理論分子科学第二研究部門 136
理論分子科学研究系
... -3) 研究活動の概略と主な成果 a) 蛋白質は自然界に存在する最も複雑な分子である。 よって， その立体構造を予測することは （その生化学的機能との 関係上， 極めて重要であるにもかかわらず） 至難の業である。 特に， 理論的に第一原理から （自由エネルギーを最小化 することにより） 立体構造を予測することは不可能と広く信じられている。 それは， 溶媒の効果を取り入れるのが困 ...
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理論研究系 分子研リポート1999 | 分子科学研究所
... 今後の発展が期待されている研究課題 分子の理論計算は依然，極めてホットな研究課題であり，今後も大きな発展が期待される。そのためにも計算機環 境の整備が必須であることは既に述べた。そこでここでは別の側面から私見を言わせていただきたいと思う。 過去 ２ ０ 余年の間に，化学物理（物性）理論は，質的な発展をとげた。繰り込み群やスクーリング理論，カオスなど ...
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理論研究系 分子研リポート2002 | 分子科学研究所
... -3) 研究活動の概略と主な成果 a) 電荷移動錯体T T F -C A はドナー分子とアクセプター分子が交互に積層し， 低温または高圧下で常誘電中性相から二 量化を伴う強誘電イオン性相へ転移することが知られている。 さらに光照射によっても両方向へ相転移し， その時 間発展が実験で明らかになりつつある。 １次元拡張パイエルス ・ ハバードモデルを平均場近似し， 時間依存シュレ ...
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理論研究系 分子研リポート2001 | 分子科学研究所
... b) 中性イオン性相転移は基本的にドナー準位とアクセプター準位の差と電子間斥力の競合により起こることが知ら れている。 相境界近傍ではスピン揺らぎのためにイオン性相が安定化することや， スピンパイエルス不安定性のた めに格子が二量化することがわかっていた。 多くの系では降温や加圧で準位差が実質的に小さくなりイオン性相が 相対的に安定化する。 これとは逆に中性相が安定化する可能性を調べた。 ...
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理論研究系 分子研リポート2000 | 分子科学研究所
... ) 研究活動の課題と展望 化学反応は電子状態の変化に ドライ ヴされる原子の組み変えない しは構造の変化 （異性化） を伴う 化学過程であ り 、 溶液中 のそれには溶媒効果が極めて重要な役割を演 じる。 溶媒効果は反応系の溶解度、 化学平衡 （安定性） と反応速度な ど化学 反応のすべての過程に関わ り を も っている。 ...
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理論研究系 分子研リポート2002 | 分子科学研究所
... 委員Ａ 分子研の意義 分子科学研究所理論部門・電算機室は，日本の理論物理化学の中心として創設以来機能している。特に，分子研で 助手，助教授を経験した人々は，外の教育研究機関で活躍していることから，日本の理論物理化学をリードしてきて ...
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理論研究系 分子研リポート1999 | 分子科学研究所
... -3) 研究活動の概略と主な成果 a) 蛋白質は自然界に存在する最も複雑な分子である。よって，その立体構造を予測することは（その生化学的機能 との関係上，極めて重要であるにもかかわらず）至難の業である。特に，理論的に第一原理から（エネルギー関 数を最小化することにより）立体構造を予測することは不可能と広く信じられている。それは，溶媒の効果を取 ...
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理論研究系 分子研リポート1998 | 分子科学研究所
... -3) 研究活動の概略と主な成果 a) 擬１次元有機導体 (T MT T F )2X ， (T MT S F )2X は温度と圧力によって様々な電子状態を示し，分子性導体の中で最も 詳しく研究された系である。銅酸化物を契機として，異常な金属相の可能性が追求されて，金属相にも低圧側と 高圧側とで性質が異なることがわかってきた。これを次元クロスオーバーという観点から見直してみる。低圧側 ...
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理論・計算分子科学研究領域
... c) 数 nm 程度以下の固体表面担持金属ナノクラスターは，有用な触媒として働くことが多くの研究において指摘されて いる。しかし，貴金属やレアメタル等の非常に高価な原子を使っていることが多く，豊富に存在する安価な原子で代 替した触媒の開発が望まれている。本研究課題では第一原理（カー・パリネロ）分子動力学計算を用いて，固体表 ...
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理論・計算分子科学研究領域
... 計の観点から，高い電子移動度を示すオリゴチオフェン骨格に電子ドナー・アクセプターを導入した分子システムの 研究を行った。 これらの電荷移動色素の励起状態と電荷移動度を置換基効果と溶媒効果の観点から検討した。 方法は， 我々が開発した PC M SA C -C I 法と charge-transfer index を用いた。励起状態と電荷移動度には，顕著な溶媒効果が計 ...
