Winmostar™ ご紹介
https://winmostar.com/
http://x-ability.co.jp/wm4u.pdf
株式会社クロスアビリティ
X-Ability Co.,Ltd.
[email protected]
Winmostar™とは?
Winmostar
TM
は、分子モデリングから
量子化学計算
・
分子動力学
計算・
固体物理計算
の実行、および計算結果の表示・可視化まで
をPC上で実現するソフトウェアです。
Winmostar™の機能
モデリング・可視化等の基本機能に以下が加わっています。
• ポリマービルダ(モノマー登録、ポリマービルダ、ポリマーセルビルダ)
• 界面ビルダ
• 結晶ビルダ、表面切り出し、スラブ作成(真空層挿入)
• 点群解析(対称化および非対称単位抽出)
• Balloonを活用した簡易配座探索
• SMILESによる分子構造入力
• 分子表面積/体積、アスペクト比算出
• Sterimolパラメータ算出
#2017年4月12日現在、自動車・電機・化学・素材・医薬品メーカー、国研・大学など549ユーザのシ
ングルライセンス、 39機関での年間ライセンス契約、毎日無償版/トライアル版が平均20ダウン
ロードされています。
計算ソルバー
解析結果
・分子構造
・電子状態
・エネルギー変化
・バンド構造
初期座標作成
MOPAC6、MOPAC7
CNDO/S UV-Vis計算ソルバ内蔵
Gaussian、GAMESS、NWChem、
Gromacs、LAMMPS、Amber、
Quantum ESPRESSO、OpenMX、
FDMNES(XAFSスペクトル)
とのインター
フェイス
分子モデリング、結晶モデリング
Winmostar™とは?
GUI
赤字は分子軌道法(MO)ソルバ 青字は分子動力学法(MD)ソルバ 緑字は固体物理計算ソルバ実行できる計算の種類
量子化学計算
固体物理計算
分子動力学計算
•
電子密度、分子軌道
•
点電荷、静電ポテンシャル
•
IR・ラマン、UV-Vis, NMRスペクト
ル
•
反応座標(IRC)解析
•
遷移モーメント
など
•
格子定数、電子密度
•
点電荷、静電ポテンシャル
•
XAFSスペクトル
•
仕事関数
•
バンド図、DOS計算
•
有効遮蔽媒質(ESM)法
など
•
モル体積、熱膨張係数、比熱、体
積弾性率、エンタルピー
•
自己拡散係数、動径分布関数、
散乱関数
•
溶解度パラメータ、χパラメータ
•
溶媒和自由エネルギー
など
QMパック
1. 計算対象
・有機分子、超分子、金属錯体等
・溶媒効果
2. 計算手法
・Hartree-Fock法
・密度汎関数法
・ガウス基底
3. 対応ソルバ
・GAMESS, Gaussian, NWChem等
4. 可視化・結果解析
・分子軌道表示
・構造最適化のアニメーション表示
・スペクトル(UV-Vis, IR, Raman, NMR)
・化学反応解析(遷移状態、IRC)
Solidパック
1. 計算対象
・結晶(有機、無機)
・表面(スラブモデル)
2. 計算手法
・密度汎関数法
・平面波基底+擬ポテンシャル法
3. 対応ソルバ
・Quantum ESPRESSO, FDMNES等
4. 可視化・結果解析
・構造最適化アニメーション表示
・第一原理MDアニメーション表示
・バンド図、DOS、フェルミ面表示
・Phononバンド表示
・XAFSスペクトル表示
量子力学に基づき、周期性のある固体(結晶、表面)の特性を予測できます。
MDパック
1. 計算対象
・有機系(ポリマー、溶液等)
・無機系(セラミックス、金属、半導等)
2. 計算手法
・古典力学(力場)
3. 対応ソルバ
・Gromacs
・LAMMPS
4. 可視化・結果解析
・トラジェクトリのアニメーション表示
・温度、圧力、拡散定数、弾性率、
熱膨張、熱伝導率等
・溶媒和自由エネルギー(ER法)
古典力学に基づき、分子集合体・ポリマーの熱力学量の予測できます。
SSH
対応サーバ(Linuxクラスター)
FOCUS,TSUBAME,京
*..等
対応キューイングシステム
LSF,PBS,SLURM,SGE,NQS,ShareTask等
計算ジョブ投入
計算結果
リモートジョブ投入機能
お手元のPC上でリソースが足りなくなってきたら、
リモートサーバ上で計算を行うことができます。
ライセンス別機能一覧
モデリング機能(※1) 基本モデリング機能 クリーン(簡易分子力場法による構造最適化) 配座探索(Balloon) SMILES入力 プレゼンテーション機能(※1) 3Dプリンタ(OpenSCAD) レイトレーシング(POV-Ray) GIFアニメーション 特許出願資料用表示 分子形状解析(※1) 分子表面積/体積計算/卵形度 アスペクト比/慣性半径計算 Sterimolパラメータ計算 点群解析(表示のみ) 半経験的量子化学計算(※1) MOPAC入力データ作成/起動 (MOPAC6内蔵) エネルギー準位/分子軌道/電荷表示 双極子/遷移モーメント表示 反応座標解析 CNDO/S計算機能 (UV/Visスペクトル表示) 量子化学計算(※2) UV/Visスペクトル表示 Raman/IR, NMRスペクトル表示 GAMESS/Firefly入力データ作成/起動 NWChem入力データ作成/起動 Gaussian入力データ作成/起動 PIO入力データ作成/起動 点群解析 (対称化および非対称単位抽出)ジョブ管理機能 ジョブ投入インターフェース (リモート) ジョブマネージャ (ローカル) 分子動力学(MD) (※3) Gromacs入力データ作成/起動 LAMMPS入力データ作成/起動 Amber入力データ作成/起動 CONFLEX入力データ作成/起動 QM/MM MD計算 Gromacs各種解析ツール起動(LAMMPSコンバータ付) ポリマービルダ 界面ビルダ 自由エネルギー計算 (ER法, BAR法) 散逸粒子動力学 (DPD) 法 固体物理計算(※4) 結晶ビルダ 表面切り出し スラブ作成 (真空層挿入) Quantum ESPRESSO入力データ作成/起動 FDMNES (XAFSスペクトル) 入力データ作成/起動 第一原理MD計算 バンド図, DOS表示 仕事関数 ESM法