3. 地球生物環境研究部門
3.2. 生物分
-96 -
-97 -
新 真 生物種YPF602株 T0B055株 系統的 置 解明 向 予備研究
共和国 海水 新 従属栄養性真 生物YPF602株 学 微鏡 電子 微
鏡観察 株 知 い 何 細胞真 生物 類似 い い
生物 種類 遺伝子配列 決 系統解析 株 性真 生物 あ
藻類 あ い 一 植物類 近縁性 示唆 系統的 置 確 遺
伝子 中 株 系統的 置 精 推 情報 足 い 予想
子系統解析 微鏡観察 株 載 論文
[英文 査 付8 ] 掲載 決
株 波大学構 評 郎 新 従属栄養性真 生物 あ 学 微鏡観察
株 知 い 何 細胞真 生物 類似性 見 電子 微鏡
観察 生物種 生物群 特 的 細胞 微細構造 明
株 複数遺伝子 系統解析 行 生物群 ば
近縁性 示唆 微鏡観察結果 系統解析 結果 株
式 載 論文 投稿 &現 査
中8
" "'
式 載論文 作 並行 大 養 行い 調製
世代 用 作製 網羅的 現遺伝子&
'解析 行 解析 得 遺伝子配列 敁理 大規
模配列 作製 解析 系統的 置 精 良い解明 目指 予
あ 解析 研究& ' 藻類 含 新 巨大生物群 唱
仮 検証&研究代表者 稲垣9課題番 '
0 新 真 生物 見&稲垣 橋 ' 株 解析
沖縄県石垣島 林底泥 新規従属栄養性真 生物 株 学
微鏡 株 原虫 代表 寄生性真 生物種 大多数 占
属 予想 々 遺伝子 塩 配列 決
系統解析 行 結果形態観察 予想通 株 属
株 自 生活性 あ わ 寄生性生物種 極 近縁 あ 明 株
生活様式 逭 わ 自 生活性 寄生生活性 あ い 寄生性生活 自 生活性 適応 研究 要 情報 供 期
-98 - 1 子系統解析 方法論研究 &稲垣 橋 '
見的樹形 索法 効率評価
昨 引 見的樹形 索法 効率評価 行 々 個 配列 生
能 樹形 網羅的 索 行 解析
用い 網羅的 索 得 尤系統樹 索 得 樹形
比較 結果 索 尤系統樹 遥 出 効率 &配列 特性 依存
' 考え い& ' 複数 樹形 索 開始
索効率 改善 能 あ 明 現 解析 敁理 論文執筆 準備等
行 い
遺伝子 連結 タ解析結果 響
々 以 遺伝子 用い 遺伝子 一 植物類& 藻
類 緑色植物類 灰色藻類' 系統性 元 う 響 あ 精査 結果 一 植物類
系統 遺伝子 大 変動 明
結果 & ' 掲載
4. 研 究 業 績
研究論文
1. Takishita K, Yamaguchi H, Maruyama T, Inagaki Y. A hypothesis for the evolution of nuclear-encoded, plastid-targeted glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase genes in "chromalveolate" members. 2009 PLoS ONE 4(3) e4737.
2. Burki F, Inagaki Y, Bråte J, Archibald JM, Keeling PJ, Cavalier-Smith T, Sakaguchi M, Hashimoto T, Horak A, Kumar S, Klaveness D, Jakobsen K, Pawlowski J, Shalchian-Tabrizi K. Large-scale
phylogenomic analyses reveal that two enigmatic protist lineages, Telonemia and Centroheliozoa, are related to photosynthetic chromalveolates. 2009 Genome Biology and Evolution 1(1):231-238.
3. Kamikawa R, Sanchez-Perez GF, Sako Y, Roger AJ, Inagaki Y. Expanded phylogenies of canonical and non-canonical types of methionine adenosyltransferase reveal a complex history of these gene families in eukaryotes. 2009 Molecular Phylogenetics and Evolution 53(2):565-570.
-99 -
4. Inagaki Y, Nakajima Y, Sato M, Sakaguchi M, Hashimoto T. Gene sampling can bias multi-gene phylogenetic inferences: the relationship between red algae and green plants as the case study. 2009 Molecular Biology and Evolution 26(5):1171-1178.
