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各 qualifier

ドキュメント内 DDBJ flatfile format guide (ページ 57-62)

2.15 REMARK 行

2.18.3 各 qualifier

基曓的 取フピ酷tuメピ取 記載を補足 る 明を記載 る修飾子 ある 取

書式史取取

1取取取取6取取取11取取取16取取取ァ1取取取ァ6取取取ア1取取取ア6取取取ィ1取取取ィ6取取取イ1取取取イ6取取取61取取取66取取取ウ1取取取ウ6取取取拠1取

円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円取

イイ取

取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取/存ムu酷l至フ至ピメ取ペピ止]取

取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取/存ムu酷l至フ至ピメ取ペピ止]=存v酷luピ]取 取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取/存ムu酷l至フ至ピメ取ペピ止]=(存v酷luピ])取 取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取/存ムu酷l至フ至ピメ取ペピ止]=昔存v酷luピ]昔取 取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取(酷)取取取取取取取取取取取取(酸)取 記述例史取取

1取取取取6取取取11取取取16取取取ァ1取取取ァ6取取取ア1取取取ア6取取取ィ1取取取ィ6取取取イ1取取取イ6取取取61取取取66取取取ウ1取取取ウ6取取取拠1取 円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円取 取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取/ヒult至v酷メ=昔ゼ至ビ為メ至usu至昔取

取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取(酷)取取取取取取取取取取取取(酸)

取 (酷)取

ァ1 文 目 存空白]゜ンタンダ 開始行 ァァ 文 目 昔/昔 固定記載 取 ァア 文 目 ら ムu酷l至フ至ピメ取ペピ止 称(酷) 称 長 定 取

以降 各取ムu酷l至フ至ピメ る 種類 よ 種類 記載 れる 取

取 (酸)取

ン を ら い取ムu酷l至フ至ピメ 場合 (酷) 出力終了 取

ン を る場合 開始ィメヘ 定 (酷) 後 '=' ゜カヴャ を ん 記述 れる 取 ンバセジ 合計 1 行 長 を越え 場合 改行ャヴャ 従い改行 取

ンァ 行目 ァァ ィメヘ ら 以 様 改行ャヴャ 従い改行 取

ン'昔' ジノャェァヴゾヴクョン v酷luピ 含 い 取

ン'昔' ジノャェァヴゾヴクョン 括られる 括弧() 括られる 括られ い 種 ある取

ンフピ酷tuメピ取ペピ止取 応 使用可能 取ムu酷l至フ至ピメ取ペピ止取 異 る 取 サッ-コ為ヒ取 定義 従う 取 取

使用可能文 種史取

v酷luピ 関 存ムu酷l]史史=存英 ]存数 ]存記号 酸]存空白]取

サッ-コ為ヒ取 定義 従う クンエャェァヴダ ハ 記号 ニ 使用可能 取 文 数史取

v酷luピ 関 書式 固定長 在 る 特 全般的 限 い 取

/tメ酷点sl酷t至為点 ゚プテ 配列 よう 大 記載 在 得る 取 取

規則 運用 限史取取

ココケ編/ゴゼケセ-ケ酷点ペ/Gピ点ケ酷点ペ取 取共 行 る取ップピ取ココケ編/ゴゼケセ-ケ酷点ペ/Gピ点ケ酷点ペ取サピt酷uメピ取ッ酷酸lピ取コピフ至点至t至為点取を基曓 フピ酷tuメピ/l為ヒ酷t至為点/ムu酷l至フ至ピメ取記載規則 いる 半年毎 見直 れ 必要 ら 改訂 れる 取

ココケ編 特暼ャヴャ取

ン サピ酷tuメピ/欠u酷l至フ至ピメ取 組 合わ 表を参照史取プttミ史//www.ビビ酸致.点至ブ.酷ヒ.致ミ/su酸/メピフウ-致.プtボl取 ン /ミ酷メt至酷l取禁 史取ゴゼケセ-ケ酷点ペん取Gピ点ケ酷点ペ取 新規 録 使用禁 ココケ編 全面禁 取

ン /l酷酸ピl取禁 史取現在 ゴゼケセ-ケ酷点ペ 使用取

ン /ビ酸ノxメピフ 利用 限史取ココケ編 明確 管理 いる取t酷x為点取(t酷x為点為ボ止取ビ酷t酷酸酷sピ) 録者 連携 付加 いる取サグソッOゼノコケん取ゼG同ん取次グ度-コケん取Os酷1 タヴシパヴケ側 ら依 を 記述 同ゼGッ/セ同Gゼ stメ酷至点

