計算科学連携教育研究センタ
計算科学技術特論 A 古典分子動力学計算法の高速化 2019 年 7 月 4 日名古屋大学大学院工学研究科附属計算科学連携教育研究センター吉井範行
... 短距離相互作用 Cell index法 • 帳簿を作成，更新する際のN(N-1)/2通りの距離計算が大きな負荷.大き なメモリを要する． • L/ r l が4以上の場合には，一辺の長さがr l よりも大きくなる範囲内で基本 セルそのものをx，y， zそれぞれの方向に4分割以上の分割を行う． ...
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計算科学研究センターの現状と今後 分子研リポート2003 | 分子科学研究所
... ・ 計算科学研究センターに改組され今日に至っている。 この間， 一 貫して計算科学分野の学術研究発展の先導的な役割はもとより，全国共同利用センターの中心拠点として大きな貢献 をなしてきている。一方，計算科学研究センターを廻る環境は大きく変化しようとしている。その一つは ２ ０ ０ ４ 年４月 ...
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計算科学研究センターの将来構想 分子研リポート2001 | 分子科学研究所
... 5-3-2 計算科学研究センターを巡る状況 「計算科学研究センター」 （以下， 「センター」と略）が発足（機構化）して２年が経過しようとしている。昨年度の 「分子研リポート」において，我々は「センター」の将来構想に関して二つの点を明確にした。ひとつは ７ ０ ０ 名近い分 ...
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自然科学研究機構連携事業 分子研リポート2006 | 分子科学研究所
... 2-17-3 分野間連携による学際的・国際的研究拠点形成 巨大計算新手法の開発と分子・ 物質シミュレーション中核拠点の形成 方法論の開発からそれに基づいた巨大計算にいたるまで，分子・物質の第一原理から出発した計算科学研究の中核 ...
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出版物・パンフレット | 理化学研究所 計算科学研究センター(RCCS)
... 「京」のようなスーパーコンピュータは、普通のパソコンの何万倍も計算が速い。実は、 「京」もパ ソコンも、CPUやメモリ、ハードディスク、電源、冷却装置など、基本的なつくりは同じなんだ。大き な違いはCPUの数。パソコンは普通CPUが1個しかないけれども、 「京」はなんと8万個以上の CPUがつながっているんだ。それぞれのCPUが同時に計算できるから、 「京」は速く、たくさんの ...
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出版物・パンフレット | 理化学研究所 計算科学研究センター(RCCS)
... 「京」やポスト「京」では、ネットワークで接続された膨大な数の計算ノードが 相互に通信し合いながら手分けして並列に処理を進めることにより、大規模な計 算を高速で実行する。しかし、ノード数が多くなるにつれて通信や同期に時間が かかり、全体として計算機の規模に見合った性能を実現しにくくなる。また、昨 今の大規模並列計算機は、複数のマルチコアプロセッサからなる共有メモリ型ノー ...
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計算科学研究センター（3ページ） 分子研リポート2012 | 分子科学研究所
... 高性能分子シミュレータは，演算サーバ，ファイルサーバ，フロントエンドサーバ，運用管理クラスタおよびネッ トワーク装置から構成される。演算サーバは， 富士通製の PR IME R GY .C X 250S 1 で， 16.C PU コア /64.GB yte 構成のノー ド 368 台からなる共有メモリ型スカラ計算機の PC クラスタである。理論総演算性能は 136.6. T flops，総メモリ容量は 23. T B ...
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計算科学研究センター（3ページ） 分子研リポート2011 | 分子科学研究所
... 研究施設の現状と将来計画 301 8-6 計算科学研究センター 計算科学研究センターは，２ ０ ０ ０年度の電子計算機センターから計算科学研究センターへの組織改組にともない， ...
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計算科学研究センター 分子研リポート2004 | 分子科学研究所
... 名にもおよぶ全国の利用者に共同利用施設として広くサービスを提供し， 計算 科学分野の中核的拠点センターとしての役割を果たしている。 最近の大規模計算への要求に答えるために， ２ ０ ０ ４ 年４ 月から運用の抜本的な変更を行い，これまでと比較してはるかに高度で便利な計算環境の整備を行った。変更の主な ...
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計算科学研究センター 分子研リポート2006 | 分子科学研究所
... 5-5 計算科学研究センター 計算科学研究センターにおいては，２０００年度における計算科学研究センター化にともない，従来の共同利用に加 えて，理論，方法論の開発等の研究以外にも，研究の場の提供，ネットワーク業務の支援，人材育成等の新たな業務 ...
