取取(酷)取取取取取取取(酸)取取取取取取取(ヒ)取取取取取取取(ビ)取取取取取取(ピ)取取取取取取取(フ)取取取取取取取(ブ)取

(酷)-(酸)取塩基番号を示 数 各暷大 拡 桁 区 り文 昔-昔 固定 取

(ヒ).(ビ)取酷ヒヒピss至為点取点uボ酸ピメ取 取vピメs至為点取点uボ酸ピメん取t至取点uボ酸ピメ取為メ取コ次グ/ゴ次グ/S次グ取メu点取至ビ取 取 存酷ヒヒピss至為点取点uボ酸ピメ].存vピメs至為点取点uボ酸ピメ]取

取 tメ酷ヒピノ至ビ取存t至下下下下下下下]取 下取ッメ酷ヒピ取グメヒプ至vピ取 vピメs至為点取概念 い 取

取 下取コ次グ 使用 実 い 想定 取

取 下取あ コケセ同ソ緩 行 ッメ酷ヒピ取グsピボ酸l止取グメヒプ至vピ 記載 モンェ 留 る公算 高い取 (ピ)-(フ)取塩基番号を示 数 各暷大 拡 桁 区 り文 昔-昔 固定 取

(ブ)取引用 鎖 ら 空白 相補鎖 ら 取昔ヒ昔取 出力 取 取

使用可能文 種 文 数史 述 書式通り 取 規則 運用 限史取取

ココケ編/ゴゼケセ-ケ酷点ペ/Gピ点ケ酷点ペ取 い 段 階 (1拡拡拡 年 時 確 実 ) ら 自 ら を 取 ミメ至ボ酷メ止取 点uヒlピ為t至ビピ取 sピムuピ点ヒピ取 ビ酷t酷酸酷sピ取 置 付 り れ を 典 引 用 ( 必 要 応 改 変 ) る 取 次ピフSピムん取 Sw至ss-度メ為t取 (ツ点至度メ為t) を取 sピヒ為点ビ酷メ止取ビ酷t酷酸酷sピ取 差 化 い ッメ酷ヒピ取グメヒプ至vピ取(コッグ)ん取Sプ為メt取次ピ酷ビ取グメヒプ至vピ取(コ次グ) ミメ至ボ酷メ止取

ィ拡取 sピムuピ点ヒピ取ビ酷t酷酸酷sピ取 ある 識 いる 取

ココケ編/ゴゼケセ-ケ酷点ペ/Gピ点ケ酷点ペ取 時 論文引用 取点uヒlピ為t至ビピ取sピムuピ点ヒピ取ビ酷t酷酸酷sピ取 あり 引用 よる配列 取(メピ)取酷ssピボ酸lピ取あるい 取(メピ)取酷点点為t酷t至為点取を論文 ら参照 る 入れる 要求 れ

従 来 ミメ至ボ酷メ止取 塩 基 配 列 タ ヴ シ パ ヴ ケ 区 枠 組 ココケ編/ゴゼケセ-ケ酷点ペ/Gピ点ケ酷点ペ 共 通 ッ度グ取 ビ酷t酷酸酷sピ を構築 る 取

ァ00ア 年 実験的 証 い 入れ ッ度グノ至点フピメピ点t至酷l取 取ッ度グノピxミピメ至ボピ点t酷l取 区 取

ァ00拠 年 メ酷w取メピ酷ビ取 取(メピ)酷ssピボ酸lピ取 関 引用元を逐 記載 る義務を 取ッ度グノメピ酷ssピボ酸lピ取 ィ ゾガモヴ追加 合意 取

ァ00拡 年 Gピ点ケ酷点ペ ら取ッ度グ-テGSん取ッ度グ-sヒ酷フフ為lビノゲOソ取 暷初 録例 取

検索体系 特 合意 い Gピ点ケ酷点ペ取 ミピメ至為ビ至ヒ酷l取メピlピ酷sピ取 ッ度グ を含 い ココケ編 含 い

る 取

ッ度グ 場合 酷ヒヒピss至為点取点uボ酸ピメ( 録 後付 場合 ある 配列タヴシ )雑 記載 れ い ら ココケ編/ゴゼケセ-ケ酷点ペ/Gピ点ケ酷点ペ ら 何れ ら 公開 い規則 いる 限 ッSグ 在 い 取 コゴサ同ソ同ッ同Oソん取緩ゴトテO次コS取 適 記載 る必要 ある 取

ッ度グ 配列自体 引用 ミメ至ボ酷メ止取sピムuピ点ヒピ取 酷l至ブ点ボピ点t 高い 率を要 る 記 ツ次セ 解 取 取 ッ度グ史取プttミ史//www.ビビ酸致.点至ブ.酷ヒ.致ミ/su酸/tミ酷-致.プtボl取

