Top PDF 分子向けの分子計算法、高速計算法、高精度分子計算法の

理論・計算分子科学研究領域

... F 計算を実現した。本研究では，密度行列繰り込み群を出発して動的電子相関を二次の摂動論から効率よく見積もる DMR G-C A SPT 2（C omplete-A ctive-Space Second-order Perturbation T heory）法を開発した。C A SPT 2 法は，オリジナルには R oos ...

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理論・計算分子科学研究領域

... T 法）」の基礎理論を確立した。C T 法は，Hami l toni an を指数型の多体演算子でユニタリー変換を行い，強い相関と弱い相関との相互作用の構造を有効ハミルトニアン H = e –A He A として構築する。特徴的な点として，複雑な強い相関の構造は， ...

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理論・計算分子科学研究領域

... 本研究分野は量子力学，統計力学，分子シミュレーションを中心とした分子科学分野の理論・方法論を基礎として，分子およびその集合体の構造，物性，化学反応，相転移，ダイナミクスなど物質が示す様々な現象を電子・原子レベルから理論的に考究する学術分野であり，計算機科学の発展とも相俟って，現在，急速にその重要性に対する認識が ...

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計算科学研究センターの現状と今後分子研リポート2003 | 分子科学研究所

... 大規模計算のための環境整備高速パソコンクラスターの普及などに伴って，計算科学研究センターへの期待と役割が最近変化してきている。このために，利用者の意見を広く集めて，魅力ある中核計算センターとしてさらに大きく発展するために，８月２５日か ...

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電子計算機センター将来計画分子研リポート1998 | 分子科学研究所

... 欧米では，計算機アーキテクチャの研究を専門とする分野はもちろんのこと，科学計算分野においても単体 C PU 性能の向上に頼る時代は終わり，基本ソフトウエアと高速通信技術における並列計算技術の発展に将来の大規模計算環 ...

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計算科学研究センターの将来構想分子研リポート2001 | 分子科学研究所

... 将来計画及び運営方針 255 「センター」ではこれらの発展をふまえて，上記５研究所が連携した「ナノサイエンス」を主題とする新しい「計算科学」プロジェクトを国に提案する方向で検討を開始した。現在，いわゆる「ナノテクノロジー」という言葉から想像されるのは，L S I 加工技術や記憶媒体の高密度化など計算機製造にまつわる工学研究である。また，化学における ...

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計算科学研究センター分子研リポート2006 | 分子科学研究所

... 将来計画及び運営方針　285 ブ作業領域として提供され，実効容量 104 T B および総理論読み出し性能 12 G B /s を有するディスク I /O を実現する。本サブシステムは大容量（最大 6 T B ）の共有メモリおよび超高速ディスク I/O に特徴をもち，大規模で高精度な量子化学計算を可能とする。 ...

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計算科学研究センター（3ページ）分子研リポート2011 | 分子科学研究所

... /s のバンド幅で演算ノード間が相互接続され，大規模な分子動力学計算などノードをまたがる並列ジョブを高速で実行することができる。特に後者においては，v S M P を導入することで複数ノードを仮想的に 1 ノードの共有メモリシステムとして運用できる機構を有する。UV 1000 は ...B の容量の外部磁気ディスクを共有し，NF S ...

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計算科学研究センター分子研リポート2004 | 分子科学研究所

... 314 将来計画及び運営方針るため C PU から主記憶へのアクセス速度が非等価ではあるが，利用者プログラムから大容量のメモリを容易に利用することができるので，大規模な並列ジョブの実行が可能となる。高速シミュレーションシステムの日立製 S R 8000 は，主に機構内における利用を目的として運用されている。 ...

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計算科学研究センター（3ページ）分子研リポート2012 | 分子科学研究所

... P の導入により複数ノードを仮想的に 1 ノードの巨大共有メモリシステムとして運用できることである。しかも，ジョブ毎にこの制御が可能である。また 32 ノードには，NV ID IA 社製の G PG ...B の容量の外部磁気ディスクを共有し， NF S より高速なパラレル NF S が使用できる。PR IME HPC .../32GB ...

