創薬における計算生命科学
創薬の非臨床段階における ヒト腸管薬物代謝予測法の開発 筑波大学大学院生命環境科学研究科生命産業科学専攻博士 ( 生物工学 ) 学位論文 門野啓太郎
... はアステラス製 薬により合成されたものを使用した。Dormicam (5 mg/mL ミダゾラム注射 溶液) および Prograf (5 mg/mL タクロリムス注射溶液) はアステラス製薬 より提供されたものを使用した。Sandimmun (50 mg/mL サイクロスポリン 注 射 溶 液 ) は ノ バ ル テ ィ ス 製 薬 よ り 購 入 し た も の を 使 用 し た 。 ...
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ラクオリア創薬株式会社と 名古屋大学トランスフォーマティブ生命分子研究所の共同研究開始のお知らせ－体内時計のリズムを調節する新薬の創出を目指して－
... 一方、 ITbM は 2012 年 10 月に文部科学省の世界トップレベル研究拠点プログラム （ WPI ） に 採択され、名古屋大学に設立された国際研究所です。 WPI は、日本の優れた頭脳と得意分野 のもとに、 世界的な研究者が集まる研究環境を整備し、 国際的な知の拠点を形成することを 目的とした研究支援プログラムです。 ITbM では、 拠点長の伊丹教授を中心に、 世界屈指の分 ...
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PDFファイル 1G3 「生命科学における知識共有」
... い 生 物 表 現 型 個 々 独 立 現 く 相互 深く関係 い 事 意味 い 例え 個体 生物 示 様々 表現型 盤 分子 ニ 通 互 い 関 係 生 物 種 間 分 子 進 化 的 関係 通 互い 関連 い 生態系 い 生物 士 相互作用や 環境応答 通 関係 い 遺 伝 子 多 型 薬 物 応 答 個 人 差 生 出 う 遺 伝 因 子 環 境 因 子 組 わ 表 現 型 い 理 解 ...
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PDFファイル 1G3 「生命科学における知識共有」
... 概念間で関連す るものをリストア ップするた めに， 相関の強さ を調 べ た ． 各 概 念 ペ ア を毎 にそ の概 念 を 付 与 さ れ た 遺 伝 子 数 に 基 づ き ， 図 １ のよ う な 分 割 表 を 作 成 し て ， 概 念 の 独 立 検 定 を Fisher exact test （両側）で P 値を計算する． Bonferroni の多重 検定で５ ％以 下のペア を有 意に相関 があると ...
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PDFファイル 1G3 「生命科学における知識共有」
... RDF 公開 開始 2011 年 タン 質立 体構造 DB あ PDB RDF 化 2013 年 欧 ン 研 究 所 EBI 生 物 学 セ 計算機 収集 DB あ BioModels 実 験 使 サン 関 DB あ Biosamples 薬 生物 活 性 DB あ ChEMBL 遺 伝 子 発 現情 報 DB あ ExpressioAtlas 子 DB あ Reactome 5 ...
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1. 医薬品創出の基盤強化に向けて 2015 年度までの達成目標 相談 シーズ評価 400 件 有望シーズへの創薬支援 40 件 企業への導出 ( ライセンスアウト ) 1 件 < 創薬支援ネットワーク等の支援基盤 > 創薬支援ネットワーク : 創薬支援ネットワーク協議会 実務担当者会議による強固な
... 厚生労働省、文部科学省の連携による革新的医薬品等の創出と感染症対策の強化 新型インフルエンザ等の感染症から国民及び世界の人々を守るため、感染症に関する国内外での研究を厚生労働省と文部科学省が連携して 推進するとともに、その成果をより効率的・効果的に治療薬・診断薬・ワクチンの開発等につなげることで、感染症対策を強化する。 ８．新興・再興感染症制御プロジェクト ...
