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確認

ドキュメント内 Rインストール手順 (ページ 51-73)

3. 確認

2018.11.15 52

①これくらいでOK。作業自体は、さきほどと同じくコピペです。

ここではアグリバイオの講義で使いそうなパッケージを実際に 読み込む(ロードする)作業を行っています。1回目とか2回目と か書いていますが、中身は同じです。1回目はごちゃごちゃ 様々なメッセージが出ます。2回目はエラーが出て読み込めな かったパッケージのみメッセージが出ることを利用しています。

3. 確認

赤枠内のコード全体を①コピーして…

3. 確認

2018.11.15 54

赤枠内のコード全体を①コピーして…

②R Console画面上で、右クリックで③ ペースト。インストール完了直後の状 態でも、一旦終了してRを再び起動さ せたあとの状態でもどちらでもよい。

3. 確認

途中経過。こんな感じで画面がどんど ん遷移します。1分程度で終了します。

3. 確認

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終了後の状態。①R Console画面上に見え ている範囲のパッケージ群は、エラーなく ロード(読み込み)できていると解釈します。

②上にスクロールさせていって、エラーメッ セージが出ているものがないかを確認

3. 確認

①上方向に1クリックした段階で、②早速発見!

3. 確認

2018.11.15 58

①のあたりを少しずつクリックしていって、2/3ページほ どさらに上部に移動させたところ。ロードできなかったの は、②EBSeqというパッケージであるが、その原因は③

blockmodelingというパッケージであると解釈します。

3. 確認

①のあたりを少しずつクリックしていって、さらに1/3ページほど さらに上部に移動させたところ。②ここが2回目の確認用コード の最初なので、今回の場合は③blockmodelingのみに対応すれ ばよい。④EBSeqを使わないのであれば、このまま放置でもよい。

② ①

Contents

◼ 事前準備:古いR本体とパッケージ群の削除

◼ R本体のインストール

◼ PC環境設定(登録されている拡張子も表示する)

◼ Rの起動と終了

◼ パッケージ群のインストール

◼ インストール確認

◼ エラーへの対処

60 2018.11.15版

エラーへの対処

ここでは、①EBSeqを読み込めるようにすることを目的とし て、②blockmodelingのエラーへの対処を行います。このエ ラーメッセージは非常に分かりにくく、私も最初に遭遇した ときは試行錯誤しながら対処しました。この問題への対処 は中上級レベルですが、誰かがブログなどに記載してい るかもしれませんのでググるのが基本です。私のウェブ ページ上にも対処法を記載してあるので、それを見せます

エラーへの対処

2018.11.15 62

このウェブページ上で、以前に認識して掲載 したblockmodelingのエラーへの対処法を

「ページ内検索(CTRL + Fキー)」で探します。

エラーへの対処

①blockmodeぐらいまで打ち込んだ段階で、

②以前記載した対処法の部分に飛びます。

エラーへの対処

2018.11.15 64

①対処法です

エラーへの対処

①ドキュメント(今回インストール された場所)、②R、③win-library

エラーへの対処

2018.11.15 66

①3.5(今回インストールしたR本体のバー ジョン3.5.1と対応)。②この中にインストー ルされたRパッケージがアルファベット順 に並んでいるので、blockmodelingを探す

エラーへの対処

①blockmodelingを発見。②

CITATIONというファイルを削除

エラーへの対処

2018.11.15 68

ファイルを削除し終えたら、①R Console画面上 で、もう一度②library(EBSeq)と打ち込んで確認

エラーへの対処

①つまりこういうことです。リターンキーを押すと…

エラーへの対処

2018.11.15 70

画面がば~っと流れてよくわかりません。①を少 しずつ押していって、エラーが出ていないかを確 認してもよいですが、ここではやらずに(小技の伝 授を兼ねて)もう一度library(EBSeq)を実行します

エラーへの対処

①キーボードの上矢印キーを1回押すと、

②直前に打ち込んだコマンドが表示される。

この状態でもう一度リターンキーを押す。

エラーへの対処

2018.11.15 72

無事エラーが出なくなりました

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