取 下取ココケ編取 クケゾヘヤパャ 取ッ度グ取メピ酷ssピボ酸lピ取 録 曑対応 ある 取 取

イ0取 2.17.2 TSA PRIMARY

ビ至v至s至為点 ッSグ 場合 ゲOゼゼゴソッ 行 サゴグッツ次ゴ 行 間 出力 る 取

固定バセジ行 後 組 ら る行 連 る 取

条件 当 い場合 度次同ゼグ次ト 行自体 出力を行わ い 取 取

書式史取取

1取取取取6取取取11取取取16取取取ァ1取取取ァ6取取取ア1取取取ア6取取取ィ1取取取ィ6取取取イ1取取取イ6取取取61取取取66取取取ウ1取取取ウ6取取取拠1取 円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円取 度次同ゼグ次ト取取取取取ッSグノS度グソ取取取取取取取取取取取取度次同ゼグ次トノ同コゴソッ同サ同ゴ次取度次同ゼグ次トノS度グソ取取取取取取取取ゲOゼ度取

取取取取取取取取取取取取存st酷メtノ下]-存ピ点ビノノノ下]取存酷ヒヒピss至為点].存vピメ]取取存st酷メtノ下]-存ピ点ビノノノ下]取ヒ取 取取取取取取取取取取取取(酷)取取取取取取取(酸)取取取取取取取(ヒ)取取取取取取取取取(ビ)取取取取(ピ)取取取取取取取(フ)取取取取取取取(ブ)取 記述例史取取

1取取取取6取取取11取取取16取取取ァ1取取取ァ6取取取ア1取取取ア6取取取ィ1取取取ィ6取取取イ1取取取イ6取取取61取取取66取取取ウ1取取取ウ6取取取拠1取 円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円取 度次同ゼグ次ト取取取取取ッSグノS度グソ取取取取取取取取取取取取度次同ゼグ次トノ同コゴソッ同サ同ゴ次取度次同ゼグ次トノS度グソ取取取取取取取取ゲOゼ度取

検証※通常取取1ァアィイ6ウ拠拡-1ァアィイ6ウ拠拡取ググ1ァアィイ6.1ァ取取取取取取取取1ァアィイ6ウ拠拡-1ァアィイ6ウ拠拡取ヒ取 検証※テGS取取取1ァアィイ6ウ拠拡-1ァアィイ6ウ拠拡取ググググ011ァアィイ6ウ拠.1ァ取取1ァアィイ6ウ拠拡-1ァアィイ6ウ拠拡取ヒ取 検証※コッグ取取取1ァアィイ6ウ拠拡-1ァアィイ6ウ拠拡取ッ同1ァアィイ6ウ拠拡01ァアィイ6取1ァアィイ6ウ拠拡-1ァアィイ6ウ拠拡取ヒ取 検証※コ次グ取取取1ァアィイ6ウ拠拡-1ァアィイ6ウ拠拡取コ次次1ァアィイ6.1ァアィイ6ウ拠取1ァアィイ6ウ拠拡-1ァアィイ6ウ拠拡取ヒ取 取取取取取取取取取取取取(酷)取取取取取取取(酸)取取取取取取取(ヒ)取取取取取取取取取(ビ)取取取取(ピ)取取取取取取取(フ)取取取取取取取(ブ)取

(酷)-(酸)取塩基番号を示 数 各暷大 拡 桁 区 り文 昔-昔 固定 取

(ヒ).(ビ)取酷ヒヒピss至為点取点uボ酸ピメ取 取vピメs至為点取点uボ酸ピメん取t至取点uボ酸ピメ取為メ取コ次グ/ゴ次グ/S次グ取メu点取至ビ取 取 存酷ヒヒピss至為点取点uボ酸ピメ].存vピメs至為点取点uボ酸ピメ]取

取 tメ酷ヒピノ至ビ取存t至下下下下下下下]取vピメs至為点取概念 い 取

取 メu点取至ビ取離次次下下下下下下.下下下下下下下下取前半 取sピムuピ点ヒピメ取メu点取 同コん取取

取 取 後半 中 各配列 同コ vピメs至為点取概念 い 取

取 下取実 使用 い 想定 取

取 下取コケセ同ソ緩 行 ッメ酷ヒピ取グsピボ酸l止取グメヒプ至vピ 記載 モンェ 留 る公算 高い取 (ビ)取vピメs至為点取実質 ァ 桁以 数 取

(ピ)-(フ)取塩基番号を示 数 各暷大 拡 桁 区 り文 昔-昔 固定 取 (ブ)取引用 鎖 ら 空白 相補鎖 ら 取昔ヒ昔取 出力 取

使用可能文 種 文 数史 述 書式通り 取 規則 運用 限史取取

ッSグ取 入史取ァ00拠 合意ん取同ゲゼァ00拠取 式 開始 取

従来 ココケ編/ゴゼケセ-ケ酷点ペ/Gピ点ケ酷点ペ取 ゴSッ取酷ssピボ酸lピ取 録を許 い 取

取 下取 録者 れ 告 録 明 例 ある れ 取

取 下取理研ブゞケ シッゲ 境界 例 れ い 取

イ1取

い わ ゆ る 世 代 ク ヴ ォ ン キ ヴ tメ酷点sヒメ至ミt為ボピ タ ヴ シ ら ヒ為ボミut酷t至為点酷l取 酷ssピボ酸lピ取 為点l止 取 プ至ブプ-tプメ為uブプミut取解析タヴシ 成立 得る状況 ら 規 を 和 取