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博士論文 含窒素複素環式カルベン 触媒を用いる反応の開発 2013 京都大学大学院薬学研究科創薬科学専攻 鍬野哲
... そこで、NHC－HOBt 部分構造水素結合複合体及び NHC－H 2 O 水素結合複 合体の DFT 計算を行い、同様の評価を行った（Figure 10）。NHC－HOBt 部分 構造水素結合複合体の C－H 結合長は 1.64 Å、NHC－H 2 O 水素結合複合体の C － H 結合長は 1.99 Å であり、また複合体形成による安定化は NHC－HOBt 部 分構造水素結合複合体の方が NHC－H 2 O ...
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細胞周期 M 期開始における リン酸化 ATF7 の役割 2015 年 千葉大学大学院医学薬学府先端生命科学専攻 分子細胞生物学研究室 長谷川仁美
... 次に、M 期で見られる ATF7 のリン酸化が細胞周期進行に関与するかどうかを解析 する為に、DTB で ATF7-wt 又は ATF7-TA 誘導発現細胞を同調し、チミジンを除いて 細胞周期を再開させ、その後の細胞周期進行の様子を Facs で解析した。Dox はチミジ ンを除く時に添加した。PI を用いて DNA のピークを解析し、抗ヒストン H3 Ser-10 抗体で細胞を染色し、染色された細胞を M ...
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東京大学医科学研究所 The Institute of Medical Science, The University of Tokyo ポスト 個別化 京 重点課題 (2 ) 予防医療を支援する統合計算生命科学 ポスト 京 重点課題 2 個別化 予防医療を支援する統合計算生命科学 がん細胞が免疫か
... 図 1: がん細胞の免疫回避の仕組みと免疫チェックポイント阻害剤の標的 しかし、問題点もあります。免疫チェックポイント阻害薬は特定のがん種では極めて高い奏 功率が得られますが、他のがん種では、効果の得られる患者の割合が大変低く、同治療の 費用が極めて高額に及ぶことを考えると、こうしたがん種についてはすべての患者に投与す ることが困難です。従って、治療効果を予測する優れたマーカーを開発することにより、例え ...
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アカデミア研究者のための 創薬分野における Translational Research の専門用語ハンドブック TECHNICAL TERMS HANDBOOK Ver. 1.0
... TECHNICAL TERMS HANDBOOK 基礎医学研究では医学領域における根源的な生物学的課題に取り組む事が多く、「真 実を探求する」科学者としての強い動機と、その成果を一流の国際雑誌へ論文を発表 するというアウトプットの評価で成立している。一方で昨今の医薬品市場の変化によ り、製薬企業はその研究開発の進め方を大きく変更しており、多くの大手製薬企業が ...
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21世紀の生命科学におけるRNA研究のインパクト
... １ はじめに 東京都臨床医学総合研究所（現東京都医学総合研究所）にて、当時ゲノムが 同定されて間もない C 型肝炎ウイルスの研究プロジェクトが開始されるとい うので、故野本明男先生から手紙を頂いたのを機会に、米国 NIH（米国国立 衛生研究所）の留学生活をきりあげ 1992 年の秋に帰国した。C 型肝炎ウイル スは重篤な病気を引き起こすウイルスであるのに加え、そのゲノムは一本鎖 の RNA ...
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数学と計算機科学の相互作用：計算代数とHaskellにおける安全性と拡張性
... 各テーマの内容および著者による研究成果は以下の通りである。 1) の研究テーマでは、純粋関数型言語における「副作用」を伴う機能の合成を取り上げている。一般の 手続き型プログラム言語が、入力されたデータを操作する命令の列を主体にしてプログラムを組むのに対 し、関数型プログラミング言語では、入力されたデータに対し、関数の適用を組み合わせることによってプ ...
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GROMACS-Viewer 利用者マニュアル 平成 26 年 3 月 独立行政法人理化学研究所 HPCI 計算生命科学推進プログラム
... 分子鎖ごとに色を変える color chain ２次構造ごとに色を変える color structure 詳細は jV のマニュアル http://pdbj.org/jv/manual/color_ja.html を参照してください。 本アプリケーションでは独自に dssp 配色を定義しています。4.5 節の内容に沿って Gromacs の DSSP 計算結果を読み込んだ場合、そこに記述されている配色を使用すること ...
