計算科学研究センタ
計算科学研究センター 分子研リポート2004 | 分子科学研究所
... （２）計算科学は実験科学の側面を有する 計算科学はコンピュータを実験装置とした実験科学でもある。このことは以下のことを意味する。まず，最先端の コンピュータ（実験装置）群が不可欠である。このコンピュータ群には高速演算可能な計算機もあれば，並列計算を ...
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計算科学研究センター 分子研リポート2004 | 分子科学研究所
... 将来計画及び運営方針 313 5-4 計算科学研究センター ２ ０ ０ ５ 年１月現在の計算機システムの概要を下図に示す。 図の左側は ２ ０ ０ ０ 年３月に導入されたスーパーコンピュータ システムで，図の右側は ２ ０ ０ ３ 年３月に更新されて山手地区に設置された汎用高速演算システムである。 ...
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計算科学研究センター 分子研リポート2006 | 分子科学研究所
... 5-5 計算科学研究センター 計算科学研究センターにおいては，２０００年度における計算科学研究センター化にともない，従来の共同利用に加 えて，理論，方法論の開発等の研究以外にも，研究の場の提供，ネットワーク業務の支援，人材育成等の新たな業務 ...
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計算科学研究センターの現状と今後 分子研リポート2003 | 分子科学研究所
... ・ 計算科学研究センターに改組され今日に至っている。 この間， 一 貫して計算科学分野の学術研究発展の先導的な役割はもとより，全国共同利用センターの中心拠点として大きな貢献 をなしてきている。一方，計算科学研究センターを廻る環境は大きく変化しようとしている。その一つは ２ ０ ０ ４ 年４月 ...
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計算科学研究センターの将来構想 分子研リポート2001 | 分子科学研究所
... 5-3-2 計算科学研究センターを巡る状況 「計算科学研究センター」 （以下， 「センター」と略）が発足（機構化）して２年が経過しようとしている。昨年度の 「分子研リポート」において，我々は「センター」の将来構想に関して二つの点を明確にした。ひとつは ７ ０ ０ 名近い分 ...
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計算科学研究センター（3ページ） 分子研リポート2011 | 分子科学研究所
... 研究施設の現状と将来計画 301 8-6 計算科学研究センター 計算科学研究センターは，２ ０ ０ ０年度の電子計算機センターから計算科学研究センターへの組織改組にともない， ...
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計算科学研究センター（3ページ） 分子研リポート2012 | 分子科学研究所
... 318 研究施設の現状と将来計画 8-6 計算科学研究センター 計算科学研究センターは，２ ０ ０ ０年度の電子計算機センターから計算科学研究センターへの組織改組にともない， ...
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出版物・パンフレット | 理化学研究所 計算科学研究センター(RCCS)
... ポスト「京」で未来をひらく！ 「京」を動かしているのは私たち！ 「京」よりさらに性能の良いスーパーコンピュータ、ポスト「京」は現在 開発中。ポスト「京」は私たちにどんな未来を見せてくれるのでしょうか。 複雑なハードウェアの「京」を安定に、かつ無駄なく早く 計算させるために、私たちは「京」を支えています。 ...
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出版物・パンフレット | 理化学研究所 計算科学研究センター(RCCS)
... 「京」やポスト「京」では、ネットワークで接続された膨大な数の計算ノードが 相互に通信し合いながら手分けして並列に処理を進めることにより、大規模な計 算を高速で実行する。しかし、ノード数が多くなるにつれて通信や同期に時間が かかり、全体として計算機の規模に見合った性能を実現しにくくなる。また、昨 今の大規模並列計算機は、複数のマルチコアプロセッサからなる共有メモリ型ノー ...
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出版物・パンフレット | 理化学研究所 計算科学研究センター(RCCS)
... Isseki Yu(iTHES Research Group, RIKEN, Theoretical Molecular Science Laboratory, RIKEN), Takaharu Mori(Theoretical Molecular Science Laboratory, RIKEN), Tadashi Ando(Laboratory for Biomo[r] ...
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出版物・パンフレット | 理化学研究所 計算科学研究センター(RCCS)
... ミュレーションのかたちも現れてきています。 シミュレーションとは、 どのような意味だろうか？ 辞書の中では、 シミュレーションは次のように解説されています。 「物理的あるいは抽象的なシステムをモデルで表現し、 そのモデルを使って実 験を行うこと。 模擬実験 （大辞林 第3版より抜粋） 」 。 模擬や模倣というのは科学や工学の分野における定義ですが、 私たちは普段から 「明日の段 取りをシミュレーションする」 など、 ...
