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分子向けの分子計算法、高速計算法、高精度分子計算法の

理論・計算分子科学研究領域

理論・計算分子科学研究領域

... F 計算を実現した。本研究では,密度行列繰り込み群を出発して動的電子相関を二次摂動論から効率よく見積もる DMR G-C A SPT 2(C omplete-A ctive-Space Second-order Perturbation T heory)を開発した。C A SPT 2 は,オリジナル には R oos ...

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理論・計算分子科学研究領域

理論・計算分子科学研究領域

... T ) 」基礎 理論を確立した。C T は,Hami l toni an を指数型多体演算子でユニタリー変換を行い,強い相関と弱い相関と 相互作用構造を有効ハミルトニアン H = e –A He A として構築する。特徴的な点として,複雑な強い相関構造は, ...

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理論・計算分子科学研究領域

理論・計算分子科学研究領域

... 本研究分野は量子力学,統計力学,分子シミュレーションを中心とした分子科学分野理論・方法論を基礎として, 分子およびその集合体構造,物性,化学反応,相転移,ダイナミクスなど物質が示す様々な現象を電子・原子レベ ルから理論的に考究する学術分野であり,計算機科学発展とも相俟って,現在,急速にその重要性に対する認識が ...

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計算科学研究センターの現状と今後 分子研リポート2003 | 分子科学研究所

計算科学研究センターの現状と今後 分子研リポート2003 | 分子科学研究所

... 大規模計算ため環境整備 高速パソコンクラスター普及などに伴って,計算科学研究センターへ期待と役割が最近変化してきている。こ ために,利用者意見を広く集めて,魅力ある中核計算センターとしてさらに大きく発展するために,8月 2 5 日か ...

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電子計算機センター将来計画 分子研リポート1998 | 分子科学研究所

電子計算機センター将来計画 分子研リポート1998 | 分子科学研究所

... 欧米では,計算機アーキテクチャ研究を専門とする分野はもちろんこと,科学計算分野においても単体 C PU 性 能向上に頼る時代は終わり,基本ソフトウエアと高速通信技術における並列計算技術発展に将来大規模計算環 ...

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計算科学研究センターの将来構想 分子研リポート2001 | 分子科学研究所

計算科学研究センターの将来構想 分子研リポート2001 | 分子科学研究所

... 将来計画及び運営方針 255 「センター」ではこれら発展をふまえて,上記5研究所が連携した「ナノサイエンス」を主題とする新しい「計算 科学」プロジェクトを国に提案する方向で検討を開始した。現在,いわゆる「ナノテクノロジー」という言葉から想 像されるは,L S I 加工技術や記憶媒体高密度化など計算機製造にまつわる工学研究である。また,化学における ...

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計算科学研究センター 分子研リポート2006 | 分子科学研究所

計算科学研究センター 分子研リポート2006 | 分子科学研究所

... 将来計画及び運営方針 285 ブ作業領域として提供され,実効容量 104 T B および総理論読み出し性能 12 G B /s を有するディスク I /O を実現する。 本サブシステムは大容量(最大 6 T B )共有メモリおよび超高速ディスク I/O に特徴をもち,大規模で精度な量子 化学計算を可能とする。 ...

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計算科学研究センター(3ページ) 分子研リポート2011 | 分子科学研究所

計算科学研究センター(3ページ) 分子研リポート2011 | 分子科学研究所

... /s バンド幅で演算ノード間が相互接続され,大規模な分子動力学計算などノードをまたがる並列ジョブを 高速で実行することができる。特に後者においては,v S M P を導入することで複数ノードを仮想的に 1 ノード共有 メモリシステムとして運用できる機構を有する。UV 1000 は ...B 容量外部磁気ディスクを 共有し,NF S ...

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計算科学研究センター 分子研リポート2004 | 分子科学研究所

計算科学研究センター 分子研リポート2004 | 分子科学研究所

... 314 将来計画及び運営方針 るため C PU から主記憶へアクセス速度が非等価ではあるが, 利用者プログラムから大容量メモリを容易に利用す ることができるので,大規模な並列ジョブ実行が可能となる。高速シミュレーションシステム日立製 S R 8000 は, 主に機構内における利用を目的として運用されている。 ...

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計算科学研究センター(3ページ) 分子研リポート2012 | 分子科学研究所

計算科学研究センター(3ページ) 分子研リポート2012 | 分子科学研究所

... P 導入により複数ノードを仮想的に 1 ノード 巨大共有メモリシステムとして運用できることである。しかも,ジョブ毎にこの制御が可能である。また 32 ノード には,NV ID IA 社製 G PG ...B 容量外部磁 気ディスクを共有し, NF S より高速なパラレル NF S が使用できる。PR IME HPC .../32GB ...