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計算生命MD講義資料.pptx
... （ Ab-iniAo構造解析の図は昭和薬科大学 穴見康昭さんよりご提供いただいた。） ○ GASBORで計算したAb-iniKoモデルと結晶構造の比較 ・アポ体の溶液構造と Agonist複合体結晶構造 （ PDB id: 2ZLC） との比較 ...
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つくばリポジトリ H19 計算生命分野
... 14. 生体高分子の分子動力学計算 , 舘 賢 , 計算 ュ ョンと分析 解析 日本表面科学 会編 , 丸善出版 , 21 (2007). 15. RNA 酵素反応の機構 --- 子力学 基づく ュ ョン 創 子構造生物学 への 序 , 舘 賢， エ ウ , 化学と工業 日本化学会 , 60, 587 (2007). ...
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『ラクオリア創薬』 企業調査レポート｜サービス紹介｜FISCO
... 同社は 2018 年 2 月 20 日付リリースで、名古屋大学初の産学協同研究センター「ラクオリア創薬産学協同研究 センター」の設置を発表した。同社は 2014 年 4 月に名古屋大学環境医学研究所内に産学協同研究部門「薬効 解析部門」を設置したのを皮切りに、2015 年 2 月に産学協同研究講座「薬剤科学・分析化学講座」と「新薬創 成化学講座」の設置契約を締結し、同年 8 ...
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非破壊 迅速 低コスト に ips 細胞の状態を評価できる品質管理技術を開発 名古屋大学大学院創薬科学研究科 ( 研究科長 : 人見清隆 ) 基盤創薬学専攻創薬生物科学講座細胞分子情報学分野の加藤竜司 ( かとうりゅうじ ) 准教授 国立研究開発法人医薬基盤 健康 栄養研究所ヒト幹細胞応用開発室の古
... 【ポイント】 ・自動化された細胞の培養観察装置、細胞画像処理技術、大量の画像から得られる細胞形状デ ータのバイオインフォマティクス解析を組み合わせることで、「非破壊」･「迅速」･「低コ スト」に iPS 細胞などのヒト多能性幹細胞の培養工程における画像評価によるリアルタイム の品質管理技術を開発。 ...
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( 様式 10) 16am j0005 平成 29 年 5 月 31 日 平成 28 年度医療研究開発推進事業費補助金 ( 生命動態システム科学推進拠点事業 ) 補助事業成果報告書 I. 基本情報 事業名 : 創薬等ライフサイエンス研究支援基盤事業 ( 生命動態システム科学推進拠点事業
... 64. A homeotic transformation in neural crest-specific Dlx5-overexpressing mice. 神経堤細胞特 異的 Dlx5過剰発現マウスにおける顎顔面のトランスフォーメーション, ポスター, Miki Shimizu, Taro Kitazawa, Yumiko Kawamura, Nicolas Narboux-Nême, Giovanni Levi, ...
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講義資料 計算生命科学の基礎Ⅳ （→終了しました） | 計算科学教育センター
... III-1. 酸素運搬タンパク質ヘムエリスリン III-2. 光合成反応中心のスペシャルペア IV. 生体高分子生化学的機能解析のための分子計算技術の開発 IV-1. 半経験的分子軌道法によるQM部分の高速化 ...
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講義資料 計算生命科学の基礎Ⅳ （→終了しました） | 計算科学教育センター
... 1) 核膜孔複合体は核<->細胞質の高分子輸送を制御し、細胞内のタンパク質局在の管理に重要。分子量 120MDa、約30の異なるタンパク質からなる超分子で、実験的構造解析は極めて困難である。 2) そこで、実験(超遠心..結合 アッセイ..構造解析)から計算機解析( インフォマティクス)までを統合して 、 一つの複合体構造を決定(予測)する。 ...
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