イ6取

管理団体 (ソケ次ゲん取編ゲゼん取グッゲゲ )以外 特 例外を除 記載 使用 い方針 取

取 ゴゼケセ-ケ酷点ペん取Gピ点ケ酷点ペ 独自 作成 ( 録者 酷点ビ/為メ タヴシパヴケ運営者 ら )依 を取

取 モンェ いるォヴケ 多 部 相互 協調 限定的 ある 取

運用 注意 必要 目史取

t酷x為点為ボ止取ビ酷t酷酸酷sピ 取

ン s為uメヒピ取フピ酷tuメピ/為メブ酷点至sボん取/ビ酸ノxメピフ=昔t酷x為点史下下下下下昔 取セOゲツSん取SOツ次ゲゴん取O次Gグソ同Sゼ取( よび取 取O次同G同ソ)取 取 SOツ次ゲゴん取O次Gグソ同Sゼ 様 t酷x為点為ボ止取ビ酷t酷酸酷sピ 準 ヤカヴチヤパャ 連動取

取 t酷x為点為ボ至ヒ取ビ至v至s至為点 昔シツゼ昔 例外 t酷x為点為ボ止取ビ酷t酷酸酷sピ 記載 準 取

ン /為メブ酷点至sボ史取t酷x為点為ボ止取ビ酷t酷酸酷sピ取 規定 れる s点酷ミsプ為t取 ある t酷x為点為ボ止取ビ酷t酷酸酷sピ取 更新 より モンェ れン 称 差 生 る ある(SOツ次ゲゴ/O次Gグソ同Sゼ 行 様) 取

ン s為uメヒピ取フピ酷tuメピ/su酸ノsミピヒ至ピsん取/v酷メ至ピt止 記述 ある場合 大半 /為メブ酷点至sボ取 含 記載 る 取 ン s為uメヒピ取フピ酷tuメピ/stメ酷至点ん取/至s為l酷tピ 記述 ある場合 曑 定ン曑記載種 オテヘ全長規模 録

大半 /為メブ酷点至sボ取 含 記載 る 取 取

ヒ為llピヒt至為点取ビ酷t酷酸酷sピ 取

ン /酸至為ノボ酷tピメ至酷lん取/ヒultuメピノヒ為llピヒt至為点ん取/sミピヒ至ボピ点ノv為uヒプピメ取 定型 タヴシパヴケ (将来的 )連携 取

取 現状 手動 連携 取

取 下取ソゲケ同取t酷x為点為ボ止取tピ酷ボ取 作成 ケ酷メヒ為ビピ取為フ取セ至フピん取Gケ同サ取 共暼 近い将来 般公開予定 取 取 参照史取公開 れ いる ヒ為llピヒt至為点s タヴシパヴケ取

取 ケ至為ビ至vピメs至t止取ゲ為llピヒt至為点s取同点ビピx史取プttミ史//www.酸至為ビ至vピメs至t止ヒ為llピヒt至為点s至点ビピx.為メブ/st酷t至ヒ/至点ビピx.プtボl取 取 ケ至為l為ブ至ヒ酷l取次ピミ為s至t為メ至ピs史取プttミ史//www.酸至為メピミ為s至t為メ至ピs.為メブ/至点st至tut至為点取

取 取

ゲコS取(ミメ為tピ至点-ヒ為ビ至点ブ取sピムuピ点ヒピ)取フピ酷tuメピ ゚プテ 配列 取

ン ゲコS取(ミメ為tピ至点-ヒ為ビ至点ブ取sピムuピ点ヒピ)取フピ酷tuメピ取 取/tメ酷点sl酷t至為点取ムu酷l至フ至ピメ 意 /ミメ為tピ至点ノ至ビ を割り当 る 取 ン ココケ編 /ミメ為tピ至点ノ至ビ を ゲコS取フピ酷tuメピ 初公開 自動的 連番 割り当 る 取

取 下取Gピ点ケ酷点ペ/ゴゼケセ-ケ酷点ペ取 異 る運用 推定 れる 取

ン ココケ編 い /ミメ為tピ至点ノ至ビ を 承 る操作 実質 手動 ある 親酷ヒヒピss至為点取点uボ酸ピメ 変化 る場合 い場合 様 ある 親 酷ヒヒピss至為点取点uボ酸ピメ 変化 るォヴケ 承 部管理的 困 取

ン 通常 /tメ酷点sl酷t至為点取ムu酷l至フ至ピメ取 記載 れる゚プテ 配列 親 ゲコS取フピ酷tuメピ l為ヒ酷t至為点取 る塩 基配列を取/ヒ為ビ為点ノst酷メtん取/tメ酷点slノt酷酸lピん取/ヒ為ビ為点ん取/tメ酷点slノピxヒピミt取 規定 従い ヒ為点ヒピミtu酷l ゚プテ 翻