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理論・計算分子科学研究領域

... T 法）」の基礎理論を確立した。C T 法は，H ami l toni an を指数型の多体演算子でユニタリー変換を行い，強い相関と弱い相関との相互作用の構造を有効ハミルトニアン H = e –A He A として構築する。特徴的な点として，複雑な強い相関の構造は，対応する密度行列を通して取り扱われるため， ...

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理論・計算分子科学研究領域

... F 法の開発 c). 共役有機化合物（ジフェニルポリエン，ポリカルベン）の電子状態，多重スピン状態の解析 A ...T 法）」の基礎理論を確立した。C T 法は， H ami l toni an を指数型の多体演算子でユニタリー変換を行い，強い相関と弱い相関との相互作用の構造を有効ハミルトニアン ...

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電子計算機室分子研リポート2002 | 分子科学研究所

... e) ミセルや二重層膜に代表されるような水溶液中における溶質分子の集団的な自発的構造形成に対するシミュレーション手法を確立することを目的として，溶質分子にかかる平均力やメモリーについての解析を行っている。特に前者については，水中での自由エネルギー解析に対応し，充分な精度を得るために大規模計算を行っている。同時に， ...

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理論・計算分子科学研究領域

... 未だ大きな隔たりがあることも事実である。この溝を埋めるためには，機能性発現のメカニズムの解明を行い，任意の機能性を物質に付加する方法を見出す必要がある。我々は，ナノ構造体における機能性発現には光誘起電子ダイナミクスが極めて重要な鍵を握ると考える。本研究課題では，ナノ構造体における実時間・実空間電子・電磁場ダ ...

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理論・計算分子科学研究領域

... などの分光実験と他の実験事実との相補的解析により様々な考察がなされてきたが，複数の同種金属が存在する事によりスペクトルが複雑になりその同定には曖昧さが残る。よって多配置理論を用いた量子化学計算により任意の構造における M n イオンの個々の酸化状態の決定を行う。また，２０１１年に光合成系 I I ...

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理論・計算分子科学研究領域

... ISM の計算速度は大量（10 万規模）の薬剤候補化合物を短時間にスクリーニングするほど高くはない。（K - computer を全ノード使えば，1 万の化合物のスクリーニングをおそらく１時間以内に終了することができると思われる。）従来のワークステーションのように誰でもアクセスできる高性能マシンで性能を発揮する 3D - R I ...

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理論・計算分子科学研究領域

... 物理は，原子間スケールで擬縮退した電子状態に由来する強い電子相関効果であり，この相関効果の問題の複雑さは分子サイズに対して指数関数的に複雑化し，既存の量子化学計算法ではこの現象を効率よく高精度で計算することが ...

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理論・計算分子科学研究領域

... 表面・界面で起こる新しいダイナミクスの機構解明とその機構に基づく新規量子デバイス設計へ向けた基礎的知見の獲得を最終的な目標として研究を進めている。これまで開発してきた時間依存密度汎関数理論に基づく電子ダイナミクス法計算プログラムを用いて，最近，我々は近接場光局所電子励起によって，銀ナノクラスターに力を発生することができ， ...

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計算科学研究センター分子研リポート2004 | 分子科学研究所

... （２）計算科学は実験科学の側面を有する計算科学はコンピュータを実験装置とした実験科学でもある。このことは以下のことを意味する。まず，最先端のコンピュータ（実験装置）群が不可欠である。このコンピュータ群には高速演算可能な計算機もあれば，並列計算を ...

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計算分子科学研究系

... b) 量子－古典混合系近似に基づいて，水溶液中における分子内プロトン移動の量子動力学シミュレーションによる検討を進めている。状態間デコヒーレンスの速い系を有効に記述し得るサーフィスホッピングの枠組みの中で，シミュレーションに用いられる運動方程式に関して，前年の透熱表示に引き続き，今年度は断熱表示による書き下し等方 ...

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