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高生産 高性能プログラミング のための並列言語 XcalableMP 佐藤三久 筑波大学計算科学研究センター
... 2007年１２月にkick-off, 現在、e-scienceプロジェクトの並列プログラミング検討 委員会に移行 メーカからのコメント・要望（活動開始時） 科学技術アプリケーション向けだけでなく、組み込みのマルチコアでも使えるようなも ...
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講義資料 計算生命科学の基礎Ⅳ （→終了しました） | 計算科学教育センター
... を行う立場をゲノミクスという。 2) 構造ゲノミクスとは、ポスト(後)ゲノミクスの課題として、「代表タンパク質」の立体構 造を解析・研究することをいう。構造ゲノミクスに対して1)を配列ゲノミクスという場合 もある。 ...
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計算分子科学研究系
... -3) 研究活動の概略と主な成果 a) 可視−赤外の和周波発生分光法は， 界面構造を光学的にプローブする実験手法として広く用いられるようになって きた。 しかし得られたスペクトルを解釈する上では， しばしば経験的なフィッティングなどに伴う曖昧さがつきま とい， 界面構造を分子レベルで同定する上で実際上大きな障害となっている。 そこで近年我々は分子シミュレーショ ...
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実験と理論計算科学のインタープレイによる触媒・電池の元素戦略研究拠点Elements Strategy Initiative for Catalysis and Battery (ESICB)（文部科学省）（1ページ）
... 見合った形に変更することとなった。 最近の外部向け事業としては，第６回公開シンポジウムを３月１ ８日に東大本郷キャンパスにて開催し，第７回は ９月２ ５日に京大桂キャンパスにて開催し，それぞれ１ ０ ０名以上の参加者を得た。また，本プロジェクトで活動して いる博士研究員の講演を中心にした「次世代 ESICB セミナー」も，昨年１２月で６回を数えている。さらに内部的な ...
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理論・計算分子科学研究領域
... -3) 研究活動の概略と主な成果 a) 電子やエネルギーの移動が化学の基本であるなら，我々はそれらの化学プロセスをどのよう記述できるだろうか？ 当研究グループでは，化学現象の本質が「電子と電子との複雑な多体相互作用の複雑な量子効果」である化学現 象や化学反応をターゲットに，その高精度な分子モデリングを可能とするような量子化学的な手法開発を目指して ...
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計算機センター Vol 研究報告 リモートアクセス環境の構築と運用に関する研究 学習院大学計算機センター村上登志男学習院大学計算機センター磯上貞雄国立情報学研究所コンテンツ科学研究系孟洋学習院大学計算機センター城所弘泰 研究目的現在では 電子メールサービスをはじめとする情報センター
... 構築した環境を利用してのリモートアクセスの実際 概要 学習院外部のネットワークから学習院内部のネットワークに接続するためのリモートアクセス サーバー（RAS サーバー）を研究代表者の村上が Windows Server で本研究に先立ち構築している。 その Windows Server で構築した RAS サーバー利用し、様々なプラットホーム、クライアントを ...
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九州大学学術情報リポジトリ Kyushu University Institutional Repository マッスル サーバー ( 汎用 PC クラスタ + 特定計算向けハードウェア ) の開発 : 分子軌道法を例にして 村上, 和彰九州大学大学院システム情報科学研究院 九州大学情報基盤センタ
... 研究」（平成 12年度～16年度） • 研究代表者：村上和彰（九州大学） • 参加研究機関：九州大学，東京大学，産総研，富士総研， セイコーエプソン，アプリオリ・マイクロシステムズ ...
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理論・計算分子科学研究領域
... -3) 研究活動の概略と主な成果 a) 電子やエネルギーの移動が化学の基本であるなら，我々はそれらの化学プロセスをどのよう記述できるだろうか？ 当研究グループでは，化学現象の本質が「電子と電子との複雑な多体相互作用の複雑な量子効果」である化学現象 や化学反応をターゲットに， その高精度な分子モデリングを可能とするような量子化学的な手法開発を目指している。 ...
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理論・計算分子科学研究領域
... b). G PU を使った 3D - R I S M /R I S M プログラムの高速化：我々が開発した 3D - R I S M /R I S M 理論は，現在，A M B E R や G A M E S S などのスタンダードな分子科学計算パッケージに組み込まれ，分子科学分野に大きな影響を与えているだけ でなく，M OE ...
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