KEK計算科学センターとCC-IN2P3とで共同提案
計算科学研究センターの現状と今後 分子研リポート2003 | 分子科学研究所
... 266 将来計画及び運営方針 スーパーコンピュータシステムは，富士通製 V PP5000 と S GI 製 Origin から構成されている。V PP5000 は 1 C PU 当た りの最高演算性能が 9.6 Gflops のベクトル演算装置 30 台から構成され，各 C PU に 8 ∼ 16 GB の主記憶装置をもつベ クトル並列計算機である。 一方， S GI Origin は 1 C ...
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Activity Report KEK Progress Report グリッドシステム 飯田好美 岩井剛 川端節彌 佐々木節 鈴木聡 渡瀬芳行 八代茂夫 概要計算科学センターでは GRID コンピューティングの仕組みを利用し 本機構と共同研究を行う研
... Grid CA 自身も外部監査を受け、これに合格している。 1 The International Grid Trust Federation: http://www.gridpma.org/ 2 Asia Pacific Grid Policy Management Authority: http://www.apgridpma.org/ ...
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電子計算機センター将来計画 分子研リポート1998 | 分子科学研究所
... 一方， 計算機の発展に密着しベクトル並列型， 超 並列及び分散共有メモリの並列計算機などの新しいアーキテクチャの計算機の能力をフルに活用するためのスタッフ も重要であり，分子科学計算アルゴリズムの開拓や，計算機アーキテクチャの特徴を生かした分子シミュレーション ...
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共同研究と大学院教育 分子研リポート2008 | 分子科学研究所
... 3-4-2 岡崎コンファレンス 分子科学研究所では１ ９ ７ ６年（１ ９ ７ ５年研究所創設の翌年）より２ ０ ０ ０年まで全国の分子科学研究者からの申請を 受けて小規模国際研究集会「岡崎コンファレンス」を年２〜３回，合計６ ５回開催し，それぞれの分野で世界トップ ...
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計算科学研究センター 分子研リポート2004 | 分子科学研究所
... 先端の研究拠点としての役割を担ってきた。同様に分子科学研究所の計算機センターは最新の計算機を分子科学の研 究者に提供することにより，わが国における計算化学，シミュレーション研究に多大の貢献をしてきた。特に創立後 の １ ０ ...
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出版物・パンフレット | 理化学研究所 計算科学研究センター(RCCS)
... 「京」やポスト「京」では、ネットワークで接続された膨大な数の計算ノードが 相互に通信し合いながら手分けして並列に処理を進めることにより、大規模な計 算を高速で実行する。しかし、ノード数が多くなるにつれて通信や同期に時間が かかり、全体として計算機の規模に見合った性能を実現しにくくなる。また、昨 ...
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共同研究と大学院教育 分子研リポート2009 | 分子科学研究所
... 3-4-2 岡崎コンファレンス 分子科学研究所では１ ９ ７ ６年（１ ９ ７ ５年研究所創設の翌年）より２ ０ ０ ０年まで全国の分子科学研究者からの申請を 受けて小規模国際研究集会「岡崎コンファレンス」を年２〜３回，合計６ ５回開催し，それぞれの分野で世界トップ ...
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岡崎国立共同研究機構の将来構想とＥ地区への統合バイオサイエンスセンターの設置 分子研リポート1999 | 分子科学研究所
... 5-3 岡崎国立共同研究機構の将来構想とＥ地区への統合バイオサイエンスセンターの設置 5-3-1 統合バイオサイエンスセンター設置計画検討の経緯 (1) これまでの経過 岡崎国立共同研究機構は，これまで機構を構成する分子科学研究所，基礎生物学研究所及び生理学研究所の３研究 ...
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計算科学研究センター 分子研リポート2004 | 分子科学研究所
... 名にもおよぶ全国の利用者に共同利用施設として広くサービスを提供し， 計算 科学分野の中核的拠点センターとしての役割を果たしている。 最近の大規模計算への要求に答えるために， ２ ０ ０ ４ 年４ 月から運用の抜本的な変更を行い，これまでと比較してはるかに高度で便利な計算環境の整備を行った。変更の主な ...
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計算科学研究センター 分子研リポート2006 | 分子科学研究所
... 5-5 計算科学研究センター 計算科学研究センターにおいては，２０００年度における計算科学研究センター化にともない，従来の共同利用に加 えて，理論，方法論の開発等の研究以外にも，研究の場の提供，ネットワーク業務の支援，人材育成等の新たな業務 ...
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SENAC Vol. 48, No. 2( ) 29 [ 大規模科学計算システム ] 並列コンピュータ LX 406Re-2 の利用法 情報部情報基盤課共同利用支援係共同研究支援係サイバーサイエンスセンタースーパーコンピューティング研究部 1 章はじめに 本センターは並列コンピュータ L
... 作業ディレクトリの指定 NQSⅡ用の環境変数のひとつに PBS_O_WORKDIR 変数があります。この変数には、qsub コマンドを実行 した時点のカレントディレクトリが設定されます（リスト 6）。つまり、work ディレクトリでこのバッチリクエストを投入 する (qsub を実行する)と、$PBS_O_WORKDIR にはカレントディレクトリの work が設定され cd work ...