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インド社会科学研究協議会 (ICSSR) インドネシア研究技術高等教育省科学技術高等教育資源総局 (DGRSTHE) インドネシア科学院 (LIPI) イスラエル科学財団 (ISF) フィリピン科学技術省 (DOST) 韓国研究財団 (NRF) 国立シンガポール大学 (NUS) タイ学術研究会議 (
... 研究課題の実施に要する業務を委託する場合は、振興会と受託機関との間で、業務の実施に係る契約（業 務委託契約）を締結します。 業務委託契約により支払われた委託費は、日本側参加者に使用する経費です。本事業の交流実施におい ては、交流相手との経費相互負担を前提としておりますので、相手国側参加者の来日に要する経費（航空券、 ...
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分野間連携（自然科学研究機構）（3ページ） 分子研リポート2012 | 分子科学研究所
... 「自然科学研究における国際的学術拠点の形成事業」では，分子科学研究所，国立天文台，核融合科学研究所が共 同して進める「シミュレーションによる『自然科学における階層と全体』に関する新たな学術分野の開拓」 ，分子科 学研究所が主体的に進める「分子科学国際共同研究拠点の形成」等のプロジェクトが行われることとなった。 （この 内前者には， 平成２ ...
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分野間連携（自然科学研究機構）（3ページ） 分子研リポート2013 | 分子科学研究所
... 「自然科学研究における国際的学術拠点の形成事業」では，分子科学研究所，国立天文台，核融合科学研究所が共 同して進める「シミュレーションによる『自然科学における階層と全体』に関する新たな学術分野の開拓」 ，分子科 学研究所が主体的に進める 「分子科学国際共同研究拠点の形成」 等のプロジェクトが行われている。 （この内前者には， 平成２ ...
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分野間連携（自然科学研究機構）（3ページ） 分子研リポート2011 | 分子科学研究所
... 平成１ ７年８月８日−９日に， 「連携研究プロジェクト Imaging.S cience 第１回シンポジウム」として，公開シンポジ ウムが岡崎コンファレンスセンターで開催された。このシンポジウムでは， 天文学， 核融合科学， 基礎生物学， 生理学， 分子科学におけるイメージング関連研究に関する，機構内外の講師による１ ...
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分野間連携による学際的・国際的研究拠点形成事業（自然科学研究機構） 分子研リポート2007 | 分子科学研究所
... 究を目指す。生体機能創出に必要な，分子間相互作用の条件を，力学系理論を元に定める。これにより，分子階層に おける情報を統合し，機能階層の視点から意義付けを行うと同時に，それぞれの階層における振る舞いを予測する。 テーマ （６） ：分子キラリティのような分子レベルでの情報が，細胞や個体といった上位階層の情報に展開されてい ...
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分野間連携による学際的・国際的研究拠点形成事業（自然科学研究機構） 分子研リポート2008 | 分子科学研究所
... ２日目は，シミュレーション科学を中心とした講演が主体であった。核融合科学研究所の宇佐見教授は，階層横断 現象として理解される磁気リコネクション問題を，連結階層モデルを用いて領域分割法によるインターフェース領域 挿入条件を議論し，この連結階層モデルによる磁気リコネクション理解の検証と今後の展開を紹介した。国立天文台 ...
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HPC の歴史から将来を見る 神戸大学計算科学教育センター小柳義夫
... – 納入期限は 1988年3月22日だったが、2ヶ月遅延 – 故障が多く、並列処理は動かず。 Unix は活用。 • 工業技術院情報計算センターへの導入 – 日本勢は実質門前払い（並列ベクトルを要求） – 1987/9/28: 締め切りとなり、日本クレイ1社が応 ...
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出版物・パンフレット | 理化学研究所 計算科学研究センター(RCCS)
... Isseki Yu(iTHES Research Group, RIKEN, Theoretical Molecular Science Laboratory, RIKEN), Takaharu Mori(Theoretical Molecular Science Laboratory, RIKEN), Tadashi Ando(Laboratory for Biomo[r] ...
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出版物・パンフレット | 理化学研究所 計算科学研究センター(RCCS)
... 造が反復されていく特徴を持っており、 現在ではコンピュータでシミュレーションすることができます。 コンピュータ内につくり出した環 境下で、 生命の進化を模倣させるアプローチもあります。 これらのシミュレーションは、 私たちが生命の本質に迫る手助けをしてくれます。 身体 ̶ 人間を代替するロボット 自らの姿形を模したものに、 私たちは不思議な魅力を感じます。 古代から現代にいたるまで、 洋の東西を問わず人形を愛でる文化がある ...
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九州大学学術情報リポジトリ Kyushu University Institutional Repository マッスル サーバー ( 汎用 PC クラスタ + 特定計算向けハードウェア ) の開発 : 分子軌道法を例にして 村上, 和彰九州大学大学院システム情報科学研究院 九州大学情報基盤センタ
... 研究」（平成 12年度～16年度） • 研究代表者：村上和彰（九州大学） • 参加研究機関：九州大学，東京大学，産総研，富士総研， セイコーエプソン，アプリオリ・マイクロシステムズ ...
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