遺伝研スーパーコンピュータ（概要）
スーパーコンピュータ「京」の概要
... 本稿では，システムのハードウェア構成の概要を提示するとともに，性能，電力，信 頼性という観点でどのような施策を講じたかを中心に概説する。 Abstract RIKEN and Fujitsu have been working together to develop the K computer, with the aim of beginning shared use by November 2012, as a ...
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核融合プラズマ中の乱流が織り成すマルチスケール相互作用－スーパーコンピュータ「京」で得られた新発見－
... 【概要】 スーパーコンピュータ「京」を活用したこれまでにない精緻なプラズマ乱流のシミュレーション により、核融合プラズマ中の電子が作る乱流とイオンが作る乱流の間に相互作用が存在する ことを突き止め、その物理機構を明らかにしました。従来はスケール分離が成り立つと考えられ ていた両乱流間に、マルチスケール相互作用が存在するという本研究の結果は、プラズマ物 ...
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最先端・高性能スーパーコンピュータの開発利用 次世代ナノ統合シミュレーションソフトウエアの研究開発（文部科学省）
... 分子科学研究所は２ ０ ０ ６年４月より表記の「最先端・高性能スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクトにお ける「次世代ナノ統合シミュレーションソフトウエアの研究開発」拠点としてナノ分野の「グランドチャレンジアプ リケーション研究」を推進している。我々は「次世代スパコン」プロジェクトの一環として， わが国の近未来の学術， ...
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参考資料3 スーパーコンピュータ「京」の一般利用枠における利用研究課題として62件を選定
... （参考１）課題選定プロセスについて 「京」の課題選定に当たっては「特定先端大型研究施設の共用の促進に関する法律」に基づき、登 録機関として選定された高度情報科学技術研究機構が中立公正な立場で選定を行う。 具体的には、応募された一般利用課題について、専門分野の学識経験者による課題の評価（レビ ュー）を行い、その結果を取りまとめた課題選定・資源配分案を、課題審査委員会が審査、選定委員 会（別添 5 ...
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最先端・高性能スーパーコンピュータの開発利用 次世代ナノ統合シミュレーションソフトウエアの研究開発（文部科学省）（4ページ）
... 分子科学研究所は２ ０ ０ ６年４月より表記の「最先端・高性能スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクトにお ける「次世代ナノ統合シミュレーションソフトウエアの研究開発」拠点としてナノ分野の「グランドチャレンジアプ リケーション研究」を推進している。我々は「次世代スパコン」プロジェクトの一環として， わが国の近未来の学術， ...
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最先端・高性能スーパーコンピュータの開発利用 次世代ナノ統合シミュレーションソフトウエアの研究開発（文部科学省）（5ページ）
... 5-6 最先端・高性能スーパーコンピュータの開発利用 次世代ナノ統合シミュレーションソフトウエアの研究開発 （文部科学省） 分子科学研究所は， 平成１ ８年度より平成２ ３年度まで「最先端 ・ 高性能スーパーコンピュータの開発利用」プロジェ クトにおける「次世代ナノ統合シミュレーションソフトウエアの研究開発」拠点としてナノ分野の「グランドチャレ ...
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２次元ガラスはどこまでもやわらかくなる スーパーコンピュータにより巨大な音波ゆらぎの存在を解明
... 本研究グループは、この結晶に見られる大きい空間スケールで発現する音波振動に着目し、ガラ ス物質でも同じような運動が起こるのではないかと考えました。 ２次元面のガラス形成体内の分子 の動きを確かめるためには多くの分子の数を長い間にわたって計算する必要があります。 そこで大 型並列計算機（スーパーコンピュータ）を積極的に用いてシミュレーションを行うとともに、短時 ...
