物質生命，計算機科学等
計算機生命科学の基礎II_
... • DNA binding, E-box binding, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific DNA binding, core promoter proximal region sequence-specific DNA binding, double-strande[r] ...
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電子計算機室 分子研リポート2003 | 分子科学研究所
... 超臨界流体は温度や圧力を制御することによって溶質の溶解度を可変とすることができ， 物質の分離抽出のための 溶媒として注目される一方で， 超臨界水などは安全で効率のよい化学反応溶媒としても興味を集めている。 この超 臨界流体の示す構造と動力学について大規模系に対する分子動力学シミュレーションを実施し， 臨界タンパク光の 発生に対応する強い小角散乱や臨界減速などを良好に再現した上で， 流体中に生成されるクラスターの構造と動力 ...
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電子計算機室 分子研リポート2000 | 分子科学研究所
... b) 大気環境化学に関連する素反応の理論的研究 ： フッ化炭化水素 （HF C ） またはフッ素化エーテル類とOHラジカルと の反応は， フロンの地球温暖化への影響等に関与する大気化学における重要な素反応である。 高精度の非経験的分 子軌道計算によりメタン系及びエタン系 HF C ， フッ素化エーテル類と OH との反応経路を決定し， 変分的遷移状態 理論により反応速度定数求めた。 ...
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電子計算機室 分子研リポート2001 | 分子科学研究所
... d) 生体膜とそれを横切る物質透過の分子動力学シミュレーション e) タンパク質の機械的一分子操作の計算機シミュレーション A -3) 研究活動の概略と主な成果 a) 分子振動緩和など， 溶液中における溶質の状態間遷移を含む量子動力学を取り扱うことのできる計算機シミュレー ション手法の開発を進めている。 これまですでに， ...
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電子計算機室 分子研リポート2002 | 分子科学研究所
... A -2) 研究課題： a) 溶液中における溶質分子振動量子動力学の計算機シミュレーション b) 量子液体とその中での溶媒和に関する理論的研究 c) 生体膜とそれを横切る物質透過の分子動力学シミュレーション d) タンパク質の機械的一分子操作の計算機シミュレーション e) 水溶液中における溶質分子の平均力とメモリー解析 f) 超臨界流体の構造と動力学 ...
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講義資料 計算生命科学の基礎Ⅳ （→終了しました） | 計算科学教育センター
... III-1. 酸素運搬タンパク質ヘムエリスリン III-2. 光合成反応中心のスペシャルペア IV. 生体高分子生化学的機能解析のための分子計算技術の開発 IV-1. 半経験的分子軌道法によるQM部分の高速化 ...
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電子計算機センター 分子研リポート1998 | 分子科学研究所
... )状態を経た解離過程では基底状態との非断熱遷移が， 解離生成物 （C O） の 回転分布を説明する上で重要な役割を果たしていることを見出した。しかしながら，実験的にブロードな吸収が 得られている吸収帯に対応する理論計算は吸収スペクトルに鋭い構造を予測した。 振動励起した初期状態からの 光解離過程について新たに波束計算を行った結果， 零点振動準位 （0,0 ...
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座談会 HPCI 戦略プログラム分野 1 特別座談会 予測する生命科学 医療および創薬基盤 の 5 年間を振り返る生命科学の新たな時代を切り拓いた計算生命科学 京 を中核とする日本の高性能計算基盤 (HPCI) を活用して 生命科学分野で世界最高水準の研究成果を達成することを目指し 2011 年度か
... でどのような成果を達成してきたで しょうか。 木寺 4課題それぞれに、少しずつ違っ た意味の成果が出ています。ISLiMで は、まずはソフトウェア開発が必要 だといいながら、実際に要求されたの は、生命科学にとって意味のある成果 でした。当時求められた最も大きな 課題は、生命科学における階層接続 でした。生命には、分子から細胞・臓 器・全身という空間的に小さなもの ...
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電子計算機センター 現状と将来構想 分子研リポート1999 | 分子科学研究所
... 岡崎国立共同研究機構分子 科学研究所電子計算機センター（以下「センター」という）は，センターの大型電子計算機システムを分子科学の大 型計算等のために分子科学研究所内外の研究者の利用に供するとともに，これに必要な研究開発を行い，かつ，岡崎 ...
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東京大学医科学研究所 The Institute of Medical Science, The University of Tokyo ポスト 個別化 京 重点課題 (2 ) 予防医療を支援する統合計算生命科学 ポスト 京 重点課題 2 個別化 予防医療を支援する統合計算生命科学 がん細胞が免疫か
... 発 機 構 （ AMED ） の 「 革 新 的 が ん 医 療 実 用 化 研 究 事 業 （ 15Ack0106014h0002 ） 」 、 科 学 研 究 費 助 成 事 業 新 学 術 領 域 研 究 （ 22134006, 15H05909）、文部科学省 HPCI 戦略プログラム 分野１「予測する生命科学・医療および創 ...
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計算機センター Vol 研究報告 リモートアクセス環境の構築と運用に関する研究 学習院大学計算機センター村上登志男学習院大学計算機センター磯上貞雄国立情報学研究所コンテンツ科学研究系孟洋学習院大学計算機センター城所弘泰 研究目的現在では 電子メールサービスをはじめとする情報センター
... さまざまな端末が利用できるようになったことで、いつでもどこでも管理できるような環境が整 いつつあるがどのように運用するかが今後の課題となろう。 仮想デスクトップ環境 一般ユーザーの利用を想定し、特定の端末へのリモートデスクトップ接続ではなく仮想デスク トップ環境（VDI）を用意した。VDI には、VMWare 社の VMWare View、Citrix 社の VDI-in-a- box、Microsoft ...
