理論分子科学第一研究部門 118
理論分子科学研究系
... -3) 研究活動の概略と主な成果 a) 蛋白質は自然界に存在する最も複雑な分子である。 よって， その立体構造を予測することは （その生化学的機能との 関係上， 極めて重要であるにもかかわらず） 至難の業である。 特に， 理論的に第一原理から （自由エネルギーを最小化 することにより） 立体構造を予測することは不可能と広く信じられている。 それは， ...
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理論研究系 分子研リポート2000 | 分子科学研究所
... この理論の応用には次の二通りが考えられる。 第一は、 多次元系の問題を一次元多 準位の問題に変換して、 多チャンネルのポテンシャル交差問題に本理論を利用する方法である。 我々は３原子系の 具体的反応を例にとり、 超球座標を用いて一次元化して理論を応用した。 全反応確率などが大変良く再現される事 を確認した。 ...
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理論研究系 分子研リポート2002 | 分子科学研究所
... 分子科学に関する教育，研究を行なっている場所が日本の大学に極めて少ない現状の話（訴え）があったが，そう であるならば由々しき事態であるといわなければならない。皮肉にも，この事実がかえって分子科学研究所の存在す る必要性を高めるのには役にたつのかも知れないが，事はそれほど単純でなかろう。分子科学は物理学と化学に密接 ...
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理論研究系 分子研リポート2002 | 分子科学研究所
... e) 光を照射することで低スピン相から高スピン相へ転移するスピンクロスオーバー錯体が多く知られている。 そのな かで， [Fe(2-pic) 3 ]Cl 2 ·EtOHは光誘起構造変化に協調性が現れ注目を集めている。 しかし， その挙動の理論的解明は完 全でない。 低温での光誘起高スピン相の実験から， ラマン活性の振動モードが光学活性になっていることが最近わ かった。 高温での熱平衡高スピン相とは異なる性質だが， ...
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理論研究系 分子研リポート2001 | 分子科学研究所
... (iii)分子性液体中の粘性理論 ： 液体の粘性係数は， 運動量の散逸をつかさ どる， 液体の代表的な輸送係数の一つである。 溶液化学の分野においては， 純液体， 溶液， 混合液体の粘性係数の， 温度， 圧力， 濃度依存性は， 液体の微視的な構造を推 測するための手がか り と して長年用い られている。 また， 粘性が高い液体中では物体が動き に く い という ， 巨視的スケールで の直感の延長， ...
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理論研究系 分子研リポート1999 | 分子科学研究所
... 分子研の他の研究系及び日本の他の大学との共同研究も活発に行われています。日本に於ける理論化学の状況は最 近富に改善されています。東京や京都，その他の場所に大きな研究グループが形成されています。従って，分子研は その役割を正当化する為に研究における高い評価を維持する様に十分な努力をする必要があるでしょう。岩田末広教 ...
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理論研究系 分子研リポート1999 | 分子科学研究所
... + の順序にな る。 イオンの抵抗係数に関するストークス−アインシュタイン則のブレークダウンを説明するモデルのひとつ はいわゆるいわゆる「溶媒和イオン」モデルであり，溶媒和したイオンの実効的ストークス半径が（裸の）イ オンサイズの増加とともに減少することにより上に述べた抵抗係数のイオンサイズ依存性を説明する。 もうひ とつのモデルはいわゆる「誘電摩擦」の概念に基礎をおくものであり，イオンサイズの増加とともに「誘電摩 ...
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理論研究系 分子研リポート1998 | 分子科学研究所
... b) 水素移動反応等のトンネル過程や， 光合成中心等における電子移動反応は量子過程であるが， その量子過程は， 溶 媒や蛋白質等の環境により孤立系とは非常に異なったものになっており， 場合よっては制御さえされていると考 えられる。その研究のために，経路積分法の新しい計算方法である最適化摂動理論という，ファインマンの変分 法を一般化した理論を用い， ...
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理論・計算分子科学研究領域
... c) 数 nm 程度以下の固体表面担持金属ナノクラスターは，有用な触媒として働くことが多くの研究において指摘されて いる。しかし，貴金属やレアメタル等の非常に高価な原子を使っていることが多く，豊富に存在する安価な原子で代 替した触媒の開発が望まれている。本研究課題では第一原理（カー・パリネロ）分子動力学計算を用いて，固体表 ...
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理論研究系 分子研リポート2003 | 分子科学研究所
... -3) 研究活動の概略と主な成果 a) 蛋白質は自然界に存在する最も複雑な分子である。 よって， その立体構造を予測することは （その生化学的機能との 関係上， 極めて重要であるにもかかわらず） 至難の業である。 特に， 理論的に第一原理から （自由エネルギーを最小化 することにより） 立体構造を予測することは不可能と広く信じられている。 それは， ...