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最先端・高性能スーパーコンピュータの開発利用次世代ナノ統合シミュレーションソフトウエアの研究開発（文部科学省）（4ページ）
... 5-6-3 プログラム公開に向けた取り組み 本プロジェクトは国家プロジェクトであり， そこで開発されたプログラムは 「公開」 を原則とする。一方， 本プロジェ クトで開発されたプログラムの多くは過去の履歴をもっており，公開に関しては様々な制約を帯びている。同時に， 本プロジェクトで解決を目指している課題の多くは新規の理論や方法論の開発など基礎研究の要素をもっており，研 ...
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最先端・高性能スーパーコンピュータの開発利用 次世代ナノ統合シミュレーションソフトウエアの研究開発（文部科学省）
... 計算科学はこれまでも物質設計や地球環境などの分野で重要な役割を果たし，社会の技術基盤のひとつとして確固 たる基盤を築きつつある。とりわけ，物質や生体分子の様々な機能が発現するナノスケールの現象をターゲットとす る計算科学は２ １世紀における産業を担うべき「知的ものづくり」や個人の遺伝情報に基づく「テーラーメード医療」 にとっての技術基盤として大きな期待を集めている。他方，ナノスケールの現象は伝統的な理論化学物理の視点から ...
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ニュースリリース 平成 27 年 5 月 1 日 国立大学法人千葉大学 自然科学研究機構国立天文台 スーパーコンピュータによる 宇宙初期から現在に いたる世界最大規模のダークマターシミュレーション 概要 千葉大学 東京経済大学 愛媛大学 東京大学 文教大学による研究グループは 理化学研究所計算科学研
... ※1 スーパーコンピュータ「京」 文部科学省が推進する「革新的ハイパフォーマンス・コンピューティング・インフ ラ（ HPCI）の構築」プログラムの中核システムとして、理研と富士通が共同で開発 を行い、2012 年 9 月に共用を開始した計算速度 10 ペタフロップス級のスーパーコン ピュータ。 「京（けい）」は理研の登録商標で、10 ペタ（10 の 16 乗）を表す万進法の ...
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平成 26 年度 JAXA スーパーコンピュータシステム利用成果報告 JAXA Supercomputer System Technical Summaries 2014 目次 成果概要 航空分野 1. 亜音速ジェット騒音の LES 数値予測の研究 2. エコウィング技術の研究開発環境航空機システム
... --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 【利用概要】 1. システム概要 ...
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計 算 科 学 センター Computing Research Center 中 央 計 算 機 システム Central Computer System ssspage 3 KEKネットワーク KEK Network ssspage 7 ssspage 9 スーパーコンピュータシステム Super
... KEK のスーパーコンピュータシステムは素粒子・原子核物理、物性物理、加速器物理等のシミュレーションに利用されています。「 KEK 大型シミ ュレーション研究」として共同利用の申請を受け付け、審査委員会によって利用時間が決定されます。 (http://ohgata-s.kek.jp/) KEK supercomputer system is used by collaborative researches in ...
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JAXA スーパーコンピュータシステム利用成果報告 (2017 年 4 月 ~2018 年 3 月 ) ロケットエンジンおよび超音速飛翔体用エンジンに関する燃焼流体の研究報告書番号 :R17JACA01 利用分野 :JSS2 大学共同利用 URL:
... 戸次宥人,横山央明,堀田英之 事業概要 太陽対流層内部における乱流的な対流運動による熱エネルギー・角運動量輸送過程を理解すること は,太陽固有磁場の生成・維持（ダイナモ）機構を解明する上で重要である.本研究では,数値シミュレー ションでは捉えきれていない乱流ダイナモの効果を実効的なプラントル数の上昇とモデル化すること で,近年問題となっていた熱対流速度の理論と観測との乖離を緩和する機構を新たに提案し,これを数 ...