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つくばリポジトリ H19 計算生命分野
... 6. tRNA 依存性 基転移酵素 け ンモ 分子輸送機構の動力学的解析 , 畔柳成秀，仲 田 ゆ ，萩原陽介，舘 賢 , 第７回蛋白質科学会年会 , 仙台 , 2007.5.24. 7. tRNA 合成酵素の触媒反応機構の計算科学的解析 , 萩原陽介， エ ウ ， 深井周也， 濡木理，舘 賢 , 科学研究費補助金特定領域研究 生体超分子構造 第三回ワ ョップ , 熱 ...
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電子計算機センター 分子研リポート1999 | 分子科学研究所
... M 計算の結果を比較することにより， 単分子解離 反応の解離速度が非統計的な挙動を示す起源を調べた。 b) 大気環境化学に関連する素反応の理論的研究：フッ化炭化水素（HF C ）またはフッ素化エーテル類と OH ラジカ ルとの反応は，フロンの地球温暖化への影響等に関与する大気化学における重要な素反応である。高精度の非経 験的分子軌道計算によりメタン系及びエタン系 HF C ，フッ素化エーテル類と ...
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電子計算機センター将来計画 分子研リポート1998 | 分子科学研究所
... 一方， 計算機の発展に密着しベクトル並列型， 超 並列及び分散共有メモリの並列計算機などの新しいアーキテクチャの計算機の能力をフルに活用するためのスタッフ も重要であり，分子科学計算アルゴリズムの開拓や，計算機アーキテクチャの特徴を生かした分子シミュレーション ...
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上原記念生命科学財団研究報告集, 34 (2020) 上原記念生命科学財団研究報告集, 34(2020) 132. 翻訳停滞解消を阻害する薬剤の探索と作用機序の解明 栗田大輔 弘前大学農学生命科学部分子生命科学科 Key words: リボソーム, 翻訳,YaeJ, 抗生物質, リボソームレスキュー
... に結合し、アミノアシル tRNA 結合後のリボソームの状態を安定化することにより、コドンの誤読を引き起こす［3］。 注意すべき点は、どちらも翻訳のミスリーディングを起こす薬剤であるが、その作用メカニズムが異なることである。 2012 年に報告された高度好熱菌リボソームと大腸菌 YaeJ 複合体の結晶構造によると、YaeJ はリボソームの A サイト （アミノアシル tRNA ...
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講義資料 計算生命科学の基礎Ⅳ （→終了しました） | 計算科学教育センター
... 創薬等支援技術基盤プラットフォーム http://pford.jp/p4d/sac1/analysis.html 相関構造解析(correlated structure analysis) 1) 様々な実験＋理論手法からのデータを総合して生体超分子の構造・ダイナミク ス・機能を解析する研究を、 相関構造解析(correlated structure analysis また は Hybrid/Integrated ...
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建築学科 建築学 47 電気電子工学 50 電気情報工学科 電子通信工学 52 計算機工学 54 化学プロセス生命工学化学プロセス生命工学 56 物質科学工学科 応用化学応用化学 58 工学部 材料科学工学工学材料科学工学 60 建設都市工学建設都市工学 62 地球環境工学科 船舶海洋システム工学船
... 【臨床科学科】 必修科目 選択科目 実習科目 １．知識・理解について ・化学系薬学、物理系薬学、生物系薬学及び医療系薬学を基盤とした幅広い 知識を理解し、論理的に思考できる。 化学系薬学 物理系薬学 生物系薬学 医療系薬学 ・医薬品の適正使用を推進するため、服薬指導・薬歴管理・リスクマネジメ ント・安全な薬物療法の提供など、薬剤師としての知識を理解している。 ・治験に関[r] ...
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建築学科 建築学 47 電気電子工学 50 電気情報工学科 電子通信工学 52 計算機工学 54 化学プロセス 生命工学化学プロセス 生命工学 56 物質科学工学科 応用化学応用化学 58 工学部 材料科学工学工学材料科学工学 60 建設都市工学建設都市工学 62 地球環境工学科 船舶海洋システム工
... 卒業論文 自由選択科目 講 義 演習・講読・実習・実験 （３６単位） 基幹教育セミナー 課題協学科目 言語文化科目 言語文化基礎科目 （第１外国語・第２外国語） 文系ディシプリン科目 理系ディシプリン科目 健康・スポーツ科学科目 高年次基幹教育科目 総合科目 ...
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筑波大学大学院_理工情報生命学術院_数理物質科学研究群・数理物質系パンフレット
... extreme ultra violet, laser, micromachining 吉田 昭二：准教授 YOSHIDA Shoji 一つ一つの分子や原子を観察し操作する事が可能な「走査 プローブ顕微鏡」と、フェムト秒の時間分解能を持つ「量子 光学の技術」を組み合わせることで、これまでにない新し い技術を開発したり、ナノスケールでの物性研究、表面科 学、分子科学、新機能材料・素子開発のための研究を行う Our ...
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において 特定電子計算機 が客体としておかれている 特定電子計算機 については 法 2 条 1 項の中で 電気通信回線に接続している電子計算機 とされている 電気通信回線とは インターネット等のネットワーク回線であり 電子計算機は コンピュータをいう したがって 特定電子計算機は ネットワーク回線に
... USB 等を用いて当該コンピュータに感染させた者は、当該コン ピュータ管理者の、当該コンピュータの正当な権限に基づく利用行為を通じて Stuxnet をサーバーに侵入させたと評価することができる。この際、侵入の態様について、管 理者は自己の識別符号を用いる等してサーバーにアクセスしたものといえるが、 Stuxnet は、この管理者の行為に影響されず、自らサーバーの脆弱性を利用して侵入す ...
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