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自然科学研究機構分子科学研究所点検評価規則（3ページ） 分子研リポート2012 | 分子科学研究所
... 第４条 委員会は，委員長が招集し，その議長となる。 （点検評価委員会の任務） 第５条 委員会は，次に掲げる事項について企画，検討及び実施する。 一 自己点検・評価及び外部評価の基本方針に関すること。 二 自己点検・評価及び外部評価の実施に関すること。 ...
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分子集団研究系 分子研リポート1998 | 分子科学研究所
... Metals に印刷中） 。現在，これらの電子相の電荷状態に関して NMR 吸収線形を調べている（学習院大学：高橋教 授との共同研究） 。今後，この異常常磁性相の起源を理解するとともに，他の系についても調べる予定である。 b) T MT C F 系で提唱されている相図は， 擬一次元電子系物理の基本的かつ重要な問題を含有しており， その電子状態 ...
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分子構造研究系 分子研リポート1998 | 分子科学研究所
... -3) 研究活動の概略と主な成果 a) 中性原子のレーザー冷却・トラップの研究：レーザートラップ可能な最も軽い原子であるへリウム原子を対象と して，レーザートラップの研究を行なっている。レーザー冷却により超低速となった原子同士の衝突現象は，極 めて微弱な摂動にも敏感であること，限られた低次の部分波のみでの衝突になること，などの特徴を持ち，常温 ...
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計算科学研究センター（3ページ） 分子研リポート2012 | 分子科学研究所
... 超高速分子シミュレータは富士通社製の PR IM E R G Y . R X 300S 7 と S G I 社製の U V 1000 から構成される共有メモリ型 スカラ計算機で，両サーバは同一体系の C PU（Intel. X eon）および OS （L i nux2.6）をもとに，バイナリ互換性を保っ て一体的に運用される。これらに加え， 京コンピュータと同じアーキテクチャの富士通社製 PR IME HPC .F X ...
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計算科学研究センター（3ページ） 分子研リポート2011 | 分子科学研究所
... 一方，高性能分子シミュレータは，演算サーバ，ファイルサーバ，フロントエンドサーバおよびネットワーク装置 から構成される。演算サーバは，日立製作所製の S R 16000 であり，1. C PU コアあたり 18.8. G fl ops の演算性能を持ち， 1 ノードが 32.C PU コアと 256.GB yte メモリを有する共有メモリ型スカラ計算機である。理論総演算性能は 5.4.T flops， ...
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自然科学研究機構連携事業 分子研リポート2006 | 分子科学研究所
... cience 第１回シンポジウム」として，公開シンポジ ウムが岡崎コンファレンスセンターで開催された。このシンポジウムでは， 天文学， 核融合科学， 基礎生物学， 生理学， 分子科学におけるイメージング関連研究に関する，機構内外の講師による１ ６件の講演，及び今後の分野間連携研究 に関する全体討論が行われた。参加者は機構外３ ６名，機構内１ ４ ...
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理化学研究所計算科学研究機構研究部門量子系分子科学研究チーム殿 hp170163: 有機半導体 有機分子発光材料の全自動探索シミュレーションシステムの開発 高度化支援作業 2017 年 9 6 ( R405 般財団法 度情報科学技術研究機構利 援部 1
... 対象モジュール： PWscf（pw.x） • 依頼内容 オープンソースの第一原理電子状態計算プログラムQuantum ESPRESSOの最新版v6.1のPWscfモ ジュール(pw.x)について、実行性能の阻害要因のひとつとなっている対角化計算に対して、EPLAライ ブラリ導入による高速化を行い、ライブラリ導入前の(ScaLAPACKを使用した)コードとELPAライブラリ ...
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自然科学研究機構分子科学研究所点検評価規則（3ページ） 分子研リポート2015 | 分子科学研究所
... 第４条 委員会は，委員長が招集し，その議長となる。 （点検評価委員会の任務） 第５条 委員会は，次に掲げる事項について企画，検討及び実施する。 一 自己点検・評価及び外部評価の基本⽅針に関すること。 二 自己点検・評価及び外部評価の実施に関すること。 ...
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自然科学研究機構分子科学研究所点検評価規則（3ページ） 分子研リポート2014 | 分子科学研究所
... 第４条 委員会は，委員長が招集し，その議長となる。 （点検評価委員会の任務） 第５条 委員会は，次に掲げる事項について企画，検討及び実施する。 一 自己点検・評価及び外部評価の基本方針に関すること。 二 自己点検・評価及び外部評価の実施に関すること。 ...
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自然科学研究機構分子科学研究所点検評価規則（3ページ） 分子研リポート2013 | 分子科学研究所
... 第４条 委員会は，委員長が招集し，その議長となる。 （点検評価委員会の任務） 第５条 委員会は，次に掲げる事項について企画，検討及び実施する。 一 自己点検・評価及び外部評価の基本方針に関すること。 二 自己点検・評価及び外部評価の実施に関すること。 ...
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