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S PECIAL INTERVIEW 次世代スーパーコンピュータの性能を最大限に活かしライフサイエンス分野で世界のトレンドセッターをめざす! ライフサイエンス研究分野の未来を切り拓くバイオスーパーコンピューティング 次世代計算科学研究開発プログラム副プログラムディレクター 姫野龍太郎 次世代スーパー
... 私たちのグループの研究内容を一言で言えば、次世 代スーパーコンピュータの性能をいかんなく引き出すタ ンパク質の全電子シミュレーションソフトウェアを開 発することです。選定されたターゲット・ソフトウェ アは、標準的な電子状態計算法である密度汎関数法を用 いて数々のタンパク質の全電子波動関数計算を達成した 実績を持つProteinDFです。そのISLiM版への移植と 超並列化チューニングは平野が担当しています。彼は ...
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長崎は遺伝研 大量遺伝情報研究室の所属です 国立遺伝学研究所 生命情報研究センター 3F 2F 欧州EBIと米国NCBIと密接に協力しながら DDBJ/EMBL/GenBank国際塩基配列データ ベースを構築しています 私たちは 塩基配列登録を支援するシステムづくり 登録データの活用するシステムづく
... 遺伝研スーパーコンピュータシステム(NIGスパコンシステム) ゲノム解析を主な目的とした大規模計算機利用拠点として 最新鋭の大規模クラスタ型 計算機、大規模メモリ共有型型計算機、および大容量高速ディスク装置で構成された スーパーコンピューティングシステムサービスを提供しています。 ...
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TSUBAME 2.0 の全貌 松岡聡 * 遠藤敏夫 ** 丸山直也 * 佐藤仁 * 滝澤真一朗 * * 東京工業大学学術国際情報センター ** 東京工業大学情報理工学研究科 2010 年 11 月に東京工業大学は新しいスーパーコンピュータTSUBAME 2.0 を稼働開始する TSUBAME 2.
... 物理学は、理論研究と実験研究が車の両輪となって発展してきた 学問領域である。その中で、計算機を用いる物理学研究を、理論研 究、実験研究と並ぶ、第 3 の柱に位置づけることが、20 世紀後半の 一時期になされたことがある。しかし、20 世紀末からの計算機資 源の急速な普及により、むしろ、理論研究活動および実験研究活 動の全般に渡って、計算機が深く組み込まれた状況に現在は至って ...
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九州大学がスーパーコンピュータ｢高性能アプリケーションサーバシステム｣の本格稼働を開始
... *4 世界のスーパーコンピュータの演算性能値をランキングする TOP500 に利用される LINPACK ベンチマークプログラムの実行結果 *5 PFLOPS(ぺタフロップス)： 浮動小数点演算を 1 秒間に 1000 兆回実行する能力 本センターは全国共同利用施設として、 1969 年から全国の大学や研究所の研究者に対し高度な 計算サービスを提供しています。従来システムは 2009 年 5 ...
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理研スーパーコンピュータ・システム
... メモリ(記憶装置)のスピードについて メモリ(記憶装置)にも幾つか種類がある。 アクセススピードが速い= コスト高、容量小 アクセススピードが遅い= コスト安、容量大 一桁容量が大きくなると、一桁遅くなる 一桁容量が小さくなると、一桁速くなる レイテンシ:アクセスする時間 データを取ってくる命令を出してから、帰ってく るまでのことをレイテンシ(latenc[r] ...
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統計数理研究所とスーパーコンピュータ
... 4/44 スーパーコンピュータの定義（？） • 「科学技術における高性能計算（ high-performance computing、HPC）を主要目的とする大規模コンピュータ」 • 「その時代の最新技術が投入された最高クラスの性能の ...
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平成28年度スーパーコンピュータ利用報告書
... １. 伊藤研悟, 小松功典, 坪井裕理, 伊達康博, 菊地淳, 代謝混合物のフラグメント集積法による構造生成と 計算化学による推定構造の総合評価,日本農芸化学会 2016, 札幌, 2016 年 3 月 27-30 日 ２. K. Ito, T. Komatsu, Y. Tsuboi, Y. Date, J. Kikuchi, Structure determination of metabolites in ...
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