Edit アイコンをクリッ クします。

例 16S rRNA アノテーションの入力

② Edit アイコンをクリッ

Qualifier を追加するには Select Qualifier アイコンをクリック

追加したい

qualifier

横のチェックボックスにチェックを加えて、

Save

をクリックすると、

qualifier

を追加できます。

qualifier

を消す場合は、チェックを外します。値が入力された

qualifier

の消去を行う場合

"

確認ダイアログ

"

が出現しますの で、

"OK"

をクリックすると消去できます。

アノテーションに必須な

qualifier

は消去不可能です。

template の種類により、選択可能な qualifier は

異なります。

"Edit" クリック時の編集画面

生物名を学名で入力します

(

参 考

:

補足資料「生物名の入力に ついて」、「生物名入力における カテゴリーの選択について」

)

strain

および、採取情報を

入力します

該当情報がない場合は、

空欄にします。

rRNA

の

location

が配列全長として

自動的に設定されます。必要に応 じて修正します。

16S rRNA

のテンプレート選択しているの

で、プロダクト名は初めから入力済みに なっており修正不可能です。

入力後、

Save

をクリックします

1 件目入力完了時

2

件名以降も、

1

件目と同様に

Edit

アイ コンをクリックして入力を行い、アノ テーション入力を完了させてください。

このページで入力を中断・再開するにはブラウザでブックマークするか、ページのURL を保存してください。ブラウザーを閉じた後でもブックマークしたURLを用いて、再開す ることが可能です。

Link:

•

•

•

•

•

値が空欄の

qualifier

は、

DDBJ

に送信されるア ノテーションファイル中に出力されません。

annotation 入力後 "Confirm" をクリックしてチェックを行う

annotation

入力後、

Confirm

をク リックします。入力した内容の書 式チェックが行われます

チェック後、次のステップに進める場合のみ、

"Next"

がクリック可能になります。チェックで

Error

が生じる場合はクリックできません

このページで入力を中断・再開するにはブラウザでブックマークするか、ページのURL を保存してください。ブラウザーを閉じた後でもブックマークしたURLを用いて、再開す ることが可能です。

参考

:

補足資料「エラーチェックに関する仕様」

入力例２

ミトコンドリア COI 配列の入力画面例

6.Template にて "single protein-coding sequence (CDS), organelle"

を選択した場合の画面例

この例では

/isolate, /collection_date, /lat_lon, /dev_stage

を選択しています。

⇒下表に続く

⇒上表からの続き

Link:

•

•

•

•

•

このページで入力を中断・再開するにはブラウザでブックマークするか、ページの URLを保存してください。ブラウザーを閉じた後でもブックマークしたURLを用いて、再 開することが可能です。

テクニック２

Edit Column を利用すれば、エクセルなどで

作成したリストからの paste が可能

補足資料「 Edit Column をクリックした場合」

テクニック１

編集アイコンから copy 機能 を利用すれば、同じ値の copy が可能

補足資料「 Qualifier の編集ア

イコンをクリックした場合」

入力例３

ミトコンドリアゲノム部分配列の annotation 入力例

6.Template にて other を選択した場合

このページで入力を中断・再開するにはブラウザでブックマークするか、ページのURL を保存してください。ブラウザーを閉じた後でもブックマークしたURLを用いて、再開す ることが可能です。

③

Edit

をクリックして

source feature

への入力 を行います。

①

"Select Qualifier"

で、

qualifier

を追加します。

この例では、

country isolate organelle

を追加しました。

参考

:

•

•

•

•

•

②

この

source

で追加した

qualifier

を、以降のすべてのエント

リーの

source

フィーチャーにもコピーしたい場合には、このア

イコンをクリックします。なお、

qualifier

の値はコピーされま せん。

④ここをクリックし、追加したい

feature

をリストから選択すると追加されます

⑤

feature

配下に追加すべき

qualifier

がある場合に

"Select Qualifier"

をクリックし ます

Edit クリック時

生物名を学名で入力します

(

参 考

:

補足資料「生物名の入力に ついて」、「生物名入力における カテゴリーの選択について」

)

入力後、

Save

をクリック

各情報を入力します

genetic code

には生物名入力時に整数値

が自動入力されることを確認、空欄であれ ば手動で

genetic code(

整数値

)

を入力

⑥追加した

feature

の

location

を修正し ます。クリックすると入力ウインドウが 現れるので、値を入力します。

⑧続いて、次の

feature

を追加します。

⑦

qualifier

値を編集します。

qualifier

をクリックすると入力ウインドウが現れるので、値

を入力します。

ドキュメント内 DDBJ Nucleotide Sequence Submission Systemの紹介 (ページ 72-83)