酷ssピボ酸lピ 前 生 為utミut 必 従来 ゴSッん取ッメ酷ヒピ取グメヒプ至vピん取コ次グ/ゴ次グ/S次グ取 何れ 録 る を 義務 生 為utミut 対応関係を取ッ度グ取 類似 取度次同ゼグ次ト取 記載出力 取

コゴサ同ソ同ッ同Oソん取緩ゴトテO次コS取 適 記載 る必要 ある 取

ッSグ 配列自体 引用 ミメ至ボ酷メ止取sピムuピ点ヒピ取 酷l至ブ点ボピ点t 高い 率を要 る 記 ツ次セ 解 取 取 ッSグ史取プttミ史//www.ビビ酸致.点至ブ.酷ヒ.致ミ/su酸/ts酷-致.プtボl取

イァ取

2.18 FEATURES

作成 様

以 取フピ酷tuメピ取ペピ止取キノゾヴノャ 表示開始を示 バセジ あり 記載 定型 記 通り 取

1取取取取6取取取11取取取16取取取ァ1取取取ァ6取取取ア1取取取ア6取取取ィ1取取取ィ6取取取イ1取取取イ6取取取61取取取66取取取ウ1取取取ウ6取取取拠1取 円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円取 サゴグッツ次ゴS取取取取取取取取取取取取取セ為ヒ酷t至為点/欠u酷l至フ至ピメs取

以 各フピ酷tuメピ 行 存フピ酷tuメピ]取存l為ヒ酷t至為点]取 各ムu酷l至フ至ピメ行取存ムu酷l至フ至ピメ取点酷ボピ](-存v酷luピ])取 録者 よ

り記載 れ 記述 れる取

目 取昔ップピ取ココケ編/ゴゼケセ/Gピ点ケ酷点ペ取サピ酷tuメピ取ッ酷酸lピ史取コピフ至点至t至為点昔取(以 サッ-コ為ヒ) 暷新トヴグョン 準 る 取

取 サッ-コ為ヒ史取プttミ史//www.ビビ酸致.点至ブ.酷ヒ.致ミ/サッ/フullノ至点ビピx.プtボl取 取

2.18.1 feature

書式史取取

1取取取取6取取取11取取取16取取取ァ1取取取ァ6取取取ア1取取取ア6取取取ィ1取取取ィ6取取取イ1取取取イ6取取取61取取取66取取取ウ1取取取ウ6取取取拠1取 円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円取 取取取取取存フピ酷tuメピ取点酷ボピ]取取存l為ヒ酷t至為点]取

取取取取取取(酷)取取取取取取取取取取取取(酸)取 記述例史取取

1取取取取6取取取11取取取16取取取ァ1取取取ァ6取取取ア1取取取ア6取取取ィ1取取取ィ6取取取イ1取取取イ6取取取61取取取66取取取ウ1取取取ウ6取取取拠1取 円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円取 取取取取取s為uメヒピ取取取取取取取取取取1..ァア6ウ取

取取取取取取(酷)取取取取取取取取取取取取取取(酸)取

イ 文 空白 後 取

(酷)取フピ酷tuメピ取 称史取書式 約 ら 1イ 文 以 取 取 使用可能文 史取存英 ]存数 ]ノ'-取

取 定義 れ い い 称 使用 い サッ-コ為ヒ取 定義 従う 取

(酸)取l為ヒ酷t至為点 取

取 l為ヒ酷t至為点 記載法 サッ-コ為ヒ取 ある 明 割愛 取

取 参考取ツ次セ史取プttミ史//www.ビビ酸致.点至ブ.酷ヒ.致ミ/su酸/メピフ拡-致.プtボl取

取 ウ拡 文 を越える場合 ァ 行目 ァァ 文 目 ら 記載 改行規則 従う 取

取 使用可能文 種史取存セOゲ]史史=致為至点取為メビピメ取ヒ為ボミlピボピ点t取存グヒヒ下]史ん.()ネカキ取 取

意味的 各 フピ酷tuメピ取 称(酷) 相当 る塩基配列 置を塩基番号 為ミピメ酷t為メ 示 l為ヒ酷t至為点(酸) 組

合わ 示 塩基配列 生 情報学的 注釈を記載 る 取

規則 運用史取取

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