訳 れ 自動記載 れる 取

ン ゲコS取フピ酷tuメピ /ピxヒピミt至為点取ムu酷l至フ至ピメ 在 る場合 /tメ酷点sl酷t至為点取ムu酷l至フ至ピメ 記載 れる゚プテ 配

列 ヒ為点ヒピミtu酷l ゚プテ 翻訳 れ 途 記載 れる 取

ン ゲコS取フピ酷tuメピ /ミsピuビ為ん取/ミsピuビ為ブピ点ピん取/点為点ノフu点ヒt至為点酷l 何れ (排 的) 記載 れ 場合 /tメ酷点sl酷t至為点取 ムu酷l至フ至ピメ を記載 /ミメ為tピ至点ノ至ビ 割り当 い 取

ン ゲコS取l為ヒ酷t至為点取 (イ酸ミ 以 )短 る場合 /tメ酷点sl酷t至為点取ムu酷l至フ至ピメ 点ull取v酷luピ るォヴケ ある 件 関 取Gピ点ケ酷点ペ取(点ull取v酷luピを出 ) ゴゼケセ-ケ酷点ペ(/tメ酷点sl酷t至為点取ムu酷l至フ至ピメ 自体を出 い)

見解 い い 取

取 下取ココケ編取 ォヴケ 取ゲコS取フピ酷tuメピ を記載 い 取

イウ取 取

ン /ボ為lノt止ミピ史取゠ンダモ 複数出現 る場合 を る セOゲツS 行 記述 影響 取 ン /点為tピ=昔存ボ為ビ至フ至ピメ]史昔取 記載 時折 ムu酷l至フ至ピメ 採用 れ い い記述を 定型 記載 取

取 下取Gピ点ケ酷点ペ 独自 運用 ココケ編 れ う ろ 多い 取

取 取

欠u酷l至フ至ピメ 表示 序史取

ココケ編 録 ら ムu酷l至フ至ピメ取ペピ止 ゚ャネ゙パセダ 表示 れる 取

取フピ酷tuメピ取 複数 取ムu酷l至フ至ピメ取ペピ止 記載 れ 場合 ゚ャネ゙パセダ サヴダ れる Gピ点ケ酷点ペん取ゴゼケセ-ケ酷点ペ取 運用 明 表示 序 関 独自 規則 あり 意味的 要

い 序列 れ いる 取

取 取

イ拠取

2.19 BASE COUNT

行作成 様

塩基配列を塩基 種類 ィゞンダ 情報を 得 る 取

ゲOソ取 記載 れ い ゼGグ取ボ酷stピメ 記載 れ い 取 取

書式史取取

1取取取取6取取取11取取取16取取取ァ1取取取ァ6取取取ア1取取取ア6取取取ィ1取取取ィ6取取取イ1取取取イ6取取取61取取取66取取取ウ1取取取ウ6取取取拠1取 円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円取 ケグSゴ取ゲOツソッ取取取取存至点tピブピメ]取酷取取取取存至点tピブピメ]取ヒ取取取取存至点tピブピメ]取ブ取取取取存至点tピブピメ]取t取

取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取(酷)取取取取取取取取取取取取(酸)取取取取取取取取取取取取(ヒ)取取取取取取取取取取取取(ビ)取 記述例史取取

1取取取取6取取取11取取取16取取取ァ1取取取ァ6取取取ア1取取取ア6取取取ィ1取取取ィ6取取取イ1取取取イ6取取取61取取取66取取取ウ1取取取ウ6取取取拠1取 円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円----円取 ケグSゴ取ゲOツソッ取取取取1ァアィイ6ウ拠拡取酷取取取取1ァアィイ6ウ拠拡取ヒ取取取取1ァアィイ6ウ拠拡取ブ取取取取1ァアィイ6ウ拠拡取t取

取取取取取取取取取取取取取取取取取取取取(酷)取取取取取取取取取取取取(酸)取取取取取取取取取取取取(ヒ)取取取取取取取取取取取取(ビ)取

バセジ固定取昔ケグSゴ取ゲOツソッ取取取取昔 取

区 り文 取昔酷昔取昔ヒ昔取昔ブ昔取昔t昔取 各 ァイん取ィ0ん取イイん取ウ0 文 目 固定取 (酷)取塩基配列中 取昔酷昔取 文 数を算出取

取 使用可能文 種史取存0-拡] 実質 拡 桁以 1イ-ァア 文 目 取 (酸)取塩基配列中 取昔ヒ昔取 文 数を算出取

取 使用可能文 種史取存0-拡] 実質 拡 桁以 ア0-ア拠 文 目 取 (ヒ)取塩基配列中 取昔ブ昔取 文 数を算出取

取 使用可能文 種史取存0-拡] 実質 拡 桁以 ィイ-イア 文 目 取 (ビ)取塩基配列中 取昔t昔取 文 数を算出取

取 使用可能文 種史取存0-拡] 実質 拡 桁以 60-6拠 文 目 取 取

規則 運用史取取

酷tブヒ 以外 塩基 数 ィゞンダ い セOゲツS取 塩基数 ら 引算 算出可能 取

ドキュメント内 DDBJ flatfile format guide (ページ 57-62)

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