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理論・計算分子科学研究領域

理論・計算分子科学研究領域

... T ) 」基礎理論を確立 した。C T は,H ami l toni an を指数型多体演算子でユニタリー変換を行い,強い相関と弱い相関と相互作用 構造を有効ハミルトニアン H = e –A He A として構築する。特徴的な点として,複雑な強い相関構造は,対応する密 度行列を通して取り扱われるため, ...

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理論・計算分子科学研究領域

理論・計算分子科学研究領域

... F 開発 c). 共役有機化合物(ジフェニルポリエン,ポリカルベン)電子状態,多重スピン状態解析 A ...T ) 」基礎理論を確立した。C T は, H ami l toni an を指数型多体演算子でユニタリー変換を行い,強い相関と弱い相関と相互作用構造を有効ハミルト ニアン ...

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電子計算機室 分子研リポート2002 | 分子科学研究所

電子計算機室 分子研リポート2002 | 分子科学研究所

... e) ミセルや二重層膜に代表されるような水溶液中における溶質分子集団的な自発的構造形成に対するシミュレー ション手法を確立することを目的として, 溶質分子にかかる平均力やメモリーについて解析を行っている。 特に 前者については, 水中で自由エネルギー解析に対応し, 充分な精度を得るために大規模計算を行っている。 同時に, ...

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理論・計算分子科学研究領域

理論・計算分子科学研究領域

... 未だ大きな隔たりがあることも事実である。この溝を埋めるためには,機能性発現メカニズム解明を行い,任意 機能性を物質に付加する方法を見出す必要がある。我々は,ナノ構造体における機能性発現には光誘起電子ダイ ナミクスが極めて重要な鍵を握ると考える。本研究課題では,ナノ構造体における実時間・実空間電子・電磁場ダ ...

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理論・計算分子科学研究領域

理論・計算分子科学研究領域

... など分光実験と他実験事実と 相補的解析により様々な考察がなされてきたが,複数同種金属が存在する事によりスペクトルが複雑になりその同 定には曖昧さが残る。よって多配置理論を用いた量子化学計算により任意構造における M n イオン個々酸化状 態決定を行う。また,2 0 1 1年に光合成系 I I ...

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理論・計算分子科学研究領域

理論・計算分子科学研究領域

... ISM 計算速度は大量(10 万規模)薬剤候補化合物を短時間にスクリーニングす るほど高くはない。 (K - computer を全ノード使えば,1 万化合物スクリーニングをおそらく 1時間以内に終了するこ とができると思われる。 )従来ワークステーションように誰でもアクセスできる高性能マシンで性能を発揮する 3D - R I ...

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理論・計算分子科学研究領域

理論・計算分子科学研究領域

... 物理は,原子間スケールで擬縮退した電子状態に由来する強い電子相関効果であり,この相関効果問題複雑さは 分子サイズに対して指数関数的に複雑化し,既存量子化学計算ではこの現象を効率よく精度計算することが ...

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理論・計算分子科学研究領域

理論・計算分子科学研究領域

... 表面・界面で起こる新しいダイナミクス機構解明とその機構に基づく新規量子デバイス設計へ向けた基礎的知見 獲得を最終的な目標として研究を進めている。これまで開発してきた時間依存密度汎関数理論に基づく電子ダイ ナミクス計算プログラムを用いて,最近,我々は近接場光局所電子励起によって,銀ナノクラスターに力を発生す ることができ, ...

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計算科学研究センター 分子研リポート2004 | 分子科学研究所

計算科学研究センター 分子研リポート2004 | 分子科学研究所

... (2)計算科学は実験科学側面を有する 計算科学はコンピュータを実験装置とした実験科学でもある。このことは以下ことを意味する。まず,最先端 コンピュータ(実験装置)群が不可欠である。このコンピュータ群には高速演算可能な計算機もあれば,並列計算を ...

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計算分子科学研究系

計算分子科学研究系

... b) 量子-古典混合系近似に基づいて,水溶液中における分子内プロトン移動量子動力学シミュレーションによる検 討を進めている。 状態間デコヒーレンス速い系を有効に記述し得るサーフィスホッピング枠組み中で, シミュ レーションに用いられる運動方程式に関して,前年透熱表示に引き続き,今年度は断熱表示による書き下し等方 ...

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