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理論・計算分子科学研究領域
... -3) 研究活動の概略と主な成果 a) これまでに提案，改良・発展をさせてきた時間依存形式による溶質分子の電子状態の時間依存変化を記述する方法 を色素分子の光励起電子移動反応プロセスなどの研究に応用し，光励起後の励起状態におけるフェムト秒オーダー での超高速電子移動反応プロセスや溶媒和過程の解析を可能にしてきた。これらの提案された方法論をさらに，光 ...
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自然科学研究機構分子科学研究所点検評価規則（3ページ） 分子研リポート2013 | 分子科学研究所
... 第４条 委員会は，委員長が招集し，その議長となる。 （点検評価委員会の任務） 第５条 委員会は，次に掲げる事項について企画，検討及び実施する。 一 自己点検・評価及び外部評価の基本方針に関すること。 二 自己点検・評価及び外部評価の実施に関すること。 ...
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分子構造研究系 分子研リポート1998 | 分子科学研究所
... -3) 研究活動の概略と主な成果 a) 中性原子のレーザー冷却・トラップの研究：レーザートラップ可能な最も軽い原子であるへリウム原子を対象と して，レーザートラップの研究を行なっている。レーザー冷却により超低速となった原子同士の衝突現象は，極 めて微弱な摂動にも敏感であること，限られた低次の部分波のみでの衝突になること，などの特徴を持ち，常温 ...
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計算科学研究センター（3ページ） 分子研リポート2012 | 分子科学研究所
... 高性能分子シミュレータは，演算サーバ，ファイルサーバ，フロントエンドサーバ，運用管理クラスタおよびネッ トワーク装置から構成される。演算サーバは， 富士通製の PR IME R GY .C X 250S 1 で， 16.C PU コア /64.GB yte 構成のノー ド 368 台からなる共有メモリ型スカラ計算機の PC クラスタである。理論総演算性能は 136.6. T ...
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計算科学研究センター（3ページ） 分子研リポート2011 | 分子科学研究所
... まず，超高速分子シミュレータは富士通社製の P R I M E R G Y と S G I 社製の U V 1000 から構成される共有メモリ型ス カラ計算機で，両サーバは同一体系の C PU（Intel. X eon）および OS （L i nux2.6）をもとに，バイナリ互換性を保って 一体的に運用される。これらに加え，京コンピュータと同じアーキテクチャの富士通社製 P R I M E H P C . F X 10 ...
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自然科学研究機構連携事業 分子研リポート2006 | 分子科学研究所
... cience 第１回シンポジウム」として，公開シンポジ ウムが岡崎コンファレンスセンターで開催された。このシンポジウムでは， 天文学， 核融合科学， 基礎生物学， 生理学， 分子科学におけるイメージング関連研究に関する，機構内外の講師による１ ６件の講演，及び今後の分野間連携研究 に関する全体討論が行われた。参加者は機構外３ ６名，機構内１ ４ ...
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理化学研究所計算科学研究機構研究部門量子系分子科学研究チーム殿 hp170163: 有機半導体 有機分子発光材料の全自動探索シミュレーションシステムの開発 高度化支援作業 2017 年 9 6 ( R405 般財団法 度情報科学技術研究機構利 援部 1
... 対象モジュール： PWscf（pw.x） • 依頼内容 オープンソースの第一原理電子状態計算プログラムQuantum ESPRESSOの最新版v6.1のPWscfモ ジュール(pw.x)について、実行性能の阻害要因のひとつとなっている対角化計算に対して、EPLAライ ブラリ導入による高速化を行い、ライブラリ導入前の(ScaLAPACKを使用した)コードとELPAライブラリ ...
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自然科学研究機構分子科学研究所点検評価規則（3ページ） 分子研リポート2015 | 分子科学研究所
... 第４条 委員会は，委員長が招集し，その議長となる。 （点検評価委員会の任務） 第５条 委員会は，次に掲げる事項について企画，検討及び実施する。 一 自己点検・評価及び外部評価の基本⽅針に関すること。 二 自己点検・評価及び外部評価の実施に関すること。 ...
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自然科学研究機構分子科学研究所点検評価規則（3ページ） 分子研リポート2014 | 分子科学研究所
... 第４条 委員会は，委員長が招集し，その議長となる。 （点検評価委員会の任務） 第５条 委員会は，次に掲げる事項について企画，検討及び実施する。 一 自己点検・評価及び外部評価の基本方針に関すること。 二 自己点検・評価及び外部評価の実施に関すること。 ...
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自然科学研究機構分子科学研究所点検評価規則（3ページ） 分子研リポート2012 | 分子科学研究所
... 第４条 委員会は，委員長が招集し，その議長となる。 （点検評価委員会の任務） 第５条 委員会は，次に掲げる事項について企画，検討及び実施する。 一 自己点検・評価及び外部評価の基本方針に関すること。 二 自己点検・評価及び外部評価の実施に関すること。 ...
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