学会発表 招待講演 し
その他の学会発表
1. 石 奏 稲垣祐 晶 神 龍馬 橋 哲男. Apicoplast 来配列 含 色素体rpo 子系
統樹 検出&Oral'2009 7 4-5日第4回日 逭 原生生物研究会(宮城 教育大)
2. 裕子 中山 郎 中山剛 井 勲 稲垣祐 . 珪藻共生体 spheroid body 逭
&Oral'2009 7 4-5日第4回日 逭 原生生物研究会(宮城教育大)
3. 崎洋志 稲垣祐 瀧 清貴 樹 矢 彬憲 拓也 神 龍馬 雪 直 Martin
Kolisko Alastair Simpson Andrew Roger 橋 哲男. 複数遺伝子解析 Fornicata 生物群 系 統逭 解明&Oral'2009 7 4-5日第4回日 逭 原生生物研究会(宮城教育大)
4. 神 龍馬 増 学 稲垣祐 子芳彦. 藻類2種 逭
&Oral'2009 7 4-5日第4回日 逭 原生生物研究会(宮城教育大)
5. 拓也 瀧 清貴 篠崎文彦 千國 子 Marianne Aastebol Minge Kamran Shalchian-Tabrizi 河 地 伸 渡遳信 井 勲 橋 哲男 稲垣祐 . a,b 持 緑色渦鞭毛藻類Lepidodinium
chlorophorum 葉緑体起源 索811葉緑体遺伝子配列 解析&Oral'2009 7 4-5
日第4回日 逭 原生生物研究会(宮城教育大)
6. 稲垣祐 Fabien Burki Jon Brate John Archibald Patrick Keeling Thomas Cavalier-Smith 坂 美 亜子 橋 哲男 Ales Horak Dag Klaveness Kjetill Jakobsen Jan Pawlowski Kamran
Shalchian-Tablizi. 127遺伝子 解析 類 中心粒 陽虫 系統的 置&Oral'
2009 7 4-5日第4回日 逭 原生生物研究会(宮城教育大)
7. Martin Kolisko, Jeffrey D. Silberman, Ivan Cepicka, Naoji Yubuki, Kiyotaka Takishita, Yuji Inagaki, Andrew J. Roger, Alastair G. B. Simpson. New isolates of Carpediemonas-like orgaisms and phylogeny of Excavata.&Poster'2009 8 23+28日 ICOPXIII& Armação dos Búzios'
-100 -
8. Naoji Yubuki, Akinori Yabuki, Yuji Inagaki, Takeshi Nakayama, Isao Inouye, Brian S. Leander. A novel, free-living parabasalid from Pacific mangrove sediments groups strongly with parasitic trichomonads as inferred from ultrastructural and molecular phylogenetic data. &Poster'2009 8 23+28日
ICOPXIII& Armação dos Búzios'
9. 石 奏 稲垣祐 晶 神 龍馬 橋 哲男. Apicoplast 来配列 含 色素体rpo 子系
統樹 検出&Poster'2009 9 2-4日 第11回日 逭 学会( 海遈大)
10. 裕子 中山 郎 中山剛 井 勲 稲垣祐 . 珪藻共生体 spheroid body 逭
&Poster'2009 9 2-4日 第11回日 逭 学会( 海遈大)
11. 崎洋志 稲垣祐 瀧 清貴 樹 矢 彬憲 拓也 神 龍馬 雪 直 Martin
Kolisko Alastair Simpson Andrew Roger 橋 哲男. 複数遺伝子解析 Fornicata 生物群 系
統逭 解明&Poster'2009 9 2-4日 第11回日 逭 学会( 海遈大)
12. 神 龍馬 増 学 稲垣祐 子芳彦. 藻類2種 逭
&Poster'2009 9 2-4日 第11回日 逭 学会( 海遈大)
13. 拓也 瀧 清貴 篠崎文彦 千國 子 Marianne Aastebol Minge Kamran Shalchian-Tabrizi 河 地 伸 渡遳信 井 勲 橋 哲男 稲垣祐 . a,b 持 緑色渦鞭毛藻類Lepidodinium chlorophorum 葉緑体起源 索&Poster'2009 9 2-4日 第11回日 逭 学会( 海遈大)
14. 稲垣祐 美和子 Laurent Choy 藤 久 橋 哲男. 202万樹形 網羅的 索結果
見的樹形 索法 効率評価&Poster'2009 9 2-4日 第11回日 逭 学会( 海遈大) 15. Yuko Ikegami, Takuro Nakayama, Takeshi Nakayama, Isao Inouye, Yuji Inagaki. Origin of
nitrogen-fixing cyanobacterial symbionts in epithemiacean diatoms.&Poster'2009 9 20-24日 LEOPOLDINA-SYMPOSIUM "Molecular Genetics of Chloroplasts and Mitochondria" (
自 大)
16. Ryoma Kamikawa, Isao Masuda, Manabu Ueda, Oyama Kenichi, Sadaaki Yoshimatsu, Yuji Inagaki, Yoshihiko Sako. Evolution of the mitochondrial genomes from two closely related raphidophytes Chattonella marina and Heterosigma akashiwo.&Poster'2009 9 20-24日
LEOPOLDINA-SYMPOSIUM "Molecular Genetics of Chloroplasts and Mitochondria" ( 自 大)
17. Takuya Matsumoto, Kiyotaka Takishita, Tomoko Chikuni, Fumihiko Shinozaki, Marianne A. Minge, Kamran Shalchian-Tabrizi, Tetsuo Hashimoto, Yuji Inagaki. Searching for the origin of green-colored plastids in the dinoflagellate Lepidodinium chlorophorum.&Poster'2009 9 20-24日
LEOPOLDINA-SYMPOSIUM "Molecular Genetics of Chloroplasts and Mitochondria" ( 自 大)
18. 裕子 中山 郎 中山剛 井 勲 稲垣祐 . 珪藻共生体 spheroid body 逭
&Oral'2009 10 30日-11 1日 第42回日 原生動物学会(石巻専 大)
-101 -
19. 矢 彬憲 中山剛 雪 直 橋 哲男 稲垣祐 石 健一郎. 新規 鞭毛虫
Tsukubamonas globosa gen. et sp. nov. 類学的 系統学的研究&Oral'2009 10 30日-11 1 日 第42回日 原生動物学会(石巻専 大)
-102 -