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計算科学研究センターの将来構想 分子研リポート2001 | 分子科学研究所
... 5-3-2 計算科学研究センターを巡る状況 「計算科学研究センター」 （以下， 「センター」と略）が発足（機構化）して２年が経過しようとしている。昨年度の 「分子研リポート」において，我々は「センター」の将来構想に関して二つの点を明確にした。ひとつは ７ ０ ０ 名近い分 ...
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共同研究と大学院教育 分子研リポート2007 | 分子科学研究所
... 3-4-2 岡崎コンファレンス 分子科学研究所では１ ９ ７ ６年（１ ９ ７ ５年研究所創設の翌年）より２ ０ ０ ０年まで全国の分子科学研究者からの申請を 受けて小規模国際研究集会「岡崎コンファレンス」を年２〜３回，合計６ ５回開催し，それぞれの分野で世界トップ ...
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出版物・パンフレット | 理化学研究所 計算科学研究センター(RCCS)
... 「京」のようなスーパーコンピュータは、普通のパソコンの何万倍も計算が速い。実は、 「京」もパ ソコンも、CPUやメモリ、ハードディスク、電源、冷却装置など、基本的なつくりは同じなんだ。大き な違いはCPUの数。パソコンは普通CPUが1個しかないけれども、 「京」はなんと8万個以上の CPUがつながっているんだ。それぞれのCPUが同時に計算できるから、 「京」は速く、たくさんの ...
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計算科学研究センター（3ページ） 分子研リポート2012 | 分子科学研究所
... ２ ０ １ ３年３月現在の共同利用サービスを行っている計算機システムの概要を示す。本システムは， 「超高速分子シ ミュレータ」と「高性能分子シミュレータ」から構成されている。前者は２ ０ １ ２年２月に更新され，後者は２ ０ １ ３年 ３月に更新された。両シミュレータは，いずれも量子化学，分子シミュレーション，固体電子論などの共同利用の多 ...
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SENAC Vol. 52, No. 2( ) 37 [ 大規模科学計算システム ] アプリケーションサービスの紹介 情報部情報基盤課共同利用支援係 はじめに 本センター大規模科学計算システムでは 分子軌道計算 数式処理 データ処理等の各アプリケーションソフトウェアをサービスしています
... 並列コンピュータへの初回ログイン時には公開鍵と秘密鍵のペアを作成する必要があります。鍵ペアの作成 方法については本誌 30 ページの「SSH アクセス認証鍵生成サーバの利用方法」をご参照ください。 なお、他人名義の利用者番号でのシステム利用は禁止します。パスワード、秘密鍵およびパスフレーズの使い 回しは、不正アクセスのリスク（不正ログイン、クライアントのなりすまし、暗号化された通信の暴露、他サーバへ ...
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電子計算機センター 現状と将来構想 分子研リポート1999 | 分子科学研究所
... 岡崎国立共同研究機構分子 科学研究所電子計算機センター（以下「センター」という）は，センターの大型電子計算機システムを分子科学の大 型計算等のために分子科学研究所内外の研究者の利用に供するとともに，これに必要な研究開発を行い，かつ，岡崎 ...
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共同研究と大学院教育 分子研リポート2012 | 分子科学研究所
... 3-4-2 岡崎コンファレンス 分子科学研究所では，１ ９ ７ ６年（１ ９ ７ ５年研究所創設の翌年）より２ ０ ０ ０年まで全国の分子科学研究者からの申請 を受けて小規模国際研究集会「岡崎コンファレンス」を年２〜３回，合計６ ５回開催し，それぞれの分野で世界トッ ...
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計算科学研究センター（3ページ） 分子研リポート2011 | 分子科学研究所
... カ国から利用されている。 共同利用に関しては，２ ０ １ １年度は 170 の研究グループにより，総数 666 名にもおよぶ利用者がこれらのシステム を日常的に利用している。また，世界をリードする計算科学研究を本センターから発信していくことができるよう， 大規模ユーザのために施設利用Ｓを設定し，２ ０ １ １年度は５件の利用グループに従来の共同利用の枠を超えた超大規 ...
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201 年ハイパフォーマンスコンピューティングと計算科学シンポジウム Computing Symposium 201 HPCS /1/ 1. *1 [1] [2] * 2 2 Computer Assisted Proof * 3 * BASIC 2 1 Sibaura Institut
... シュミットの直交化では，直交行列の列ベクトルご とに共通因子を ScalVec 関数によって括り出すこと で，内積計算の桁数を少なくすることができる．こ のチューニングにより， ScalVec での GCD 計算の 少なからぬ時間を相殺して，乗算の桁数削減効果で， 約 55% の計算時間に改善された．十進 BASIC ...
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