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◎  FOXP2

ドキュメント内 バイオインフォマティクス第1回2018.pptx (ページ 70-79)

FOXP2

は転写因子(

transcripQonfactor)

DNA

に結合して、他の遺伝子の転写を制御

R533H DNA

結合ドメインの変異

R328X

ナンセンス変異 

     終止コドンが形成されることで、タンパク質の      生合成が途中でとまってしまう

FOXP2

が発現を制御している遺伝子の一つ

CNTAP2 (contacQn associated protein like 2)

CNTAP2

の変異

:

無意味な言葉を繰り返すことが困難

かつては

FOXP2

は「文法遺伝子」と言われていた。

(1)  FOXP2

は脊椎動物に広く分布している シナプス可塑性や神経の発達に関与

(1) 

文法というより、コンテキスト情報を加味して発話の内容を 理解することや発話や運動能力に関わる。

「コンテキスト情報を加味して発話の内容を理解」とは?

「あなたは賢いですね」と言われた時、字義通りなのか、

皮肉なのかを、前後の文脈から理解

「文法遺伝子」は言い過ぎだが、人間のコミュニケーションに 関わる遺伝子であることは間違いない

FOXP2 のどこがヒトと他の動物と異なっているのか?

  我々を他の動物と(言語に関して)区別する変異の候補   をみつけたい

アラインメントから他の動物の

FOXP2

では保存しているの

ヒト

FOXP2

のみで変化しているサイトを候補として同定

(1)  FoxP2.fasta

をダウンロードして、デスクトップにおく

(2)  

メモ帳で

FoxP2.fasta

がマルチ

Fasta

形式であることを確認

(3) Ma\

でマルチプルアラインメントを作成し、

Clustal

形式で

ファイルに保存

(4)

得られたアラインメントをメモ帳で開いて、上記サイトを確認

CLUSTAL format alignment by MAFFT L-INS-i (v7.130b)

human MMQESATETISNSSMNQNGMSTL-SSQLDAGSRDGRSS-GDTSSEVSTVELLHLQQQQAL chimp MMQESATETISNSSMNQNGMSTL-SSQLDAGSRDGRSS-GDTSSEVSTVELLHLQQQQAL macaque MMQESATETISNSSMNQNGMSTL-SSQLDAGSRDGRSS-GDTSSEVSTVELLHLQQQQAL cat MMQESATETISNSSMNQNGMSTL-SSQLDAGSRDGRSS-GDTSSEVSTVELLHLQQQQAL boar MMQESATETISNSSMNQNGMSTL-SSQLDAGSRDGRSS-GDTSSEVSTVELLHLQQQQAL chicken MMQESATETISNSSMNQNGMSTL-GSQLDAGSRDGRSS-GDTSTEVSTVELLHLQQQQAL Anolis MMQESATETISNSSMNQNGMSTL-SSQLDASSRDGRSS-GDTGTEVSTVELLHLQQQQAL Xenopus MMQESATETISNSSMNQNGMSTL-SSQLDAGSRDGRSS-SDTSSEVSTVELLHLQQQQAL zebrafish MMQESANETISNSSMSQNGMSSL-SSQLDAGSRDGRSS-GETSSEVSAVELLHLQQQQAL fugu MMQESATETISNSSMSQNGMSTLSSSQLEAGSRDGRSSAGDTSSEVSTVELLHLQQQQAL ******.********.*****:* .***:*.******* .:*.:***:************

human QAARQLLLQQQTSGLKSPKSSDKQRPLQVPVSVAMMTPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQL chimp QAARQLLLQQQTSGLKSPKSSDKQRPLQVPVSVAMMTPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQL macaque QAARQLLLQQQTSGLKSPKSSDKQRPLQVPVSVAMMTPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQL cat QAARQLLLQQQTSGLKSPKSSDKQRPLQVPVSVAMMTPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQL boar QAARQLLLQQQTSGLKSPKSSDKQRPLQVPVSVAMMTPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQL chicken QAARQLLLQQQTSGLKSPKGTDKQRPLQVPVSVAMMTPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQL Anolis QAARQLLLQQQTSGLKSPKSSDKQRPLQVPVSVAMMTPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQL Xenopus QAARQLLLQQQTSGLKSPKNNEKQRPLQVPVSMAMMTPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQL zebrafish QAARQLLLQQPGSGLKSPKNNDKQRPLQVPVSVAMMSPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQL fugu QAARQLLLQQPGSGLKSPKSQDKQRPLQVPVSVAMMSPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQL ********** *******. :**********:***:***********************

human KH---GGLDLTTNNSSSTTSSNTS-KASPPITHHSIVNGQSSVL-SARRD--chimp macaque KH---GGLDLTTNNSSSTTSSTTS-KASPPITHHSIVNGQSSVL-NARRD--cat KH---GGLDLTTNNSSSTTSSTTS-KASPPITHHSIVNGQSSVL-SARRD--boar chicken Anolis KH---GGLDLTTNNSSSTTSSTTS-KASPPITHHSIVNGQSSVL-NARRD--Xenopus KH---GGLDLTTNISSSTTSTTTS-KASPPITHHSLLNGQASVL-SARRD--zebrafish KH---SGLDLSTNNNTSTTSTSNP-KASPPITHHSMSNGQSPALNNNRRE--fugu KHNSSGSTGGGNGGGLDLSTNNSSSTTSSSNPAKASPPLSHHSIANGQSPIL-NHRRERE ** .****:** .:****:... *****::***: ***:. * . **:

 

二つの候補サイトが選ばれる T303N  魚類では S

N325S ネコとアフリカツメガエルは例外だが強く保存

FoxP2

の構造は

DNA

結合ドメインしか決定されていないので、構造上の表示

は行わない(行えない)

マウスの

FOXP2

で、この2つのサイトをヒトのアミノ酸に 変化させた実験が行われた。

ミッキーマウスは生まれなかった

しかし、大脳基底核

(basal ganglia,

運動制御や学習に関与

)

の 線条体

(striatum)

中の

medium spiny neuron (spiny neuron =

有棘細胞、

MS

細胞とよばれる。

GABA

を伝達物質とする抑制性

ニューロン)の樹状突起の長さやシナプス可塑性が増大していた。

(Enard et al. 2009)

この観察とヒトの言語能獲得との関係は不明

Mol Biol Evol (2012) 30, 844-852

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